ホモサピエンス種のタンパク質コード遺伝子
| MC1 |
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| 利用可能な構造 |
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| PDB | オルソログ検索: PDBe RCSB |
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| PDB IDコードのリスト |
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2MKF、2MKG、2RR9、2N9E |
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| 識別子 |
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| エイリアス | UIMC1、RAP80、X2HRIP110、ユビキチン相互作用モチーフを含む1 |
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| 外部ID | オミム:609433; MGI : 103185;ホモロジーン: 9455;ジーンカード:UIMC1; OMA :UIMC1 - オルソログ |
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| 遺伝子の位置(マウス) |
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 | | クロ。 | 13番染色体(マウス)[2] |
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| | バンド | 13|13 B1 | 始める | 55,175,693 bp [2] |
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| 終わり | 55,248,113 bp [2] |
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| RNA発現パターン |
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| ブギー | | 人間 | マウス(相同遺伝子) |
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| トップの表現 | - 左精巣
- 右精巣
- 腓骨神経
- アキレス腱
- 単球
- 左卵巣
- 顆粒球
- 右卵巣
- 結腸上皮
- 子宮体部
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| | トップの表現 | - 海馬歯状回顆粒細胞
- 胚葉上層
- 大動脈領域の中膜
- パネートセル
- 原腸胚
- 腸間膜リンパ節
- 大腿骨体
- 脾臓
- 毛包
- 骨髄
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| | 参照表現データの詳細 |
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| バイオGPS |  | | 参照表現データの詳細 |
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| 遺伝子オントロジー |
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| 分子機能 |
- ヒストン結合
- K63結合ポリユビキチン修飾依存性タンパク質結合
- タンパク質結合
| | 細胞成分 | | | 生物学的プロセス |
- 電離放射線に対する反応
- DNA修復の正の調節
- ヒストンH2A K63結合脱ユビキチン化
- 転写の負の調節、DNAテンプレート
- 非相同末端結合による二本鎖切断の修復
- 転写の調節、DNAテンプレート
- 転写、DNAテンプレート
- DNA損傷刺激に対する細胞反応
- 二本鎖切断修復
- DNA修復
- タンパク質の脱ユビキチン化
- 有糸分裂G2 DNA損傷チェックポイントシグナル伝達
- クロマチン組織
| | 出典:Amigo / QuickGO |
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| オルソログ |
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| 種 | 人間 | ねずみ |
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| エントレズ | | |
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| アンサンブル | | |
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| ユニプロット | | |
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| RefSeq (mRNA) | |
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NM_001199297 NM_001199298 NM_016290 NM_001317961 |
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NM_001293660 NM_011307 NM_001359757 NM_001359758 |
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| RefSeq (タンパク質) | |
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NP_001186226 NP_001186227 NP_001304890 NP_057374 |
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NP_001280589 NP_035437 NP_001346686 NP_001346687 |
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| 場所 (UCSC) | 5 章: 176.91 – 177.02 Mb | 13 章: 55.18 – 55.25 Mb |
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| PubMed検索 | [3] | [4] |
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| ウィキデータ |
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BRCA1-A複合体サブユニットRAP80は、ヒトではUIMC1遺伝子によってコードされるタンパク質である。[5] [6]
DNA損傷の修復
UIMC1遺伝子のタンパク質産物であるRAP80は、脱ユビキチン複合体BRCA1-Aのコア構成要素である。[7] BRCA1-A複合体の他のコア構成要素は、BRCC36タンパク質(BRCC3遺伝子)、BREタンパク質(BRE(遺伝子))、およびMERIT40タンパク質(BABAM1遺伝子)である。[7]
BRCA1は、 BRCA1-A とは異なり、染色体損傷の修復に使用され、DNA 二重鎖切断のエラーのない相同組換え(HR) 修復において重要な役割を果たします。 BRCA1 を DNA 損傷部位から隔離すると、相同組換えが抑制され、非相同末端結合(NHEJ)のプロセスによって細胞が修復の方向にリダイレクトされます。 [7] BRCA1-A 複合体の役割は、 BRCA1 に高い親和性で結合し、 DNA 損傷部位から BRCA1 を隔離されたままの末梢へと引き離し、 HR よりも NHEJ を促進することであると考えられます。
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000087206 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000025878 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ Yan Z、Kim YS、Jetten AM (2002年8月)。「RAP80、レチノイド関連精巣関連受容体と相互作用する新規核タンパク質」。J Biol Chem . 277 (35): 32379–88. doi : 10.1074/jbc.M203475200 . PMID 12080054。
- ^ 「Entrez Gene: UIMC1 ユビキチン相互作用モチーフ 1 を含む」。
- ^ abc Rabl J (2020年10月). 「BRCA1-AとBRISC:ユビキチンシグナル伝達のための多機能分子マシン」. Biomolecules . 10 (11). doi : 10.3390/biom10111503 . PMC 7692841. PMID 33142801 .
