カルココ2

カルココ2
利用可能な構造
ＰＤＢ	ヒト UniProt 検索: PDBe RCSB
PDB IDコードのリスト
	3VVV、3VVW、4GXL、4HAN、2MXP、4XKL
識別子
エイリアス	CALCOCO2、NDP52、カルシウム結合およびコイルドコイルドメイン2
外部ID	オミム：604587;ホモロジーン: 31339;ジーンカード：CALCOCO2; OMA :CALCOCO2 - オルソログ
遺伝子の位置（ヒト）
クロ。	染色体17（ヒト）
終わり	48,866,522 bp
RNA発現パターン
	トップの表現
	アキレス腱; ; 胃粘膜; ; 右肺; ; 結腸上皮; ; 腓骨神経; ; 左精巣; ; 右精巣; ; 直腸; ; 膝窩動脈; ; 脛骨動脈;
	該当なし
	参照表現データの詳細
	参照表現データの詳細
遺伝子オントロジー
分子機能	タンパク質結合; タンパク質ホモ二量体化活性;
細胞成分	細胞質; 細胞質の核周囲領域; オートファゴソーム; オートファゴソーム膜; 細胞骨格; 膜; 細胞質小胞; 核; 細胞内膜で囲まれた細胞小器官; 細胞質;
生物学的プロセス	オートファジー; ウイルスプロセス; オートファゴソーム成熟の正の制御; インターフェロンガンマに対する反応; 異種食;
	出典:Amigo / QuickGO
オルソログ
	10241
	該当なし
	ENSG00000136436
	該当なし
	Q13137
	該当なし
	NM_001261390 ; NM_001261391 ; NM_001261393 ; NM_001261395 ; NM_005831
	該当なし
	NP_001248319 ; NP_001248320 ; NP_001248322 ; NP_001248324 ; NP_005822
	該当なし
	ウィキデータ
人間の表示/編集

カルシウム結合コイルドコイルドメイン含有タンパク質2は、ヒトではCALCOCO2遺伝子によってコードされるタンパク質である。^[3]^[4]

この遺伝子によってコードされるタンパク質は、核ドメイン 10 (ND10) 体のサブユニットです。ND10 体は、核あたり 10 個の点として免疫組織化学的に現れる核ドメインです。ヌクレアーゼ消化および塩抽出に対する耐性に基づいて、核マトリックスに関連していると考えられています。ND10 タンパク質はHSV-1感染によって核から除去され、ウイルスのライフサイクルで役割を果たしている可能性があります。^[4]

CALCOCO2はオートファジー受容体であり、ヒトβ細胞におけるCALCOCO2の喪失はオートファジーを介したインスリン顆粒恒常性の変化と関連している。したがって、CALCOCO2の変異は2型糖尿病のリスクと関連している。^[5]

参考文献

^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000136436 – Ensembl、2017 年 5 月
^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
^ Korioth F, Gieffers C, Maul GG, Frey J (1995 年 7 月). 「ウイルス感染およびインターフェロン治療により再分布する核ドメイン 10 の新規タンパク質 NDP52 の分子特性」. The Journal of Cell Biology . 130 (1): 1– 13. doi :10.1083/jcb.130.1.1. PMC 2120522. PMID 7540613 .
^ ab 「Entrez Gene: CALCOCO2 カルシウム結合およびコイルドコイルドメイン 2」。
^ Rottner AK、Ye Y、Navarro-Guerrero E、Rajesh V、Pollner A、Bevacqua RJ、et al. (2022年12月). 「ゲノムワイドCRISPRスクリーンにより、CALCOCO2が2型糖尿病リスクに影響を与えるベータ細胞機能の調節因子であることが特定されました」。Nature Genetics . 55 (1): 54– 65. doi : 10.1038/s41588-022-01261-2 . PMC 9839450 . PMID 36543916.

