Loading article…
| CHD8 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 識別子 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| エイリアス | CHD8、AUTS18、HELSNF1、クロモドメインヘリカーゼDNA結合タンパク質8、IDDAM | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 外部ID | オミム：610528; MGI : 1915022;ホモロジーン：72405;ジーンカード：CHD8; OMA :CHD8 - オルソログ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| ウィキデータ | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
クロモドメインヘリカーゼDNA結合タンパク質8は、ヒトではCHD8遺伝子によってコードされる酵素である。[5] [6]
関数
CHD8遺伝子は、タンパク質クロモドメインヘリカーゼDNA結合タンパク質8をコードしており、[7]これは胎児の発育に不可欠なクロマチン調節酵素です。 [8] CHD8はATP依存性酵素です。[9]
このタンパク質には、ATP を ADP に加水分解する Snf2 ヘリカーゼドメインが含まれています。[9] CHD8 は、ヌクレオソームの位置を変更してクロマチン構造をリモデリングすることで転写抑制因子として機能する DNA ヘリカーゼをコードしています。[8] CHD8 は Wnt シグナル伝達を負に制御します。[10] Wnt シグナル伝達は、脊椎動物の初期発生と形態形成に重要です。CHD8 はリンカーヒストン H1 もリクルートし、β-カテニンと p53 標的遺伝子の抑制を引き起こすと考えられています。[7] CHD8 の重要性は、CHD8 ノックアウトマウスが広範囲にわたる p53 誘導アポトーシスのために胎生 5.5 日後に死亡したという研究で観察されています。[7]
最近、CD8は長鎖非コードRNA（lncRNA）の調節と関連付けられている[11]。また、XCIのマスター調節因子であるXist長鎖非コードRNAをXist調節領域に競合的に結合して調節することにより、X染色体不活性化（XCI）の開始を調節するとも関連付けられている[12] 。
臨床的意義
この遺伝子の変異は、ヒトおよびマウスモデルにおける自閉症の症例の一部と関連していることが報告されている[13]。[14]
CHD8の変異はβ-カテニン調節遺伝子の上方制御につながる可能性があり、脳の一部ではこの上方制御が脳の過成長、別名大頭症を引き起こす可能性がある[8]
いくつかの研究により、自閉症スペクトラム障害（ASD）におけるCHD8の役割が明らかにされている。[8] CHD8の発現は、ヒトの中期胎児発育中に著しく増加する。[7]クロマチンリモデリング活性と転写調節因子との相互作用は、ASDの病因において重要な役割を果たすことが示されている。[15]発達中の哺乳類の脳には、ASDリスク遺伝子に関連する保存されたCHD8標的領域がある。[8]ヒト神経幹細胞におけるCHD8のノックダウンは、CHD8の標的となるASDリスク遺伝子の調節不全をもたらす。[16]
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000100888 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000053754 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ Nagase T, Kikuno R, Nakayama M, Hirosawa M, Ohara O (2000 年 8 月). 「未確認ヒト遺伝子のコード配列の予測。XVIII. 試験管内で大きなタンパク質をコードする脳由来の 100 個の新しい cDNA クローンの完全な配列」 。DNA研究。7 ( 4 ) : 273–81。doi : 10.1093/dnares/7.4.271。PMID 10997877。
- ^ 「Entrez Gene: CHD8 クロモドメイン ヘリカーゼ DNA 結合タンパク質 8」。
- ^ abcd Nishiyama M, Oshikawa K, Tsukada Y, Nakagawa T, Iemura S, Natsume T, et al. (2009年2月). 「CHD8は初期胚発生中のヒストンH1リクルートメントを介してp53媒介アポトーシスを抑制する」Nature Cell Biology . 11 (2): 172–82. doi :10.1038/ncb1831. PMC 3132516 . PMID 19151705.
- ^ abcde Ronan JL、Wu W、 Crabtree GR（2013年5月）。「神経発達から認知へ：クロマチンの予想外の役割」。Nature Reviews 。遺伝学。14（5）：347–59。doi ：10.1038/nrg3413。PMC 4010428。PMID 23568486。
- ^ ab Thompson BA、Tremblay V、Lin G、Bochar DA (2008 年 6 月)。「CHD8 は、ベータカテニン標的遺伝子を制御する ATP 依存性クロマチンリモデリング因子です」。分子細胞生物 学。28 ( 12): 3894–904。doi :10.1128/MCB.00322-08。PMC 2423111。PMID 18378692。
- ^ Nishiyama M, Skoultchi AI, Nakayama KI (2012年1月). 「CHD8によるヒストンH1のリクルートはWnt-β-カテニンシグナル伝達経路の抑制に必須である」.分子細胞生物学. 32 (2): 501–12. doi :10.1128/MCB.06409-11. PMC 3255766. PMID 22083958 .
