ホモサピエンス種のタンパク質コード遺伝子
ウリフ1 利用可能な構造 ＰＤＢ オルソログ検索: PDBe RCSB PDB IDコードのリスト 2FAZ、2L3R、2LGG、2LGK、2LGL、2PB7、3ASK、3ASL、3BI7、3CLZ、3DB3、3DB4、3DWH、3FL2、3SHB、3SOU、3SOW、3SOX、3T6R、3ZVY、3ZVZ、4GY5、 4QQD、5C6D、5IAY
識別子 エイリアス UHRF1 、ICBP90、Np95、RNF106、hNP95、hhuNp95、TDRD22、PHDおよびリングフィンガードメイン1を有するユビキチン様 外部ID オミム ：607990; MGI : 1338889; ホモロジーン : 7866; ジーンカード ：UHRF1; OMA :UHRF1 - オルソログ 遺伝子の位置（ マウス ） クロ。 17番染色体（マウス） [2] バンド 17|17 デイ 始める 56,610,321 bp [2] 終わり 56,630,486 bp [2]
RNA発現 パターン ブギー 人間 マウス （相同遺伝子） トップの表現 卵母細胞 二次卵母細胞 胸腺 心室帯 神経節隆起 頬粘膜細胞 海綿骨 回腸粘膜 骨髄 子宮内膜間質細胞
トップの表現 二次卵母細胞 一次卵母細胞 上顎突出 胎児の尾 受精卵 下顎突出 腹壁 真皮 胚葉上層 髄質集合管
参照表現データの詳細
バイオGPS 参照表現データの詳細
遺伝子オントロジー 分子機能
DNA結合 ユビキチンタンパク質リガーゼ活性 ヘミメチル化DNA結合 DNA結合転写因子活性 メチルCpG結合 シス調節領域配列特異的DNA結合 金属イオン結合 ユビキチンタンパク質転移酵素活性 メチル化ヒストン結合 タンパク質結合 同一のタンパク質結合 トランスフェラーゼ活性 亜鉛イオン結合 ヒストン結合 細胞成分
ユークロマチン 核マトリックス レプリケーションフォーク ヘテロクロマチン 核 生物学的プロセス
ヒストンモノユビキチン化 タンパク質代謝プロセスの正の調節 転写の調節、DNAテンプレート DNAメチル化の維持 DNAトポイソメラーゼ（ATP加水分解）活性の正の調節 RNAポリメラーゼIIによる転写の負の制御 転写、DNAテンプレート DNAメチル化依存性ヘテロクロマチンアセンブリの調節 DNA損傷刺激に対する細胞反応 タンパク質のユビキチン化 細胞周期 細胞集団の増殖 ヒストンのユビキチン化 DNA修復 RNAポリメラーゼIIによる転写の正の制御 タンパク質の自己ユビキチン化 クロマチン組織 ユビキチン依存性タンパク質分解プロセス 上皮細胞増殖の調節 出典:Amigo / QuickGO
オルソログ 種 人間 ねずみ エントレズ アンサンブル ユニプロット RefSeq (mRNA) NM_001048201 NM_001290050 NM_001290051 NM_001290052 NM_013282
NM_001111078 NM_001111079 NM_001111080 NM_010931
RefSeq (タンパク質) NP_001041666 NP_001276979 NP_001276980 NP_001276981 NP_037414
NP_001104548 NP_001104549 NP_001104550 NP_035061
場所 (UCSC) 19章: 4.9 – 4.96 Mb 17章: 56.61 – 56.63 Mb PubMed 検索 [3] [4]
ウィキデータ
ユビキチン様でPHDおよびRINGフィンガードメインを含む1は、 UHRF1 としても知られ、ヒトでは UHRF1 遺伝子 によってコードされる タンパク質 です 。 [5] [6]
関数 この遺伝子は、 RINGフィンガー 型 E3ユビキチンリガーゼ のサブファミリーのメンバーをコードしています 。このタンパク質はS期にヘミメチル化DNAに結合し、主要なDNAメチルトランスフェラーゼタンパク質である DNMT1 をリクルートして、クロマチン構造と遺伝子発現を制御します。その発現はG1期後期にピークに達し、 細胞周期 のG2期とM期の間継続します。G1/S遷移で主要な役割を果たし、 p53 依存性DNA損傷チェックポイントで機能します。この遺伝子には、異なるアイソフォームをコードする複数の転写バリアントが見つかっています。当初はトポイソメラーゼ2aの直接的な制御因子として特定されましたが、これはその後反証されました。Uhrf1は、ゼブラフィッシュを使用して生体内で広範に研究されています。
臨床的意義 UHRF1は最近、肝臓癌の主な種類である肝細胞癌における新たな 癌遺伝子 として同定されました。 [7]
参考文献
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さらに読む
