アカリオクロリスマリーナ

アカリオクロリスマリーナ
科学的分類
ドメイン：	細菌
門:	シアノバクテリア
クラス：	藍藻類
注文：	シネココッカス目
家族：	アカリオクロリダ; 科 Komárek et al . 2014年
属:	アカリオクロリス; 宮下＆茅原 2003
種：	A. マリーナ
二名法名
	アカリオクロリスマリーナ; 宮下・千原、2003

Acaryochloris marina は単細胞のシアノバクテリアの一種で、主な色素としてクロロフィル d を生成する（通常使用されるクロロフィル aの代わりに）ため、波長 700～750 nm の遠赤色光を使用して光合成を行うことができます。^[3]^[4]A. marinaは温帯および熱帯の海洋環境に生息しています。A. marinaの株は、紅藻類の着生植物として、ホヤ類に関連して、また潮間帯の岩石（すなわち岩石上層）、複数の環境から分離されています^{。 [5]}

説明

1993年に西太平洋のパラオ共和国の沿岸サンゴから初めて発見され、1996年に発表されました。^{[6] 1996年の}ネイチャー誌の論文では正式な説明がその後すぐに発表されると主張されていましたが、^[6]系統発生の問題（深く分岐したシアノバクテリア）により、2003年に暫定的な部分的な説明が発表されました。^[1]

ゲノム

そのゲノムは2008年に初めて解読され、9つのプラスミドを含む8.3 Mbの大きな細菌ゲノムであることが明らかになりました。^[7]

語源

Acaryochlorisという名前は、ギリシャ語の接頭辞a (ἄν) ^[8]（「なし」を意味する）、caryo (κάρυον) ^[9]（「木の実」（ここでは「核」を意味する）、chloros (χλωρός) ^[10]（緑を意味する）を組み合わせたものである。^[11]したがって、これは新ラテン語の Acaryochlorisであり、「核のない緑」を意味する。^[1] 種小名の marinaはラテン語で「海の」を意味する。^[1]

分類

歴史的な理由により、シアノバクテリアの分類は問題があり、多くは正式に公表されておらず、分類の枠組みにまだ組み込まれていない。^[12]正式に認められていない種の一つにアカリオクロリス・マリナがあるが、公式文書では厳密には「アカリオクロリス・マリナ」と表記されるべきであるが、実際にはめったにそうは書かれていない（cf. ^[7]^[13]）

太陽系外惑星の居住可能性

NASAのナンシー・キアンを含む科学者たちは、アカリオクロリス・マリナの存在は、クロロフィルaではなくクロロフィルdを使用する生物が、赤色矮星（太陽よりもはるかに少ない光を発する）を周回する太陽系外惑星で酸素発生型光合成を行うことができる可能性があることを示唆していると提唱している。 ^[14]^[15]天の川銀河の恒星の約70％が赤色矮星であるため、^[16]A. marinaの存在は、酸素発生型光合成が、宇宙生物学者が当初考えていたよりもはるかに多くの太陽系外惑星で起こっている可能性があることを示唆している。

参照

プロクロロコッカス

参考文献

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^ Nürnberg, Dennis J.; Morton, Jennifer; Santabarbara, Stefano; Telfer, Alison; Joliot, Pierre; Antonaru, Laura A.; Ruban, Alexander V.; Cardona, Tanai; Krausz, Elmars; Boussac, Alain; Fantuzzi, Andrea; Rutherford, A. William (2018-06-15). 「クロロフィル f を含む光化学系の赤色限界を超えた光化学」. Science . 360 (6394): 1210–1213. Bibcode :2018Sci...360.1210N. doi :10.1126/science.aar8313. ISSN 0036-8075. PMID 29903971.
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[desc-1] 宮下博司;池本博司;倉野直也；宮地、S.千原正史 (2003) 「アカリオクロリスマリーナ Gen. Et Sp. Nov. (シアノバクテリア)、主要な色素として Chl D を含む酸素発生性光合成原核生物 1」。生理学のジャーナル。39 (6): 1247–1253。Bibcode :2003JPcgy..39.1247M。土井：10.1111/j.0022-3646.2003.03-158.x。S2CID 84330163。

[2] コマレク J、カシュトフスキー J、マレシュ J、ヨハンセン JR (2014)。「多相アプローチを使用したシアノ原核生物 (シアノバクテリア属) 2014 の分類学的分類」(PDF)。プレスリア。86 : 295–335。

[3] Nürnberg, Dennis J.; Morton, Jennifer; Santabarbara, Stefano; Telfer, Alison; Joliot, Pierre; Antonaru, Laura A.; Ruban, Alexander V.; Cardona, Tanai; Krausz, Elmars; Boussac, Alain; Fantuzzi, Andrea; Rutherford, A. William (2018-06-15). 「クロロフィル f を含む光化学系の赤色限界を超えた光化学」. Science . 360 (6394): 1210–1213. Bibcode :2018Sci...360.1210N. doi :10.1126/science.aar8313. ISSN 0036-8075. PMID 29903971.

