ホモサピエンス種のタンパク質コード遺伝子
TFF2 利用可能な構造 PDB オルソログ検索: PDBe RCSB PDB IDコードのリスト 2DYZ、2DZ0、2DZ1
識別子 エイリアス TFF2 、SML1、SP、トレフォイル因子2 外部ID オミム : 182590; MGI : 1306805; ホモロジーン : 3956; ジーンカード :TFF2; OMA :TFF2 - オルソログ 遺伝子の位置( マウス ) クロ。 17番染色体(マウス) [2] バンド 17 A3.3|17 15.8 cM 始める 31,360,023 bp [2] 終わり 31,363,256 bp [2]
RNA発現 パターン ブギー 人間 マウス (相同遺伝子) トップの表現 膵管細胞 胃粘膜 幽門 胆嚢 胃の本体 生殖腺 十二指腸 眼底 ランゲルハンス島 噴門
トップの表現 胃の粘液細胞 胃の上皮 幽門洞 十二指腸 ランゲルハンス島 気管 胆嚢 呼吸器上皮 嗅上皮 胚
参照表現データの詳細
バイオGPS 参照表現データの詳細
遺伝子オントロジー 分子機能 細胞成分 生物学的プロセス
傷の治癒
胃腸上皮の維持
胃酸分泌の抑制
ケモカインを介したシグナル伝達経路
出典:Amigo / QuickGO
ウィキデータ
トレフォイル因子2 は、 ヒトでは TFF2 遺伝子によってコードされる タンパク質 である。 [5] [6] [7]
トレフォイルファミリーのメンバーは、3つの保存された ジスルフィド を含む40アミノ酸ドメインである トレフォイルモチーフのコピーを少なくとも1つ持つという特徴があります。これらは、 胃腸 粘膜 で発現する 安定した分泌 タンパク質 です。その機能は定義されていませんが、粘膜を損傷から保護し、 粘液層を安定化し、 上皮 の治癒に影響を与える可能性があります 。コードされているタンパク質は 胃酸 分泌を阻害します。この 遺伝子と他の2つの関連するトレフォイルファミリーメンバー遺伝子は、 染色体21 上の クラスター に存在します 。 [7]
グリカン結合
ヒトトレフォイル因子はすべて、 二糖類 GlcNAc -α-1,4- Galと特異的に相互作用する レクチン である。 [8] この二糖類は、粘膜内の大きく高度に グリコシル化され た ムチンにのみ存在することが知られている珍しいグリコトープである。このグリコトープの二価結合を介して ムチンを 架橋することにより 、トレフォイル因子は粘液の厚さと粘度を可逆的に調節することができる。 [8]
参考文献
^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000160181 – Ensembl 、2017 年 5 月
^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000024028 – Ensembl 、2017 年 5 月
^ 「Human PubMed Reference:」。 国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館 。
^ 「マウス PubMed リファレンス:」。 国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館 。
^ Tomasetto C、Rockel N、Mattei MG、Fujita R、Rio MC (1992 年 9 月)。「ヒト鎮痙タンパク質 (SML1/hSP) をコードする遺伝子は 21q 22.3 にあり、相同乳がんマーカー遺伝子 BCEI/pS2 に物理的にリンクしています」。Genomics . 13 ( 4): 1328–30. doi :10.1016/0888-7543(92)90059-2. PMID 1505966。
^ Gott P、Beck S、Machado JC、Carneiro F、Schmitt H、Blin N (1997 年 5 月)。「ヒトトレフォイルペプチド: 21q22.3 のゲノム構造と協調発現」。Eur J Hum Genet。4 ( 6 ): 308–15。doi : 10.1159 /000472224。PMID 9043862。S2CID 25235589 。
^ ab 「Entrez Gene: TFF2 トレフォイル因子 2 (鎮痙タンパク質 1)」。
^ ab Järvå MA, Lingford JP, John A, Soler NM, Scott NE, Goddard-Borger ED (2020年5月). 「トレフォイル因子は粘液での役割を定義するレクチン活性を共有する」. Nature Communications . 11 (1): 2265. Bibcode :2020NatCo..11.2265J. doi : 10.1038/s41467-020-16223-7 . PMC 7221086. PMID 32404934.
