ホモサピエンス種のタンパク質コード遺伝子
ＺＢＴＢ３３ 利用可能な構造 ＰＤＢ オルソログ検索: PDBe RCSB PDB IDコードのリスト 2LT7、3FKC、3M4T、3M8V、4F6M、4F6N
識別子 エイリアス ZBTB33 、ZNF-kaiso、ZNF348、ジンクフィンガー、BTBドメインを含む33 外部ID OMIM : 300329; MGI : 1927290; HomoloGene : 4931; GeneCards : ZBTB33; OMA :ZBTB33 - オルソログ 遺伝子の位置（ マウス ） クロ。 X染色体（マウス） [2] バンド X|X A3.3 始める 37,278,670 bp [2] 終わり 37,285,923 bp [2]
RNA発現 パターン ブギー 人間 マウス （相同遺伝子） トップの表現 二次卵母細胞 太ももの皮 内皮細胞 ヒップの皮膚 ブロードマン領域23 歯肉上皮 鼻咽頭上皮 精巣上体 気管支上皮細胞 中側頭回
トップの表現 内側神経節隆起 毛包 顆頭 松果体 蝸牛管の前庭膜 三叉神経節 脈絡叢上皮 膀胱移行上皮 耳下腺 窩
参照表現データの詳細
バイオGPS 参照表現データの詳細
遺伝子オントロジー 分子機能
メチルCpG結合 配列特異的DNA結合 DNA結合 タンパク質結合 金属イオン結合 核酸結合 DNA結合転写因子活性、RNAポリメラーゼII特異的 細胞成分 生物学的プロセス
細胞内シグナル伝達 転写の負の調節、DNAテンプレート 転写の調節、DNAテンプレート Wntシグナル伝達経路 転写、DNAテンプレート RNAポリメラーゼIIによる転写の調節 出典:Amigo / QuickGO
ウィキデータ
転写調節因子Kaiso は、ヒトでは ZBTB33 遺伝子によってコードされる タンパク質 である 。 [5] この遺伝子は、メチル化CGCGと非メチル化コンセンサスKAISO結合部位TCCTGCNAに結合する、二峰性DNA結合特異性を持つ転写調節因子をコードしている。このタンパク質は、N末端POZ/BTBドメインと3つのC末端ジンクフィンガーモチーフを含む。N-CoRリプレッサー複合体をリクルートして、ヒストンの脱アセチル化と標的遺伝子プロモーターにおける抑制性クロマチン構造の形成を促進する。Wntシグナル伝達経路の標的遺伝子の抑制に寄与する可能性があり、カテニンデルタ2（CTNND2）をリクルートすることで標的遺伝子のサブセットの転写を活性化することもある。カテニンデルタ1（CTNND1）との相互作用は、メチル化DNAと非メチル化DNAの両方への結合を阻害する。また、核輸入受容体インポーチンα2（カリオフェリンα2またはRAGコホート1としても知られる）と直接相互作用し、このタンパク質の核輸入を媒介する可能性がある。同じタンパク質をコードする代替スプライス転写バリアントが同定されている。 [6]
ジュリエット・ダニエル博士によって命名されたKAISO遺伝子は、カリブ海、トリニダード・トバゴなどで人気の「カリプソ」音楽にちなんで名付けられました。
インタラクション ZBTB33はHDAC3 [7] 、 核受容体コリプレッサー1 [7] 、 CTNND1 [8] と 相互作用する ことが示されている 。
参考文献
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さらに読む
Daniel JM、Reynolds AB (1999 年 5 月)。「カテニン p120(ctn) は、新規 BTB/POZ ドメイン ジンク フィンガー転写因子である Kaiso と相互作用します」。 分子 細胞 生物 学 。19 (5): 3614–23。doi :10.1128/ mcb.19.5.3614。PMC 84161。PMID 10207085 。 Hartley JL、Temple GF、 Brasch MA (2000 年 11 月)。「in vitro 部位特異的組み換えを用いた DNA クローニング」。 ゲノム 研究 。10 ( 11): 1788–95。doi :10.1101/gr.143000。PMC 310948。PMID 11076863 。 ヴィーマン S、ヴァイル B、ヴェレンロイター R、ガッセンフーバー J、グラスル S、アンゾルゲ W、ベッヒャー M、ブロッカー H、バウアーザックス S、ブルーム H、ラウバー J、デュスターヘフト A、バイエル A、ケーラー K、ストラック N、メーヴェス HW、オッテンヴェルダー B 、オーバーマイヤー B、タンペ J、ホイブナー D、ワンブット R、コーン B、クライン M、プストカ A (2001 年 3 月)。 「ヒトの遺伝子とタンパク質のカタログを目指して: ヒト cDNA をコードする 500 個の新規完全タンパク質の配列決定と分析」。 ゲノム研究 。 11 (3): 422-35。 土井 ：10.1101/gr.GR1547R。 PMC 311072 。 PMID 11230166。 プロホートチョーク A、ヘンドリッヒ B、ヨルゲンセン H、ルゾフ A、ウィルム M、ゲオルギエフ G、バード A、プロホートチョーク E (2001 年 7 月)。 「p120 カテニンのパートナーである Kaiso は、DNA メチル化依存性の転写抑制因子です。」 遺伝子と発生 。 15 (13): 1613–8。 土井 ：10.1101/gad.198501。 PMC 312733 。 PMID 11445535。 Daniel JM、Ireton RC、Reynolds AB (2001 年 6 月)。「Kaiso に対するモノクローナル抗体: 新規転写因子および p120ctn 結合タンパク質」。 ハイブリドーマ 。20 ( 3): 159–66。doi : 10.1089 /027245701750293484。