- ^ Wilkinson B, Grepo N, Thompson BL, Kim J, Wang K, Evgrafov OV, et al. (2015年5月). 「自閉症関連遺伝子クロモドメインヘリカーゼDNA結合タンパク質8（CHD8）は非コードRNAと自閉症関連遺伝子を制御する」. Translational Psychiatry . 5 (5): e568. doi :10.1038/tp.2015.62. ISSN 2158-3188. PMC 4471293. PMID 25989142 .
- ^ Cerase A、Young AN、Ruiz NB、Buness A、Sant GM、Arnold M、et al. (2021-04-15). 「Chd8はXist発現の微調整制御を通じてマウスのX染色体の不活性化を制御する」. Communications Biology . 4 (1): 485. doi :10.1038/s42003-021-01945-1. ISSN 2399-3642. PMC 8050208. PMID 33859315 .
- ^ Bernier R, Golzio C, Xiong B, Stessman HA, Coe BP, Penn O, et al. (2014年7月). 「CHD8の破壊的変異が発達初期における自閉症のサブタイプを定義する」. Cell . 158 (2): 263–276. doi :10.1016/j.cell.2014.06.017. PMC 4136921. PMID 24998929 .
- ^ Gompers AL、Su-Feher L、Ellegood J、 Copping NA、Riyadh MA、Stradleigh TW、他 (2017 年 8 月)。「生殖系列 Chd8 ハプロ不全がマウスの脳の発達を変化させる」。Nature Neuroscience。20 ( 8 ) : 1062–1073。doi : 10.1038 / nn.4592。OSTI 1436635。PMC 6008102。PMID 28671691。
- ^ Sugathan A, Biagioli M, Golzio C, Erdin S, Blumenthal I, Manavalan P, et al. (2014年10月). 「CHD8は神経前駆細胞における自閉症スペクトラム障害に関連する神経発達経路を制御する」Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 111 (42): E4468-77. Bibcode :2014PNAS..111E4468S. doi : 10.1073/pnas.1405266111 . PMC 4210312 . PMID 25294932.
- ^ Cotney J、Muhle RA、Sanders SJ、Liu L、Willsey AJ、Niu W、他 (2015 年 3 月)。「自閉症関連クロマチン修飾因子 CHD8 はヒトの神経発達中に他の自閉症リスク遺伝子を制御する」。Nature Communications。6 ( 6 ) : 6404。Bibcode : 2015NatCo...6.6404C。doi : 10.1038/ncomms7404。PMC 4355952。PMID 25752243。
外部リンク
- UCSC ゲノム ブラウザのヒト CHD8 ゲノムの位置と CHD8 遺伝子の詳細ページ。
- PDBe-KBのUniProt : Q9HCK8 (クロモドメイン-ヘリカーゼ-DNA 結合タンパク質 8)のPDBで入手可能なすべての構造情報の概要。
さらに読む
- 中島 D、岡崎 N、山川 H、菊野 R、大原 O、長瀬 T (2002 年 6 月)。 「KIAA 遺伝子の発現準備が整った cDNA クローンの構築: 330 個の KIAA cDNA クローンの手動キュレーション」。DNA 研究。9 (3): 99-106。土井：10.1093/dnares/9.3.99。PMID 12168954。
- Epplen C, Epplen JT (1994 年 1 月). 「ヒトリンパ球の mRNA における (cac)n/(gtg)n 単純反復配列の発現」.ヒト遺伝学. 93 (1): 35–41. doi :10.1007/BF00218910. PMID 7505766. S2CID 22998633.
- Sakamoto I, Kishida S, Fukui A, Kishida M, Yamamoto H, Hino S, et al. (2000 年 10 月). 「新規 β-カテニン結合タンパク質は β-カテニン依存性 Tcf 活性化および軸形成を阻害する」. The Journal of Biological Chemistry . 275 (42): 32871–8. doi : 10.1074/jbc.M004089200 . PMID 10921920.