[4] 浜口佑;川上啓介；新沢・伊藤京子；井上柏野、夏子。伊藤茂；伊福健太郎；山下栄樹;前田航;米倉康二樫野、康裕（2021-04-20）。「アカリオクロリスマリーナの光化学系Iを利用した遠赤色光の構造」ネイチャーコミュニケーションズ。12 (1): 2333. Bibcode :2021NatCo..12.2333H。土井：10.1038/s41467-021-22502-8。ISSN 2041-1723。PMC 8058080。PMID 33879791。

[5] Miller, Scott R.; Abresch, Heidi E.; Baroch, Jacob J.; Fishman Miller, Caleb K.; Garber, Arkadiy I.; Oman, Andrew R.; Ulrich, Nikea J. (2022年3月). 「クロロフィルd産生シアノバクテリアAcaryochloris marinaのゲノムおよび機能的変異」.微生物. 10 (3): 569. doi : 10.3390/microorganisms10030569 . ISSN 2076-2607. PMC 8949462. PMID 35336144 .

[n96-6] H. ミヤシタ;池本博司;倉野直也；安達和也;千原正人＆宮地真司 (1996)。「主要な色素としてのクロロフィル d」。自然。383 (6599): 402。ビブコード:1996Natur.383..402M。土井：10.1038/383402a0。

[genome-7] WD、スウィングリー;チェン、M。チョン、PC;アラバマ州コンラッド。デジェサ、LC;ハオ、J.ホンチャック、BM;カルバッハ、LE;クルドグル、A.ラヒリ、S.サウスダコタ州マストリアン。宮下博司；ペイジ、L.ラーマクリシュナ、P.佐藤、S.サトリー、W.M.島田裕也；テイラー、HL;トモ、T.土屋哲也;ワン、ZT;レイモンド、J.三室正；ブランケンシップ, RE州;タッチマン、JW (2008)。「クロロフィル D 産生シアノバクテリア、アカリオクロリスマリーナにおけるニッチ適応とゲノム拡大」。米国科学アカデミーの議事録。105 (6): 2005 ～ 2010 年。Bibcode : 2008PNAS..105.2005S . doi : 10.1073 / pnas.0709772105.PMC2538872.PMID18252824 .

[8] ἄν.リデル、ヘンリー・ジョージ、スコット、ロバート、ペルセウス・プロジェクトのギリシャ語-英語辞書

[9] κάρυον.リデル、ヘンリー・ジョージ;スコット、ロバート;ペルセウスプロジェクトのギリシャ語-英語辞書

[chloro-10] χλωρός.リデル、ヘンリー・ジョージ;スコット、ロバート;ペルセウスプロジェクトのギリシャ語-英語辞典

[11] LPSNの接尾辞の性別; Parte, Aidan C.; Sardà Carbasse, Joaquim; Meier-Kolthoff, Jan P.; Reimer, Lorenz C.; Göker, Markus (2020年11月1日). 「命名法上の地位を有する原核生物名のリスト（LPSN）がDSMZに移動」。International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology . 70 (11): 5607–5612. doi : 10.1099/ijsem.0.004332 .

[12] LPSNにおけるシアノバクテリアの分類; Parte, Aidan C.; Sardà Carbasse, Joaquim; Meier-Kolthoff, Jan P.; Reimer, Lorenz C.; Göker, Markus (2020年11月1日). 「命名法上の常設名を持つ原核生物名のリスト（LPSN）がDSMZに移動」。International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology . 70 (11): 5607–5612. doi : 10.1099/ijsem.0.004332 .

[13] Kühl, M.; Chen, M.; Ralph, PJ; Schreiber, U.; Larkum, AWD (2005). 「生態学: クロロフィル d を含むシアノバクテリアのニッチ」. Nature . 433 (7028): 820. Bibcode :2005Natur.433..820K. doi : 10.1038/433820a . PMID 15729331.

[14] Gronstal, Aaron (2012年2月)。「Far-Out Photosynthesis」。ニュースと特集。NASA 。 2014年1月26日閲覧。

[15] Mielke, SP; NY Kiang; RE Blankenship; MR Gunner & D. Mauzerall (2011). 「Chl dを利用するシアノバクテリアの光合成効率は、Chl aを利用する酸素発生種の効率と同等かそれ以上である」。Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Bioenergetics . 1807 (9): 1231–1236. Bibcode :2011BBAcB1807.1231M. doi :10.1016/j.bbabio.2011.06.007. PMID 21708123.

[16] 「Colorful Dwarfs」。StarDate。テキサス大学マクドナルド天文台。 2014年1月23日閲覧。