| TRNT1 |
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| 利用可能な構造物 |
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| PDB | オルソログ検索: PDBe RCSB |
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| 識別子 |
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| 別名 | TRNT1、CCA1、MtCCA、CGI-47、SIFD、tRNAヌクレオチジルトランスフェラーゼ1、RPEM |
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| 外部ID | オミム: 612907 ; MGI : 1917297 ;ホモロジーン: 9333 ;ジーンカード: TRNT1 ; OMA : TRNT1 - オルソログ |
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| RNA発現パターン |
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| Bgee | | 人間 | マウス(相同体) |
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| トップは | - 内皮細胞
- 二次卵母細胞
- 生殖腺
- アキレス腱
- 壁側胸膜
- 結腸上皮
- 膵臓上皮細胞
- 軟骨組織
- 後腎
- 睾丸
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| | トップは | - 精母細胞
- 接合子
- 精子細胞
- 生殖器結節
- 二次卵母細胞
- 胚の尾
- 卵黄嚢
- 心室帯
- 胚
- 房室弁
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| | より多くの参照発現データ |
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| バイオGPS | |
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| 遺伝子オントロジー |
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| 分子機能 | - CTP:3'-シチジン-tRNAシチジル転移酵素活性
- トランスフェラーゼ活性
- ヌクレオチド結合
- tRNA結合
- ヌクレオチジルトランスフェラーゼ活性
- ATP結合
- CTP:tRNAシチジルトランスフェラーゼ活性
- RNA結合
- 5'-3' RNAポリメラーゼ活性
- ATP:3'-シチジン-シチジン-tRNAアデニリルトランスフェラーゼ活性
| | 細胞成分 | - ミトコンドリアマトリックス
- 細胞内解剖学的構造
- ミトコンドリア
- 核質
| | 生物学的プロセス | - RNAプロセシング
- tRNA 3'末端CCA付加
- tRNAプロセシング
- tRNA 3'末端処理
- ミトコンドリアtRNAの3'末端プロセシング
| | 出典:Amigo / QuickGO |
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| オルソログ |
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| 種 | 人間 | ねずみ |
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| アントレ | | |
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| アンサンブル | | |
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| UniProt | | |
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| RefSeq(mRNA) | |
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NM_001302946 NM_016000 NM_182916 |
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NM_001242358 NM_001242360 NM_027296 |
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| RefSeq(タンパク質) | |
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NP_001289875 NP_886552 NP_001354250 NP_001354251 NP_001354252 |
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NP_001229287 NP_001229289 NP_081572 |
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| 所在地(UCSC) | Chr 3: 3.13 – 3.15 MB | Chr 6: 106.75 – 106.76 MB |
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| PubMed検索 | [ 3 ] | [ 4 ] |
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| ウィキデータ |
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tRNAヌクレオチジルトランスフェラーゼ1は、ヒトではTRNT1遺伝子によってコードされる酵素である。[ 5 ] [ 6 ] [ 7 ]この酵素は、 ATPとCTPを基質として、 ヌクレオチド配列CCAをtRNAの3'末端に付加する。この配列はアミノ酸の結合部位を形成する。[ 8 ]
参考文献
- 1 2 3 GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000072756 – Ensembl、2017年5月
- 1 2 3 GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000013736 – Ensembl、2017年5月
- ↑ 「ヒトPubMed参照:」。米国国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ↑ 「マウス PubMed 参照:」。米国国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ↑ Lai CH, Chou CY, Ch'ang LY, Liu CS, Lin W (2000年8月). "比較プロテオミクスによる線虫Caenorhabditis elegansで進化的に保存されている新規ヒト遺伝子の同定" . Genome Res . 10 (5): 703– 13. doi : 10.1101/gr.10.5.703 . PMC 310876 . PMID 10810093 .
