ホモサピエンス種のタンパク質コード遺伝子
| ALS2 |
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| 識別子 |
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| エイリアス | ALS2、ALS2CR6、ALSJ、IAHSP、PLSJ、alsin Rho グアニンヌクレオチド交換因子、alsin Rho グアニンヌクレオチド交換因子 ALS2 |
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| 外部ID | オミム:606352; MGI : 1921268;ホモロジーン: 23264;ジーンカード:ALS2; OMA :ALS2 - オルソログ |
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| 遺伝子の位置(マウス) |
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 | | クロ。 | 染色体1(マウス)[2] |
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| | バンド | 1|1 C1.3 | 始める | 59,202,085 bp [2] |
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| 終わり | 59,276,390 bp [2] |
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| RNA発現パターン |
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| ブギー | | 人間 | マウス(相同遺伝子) |
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| トップの表現 | - 小脳
- 小脳皮質
- 小脳半球
- 小脳の右半球
- 小脳虫部
- 前脛骨筋
- 左心室の心筋
- 右心房の心筋組織
- 三角筋
- 腓骨神経
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| | トップの表現 | - 網膜の神経層
- 海馬歯状回顆粒細胞
- 小脳皮質
- 桑実胚
- 受精卵
- 太ももの筋肉
- 右腎臓
- 心室帯
- 卵黄嚢
- 一次視覚野
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| | 参照表現データの詳細 |
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| バイオGPS |  | | 参照表現データの詳細 |
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| 遺伝子オントロジー |
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| 分子機能 |
- タンパク質ホモ二量体化活性
- グアニルヌクレオチド交換因子活性
- タンパク質セリン/スレオニンキナーゼ活性化因子活性
- タンパク質結合
| | 細胞成分 |
- 細胞質
- 小胞
- 中心体
- 膜
- シナプス後密度
- 細胞内膜で囲まれた細胞小器官
- 成長円錐
- フリル
- 樹状突起棘
- 軸索
- ソーマ
- 樹状突起
- 初期エンドソーム
- ニューロン投影
- ラメリポディウム
- 細胞質
- タンパク質含有複合体
| | 生物学的プロセス |
- タンパク質の局在
- ニューロン投射形態形成
- シナプス伝達、グルタミン酸
- 軸索形成
- 運動行動
- 小胞組織
- GTPase活性の調節
- 細胞死
- 子宮内胎児発育
- 行動的恐怖反応
- 酸化ストレスへの反応
- エンドソーム組織
- エンドソーム輸送
- GTPase活性の正の調節
- 受容体リサイクル
- 神経筋接合部の発達
- Racタンパク質シグナル伝達
- Rhoタンパク質シグナル伝達の制御
- エンドソームサイズの調節
- Racタンパク質シグナル伝達の正の制御
- タンパク質キナーゼ活性の正の調節
- タンパク質セリン/スレオニンキナーゼ活性の正の調節
| | 出典:Amigo / QuickGO |
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| オルソログ |
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| 種 | 人間 | ねずみ |
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| エントレズ | | |
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| アンサンブル | | |
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| ユニプロット | | |
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| RefSeq (mRNA) | | |
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NM_001159948 NM_028717 NM_146109 |
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| RefSeq (タンパク質) | | |
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NP_001153420 NP_082993 NP_666221 |
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| 場所 (UCSC) | 2 章: 201.7 – 201.78 Mb | 1 章: 59.2 – 59.28 Mb |
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| PubMed検索 | [3] | [4] |
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| ウィキデータ |
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アルシンはヒトではALS2遺伝子によってコードされるタンパク質である。[5] [6] ALS2相同遺伝子[7]は完全なゲノムデータが利用可能な
すべての哺乳類で同定されている。
参照
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000003393 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000026024 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 秦野S、ハンドCK、大須賀H、柳沢Y、大友A、デボンRS、宮本N、庄口宮田J、岡田Y、シンガラジャR、フィグレヴィッツDA、クヴィアトコウスキーT、ホズラーBA、サギーT、スカウグJ、ナシールJ 、ブラウン RH ジュニア、シェーラー SW、ルーロー GA、ヘイデン MR、イケダ JE (10 月) 2001年)。 「家族性筋萎縮性側索硬化症 2 では、推定上の GTPase 制御因子をコードする遺伝子が変異している」。ナット・ジュネ。29 (2): 166–73 .土井:10.1038/ng1001-166。PMID 11586298。S2CID 52828189 。
- ^ 「Entrez Gene: ALS2 筋萎縮性側索硬化症 2 (若年性)」.
