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| TCOF1 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| 識別子 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| エイリアス | TCOF1、MFD1、TCS、TCS1、糖蜜、糖蜜リボソーム生合成因子1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 外部ID | オミム：606847; MGI : 892003;ホモロジーン: 68049;ジーンカード：TCOF1; OMA :TCOF1 - オルソログ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| ウィキデータ | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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糖蜜タンパク質は、研究により、細胞内でリボソームRNA （rRNA）と呼ばれる分子の生成に関与していると考えられているタンパク質です。糖蜜は、rRNAが生成される核内の小さな領域である核小体で活性化します。リボソームと呼ばれる細胞構造の主要成分として、rRNAはタンパク質の組み立てに不可欠です。このタンパク質は、顔の骨やその他の組織になる構造の初期胚発生中に活性化します。このタンパク質の正確な機能は不明ですが、研究者は、顔の骨や関連構造の発達に重要な役割を果たしていると考えています。
ヒトでは、糖蜜タンパク質はTCOF1（糖蜜リボソーム生合成因子1）遺伝子によってコードされている。[5] [6] TCOF1は、LIS1相同ドメインを持つ核小体タンパク質をコードしている。[7]糖蜜タンパク質は、上流結合因子（UBF）との相互作用を通じてrRNA遺伝子の転写に関与している。この遺伝子の変異は、頭蓋顔面の発達異常を含む疾患であるトリーチャー・コリンズ症候群と関連している。この遺伝子には、異なるアイソフォームをコードする代替転写スプライスバリアントが見つかっているが、現在までに特徴付けられているのは3つだけである。[6]
UBFとの相互作用以外にも、糖蜜は核小体タンパク質pNop56との相互作用によって成熟リボソームRNAの前駆体のメチル化に関与していることが示唆されている。 [8]
TCOF1 遺伝子は、 5 番染色体の長腕 (q 腕) の位置 32 と 33.1 の間、塩基対149,717,427 から塩基対 149,760,047 までに あります。
関連疾患
トリーチャー・コリンズ症候群の患者では、TCOF遺伝子の120以上の変異が特定されている。これらの変異のほとんどは、TCOF1遺伝子の少数のDNA構成要素（塩基対）を挿入または削除するものである。TCOF1変異は、異常に小さく機能しない糖蜜の生成につながるか、細胞がこのタンパク質を生成するのを妨げる。研究者は、糖蜜の喪失により、顔面の骨や組織に発達する胚の部分でのrRNAの生成が減少すると推測している。糖蜜タンパク質の喪失がトリーチャー・コリンズ症候群に見られる顔面の発達の特定の問題を引き起こす仕組みはわかっていない。たとえば、これらの人のTCOF遺伝子の変異は、しばしば口蓋裂を引き起こす。[9]
モデル生物
チンド犬におけるこの遺伝子の変異は、チンド犬とボクサー犬の間で観察される頭蓋の違いと関連している。[10]
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000070814 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000024613 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ Jabs EW、Li X、Coss CA、Taylor EW、Meyers DA、Weber JL (1992年2月)。「Treacher Collins症候群遺伝子座の5q31.3----q33.3へのマッピング」。Genomics。11 ( 1 ) : 193–8。doi : 10.1016/0888-7543(91)90118- X。PMID 1765376 。
- ^ ab "Entrez Gene: TCOF1 Treacher Collins-Franceschetti 症候群 1".
- ^ Valdez BC, Henning D, So RB, Dixon J, Dixon MJ (2004). 「Treacher Collins 症候群 (TCOF1) 遺伝子産物は、上流結合因子と相互作用することによりリボソーム DNA 遺伝子転写に関与している」Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 101 (29): 10709–14. Bibcode :2004PNAS..10110709V. doi : 10.1073/pnas.0402492101 . PMC 489999 . PMID 15249688.