さらに読む
- Strausberg RL、Feingold EA、Grouse LH、他 (2003)。「15,000 を超える完全長のヒトおよびマウス cDNA 配列の生成と初期分析」。Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 99 ( 26): 16899–903。Bibcode : 2002PNAS ... 9916899M。doi : 10.1073/ pnas.242603899。PMC 139241。PMID 12477932。
- Kim YS、Nakanishi G、Oudes AJ、et al. (2004)。「Tsp57:精子形成の特定の段階で誘導される新規遺伝子」。Biol . Reprod . 70 (1): 106–13. doi:10.1095/biolreprod.103.018465 . PMID 12954732。
- 太田 孝文、鈴木 勇、西川 孝文、他 (2004)。「21,243 個の完全長ヒト cDNA の完全な配列決定と特性解析」。Nat . Genet . 36 (1): 40–5. doi : 10.1038/ng1285 . PMID 14702039。
- Colland F, Jacq X, Trouplin V, et al. (2004). 「ヒトシグナル伝達経路の機能的プロテオミクスマッピング」Genome Res . 14 (7): 1324–32. doi :10.1101/gr.2334104. PMC 442148. PMID 15231748 .
- Beausoleil SA、Jedrychowski M、 Schwartz D、他 (2004)。「HeLa 細胞核リン酸化タンパク質の大規模特性評価」。Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 101 ( 33 ) : 12130–5。Bibcode :2004PNAS..10112130B。doi : 10.1073/ pnas.0404720101。PMC 514446。PMID 15302935。
- Gerhard DS、Wagner L、Feingold EA、他 (2004)。「NIH 完全長 cDNA プロジェクトの現状、品質、拡大: 哺乳類遺伝子コレクション (MGC)」。Genome Res . 14 (10B): 2121–7. doi :10.1101/gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334 。
- Olsen JV、Blagoev B、Gnad F、et al. (2006)。「シグナル伝達ネットワークにおける全体的、生体内、および部位特異的なリン酸化ダイナミクス」。Cell . 127 (3): 635–48. doi : 10.1016/j.cell.2006.09.026 . PMID 17081983. S2CID 7827573。
- Wang B、Matsuoka S、Ballif BA 、他 (2007)。「Abraxas と RAP80 は DNA 損傷応答に必要な BRCA1 タンパク質複合体を形成する」。Science。316 ( 5828 ): 1194–8。Bibcode : 2007Sci ... 316.1194W。doi : 10.1126/science.11 39476。PMC 3573690。PMID 17525340。
- Sobhian B、Shao G、Lilli DR 、他 (2007)。「RAP80 は BRCA1 を DNA 損傷部位の特定のユビキチン構造に標的化する」。Science。316 ( 5828 ): 1198–202。Bibcode : 2007Sci ... 316.1198S。doi : 10.1126/science.11 39516。PMC 2706583。PMID 17525341。
- Kim H 、Chen J、 Yu X (2007)。「ユビキチン結合タンパク質 RAP80 は BRCA1 依存性 DNA 損傷応答を媒介する」。Science。316 ( 5828 ): 1202–5。Bibcode : 2007Sci ...316.1202K。doi :10.1126/science.1139621。PMID 17525342。S2CID 31636419 。
- Shebzukhov YV、Koroleva EP、Khlgatian SV、他 (2007)。「癌関連抗原としての RAP80/UIMC1: 選択的スプライスバリアントとその免疫原性」。Cancer Lett . 255 (2): 255–62. doi :10.1016/j.canlet.2007.04.013. PMID 17562356。
- Yan J、Kim YS、Yang XP、他 (2007)。「ユビキチン相互作用モチーフを含むタンパク質 RAP80 は BRCA1 と相互作用し、DNA 損傷修復応答において機能する」。Cancer Res . 67 (14): 6647–56. doi :10.1158/0008-5472.CAN-07-0924. PMC 2391092 . PMID 17621610。
- Yan J、Yang XP、Kim YS、et al. (2007)。「RAP80 は SUMO 結合酵素 UBC9 と相互作用し、SUMO 化の新規ターゲットとなる」。Biochem . Biophys. Res. Commun . 362 (1): 132–8. doi :10.1016/j.bbrc.2007.07.158. PMC 2049087. PMID 17698038 。