さらに読む

Maruyama K, Sugano S (1994年1月). 「オリゴキャッピング：真核生物mRNAのキャップ構造をオリゴリボヌクレオチドで置き換える簡単な方法」. Gene . 138 ( 1–2 ): 171–174 . doi :10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
Sternsdorf T、Jensen K、 Züchner D 、 Will H (1997 年 7 月)。「核ドットタンパク質 52 の細胞内局在、発現、および構造」。The Journal of Cell Biology。138 ( 2): 435– 448。doi :10.1083/ jcb.138.2.435。PMC 2138200。PMID 9230084。
Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (1997年10月). 「全長濃縮cDNAライブラリーおよび5'末端濃縮cDNAライブラリーの構築と特性評価」. Gene . 200 ( 1– 2): 149– 156. doi :10.1016/S0378-1119(97)00411-3. PMID 9373149.
Florin L、Schäfer F、Sotlar K、 Streeck RE、Sapp M (2002 年 3 月)。「パピローマウイルスカプシドタンパク質 L2 によって誘導される核ドメイン 10 の再編成」。ウイルス学。295 ( 1 ) : 97– 107。doi : 10.1006/viro.2002.1360。PMID 12033769。
Di Y、Li J、Zhang Y、He X、Lu H、Xu D、他 (2003 年 6 月)。「GEMIN4 の変異体である HCC 関連タンパク質 HCAP1 は、ジンクフィンガータンパク質と相互作用する」。Journal of Biochemistry。133 ( 6 ): 713– 718。doi :10.1093/jb/mvg091。PMID 12869526 。
Everett RD、Sourvinos G、Leiper C、Clements JB、Orr A (2004 年 2 月)。「感染初期における単純ヘルペスウイルス 1 型調節タンパク質 ICP4 の核フォーカスの形成: 局在、ダイナミクス、ICP27 のリクルートメント、および ND10 様複合体の de novo 誘導の証拠」。Journal of Virology。78 ( 4 ) : 1903– 1917。doi : 10.1128 /JVI.78.4.1903-1917.2004。PMC 369473。PMID 14747555。
Colland F, Jacq X, Trouplin V, Mougin C, Groizeleau C, Hamburger A, et al. (2004 年 7 月). 「ヒトシグナル伝達経路の機能的プロテオミクスマッピング」.ゲノム研究. 14 (7): 1324– 1332. doi :10.1101/gr.2334104. PMC 442148. PMID 15231748.
Rual JF、Venkatesan K、Hao T、Hirozane-Kishikawa T、Dricot A、Li N、他 (2005 年 10 月)。「ヒトタンパク質間相互作用ネットワークのプロテオーム規模のマップに向けて」。Nature . 437 ( 7062 ) : 1173– 1178。Bibcode : 2005Natur.437.1173R。doi : 10.1038/nature04209。PMID 16189514。S2CID 4427026。
Morriswood B、Ryzhakov G、Puri C、Arden SD、Roberts R、Dendrou C、他 (2007 年 8 月)。「T6BP と NDP52 は、サイトカインシグナル伝達と細胞接着において潜在的役割を果たすミオシン VI 結合パートナーです」。Journal of Cell Science。120 ( Pt 15 ): 2574– 2585。doi :10.1242/jcs.007005。PMC 2621013。PMID 17635994。

外部リンク

UCSC ゲノムブラウザにおける CALCOCO2 ヒト遺伝子の位置。
UCSC ゲノムブラウザにおける CALCOCO2 ヒト遺伝子の詳細。

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000136436 – Ensembl、2017 年 5 月

[2] 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。

[pmid7540613-3] Korioth F, Gieffers C, Maul GG, Frey J (1995 年 7 月). 「ウイルス感染およびインターフェロン治療により再分布する核ドメイン 10 の新規タンパク質 NDP52 の分子特性」. The Journal of Cell Biology . 130 (1): 1– 13. doi :10.1083/jcb.130.1.1. PMC 2120522. PMID 7540613 .

[entrez-4] 「Entrez Gene: CALCOCO2 カルシウム結合およびコイルドコイルドメイン 2」。

[5] Rottner AK、Ye Y、Navarro-Guerrero E、Rajesh V、Pollner A、Bevacqua RJ、et al. (2022年12月). 「ゲノムワイドCRISPRスクリーンにより、CALCOCO2が2型糖尿病リスクに影響を与えるベータ細胞機能の調節因子であることが特定されました」。Nature Genetics . 55 (1): 54– 65. doi : 10.1038/s41588-022-01261-2 . PMC 9839450 . PMID 36543916.