- ^ Gonzales B, Henning D, So RB, Dixon J, Dixon MJ, Valdez BC (2005). 「Treacher Collins症候群（TCOF1）遺伝子産物はpre-rRNAメチル化に関与している」Hum Mol Genet . 14 (14): 2035–43. doi : 10.1093/hmg/ddi208 . PMID 15930015.
- ^ Dixon MJ、Marazita ML、Beaty TH、Murray JC (2011)。「口唇裂と口蓋裂：遺伝的および環境的影響を理解する」Nature Reviews Genetics (12): 167-178。
- ^ Kim RN、Kim DS、Choi SH、et al. (2012)。「大規模並列シーケンシングによる飼い犬（韓国の珍島犬）のゲノム解析」。DNA Res . 19 (3): 275–88. doi :10.1093/dnares/dss011. PMC 3372376. PMID 22474061 。
さらに読む
- Splendore A、Silva EO、Alonso LG、他 (2000)。「トリーチャーコリンズ症候群患者におけるTCOF1の変異検出率の高さは、変異のクラスター化と16の新たな病原性変化を明らかにする」。Hum . Mutat . 16 (4): 315–22. doi : 10.1002/1098-1004(200010)16:4<315::AID-HUMU4>3.0.CO;2-H . PMID 11013442. S2CID 36109746。
- Dixon MJ、Dixon J、Raskova D、他 (1993)。「トリーチャー・コリンズ症候群遺伝子座の遺伝的および物理的マッピング：染色体 5q32-33.2 への局在の改良」。Hum . Mol. Genet . 1 (4): 249–53. doi :10.1093/hmg/1.4.249. PMID 1303194。
- Maruyama K, Sugano S (1994). 「オリゴキャッピング：真核生物mRNAのキャップ構造をオリゴリボヌクレオチドで置き換える簡単な方法」Gene . 138 (1–2): 171–4. doi :10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
- Dixon MJ、Dixon J、Houseal T、他 (1993)。「トリーチャー・コリンズ症候群遺伝子座位の位置を、5q32-33.1 にある 3 つの新しいマイクロサテライトマーカー間の小さな間隔に絞り込む」。Am . J. Hum. Genet . 52 (5): 907–14. PMC 1682053. PMID 8488840 。
- ディクソン、ジル; エドワーズ、サラ J.; グラッドウィン、アマンダ J.; ディクソン、マイケル J.; ロフタス、ステイシー K.; ボナー、シンシア A.; コプリヴニカー、キャサリン; ワスムス、ジョン J. (1996)。「トリーチャー・コリンズ症候群の病因に関与する遺伝子の位置クローニング。トリーチャー・コリンズ症候群共同グループ」。Nat . Genet . 12 (2): 130–6. doi :10.1038/ng0296-130. PMID 8563749. S2CID 34312227。
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- Edwards SJ、Gladwin AJ、Dixon MJ (1997)。「トリーチャー・コリンズ症候群の変異スペクトルは、未熟終結コドンを作成する変異の優位性を明らかにする」。Am . J. Hum. Genet . 60 (3): 515–24. PMC 1712503. PMID 9042910 。
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- Wise CA、Chiang LC、Paznekas WA、他 (1997)。「TCOF1 遺伝子は、コード領域全体にわたってトリーチャーコリンズ症候群の変異を示す推定核小体リン酸化タンパク質をコードしている」。Proc . Natl . Acad. Sci. USA . 94 ( 7): 3110–5。Bibcode : 1997PNAS ...94.3110W。doi : 10.1073/ pnas.94.7.3110。PMC 20330。PMID 9096354。
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外部リンク
- トリーチャー・コリンズ症候群または下顎顔面骨異形成症に関する GeneReviews/NCBI/NIH/UW のエントリ
- ジーンカード
- 米国国立医学図書館の医学主題標目表(MeSH)における TCOF1+タンパク質、+ヒト
- UCSC ゲノム ブラウザにおける TCOF1 ヒト遺伝子の位置。
- UCSC ゲノム ブラウザにおける TCOF1 ヒト遺伝子の詳細。