- ↑ Nagaike T, Suzuki T, Tomari Y, Takemoto-Hori C, Negayama F, Watanabe K, Ueda T (2001年10月). "哺乳類ミトコンドリアtRNAヌクレオチジルトランスフェラーゼの同定と特性解析" . J Biol Chem . 276 (43): 40041– 9. doi : 10.1074/jbc.M106202200 . PMID 11504732 .
- ↑ "Entrez Gene: TRNT1 tRNA nucleotidyl transferase, CCA-adding, 1" .
- ↑ Lizano E、Scheibe M、Rammelt C、Betat H、Mörl M (2008 年 5 月)。「ヒトと大腸菌の CCA 付加酵素の比較分析: CCA 付加と tRNA 3' 末端修復の違い」。Biochimie。90 ( 5 ) : 762–72。doi : 10.1016 / j.biochi.2007.12.007。PMID 18226598。
さらに読む
- Hartley JL、Temple GF、Brasch MA (2001) 「in vitro部位特異的組換えを用いたDNAクローニング」 Genome Res . 10 (11): 1788–95 . doi : 10.1101/gr.143000 . PMC 310948. PMID 11076863 .
- Wiemann S、Weil B、Wellenreuther R、et al. (2001) 「ヒト遺伝子とタンパク質のカタログに向けて:500個の新規完全タンパク質コードヒトcDNAの配列決定と解析」Genome Res . 11 ( 3): 422–35 . doi : 10.1101/gr.GR1547R . PMC 311072. PMID 11230166 .
- Simpson JC、Wellenreuther R、Poustka A、et al. (2001) 「大規模cDNAシーケンスによって同定された新規タンパク質の系統的な細胞内局在」 EMBO Rep . 1 (3): 287–92 . doi : 10.1093/embo - reports/kvd058 . PMC 1083732. PMID 11256614 .
- Reichert AS、Thurlow DL、Mörl M (2002)「ヒトtRNAヌクレオチジルトランスフェラーゼの真正細菌起源か?」Biol . Chem . 382 (10): 1431–8 . CiteSeerX 10.1.1.657.1235 . doi : 10.1515/BC.2001.176 . PMID 11727826. S2CID 230616 .
- Strausberg RL、Feingold EA、Grouse LH、et al. (2003) 「15,000を超える全長ヒトおよびマウスcDNA配列の生成と初期解析」 . Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899–903 . Bibcode : 2002PNAS...9916899M . doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241. PMID 12477932 .
- Augustin MA 、Reichert AS、Betat Hら (2003)。「ヒトCCA付加酵素の結晶構造:テンプレート非依存性重合に関する知見」。J . Mol. Biol . 328(5):985–94。doi : 10.1016 / S0022-2836(03) 00381-4。PMID 12729736。
- Gerhard DS、Wagner L、Feingold EA、et al. (2004) 「NIH全長cDNAプロジェクトの現状、品質、および拡張:哺乳類遺伝子コレクション(MGC)」 . Genome Res . 14 (10B): 2121–7 . doi : 10.1101 /gr.2596504 . PMC 528928. PMID 15489334 .
- Wiemann S、Arlt D、Huber W、et al . (2004 ) 。 「ORFeomeから生物学へ:機能ゲノミクスパイプライン」。Genome Res。14 ( 10B ): 2136–44。doi : 10.1101 / gr.2576704。PMC 528930。PMID 15489336。
- Kimura K, Wakamatsu A, Suzuki Y, et al. (2006). "転写調節の多様化:ヒト遺伝子の推定代替プロモーターの大規模同定と特徴付け" . Genome Res . 16 (1): 55–65 . doi : 10.1101/gr.4039406 . PMC 1356129. PMID 16344560 .
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- Lizano E、Schuster J、Müller Mら( 2007)。「活性が改変されたヒトCCA付加酵素のスプライスバリアント」。J . Mol. Biol . 366(4):1258–65。doi:10.1016/ j.jmb.2006.12.016。PMID 17204286。