Ku DH、Chang CD、Koniecki J、Cannizzaro LA、Boghosian-Sell L、Alder H、Baserga R (1991 年 4 月)。「推定トランス活性化因子の配列を持つ、新しい成長制御相補 DNA」。 細胞 成長 と分化 。2 (4): 179–86。PMID 1868030。 ヒリアー・LD、レノン・G、ベッカー・M、ボナルド・MF、キアペリ・B、チッソー・S、ディートリッヒ・N、デュビューク・T、ファヴェッロ・A、ギッシュ・W、ホーキンス・M、ハルトマン・M、クカバ・T、レイシー・M、ル・M、ル・N、マーディス・E 、ムーア B、モリス M、パーソンズ J、プランジ C、リフキン L、ロールフィング T、シェレンバーグ K、ベントソアレス M、タン F、ティエリー メグ J、トレバスキス E、アンダーウッド K、ウォルドマン P、ウォーターストン R、ウィルソン R、マーラ M (1996 年 9 月)。 「280,000 個のヒト発現配列タグの生成と分析」。 ゲノム研究 。 6 (9): 807–28。 土井 ： 10.1101/gr.6.9.807 。 PMID 8889549。 Hopfner R、Mousli M、Jeltsch JM、Voulgaris A、Lutz Y、Marin C、Bellocq JP、Oudet P、Bronner C (2000 年 1 月)。「トポイソメラーゼ IIalpha 発現の調節に関与する新規ヒト CCAAT 結合タンパク質 ICBP90」。Cancer Research。60 ( 1 ) : 121–8。PMID 10646863。 Hopfner R、Mousli M、Garnier JM、Redon R、du Manoir S、Chatton B、Ghyselinck N、Oudet P、Bronner C (2001 年 3 月)。「トポイソメラーゼ IIalpha 遺伝子発現の調節に関与するタンパク質 ICBP90 をコードする遺伝子のゲノム構造と染色体マッピング」。Gene . 266 (1–2): 15–23. doi : 10.1016 / S0378-1119 (01)00371-7. PMID 11290415。 Mousli M、Hopfner R、Abbady AQ、Monté D、Jeanblanc M、Oudet P、Louis B、Bronner C (2003 年 7 月)。「ICBP90 は、がん細胞で発現が調節されていない新しいタンパク質ファミリーに属します」。British Journal of Cancer。89 ( 1): 120–7。doi :10.1038 / sj.bjc.6601068。PMC 2394215。PMID 12838312 。 Citterio E、Papait R、Nicassio F、 Vecchi M、Gomiero P、Mantovani R、Di Fiore PP、Bonapace IM (2004 年 3 月)。「Np95 はユビキチンリガーゼ活性を備えたヒストン結合タンパク質です」。 分子 細胞 生物学 。24 (6): 2526–35。doi : 10.1128 /MCB.24.6.2526-2535.2004。PMC 355858。PMID 14993289 。 Arima Y, Hirota T, Bronner C, Mousli M, Fujiwara T, Niwa S, Ishikawa H, Saya H (2004 年 2 月). 「p53/p21Cip1/WAF1 依存性 DNA 損傷チェックポイントシグナルによる核タンパク質 ICBP90 のダウンレギュレーションは、G1/S 遷移での細胞周期停止に寄与する」. Genes to Cells . 9 (2): 131–42. doi : 10.1111/j.1356-9597.2004.00710.x . PMID 15009091. S2CID 23980129. Abbady AQ、Bronner C、Trotzier MA、Hopfner R、Bathami K、Muller CD、Jeanblanc M、Mousli M (2003 年 12 月)。「アポトーシス誘導 Jurkat 細胞では ICBP90 発現がダウンレギュレーションされる」。Annals of the New York Academy of Sciences。1010 ( 1 ): 300–3。Bibcode : 2003NYASA1010..300A。doi : 10.1196 /annals.1299.052。PMID 15033738。S2CID 32581931。 Brandenberger R、Wei H、Zhang S、Lei S、Murage J、Fisk GJ、Li Y、Xu C、Fang R、Guegler K、Rao MS、Mandalam R、Lebkowski J、Stanton LW (2004 年 6 月)。