タンパク質
タープ2 利用可能な構造 ＰＤＢ オルソログ検索: PDBe RCSB PDB IDコードのリスト 2CPN、3ADL、3LLH、4WYQ
識別子 エイリアス TARBP2 、LOQS、TRBP、TRBP1、TRBP2、RISC ローディング複合体 RNA 結合サブユニット、RISC ローディング複合体の TARBP2 サブユニット 外部ID オミム ：605053; MGI : 103027; ホモロジーン : 7562; ジーンカード ：TARBP2; OMA :TARBP2 - オルソログ 遺伝子の位置（ マウス ） クロ。 15番染色体（マウス） [2] バンド 15 F3|15 57.65 cM 始める 102,426,627 bp [2] 終わり 102,432,111 bp [2]
RNA発現 パターン ブギー 人間 マウス （相同遺伝子） トップの表現 小脳の右半球 右子宮管 甲状腺の右葉 右副腎 右副腎皮質 横行結腸粘膜 顆粒球 甲状腺の左葉 肝臓の右葉 膵臓の体
トップの表現 精母細胞 卵黄嚢 睾丸 精子細胞 胚葉上層 胚 中脳 神経管 心臓 胚
参照表現データの詳細
バイオGPS 参照表現データの詳細
遺伝子オントロジー 分子機能
タンパク質N末端結合 タンパク質結合 siRNA結合 RNA結合 酵素結合 プレmRNA結合 二本鎖RNA結合 同一のタンパク質結合 タンパク質ホモ二量体化活性 プレmiRNA結合 miRNA結合 細胞成分
細胞質 細胞質 細胞質の核周囲領域 核 核質 核体 RISCローディング複合体 RISC 複合体 生物学的プロセス
ウイルス転写の調節 タンパク質キナーゼ活性の負の調節 多細胞生物の成長 翻訳の積極的な規制 一回受精 宿主によるウイルスに対する防御反応の負の調節 精子細胞の発達 ウイルスゲノム複製の正の制御 翻訳の規制 miRNAによる遺伝子サイレンシングに関与するmiRNAの生成 miRNA代謝プロセス 遺伝子サイレンシング RNA干渉に関与するsiRNAの生産 プレmiRNA処理 miRNAによる遺伝子サイレンシングに関与するmiRNAの産生の調節 骨格筋組織の再生 筋細胞分化の正の調節 神経前駆細胞の増殖 出典:Amigo / QuickGO
オルソログ 種 人間 ねずみ エントレズ アンサンブル ユニプロット RefSeq (mRNA) NM_004178 NM_134323 NM_134324
RefSeq (タンパク質) NP_004169 NP_599150 NP_599151
場所 (UCSC) 12 章: 53.5 – 53.51 Mb 15 章: 102.43 – 102.43 Mb PubMed 検索 [3] [4]
ウィキデータ
RISCローディング複合体サブユニットTARBP2は、ヒトでは TARBP2 遺伝子 によってコードされる タンパク質 である 。 [5] [6]
関数 後天性免疫不全症候群 （AIDS）の原因物質である HIV-1 には、複製サイクル中に染色体に組み込まれたDNAを生成するRNAゲノムが含まれています。トランス活性化因子TatによるHIV-1遺伝子発現の活性化は、転写開始部位の下流にあるRNA調節要素（TAR）に依存しています。この遺伝子によってコードされるタンパク質は、HIV-1 TAR RNA調節要素のバルジとループの間に結合し、ウイルスのTatタンパク質と相乗的にHIV-1遺伝子発現を活性化します。選択的スプライシングにより、異なるアイソフォームをコードする複数の転写バリアントが生成されます。この遺伝子には 擬似遺伝子 もあります。 [6]
インタラクション TARBP2はプロテインキナーゼR [7] [8] および RBM14 [9] と 相互作用する ことが示されている 。
参考文献
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さらに読む
Cosentino GP、Venkatesan S、Serluca FC、Green SR、Mathews MB、Sonenberg N (1995 年 10 月)。「二本鎖 RNA 依存性タンパク質キナーゼと TAR RNA 結合タンパク質は、生体内でホモ二量体とヘテロ二量体を形成する」。 米国 科学 アカデミー 紀要 。92 (21): 9445–9。Bibcode : 1995PNAS... 92.9445C。doi : 10.1073 / pnas.92.21.9445。PMC 40818。PMID 7568151 。 Kozak CA、Gatignol A、Graham K、Jeang KT、McBride OW (1995 年 1 月)。「ヒト免疫不全ウイルス (HIV-1) の TAR 領域に結合するタンパク質 TRBP をコードする遺伝子座のヒトおよびマウスにおける遺伝子マッピング」。