ホモサピエンス種のタンパク質コード遺伝子
| TRNP1 |
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| 識別子 |
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| エイリアス | TRNP1、C1orf225、TNRP、TMF1 制御核タンパク質 1、TRNP、TMF1 制御核タンパク質 1 |
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| 外部ID | オミム:616824; MGI : 1916789;ホモロジーン: 19492;ジーンカード:TRNP1; OMA :TRNP1 - オルソログ |
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| 遺伝子の位置(マウス) |
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 | | クロ。 | 染色体4(マウス)[2] |
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| | バンド | 4|4 D2.3 | 始める | 133,218,411 bp [2] |
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| 終わり | 133,225,861 bp [2] |
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| RNA発現パターン |
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| ブギー | | 人間 | マウス(相同遺伝子) |
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| トップの表現 | - 右心房の心筋組織
- 視床の外側核群
- 咽頭粘膜
- 食道粘膜
- 左心室の心筋
- 鼻上皮
- 膵臓上皮細胞
- 胃の本体
- 幽門
- 眼瞼結膜
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| | トップの表現 | - 内側背核
- 嗅覚系
- 嗅上皮
- 内側膝状体
- 網膜の神経層
- 外側膝状体
- 顔面運動核
- 橋核
- 深部小脳核
- 視覚野
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| | 参照表現データの詳細 |
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| バイオGPS | |
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| 遺伝子オントロジー |
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| 分子機能 | | | 細胞成分 | | | 生物学的プロセス |
- 多細胞生物の発達
- 細胞周期
- 転写の調節、DNAテンプレート
- 細胞集団増殖の調節
- 転写、DNAテンプレート
- 小脳皮質の形態形成
- 神経前駆細胞の増殖
- 細胞周期の調節
- 神経系の発達
| | 出典:Amigo / QuickGO |
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| ウィキデータ |
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TMF 制御核タンパク質 1は、ヒトでは TRNP1遺伝子によってコードされる核タンパク質です。TRNP1 は、細胞増殖と脳の発達に重要な役割を果たします。[5] Trnp1 は、皮質の折り畳みに主要な役割を果たすことが示された最初のタンパク質です。[5]これは、脳だけでなく幹細胞の発達中の重要なプロセスに関与する主要な幹細胞因子です。Trnp1 は遺伝子発現レベルを制御し、発達中の脳の脳回と脳溝を誘導するのに十分です。ヒトの脳における Trnp1 発現レベルの局所的な違いは、皮質の折り畳みと相関しています。[5] [6] [7]
関数
Trnp1はDNAに高い親和性で結合する。[5]その直接的な分子機能は不明であり、分子モチーフも知られていないため、新しいクラスの分子である可能性がある。[5]
Trnp1は細胞増殖に非常に強い影響を及ぼし、体外および体内での増殖率を劇的に増加させます。[5]
脳の発達における幹細胞機能に加えて、Trnp1が癌細胞において重要な役割を果たす可能性があることを示唆するデータがあります。Trnp1は癌種における遺伝子発現解析で説明されています。[8]非常に強力な増殖能力がその発癌性潜在性の原因である可能性があります。具体的には、Trnp1は(他の因子とともに)特定の大腸癌サブタイプのバイオマーカーとして機能します。 [8] [9]
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000253368 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000056596 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ abcdef Stahl R、Walcher T、De Juan Romero C、Pilz GA、Cappello S、Irmler M、Sanz-Aquela JM、Beckers J、Blum R、Borrell V、Götz M (2013 年 4 月)。「Trnp1 は放射状グリア細胞の運命を制御することで哺乳類の大脳皮質の拡大と折り畳みを制御する」。Cell . 153 ( 3): 535–49. doi : 10.1016/j.cell.2013.03.027 . hdl : 10261/338716 . PMID 23622239。
- ^ Fernández V、Llinares-Benadero C、Borrell V (2016 年5月)。「大脳皮質の拡大と折り畳み:何がわかったのか?」EMBOジャーナル。35 (10):1021–44。doi : 10.15252 / embj.201593701。PMC 4868950。PMID 27056680。
- ^ マルティネス=マルティネス MÁ、デ ファン ロメロ C、フェルナンデス V、カルデナス A、ゲッツ M、ボレル V (2016 年 6 月)。 「Cdh1およびTrnp1レベルによって定義される外側脳室下帯の形成のための制限された期間」。ネイチャーコミュニケーションズ。7 : 11812。ビブコード:2016NatCo...711812M。土井:10.1038/ncomms11812。PMC 4897765。PMID 27264089。
- ^ ab Kanth P、Bronner MP、Boucher KM、Burt RW、Neklason DW、Hagedorn CH、Delker DA (2016 年 6 月)。「無茎性鋸歯状ポリープの遺伝子シグネチャーが結腸がんのサブタイプを識別」。がん予防 研究。9 ( 6): 456–65。doi :10.1158/ 1940-6207.CAPR -15-0363。PMC 4941619。PMID 27026680。
- ^ 米国出願 20190032147、Delker D、Kanth P、「結腸癌のサブタイプを予測するための方法と組成物」、2019年1月31日公開、ユタ大学研究財団に譲渡