ＶＰＳ２５

利用可能なタンパク質構造:
パム	構造 / ECOD
ＰＤＢ	RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBサム	構造の概要

ESCRT-II 複合体サブユニット
ESCRT-II 複合体サブユニット
	エンドソーム輸送複合体 escrt-ii のサブユニット vps25 の結晶構造
識別子
シンボル	ESCRT-II
パム	PF05871
インタープロ	著作権
パム
利用可能なタンパク質構造:
パム	構造 / ECOD
ＰＤＢ	RCSB PDB; PDBe; PDBj
PDBサム	構造の概要

ＶＰＳ２５
利用可能な構造
ＰＤＢ	オルソログ検索: PDBe RCSB
PDB IDコードのリスト
	2ZME、3CUQ、3HTU
識別子
エイリアス	VPS25、DERP9、EAP20、FAP20、液胞タンパク質選別25ホモログ
外部ID	オミム：610907; MGI : 106354;ホモロジーン: 6303;ジーンカード：VPS25; OMA :VPS25 - オルソログ
遺伝子の位置（ヒト）
クロ。	染色体17（ヒト）
終わり	42,779,599 bp
遺伝子の位置（マウス）
クロ。	11番染色体（マウス）
終わり	101,150,375 bp
RNA発現パターン
	トップの表現
	横行結腸粘膜; ; 直腸; ; ランゲルハンス島; ; 腕の皮膚; ; 右子宮管; ; 回腸粘膜; ; 胃の本体; ; 平滑筋組織; ; 子宮内膜間質細胞; ; 鼻粘膜の嗅覚領域;
	トップの表現
	卵黄嚢; ; 胎児の尾; ; 性器結節; ; 右腎臓; ; リップ; ; 胚; ; 胚; ; 顆粒球; ; 太ももの筋肉; ; 胚盤胞;
	参照表現データの詳細
	参照表現データの詳細
遺伝子オントロジー
分子機能	タンパク質ホモ二量体化活性; タンパク質N末端結合; 構造分子活性; タンパク質結合;
細胞成分	細胞質; 細胞質; エンドソーム; 膜; 核質; エンドソーム膜; 細胞外エクソソーム; 核; ESCRT II複合体;
生物学的プロセス	転写の調節、DNAテンプレート; 多小胞体アセンブリ; 転写、DNAテンプレート; エンドソーム輸送; タンパク質輸送; 多小胞体選別経路を介したユビキチン依存性タンパク質分解過程に関与する液胞へのタンパク質輸送; マクロオートファジー; 上皮成長因子活性化受容体活性の負の調節; 輸送; 多小胞体選別経路;
	出典:Amigo / QuickGO
オルソログ
	84313
	28084
	ENSG00000131475
	ENSMUSG00000078656
	Q9BRG1
	Q9CQ80
	NM_032353
	NM_001284411 ; NM_001284412 ; NM_001284414 ; NM_026776
	NP_115729 ; NP_115729.1
	NP_001271340 ; NP_001271341 ; NP_001271343 ; NP_081052
	ウィキデータ
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液胞タンパク質選別関連タンパク質25は、ヒトではVPS25遺伝子によってコードされるタンパク質である。^[5]^[6]

これは、エンドソーム関連複合体 ESCRT-II (輸送タンパク質 II に必要なエンドソーム選別複合体) の構成要素です。ESCRT (ESCRT-I、-II、-III) 複合体は、多小胞体(MVB)を介してユビキチン化された膜貫通受容体をリソソームに効率的に選別します。 ^[7] ESCRT-II は、MVB でのタンパク質選別のために輸送機構をリクルートします。^[8]さらに、ヒトESCRT-II は、転写制御活性を発揮するために、RNA ポリメラーゼ II伸長因子ELLと複合体を形成することが示されています。ESCRT-II は、エンドソーム膜と一時的に結合し、それによって ESCRT-III の形成を開始します。ESCRT-III は、MVB カーゴの選別中に ESCRT-II のすぐ下流で機能する膜関連タンパク質複合体です。ESCRT-II は、ユビキチン化されたエンドソームカーゴに結合するタンパク質複合体である ESCRT-I の下流で機能します。^[9]

ESCRT-IIは、vps25のコピー2つ、 vps22のコピー1つ、およびvps36のC末端領域から構成される3葉複合体です。vps25の結晶構造は、2つの翼状ヘリックスドメイン、 vps25のN末端ドメインがvps22およびvps36と相互作用することを示しています。^[10]

参考文献

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^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000078656 – Ensembl、2017 年 5 月
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さらに読む

Kamura T、Burian D、Khalili H、他 (2001)。「ELL 関連タンパク質 EAP45 および EAP20 のクローニングと特性解析。グルコースによる遺伝子発現の調節における酵母 EAP 様タンパク質の役割」。J. Biol. Chem . 276 (19): 16528–33. doi : 10.1074/jbc.M010142200 . PMID 11278625。
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Martin-Serrano J、Yarovoy A、Perez-Caballero D、他 (2003)。「異なるレトロウイルス後期出芽ドメインは、代替アダプタータンパク質を使用して液胞タンパク質選別因子をリクルートする」。Proc . Natl. Acad. Sci . USA . 100 (21): 12414–9。Bibcode : 2003PNAS..10012414M。doi : 10.1073 / pnas.2133846100。PMC 218772。PMID 14519844。
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[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000131475 – Ensembl、2017 年 5 月

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000078656 – Ensembl、2017 年 5 月

[3] 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。

[4] 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。

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[entrez-6] 「Entrez Gene: VPS25 液胞タンパク質選別 25 ホモログ (S. cerevisiae)」。

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[pmid15469844-8] Teo H、Perisic O、Gonzalez B、Williams RL (2004 年 10 月)。「タンパク質選別に必要なエンドソーム関連複合体 ESCRT-II: 結晶構造と ESCRT-III および膜との相互作用」。Dev . Cell . 7 (4): 559–69. doi : 10.1016/j.devcel.2004.09.003 . PMID 15469844。

[pmid12194858-9] Babst M、Katzmann DJ、Snyder WB、Wendland B、Emr SD (2002 年 8 月)。「エンドソーム関連複合体 ESCRT-II は、多小胞体でのタンパク質選別のために輸送機構をリクルートする」。Dev . Cell . 3 (2): 283–9. doi : 10.1016/S1534-5807(02)00219-8 . PMID 12194858。

[pmid15579210-10] Wernimont AK、Weissenhorn W (2004 年 12 月)。「エンドソーム輸送複合体 ESCRT-II のサブユニット VPS25 の結晶構造」。BMC Struct. Biol . 4 (1): 10. doi : 10.1186/1472-6807-4-10 . PMC 539351. PMID 15579210 。