Genomics . 25 ( 1): 66– 72. doi :10.1016/0888-7543(95)80110-8. PMID 7774957。 Gatignol A、Buckler C、Jeang KT (1993 年 4 月)。 「 ヒト免疫不全ウイルス 1 型 TAR RNA 結合タンパク質 TRBP の RNA 結合モチーフとヒト P1/dsI キナーゼおよびショウジョウバエ シュタウフェンとの関連性」。 分子 細胞 生物学 。13 (4): 2193– 202。doi :10.1128/ mcb.13.4.2193。PMC 359540。PMID 8455607 。 Gatignol A、Duarte M、Daviet L、Chang YN、Jeang KT (1996)。「細胞DNA、RNA、タンパク質結合因子を介して媒介されるHIV-1のTatトランス活性化の連続ステップ 」 。 遺伝子 発現 。5 （ 4〜5 ） ： 217〜28。PMC 6138028。PMID 8723388 。 Kasof GM、Goyal L、White E (1999 年 6 月)。「Btf は、Bcl-2関連 タンパク質と相互作用する新しい細胞死促進転写抑制因子です」。 分子 細胞 生物学 。19 (6): 4390– 404。doi :10.1128/ mcb.19.6.4390。PMC 104398。PMID 10330179 。 Daviet L、Erard M、Dorin D、Duarte M、Vaquero C、Gatignol A (2000 年 4 月)。「TRBP の 2 つの dsRNA 結合ドメイン間の結合の違いの分析により、KR ヘリックス モチーフのモジュール機能が明らかになりました」。European Journal of Biochemistry . 267 (8): 2419– 31. doi :10.1046/j.1432-1327.2000.01256.x. PMID 10759868。 Duarte M、Graham K、Daher A、Battisti PL、Bannwarth S、Segeral E、Jeang KT、Gatignol A (2001)。「TRBP1 および TRBP2 の特性。TRBP2 mRNA の 5' 末端にある安定したステムループ構造は HIV-1 TAR に類似しており、処理された擬似遺伝子には見られない」。Journal of Biomedical Science。7 ( 6): 494– 506。doi : 10.1007/ bf02253365。PMID 11060498 。 Siffroi JP、Pawlak A、Alfonsi MF、Troalen F、Guellaen G、Dadoune JP (2001 年 3 月)。「ヒト精巣における TAR RNA 結合タンパク質の発現」。 分子 ヒト 生殖 。7 ( 3): 219– 25。doi : 10.1093/molehr/7.3.219。PMID 11228241 。 Daher A、Longuet M、Dorin D、Bois F、Segeral E、Bannwarth S、Battisti PL、Purcell DF、Benarous R、Vaquero C、Meurs EF、Gatignol A (2001 年 9 月)。「トランス活性化応答 RNA 結合タンパク質 (TRBP) の 2 つの二量体化ドメインは、HIV-1 長末端反復配列発現のタンパク質キナーゼ R 阻害を個別に逆転させる」。The Journal of Biological Chemistry。276 ( 36): 33899– 905。doi : 10.1074/jbc.M103584200。PMID 11438532 。 Iwasaki T, Chin WW, Ko L (2001 年 9 月). 「TRBP 相互作用タンパク質としての RRM 含有コアクチベーター活性化因子 (CoAA) およびそのコアクチベーター調節因子 (CoAM) としてのスプライスバリアントの同定と特性評価」. The Journal of Biological Chemistry . 276 (36): 33375– 83. doi : 10.1074/jbc.M101517200 . PMID 11443112. Bannwarth S、Talakoub L、Letourneur F、Duarte M、Purcell DF、Hiscott J、Gatignol A (2001 年 12 月)。「ヒト tarbp2 遺伝子の構成により、アストロサイトーシス細胞株で抑制されている 2 つのプロモーターが明らかになった」。The Journal of Biological Chemistry。276 ( 52): 48803– 13。