PMID 11461664 。 Yoon HG、Chan DW、Reynolds AB、Qin J、Wong J (2003 年 9 月)。「N-CoR はメチル CpG 結合タンパク質 Kaiso を介して DNA メチル化依存性抑制を媒介する」。 分子 細胞 。12 ( 3): 723–34。doi : 10.1016/ j.molcel.2003.08.008。PMID 14527417 。 Kondapalli J、Flozak AS、Albuquerque ML (2004 年 3 月)。 「 層流せん断応力はヒト冠動脈内皮細胞における p120 カテニン、Kaiso 転写因子、血管内皮カドヘリンの遺伝子発現を異なる形で調節する」。The Journal of Biological Chemistry。279 ( 12): 11417–24。doi : 10.1074/ jbc.M306057200。PMID 14699141 。 Wiemann S、Arlt D、Huber W、Wellenreuther R、Schleeger S、Mehrle A、Bechtel S、Sauermann M、Korf U、Pepperkok R、Sültmann H、Poustka A (2004 年 10 月)。 「ORFeome から生物学へ: 機能的ゲノミクス パイプライン」。 ゲノム研究 。 14 (10B): 2136–44。 土井 ：10.1101/gr.2576704。 PMC 528930 。 PMID 15489336。 Kim SW、Park JI、Spring CM、Sater AK、Ji H、Otchere AA、Daniel JM、McCrea PD (2004 年 12 月)。「非標準的な Wnt シグナルは Kaiso 転写リプレッサーと p120-catenin によって調節される」。Nature Cell Biology。6 ( 12 ) : 1212–20。doi :10.1038/ncb1191。PMID 15543138。S2CID 19404686 。 Ruzov A、Dunican DS、Prokhortchouk A、Pennings S、Stancheva I、Prokhortchouk E、Meehan RR (2004 年 12 月)。「Kaiso は両生類の発達に不可欠なゲノム全体の転写抑制因子です」。Development。131 ( 24 ) : 6185–94。doi : 10.1242 /dev.01549。hdl : 20.500.11820 /1328870e- 099c -4bbd- 8061-06b8b21f25ef。PMID 15548582 。 Kelly KF、Otchere AA、 Graham M 、 Daniel JM (2004 年 12 月)。「BTB/POZ 転写調節因子 Kaiso の核内移行」。Journal of Cell Science。117 ( Pt 25) : 6143–52。doi :10.1242/jcs.01541。PMID 15564377。S2CID 17008036 。 Rush J、Moritz A、Lee KA、Guo A、Goss VL、Spek EJ、Zhang H、Zha XM、Polakiewicz RD、Comb MJ (2005 年 1 月)。「がん細胞におけるチロシンリン酸化の免疫親和性プロファイリング」。Nature Biotechnology 23 ( 1): 94–101. doi :10.1038/nbt1046. PMID 15592455. S2CID 7200157. Soubry A、van Hengel J、Parthoens E、Colpaert C、Van Marck E、Waltregny D、Reynolds AB、van Roy F (2005 年 3 月)。「転写抑制因子 Kaiso の発現と核内局在は腫瘍微小環境によって制御される」。Cancer Research。65 ( 6 ) : 2224–33。doi : 10.1158/0008-5472.CAN- 04-2020。PMID 15781635 。 Spring CM、Kelly KF、O'Kelly I、Graham M、Crawford HC、Daniel JM (2005 年 5 月)。「カテニン p120ctn は、ベータカテニン/TCF 標的遺伝子マトリライシンの Kaiso 媒介転写抑制を阻害する」。 実験 細胞研究 。305 (2): 253–65。doi :10.1016/ j.yexcr.2005.01.007。PMID 15817151 。 Arányi T、Faucheux BA、Khalfallah O、Vodjdani G、Biguet NF、Mallet J、Meloni R (2005 年 7 月)。「ヒトチロシン水酸化酵素遺伝子の組織特異的メチル化により、最初のエクソンに新しい調節要素が明らかになる」。Journal of Neurochemistry。94 ( 1 ) : 129–39。doi : 10.1111/j.1471-4159.2005.03173.x。PMID 15953356 。 デフォセ PA、ケリー KF、フィリオン GJ、ペレス=トラド R、マグディニエ F、メノニ H、ノードガード CL、ダニエル JM、ギルソン E (2005 年 12 月)。 「ヒトエンハンサーブロッカーCTC結合因子は転写因子Kaisoと相互作用する」。 生物化学ジャーナル 。 280 (52): 43017–23。 土井 ： 10.1074/jbc.M510802200 。 PMID 16230345。
外部リンク この記事には、 パブリックドメイン である 米国国立医学図書館 のテキストが組み込まれています。