さらに読む
Advenier C、Lagente V、Boichot E (1997)。「気管支過敏症、気道炎症、咳嗽の予防におけるタキキニン受容体拮抗薬の役割」。Eur . Respir. J. 10 ( 8): 1892–906. doi : 10.1183/09031936.97.10081892 . PMID 9272936。
Langer G、Jagla W、Behrens-Baumann W、他 (2002)。「眼 TFF ペプチド: 結膜杯細胞の新しい粘液関連分泌産物」。 涙腺、涙液膜、ドライアイ症候群 3。 実験医学と生物学の進歩。第 506 巻。pp. 313–6。doi : 10.1007 / 978-1-4615-0717-8_44。ISBN 978-1-4613-5208-2 . PMID 12613926。
Tomasetto C、 Rio MC、Gautier C、et al. (1990)。「pS2 タンパク質のドメイン重複ホモログである hSP は、胃癌では pS2 と共発現するが、乳癌では共発現しない」。EMBO J. 9 (2): 407–14. doi :10.1002/j.1460-2075.1990.tb08125.x. PMC 551681. PMID 2303034 。
Bhogal N、Donnelly D、Findlay JB (1994)。「ニューロキニン2受容体のリガンド結合部位。ヒトニューロキニン2受容体におけるニューロキニンA結合残基の部位特異的変異誘発および同定」。J . Biol. Chem . 269 ( 44): 27269–74。doi : 10.1016/S0021-9258(18) 46979-7。PMID 7961636 。
Hanby AM、Poulsom R、Singh S、et al. (1993)。「鎮痙ポリペプチドは主要な胃前庭ペプチドである:胃における三つ葉ペプチド、ヒト鎮痙ポリペプチドおよびpS2の分布」。 消化 器 病学 。105 (4): 1110–6。doi : 10.1016 /0016-5085(93)90956-d。PMID 8405856 。
Itoh H, Tomita M, Uchino H, et al. (1996). 「ラットpS2ペプチドのcDNAクローニングと酢酸誘発性大腸炎におけるトレフォイルペプチドの発現」 Biochem. J. 318 ( 3): 939–44. doi : 10.1042/bj3180939. PMC 1217708. PMID 8836141.
May FE、Westley BR (1997)。「pNR-2/pS2 タンパク質とヒト鎮痙タンパク質 (hSP) をコードする遺伝子の密接な物理的連鎖」。Hum . Genet . 99 (3): 303–7. doi :10.1007/s004390050362. PMID 9050913. S2CID 22603186。
Seib T、Blin N、Hilgert K、他 (1997)。「ヒトの三つ葉遺伝子 TFF1、TFF2、TFF3 の 3 つは、染色体 21q22.3 の 55 kb の領域内に位置する」。Genomics . 40 ( 1): 200–2. doi :10.1006/geno.1996.4511. PMID 9070946。
Kayademir T、Silva Edos S、Pusch C、他 (1998)。「21q22.3 のヒトトレフォイルペプチド遺伝子 TFF2 内の新規 25 bp タンデムリピート: 多型と哺乳類の進化」。Eur . J. Hum. Genet . 6 (2): 121–8. doi : 10.1038/sj.ejhg.5200166 . PMID 9781055。
Brunelleschi S, Bordin G, Colangelo D, Viano I (1999). 「ヒト単球上のタキキニン受容体:関節リウマチへの関与」。ニューロペプチド。32 ( 3 ) : 215–23。doi : 10.1016 /S0143-4179(98)90040-3。PMID 10189055。S2CID 40222022 。
May FE、Semple JI、Newton JL、Westley BR (2000)。「ヒトの2 ドメイントレフォイルタンパク質TFF2は、生体内で胃内で糖化される」。Gut . 46 (4): 454–9. doi :10.1136/gut.46.4.454. PMC 1727891. PMID 10716671 。
Hattori M, Fujiyama A, Taylor TD, et al. (2000). 「ヒト染色体21のDNA配列」. Nature . 405 (6784): 311–9. Bibcode :2000Natur.405..311H. doi : 10.1038/35012518 . PMID 10830953.
Berry A、Scott HS、Kudoh J、他 (2001)。「34 個の新規マイクロサテライトマーカー、ゲノム構造、および当該領域内の 6 つの既知遺伝子の除外を使用した常染色体劣性非症候性難聴 DFNB10 遺伝子座の精密な位置特定」。Genomics . 68 ( 1): 22–9. doi :10.1006/geno.2000.6253. PMID 10950923。
Bulitta CJ、Fleming JV、Raychowdhury R、et al. (2002)。「トレフォイル因子2(TFF2)プロモーターの自動誘導には上流のシス作用要素が必要」。Biochem . Biophys. Res. Commun . 293 (1): 366–74. doi :10.1016/S0006-291X(02)00199-7. PMID 12054609。
Strausberg RL、Feingold EA、Grouse LH、他 (2003)。「15,000 を超える完全長のヒトおよびマウス cDNA 配列の生成と初期分析」。Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 99 ( 26): 16899–903。Bibcode : 2002PNAS ... 9916899M。doi : 10.1073/ pnas.242603899。PMC 139241。PMID 12477932 。
Hu GY、Yu BP、Dong WG、他 (2003)。「胃粘膜の発癌におけるTFF2の発現とヘリコバクターピロリ感染」。World J. Gastroenterol . 9 (5): 910–4. doi : 10.3748/wjg.v9.i5.910 . PMC 4611396. PMID 12717829 。