「トランスクリプトーム特性評価により、ヒト ES 細胞の成長と分化を制御するシグナル伝達ネットワークが解明」。Nature Biotechnology。22 ( 6 ) : 707–16。doi :10.1038/nbt971。PMID 15146197。S2CID 27764390 。 Trotzier MA、Bronner C、Bathami K、Mathieu E、Abbady AQ、Jeanblanc M、Muller CD、Rochette-Egly C、Mousli M (2004 年 6 月)。「タンパク質キナーゼ A による ICBP90 のリン酸化はトポイソメラーゼ IIalpha の発現を増強する」。 生化学 および生物物理学的研究通信 。319 (2): 590–5。doi :10.1016/ j.bbrc.2004.05.028。PMID 15178447 。 Unoki M, Nishidate T, Nakamura Y (2004 年 10 月)。「E2F-1 の標的である ICBP90 は HDAC1 をリクルートし、SRA ドメインを介してメチル CpG に結合する」。Oncogene . 23 (46): 7601–10. doi :10.1038/sj.onc.1208053. PMID 15361834. S2CID 21948278。 Abbady AQ、Bronner C、Bathami K、Muller CD、Jeanblanc M 、Mathieu E、Klein JP、Candolfi E、Mousli M (2005 年 8 月)。「TCR 経路は、E2F 結合部位を介した ICBP90 遺伝子のダウンレギュレーションを伴う」。 生化学薬理学 。70 (4): 570–9。doi : 10.1016 /j.bcp.2005.05.012。PMID 15964557 。 Jeanblanc M、Mousli M、Hopfner R、Bathami K、Martinet N、Abbady AQ、Siffert JC、Mathieu E、Muller CD、Bronner C (2005 年 11 月)。「網膜芽細胞腫遺伝子とその産物は ICBP90 の標的となる: 細胞周期中の G1/S 移行における重要なメカニズム」。Oncogene . 24 ( 49): 7337–45. doi : 10.1038/sj.onc.1208878 . PMID 16007129。 ジェンキンス Y、マルコフツォフ V、ラング W、シャルマ P、ピアソール D、ワーナー J、フランシー C、ファン B、ファン J、ヤム GC、ヴィスタン JP、パリ E、ヴィアラード J、ジャニコット M、ローレンス JB、パヤン DG、仁志 Y (2005 年 12 月)。 「腫瘍細胞増殖における核RINGフィンガータンパク質であるUHRF1のユビキチンリガーゼ活性の重要な役割」。 細胞の分子生物学 。 16 (12): 5621–9。 土井 ：10.1091/mbc.E05-03-0194。 PMC 1289407 。 PMID 16195352。 木村和也、若松A、鈴木裕、太田隆、西川隆、山下R、山本J、関根正、釣谷和、若栗博、石井S、杉山隆、斉藤和久、磯野裕、入江R、櫛田直、米山隆、大塚 R、神田 K、横井 T、近藤 H、我妻 M、村川 K、石田 S、石橋 T、高橋-藤井 A、棚瀬 T、永井 K、菊池 H、中井 K、磯貝 哲、菅野 S (2006 年 1 月)。 「転写調節の多様化: ヒト遺伝子の推定上の代替プロモーターの大規模な同定と特性評価」。 ゲノム研究 。 16 (1): 55-65。 土井 ：10.1101/gr.4039406。 PMC 1356129 。 PMID 16344560。 Beausoleil SA、Villén J、Gerber SA、Rush J、 Gygi SP (2006 年 10 月)。「高スループット タンパク質リン酸化解析および部位局在化のための確率ベースのアプローチ」。Nature Biotechnology。24 ( 10 ): 1285–92。doi :10.1038/ nbt1240。PMID 16964243。S2CID 14294292 。 武藤正史、藤森A、根井M、ダイノK、松田裕、黒岩A、久保E、金成Y、宇津野正、辻H、鵜飼裕、三田K、高萩正、辰巳K (2006年11月)。 「新規ヒト放射線感受性遺伝子 NP95 の単離と特性評価」。 放射線研究 。 166 (5): 723–33。 Bibcode :2006RadR..166..723M。 土井 ：10.1667/RR0459.1。 PMID 17067204。S2CID 85418126 。
