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| TMUB2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| 識別子 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| エイリアス | TMUB2、FP2653、膜貫通およびユビキチン様ドメインを含む2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 外部ID | MGI : 1919303; HomoloGene : 18581; GeneCards : TMUB2; OMA :TMUB2 - オルソログ | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| ウィキデータ | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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膜貫通ユビキチン様ドメイン含有タンパク質2は、ヒトではTMUB2遺伝子によってコードされるタンパク質である。[4] [5] [6]
遺伝子
TMUB2はヒト17番染色体の17q21.31座に位置する。 [6] TMUB2は2つの隣接する遺伝子、左側のASB16-AS1と右側のATXN7L3の間に位置する。[7] TMUB2の長さは4.99 Kbである。TMUB2遺伝子は3つのmRNA変異体に転写される可能性がある。[8]
表現
TMUB2は人体全体に遍在的に発現していると考えられる。[9]その発現レベルは他のヒト遺伝子の2.9倍と高い。[10] [11]
タンパク質
TMUB2タンパク質の機能は現在不明である。ヒトでは321アミノ酸の長い鎖から構成される。ヒトタンパク質の分子量は33.8 kdal、等電点は4.73899、膜貫通領域は3つある。[12]これらは相同遺伝子によって異なる可能性がある。
相同性
パラログ
TMUB1はTMUB2の唯一の相同遺伝子である。[13] [14]これらのタンパク質は38%の同一性と51%の類似性を共有している。[15]
オルソログ
下の表は、種間のタンパク質の多様性を示すためにTMUB2の相同遺伝子のいくつかを抜粋したものです。[15]
*クエリ範囲が限定されている
タンパク質相互作用
ヒトでは、ユビキチンC（UBC）はTMUB2と相互作用することが知られているタンパク質です。[16] [17] [18] [19]他に提案されている相互作用には、 BCL2L13（BCL2様13）[20] 、 SGTA（小さなグルタミンに富むテトラトリコペプチドリピート含有タンパク質）[20] 、 UBQLN1（ユビキリン-1） [20]などがあります。 [ 21] [22]
参考文献
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- ^ ab 「Entrez Gene: TMUB2 膜貫通およびユビキチン様ドメイン 2 を含む」。
- ^ UCSC ゲノムブラウザ: BLAT 検索
- ^ NCBI遺伝子: TMUB2
- ^ EST プロファイルビューア: 人間
- ^ エースビュー: TMUB2
- ^ NCBI GEO プロファイル
- ^ SDSC 生物学ワークベンチ 2.0
- ^ ジーンカード: TMUB2
- ^ NCBI遺伝子: TMUB1
- ^ ab NCBI BLAST: 基本的なローカルアライメント検索ツール
- ^ ダニエルセン・ジャニーMR;シルベスターセン・キャサリン・B;ベッカー・ジェンセン・サイモン。シュクラルチク・ダミアン;ポールセン・ジョン・W;ホーン・ヘイコ;ジェンセン・ラーズ・J;メイランド・ニールス。ニールセン マイケル L (2011)。 「リジンユビキチン化の質量分析分析により、サイトレベルでの乱交状態が明らかに」。分子および細胞のプロテオミクス。10 (3): M110.003590。土井: 10.1074/mcp.M110.003590。PMC 3047152。PMID 21139048。
- ^ Wagner SA; Beli P.; Weinert BT; Nielsen ML; Cox J.; Mann M.; Choudhary C. (2011). 「プロテオーム全体にわたる生体内ユビキチン化部位の定量的調査により、広範な調節役割が明らかになる」。分子 および細胞プロテオミクス。10 ( 10): M111.013284。doi : 10.1074/ mcp.M111.013284。PMC 3205876。PMID 21890473。
- ^ Kim Woong; Bennett Eric J.; Huttlin Edward L.; Guo Ailan; Li Jing; Possemato Anthony; Sowa Mathew E.; et al. (2011). 「ユビキチン修飾プロテオームの体系的かつ定量的評価」。Molecular Cell . 44 (2): 325–40. doi :10.1016/j.molcel.2011.08.025. PMC 3200427. PMID 21906983 .
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- ^ STRING: 機能性タンパク質関連ネットワーク
- ^ BioGRID データベース
さらに読む
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