- 小林 正之、花井 亮（2001 年 9 月）。「ヒトトポイソメラーゼ IIIbeta と染色体の M 期特異的な関連性」。生化学および生物物理学的研究通信。287 (1): 282–7。doi :10.1006/bbrc.2001.5580。PMID 11549288 。
- Kobayashi M, Kishida S, Fukui A, Michiue T, Miyamoto Y, Okamoto T, et al. (2002 年 2 月). 「ベータカテニン結合タンパク質である Duplin の核局在は、Wnt シグナル伝達経路に対する阻害活性に必須である」。The Journal of Biological Chemistry . 277 (8): 5816–22. doi : 10.1074/jbc.M108433200 . PMID 11744694。
- Nishiyama M, Nakayama K, Tsunematsu R, Tsukiyama T, Kikuchi A , Nakayama KI (2004 年 10 月)。「β-カテニン結合タンパク質 Duplin を欠損したマウスの早期胚死」。 分子細胞生物学。24 (19): 8386–94。doi :10.1128/ MCB.24.19.8386-8394.2004。PMC 516734。PMID 15367660。
- Lin KT、Lu RM、Tarn WY (2004 年 10 月)。「WW ドメイン含有タンパク質は初期スプライソソームと相互作用し、生体内での pre-mRNA スプライシングに関与する」。分子 細胞生物学。24 ( 20): 9176–85。doi :10.1128/MCB.24.20.9176-9185.2004。PMC 517884。PMID 15456888。
- 石原 功、押村 正之、中尾 正之 (2006 年 9 月) 。「CTCF 依存性クロマチンインシュレーターはエピジェネティックリモデリングに関連している」。分子細胞。23 (5): 733–42。doi : 10.1016/ j.molcel.2006.08.008。PMID 16949368。
- Beausoleil SA、Villén J、Gerber SA、Rush J、 Gygi SP (2006 年 10 月)。「高スループットタンパク質リン酸化分析および部位局在化のための確率ベースのアプローチ」。Nature Biotechnology。24 ( 10 ): 1285–92。doi :10.1038/ nbt1240。PMID 16964243。S2CID 14294292 。
- Olsen JV、Blagoev B、Gnad F、Macek B、Kumar C、Mortensen P、他 (2006 年 11 月)。「シグナル伝達ネットワークにおける全体的、生体内、および部位特異的なリン酸化ダイナミクス」。Cell . 127 (3): 635–48. doi : 10.1016/j.cell.2006.09.026 . PMID 17081983。
- Yuan CC、Zhao X、Florens L、Swanson SK、Washburn MP、Hernandez N (2007 年 12 月)。「CHD8 はヒト Staf と関連し、効率的な U6 RNA ポリメラーゼ III 転写に寄与する」。分子細胞生物学。27 (24): 8729–38。doi : 10.1128/ MCB.00846-07。PMC 2169411。PMID 17938208。
- Thompson BA、Tremblay V、 Lin G 、 Bochar DA (2008 年 6 月)。「CHD8 は、ベータカテニン標的遺伝子を制御する ATP 依存性クロマチンリモデリング因子です」。分子 細胞生物学。28 (12): 3894–904。doi :10.1128/MCB.00322-08。PMC 2423111。PMID 18378692。
- Caldon CE、Sergio CM、Schütte J、 Boersma MN、Sutherland RL、Carroll JS、他 (2009 年 9 月)。「サイクリン E2 のエストロゲン調節にはサイクリン D1 が必要で、c-Myc は不要」。 分子細胞生物学。29 (17): 4623–39。doi : 10.1128 /MCB.00269-09。PMC 2725719。PMID 19564413。
- Nishiyama M, Oshikawa K, Tsukada Y, Nakagawa T, Iemura S, Natsume T, et al. (2009年2月). 「CHD8は初期胚発生中にヒストンH1リクルートメントを介してp53媒介アポトーシスを抑制する」Nature Cell Biology . 11 (2): 172–82. doi :10.1038/ncb1831. PMC 3132516 . PMID 19151705.
- Rodríguez-Paredes M、Ceballos-Chávez M、Esteller M、García-Domínguez M、Reyes JC (2009 年 5 月)。「クロマチンリモデリング因子 CHD8 は伸長 RNA ポリメラーゼ II と相互作用し、サイクリン E2 遺伝子の発現を制御する」。核酸 研究。37 ( 8 ) : 2449–60。doi :10.1093/nar/gkp101。PMC 2677868。PMID 19255092。
- Yates JA、Menon T、Thompson BA 、Bochar DA (2010年2 月)。「ATP 依存性クロマチンリモデリング酵素 CHD8 による HOXA2 遺伝子発現の調節」 ( PDF )。FEBS Letters。584 (4): 689–93。doi : 10.1016 /j.febslet.2010.01.022。hdl : 2027.42/ 116349。PMID 20085832。S2CID 9956275 。