doi : 10.1074/ jbc.M104645200。PMID 11641396 。 Xu YC、Wu RF、Gu Y、Yang YS、Yang MC、Nwariaku FE、Terada LS (2002 年 8 月)。「c-Jun N 末端キナーゼの酸化活性化における TRAF4 の関与」。The Journal of Biological Chemistry。277 ( 31): 28051– 7。doi : 10.1074/ jbc.M202665200。PMID 12023963 。 Battisti PL、Daher A、Bannwarth S、Voortman J、Peden KW、Hiscott J、Mouland AJ、Benarous R、Gatignol A (2003 年 9 月)。「トランス活性化応答 RNA 結合タンパク質 TRBP2 とサイクリン T1 の相加的活性がマウス細胞における HIV タイプ 1 の発現とウイルス産生に与える影響」。AIDS 研究 と ヒトレトロウイルス 。19 (9): 767– 78。doi :10.1089/088922203769232566。PMID 14585207 。 Lee JY、Kim H、Ryu CH、Kim JY、Choi BH、Lim Y、Huh PW、Kim YH、Lee KH、Jun TY、Rha HK、Kang JK、Choi CR (2004 年 7 月)。「腫瘍抑制因子である Merlin は、トランス活性化応答性 RNA 結合タンパク質と相互作用し、その発癌活性を阻害する」。The Journal of Biological Chemistry。279 ( 29): 30265– 73。doi : 10.1074/ jbc.M312083200。PMID 15123692 。 Haase AD、Jaskiewicz L、Zhang H、Lainé S、Sack R、Gatignol A、Filipowicz W (2005 年 10 月)。「細胞 PKR および HIV-1 ウイルス発現の調節因子である TRBP は Dicer と相互作用し、RNA サイレンシングで機能する」。EMBO レポート 。6 ( 10 ): 961– 7。doi :10.1038 / sj.embor.7400509。PMC 1369185。PMID 16142218 。 ルアル JF、ヴェンカテサン K、ハオ T、弘實＝岸川 T、ドリコット A、リー N、ベリス GF、ギボンズ FD、ドレーゼ M、アイヴィ＝グエデフスー N、クリットゴード N、サイモン C、ボクセム M、ミルスタイン S、ローゼンバーグ J、ゴールドバーグDS、チャン LV、ウォン SL、フランクリン G、リー S、アルバラ JS、リム J、フロートン C、ラモサス E、セビック S、ベックス C、ラメシュ P、シコルスキー RS、ヴァンデンハウト J、ゾグビ HY、スモリャル A、ボサック S、セケーラ R、ドゥセット スタム L、キュージック ME、ヒル DE、ロス FP、ビダル M ( 2005 年 10 月）。 「ヒトタンパク質間相互作用ネットワークのプロテオームスケールマップに向けて」。 自然 。 437 (7062): 1173– 8. Bibcode :2005Natur.437.1173R. doi :10.1038/nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026. Bannwarth S、Lainé S、Daher A、Grandvaux N、Clerzius G、Leblanc AC、Hiscott J、Gatignol A (2006 年 2 月)。「リンパ球およびアストロサイトにおける NF-Y 転写因子による TRBP1 プロモーターの細胞特異的制御」。Journal of Molecular Biology。355 ( 5): 898– 910。doi :10.1016/ j.jmb.2005.11.026。PMID 16343534 。 Christensen HS、Daher A、Soye KJ、Frankel LB、Alexander MR、Lainé S、Bannwarth S、Ong CL、Chung SW、Campbell SM、Purcell DF、Gatignol A (2007 年 5 月)。「Dicer 補因子である TRBP である TAR RNA 結合タンパク質に対する低分子干渉 RNA は、ヒト免疫不全ウイルス 1 型の長い末端反復配列の発現とウイルス産生を阻害する」。Journal of Virology。81 ( 10 ) : 5121– 31。doi : 10.1128/JVI.01511-06。PMC 1900231。PMID 17360756 。