- ^ 「OrthoMaM系統マーカー:ALS2コーディング配列」。2016年3月4日時点のオリジナルよりアーカイブ。2009年12月9日閲覧。
さらに読む
- 秦野 誠 (2002). 「家族性筋萎縮性側索硬化症の原因遺伝子」生化学. 74 (6): 483–9 . PMID 12138710.
- 中島大将、岡崎直人、山川博司、他(2003年)。 「KIAA 遺伝子の発現準備が整った cDNA クローンの構築: 330 個の KIAA cDNA クローンの手動キュレーション」。DNA研究所9 (3): 99–106 .土井: 10.1093/dnares/9.3.99。PMID 12168954。
- Hadano S、Nichol K、 Brinkman RR、他 (1999)。「酵母人工染色体に基づく、ヒト染色体 2q33-q34 上の若年性筋萎縮性側索硬化症 (ALS2) の重要領域の物理マップ」。Genomics。55 ( 1): 106– 12。doi :10.1006/ geno.1998.5637。PMID 9889004 。
- Hosler BA、Sapp PC、Berger R 、他 (2000)。「染色体2q33上の劣性家族性筋萎縮性側索硬化症遺伝子座(ALS2)の精密マッピングと特徴付け」。神経 遺伝学。2 (1): 34– 42。doi : 10.1007 /s100480050049。PMID 9933298。S2CID 33368578。
- 永瀬 孝、菊野 亮、中山 正之、他 (2001)。「未確認ヒト遺伝子のコード配列の予測。XVIII. 試験管内で巨大タンパク質をコードする脳由来の 100 個の新しい cDNA クローンの完全配列」。DNA Res . 7 (4): 273– 81. doi : 10.1093/dnares/7.4.271 . PMID 10997877。
- Yang Y、Hentati A、Deng HX、他 (2001)。「3 つのグアニンヌクレオチド交換因子ドメインを持つタンパク質である alsin をコードする遺伝子が、劣性筋萎縮性側索硬化症の形で変異する」。Nat . Genet . 29 (2): 160–5 . doi :10.1038/ng1001-160. PMID 11586297. S2CID 9036123。
- Birkenhäger R, Otto E, Schürmann MJ, et al. (2001). 「BSND の変異により、感音難聴および腎不全を伴うバーター症候群が発症する」Nat. Genet . 29 (3): 310–4 . doi :10.1038/ng752. PMID 11687798. S2CID 5892001.
- Eymard-Pierre E、Lesca G、Dollet S、他 (2002)。「乳児期発症の上行性遺伝性痙性麻痺は、アルシン遺伝子の変異と関連している」。Am . J. Hum. Genet . 71 (3): 518– 27. doi :10.1086/342359. PMC 379189. PMID 12145748 。
- Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). 「15,000 を超える完全長のヒトおよびマウス cDNA 配列の生成と初期分析」Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899– 903. Bibcode :2002PNAS...9916899M. doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241 . PMID 12477932.
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- 長野 郁、村上 徹、塩手 正之、他 (2003)。「常染色体劣性筋萎縮性側索硬化症の日本人患者のALS2遺伝子非コード領域における一塩基多型」。Neurol . Res . 25 (5): 505– 9. doi :10.1179/016164103101201733. PMID 12866199. S2CID 42350605.
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- Hand CK、Devon RS、Gros-Louis F、et al. (2004)。「散発性および家族性筋萎縮性側索硬化症におけるALS2遺伝子の変異スクリーニング」。Arch . Neurol . 60 (12): 1768– 71. doi :10.1001/archneur.60.12.1768. PMID 14676054。
- 太田 孝文、鈴木 勇、西川 孝文、他 (2004)。「21,243 個の完全長ヒト cDNA の完全配列決定と特性解析」。Nat . Genet . 36 (1): 40–5 . doi : 10.1038/ng1285 . PMID 14702039。
- Kanekura K, Hashimoto Y, Niikura T, et al. (2004). 「ALS2 遺伝子の産物である Alsin は、SOD1 変異体と相互作用することにより、RhoGEF ドメインを介して SOD1 変異体の神経毒性を抑制する」J. Biol. Chem . 279 (18): 19247– 56. doi : 10.1074/jbc.M313236200 . PMID 14970233.
外部リンク
- ALS2関連疾患に関するGeneReviews/NCBI/NIH/UWのエントリ
- ALS2関連疾患に関するOMIMのエントリ
- 遺伝学ホームリファレンス - 米国国立医学図書館
- UCSC ゲノム ブラウザのヒト ALS2 ゲノムの位置と ALS2 遺伝子の詳細ページ。