ホモサピエンス種のタンパク質コード遺伝子
| CE170 について |
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| 利用可能な構造 |
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| PDB | オルソログ検索: PDBe RCSB |
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| 識別子 |
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| エイリアス | CEP170、FAM68A、KAB、KIAA0470、中心体タンパク質170 |
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| 外部ID | オミム:613023; MGI : 1918348;ホモロジーン: 22844;ジーンカード:CEP170; OMA :CEP170 - オルソログ |
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| 遺伝子の位置(マウス) |
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 | | クロ。 | 染色体1(マウス)[2] |
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| | バンド | 1|1 H4 | 始める | 176,561,219 bp [2] |
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| 終わり | 176,641,633 bp [2] |
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| RNA発現パターン |
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| ブギー | | 人間 | マウス(相同遺伝子) |
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| トップの表現 | - 神経節隆起
- 脳梁
- 心室帯
- 左精巣
- 右精巣
- 腓骨神経
- C1セグメント
- 結腸上皮
- アキレス腱
- 小脳皮質
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| | トップの表現 | - 神経節隆起
- 手
- 積雲細胞
- 精子細胞
- 心室帯
- 神経管
- 嗅球
- 小脳葉
- 胎児の尾
- 性器結節
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| | 参照表現データの詳細 |
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| バイオGPS | |
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| オルソログ |
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| 種 | 人間 | ねずみ |
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| エントレズ | | |
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| アンサンブル | |
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ENSG00000143702 ENSG00000276725 |
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| ユニプロット | | |
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| RefSeq (mRNA) | |
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NM_001042404 NM_001042405 NM_014812 |
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NM_001024722 NM_001099637 NM_001368872 NM_001368873 |
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| RefSeq (タンパク質) | |
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NP_001035863 NP_001035864 NP_055627 |
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NP_001093107 NP_001355801 NP_001355802 |
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| 場所 (UCSC) | 1 章: 243.12 – 243.26 Mb | 1 章: 176.56 – 176.64 Mb |
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| PubMed検索 | [3] | [4] |
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| ウィキデータ |
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中心体タンパク質170kDaはCEP170としても知られ、ヒトではCEP170遺伝子によってコードされるタンパク質である。[5] [6]
関数
この遺伝子の産物は、動物細胞内の主要な微小管組織化中心として機能する非膜性細胞小器官である中心体の構成要素である。間期には、コード化されたタンパク質は、中心体の組織化を助けると考えられている微小管ベースの構造である成熟した中心小体の亜遠位付属器に局在する。有糸分裂中、タンパク質は中心体近くの紡錘体微小管と結合する。タンパク質は、鞭毛内輸送タンパク質81(IFT81)、SH3ドメイン含有タンパク質PRAX-1と相互作用し、サイクリン依存性キナーゼ1(Cdk1)およびポロ様キナーゼ1(PLK1)によってリン酸化され、微小管組織化、細胞形態および繊毛安定性の維持に機能する。[5]
ヒトゲノムには転写された疑似遺伝子が含まれていると推定される。この遺伝子の選択的スプライシング転写変異体がいくつか発見されているが、これらの変異体の全長は決定されていない。[5]
参考文献
- ^ abc ENSG00000276725 GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000143702、ENSG00000276725 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000057335 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ abc 「Entrez Gene: CEP170 中心体タンパク質 170kDa」。
- ^ Guarguaglini G、Duncan PI、Stierhof YD、Holmström T、Duensing S、Nigg EA (2005 年 3 月)。「フォークヘッド関連ドメインタンパク質 Cep170 は Polo 様キナーゼ 1 と相互作用し、成熟した中心小体のマーカーとして機能します」。Molecular Biology of the Cell。16 ( 3 ): 1095–107。doi :10.1091/mbc.E04-10-0939。PMC 551476。PMID 15616186。
外部リンク
- UCSC ゲノム ブラウザのヒト CEP170 ゲノムの位置と CEP170 遺伝子の詳細ページ。
- PDBe-KBは、PDBに登録されている170kDaのヒト中心体タンパク質(CEP170)の構造情報の概要を提供します。
さらに読む
- Andersen JS 、 Wilkinson CJ、Mayor T、他 (2003)。「タンパク質相関プロファイリングによるヒト中心体のプロテオーム特性評価」。Nature . 426 ( 6966 ): 570–4。Bibcode :2003Natur.426..570A。doi :10.1038/nature02166。PMID 14654843。S2CID 4427303。
- Jin J、Smith FD、Stark C、他 (2004)。「細胞骨格調節と細胞組織化に関与する生体内 14-3-3 結合タンパク質のプロテオーム、機能、およびドメインベースの分析」。Curr . Biol . 14 ( 16 ): 1436–50。Bibcode : 2004CBio ...14.1436J。doi : 10.1016/j.cub.2004.07.051。PMID 15324660。S2CID 2371325 。
- Guarguaglini G、Duncan PI、Stierhof YD、他 (2005)。「フォークヘッド関連ドメインタンパク質 Cep170 は Polo 様キナーゼ 1 と相互作用し、成熟した中心小体のマーカーとして機能する」。Mol . Biol. Cell . 16 (3): 1095–107. doi :10.1091/mbc.E04-10-0939. PMC 551476. PMID 15616186 。
- Kim JE、Tannenbaum SR、White FM (2005)。「HT-29ヒト結腸腺癌細胞のグローバルホスホプロテオーム」。J . Proteome Res . 4 (4): 1339–46. doi :10.1021/pr050048h. PMID 16083285。
- Olsen JV、Blagoev B、Gnad F、et al. (2006)。「シグナル伝達ネットワークにおける全体的、生体内、および部位特異的なリン酸化ダイナミクス」。Cell . 127 (3): 635–48. doi : 10.1016/j.cell.2006.09.026 . PMID 17081983. S2CID 7827573。
- ラムラ S (2009)。中心体タンパク質 Cep170 の機能的特徴付け。学位論文、LMU ミュンヘン: Fakultät für Biologie (テキスト.博士論文)。 URN nbn:de:bvb:19-97838。