ホモサピエンス種のタンパク質コード遺伝子
タープ1 利用可能な構造 ＰＤＢ オルソログ検索: PDBe RCSB
識別子 エイリアス TARBP1 、TRM3、TRP-185、TRP185、TAR（HIV-1）RNA結合タンパク質1、TRMT3 外部ID オミム ：605052; MGI : 4936930; ホモロジーン : 38082; ジーンカード ：TARBP1; OMA :TARBP1 - オルソログ 遺伝子の位置（ マウス ） クロ。 染色体8（マウス） [2] バンド 8|8 E2 始める 127,152,068 bp [2] 終わり 127,201,804 bp [2]
RNA発現 パターン ブギー 人間 マウス （相同遺伝子） トップの表現 小脳の右半球 右子宮管 右前頭葉 ブロードマン領域9 側坐核 直腸 下垂体 下垂体前葉 尾状核 膵臓の体
トップの表現 大動脈弁 毛包 上行大動脈 積雲細胞 パネートセル 原始的な線 二次卵母細胞 一次卵母細胞 尿管 胎児の尾
参照表現データの詳細
バイオGPS 参照表現データの詳細
遺伝子オントロジー 分子機能
メチルトランスフェラーゼ活性 RNAメチルトランスフェラーゼ活性 トランスフェラーゼ活性 tRNA（グアニン）メチルトランスフェラーゼ活性 RNA結合 rRNA (グアノシン-2'-O-)-メチルトランスフェラーゼ活性 細胞成分 生物学的プロセス
RNAポリメラーゼIIによる転写の調節 メチル化 RNA処理 tRNAメチル化 酵素誘導rRNA 2'-O-メチル化 出典:Amigo / QuickGO
ウィキデータ
メチルトランスフェラーゼTARBP1は、ヒトでは TARBP1 遺伝子 によってコードされる 酵素 である 。 [5] [6]
後天性免疫不全症候群 （AIDS） の原因物質である HIV-1 には、複製サイクル中に染色体に組み込まれた DNA を生成する RNAゲノムが含まれています。トランス活性化因子 Tat によるHIV-1遺伝子発現の活性化は、転写開始部位の下流にあるRNA調節要素（TAR）に依存しています。この要素は安定した ステムループ構造 を形成し、この遺伝子によってコードされるタンパク質または RNAポリメラーゼIIのいずれかによって結合することができます。このタンパク質は、 転写伸長 中にRNAポリメラーゼIIをTARから切り離す働きをすると 考えられます。この遺伝子の選択的スプライシング転写物が存在する可能性がありますが、その全長の性質は決定されていません。 [6]
参考文献
^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000059588 – Ensembl 、2017 年 5 月 ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000090290 – Ensembl 、2017 年 5 月 ^ 「Human PubMed Reference:」。 国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館 。 ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。 国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館 。 ^ Wu F、Garcia J、Sigman D、 Gaynor R (1991年12月)。「tatはヒト免疫不全ウイルスのトランス活性化領域RNAループ結合タンパク質TRP-185の結合を制御する」。Genes Dev . 5 (11): 2128– 40. doi : 10.1101/gad.5.11.2128 . PMID 1936997。 ^ ab "Entrez Gene: TARBP1 Tar (HIV-1) RNA結合タンパク質1".
さらに読む
Sheline CT、Milocco LH、Jones KA (1992)。「2つの異なる核転写因子がHIV-1 TAR RNAヘアピンのループ残基とバルジ残基を認識する」。Genes Dev . 5 (12B): 2508– 20. doi : 10.1101/gad.5.12b.2508 . PMID 1752441。 Wu-Baer F、Sigman D、 Gaynor RB (1995)。「RNAポリメラーゼIIのヒト免疫不全ウイルストランス活性化領域RNAへの特異的結合は、細胞補因子とTatによって制御される」。Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 92 ( 16 ): 7153– 7。Bibcode :1995PNAS...92.7153W。doi : 10.1073 / pnas.92.16.7153。PMC 41297。PMID 7638159 。 Wu-Baer F、Lane WS、Gaynor RB (1996)。「RNAポリメラーゼIIおよびTRP-185とヒト免疫不全ウイルス1 TAR RNAの結合を刺激する細胞補因子群の同定」。J . Biol. Chem . 271 (8): 4201–8 . doi : 10.1074/jbc.271.8.4201 . PMID 8626763。 Wu-Baer F、 Lane WS、Gaynor RB (1996)。「細胞因子TRP-185はRNAポリメラーゼIIのHIV-1 TAR RNAへの結合を制御する」。EMBO J. 14 (23): 5995– 6009. doi :10.1002/j.1460-2075.1995.tb00288.x. PMC 394719. PMID 8846792 。 Yedavalli VS、Benkirane M、Jeang KT (2003)。「ヒトおよびマウスのサイクリンT1によるHIV-1長末端反復配列のTatおよびトランス活性化応答性(TAR)RNA非依存性誘導にはSp1が必要」。J . Biol. Chem . 278 (8): 6404– 10. doi : 10.1074/jbc.M209162200 . PMID 12458222。 Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). 「15,000 を超える完全長のヒトおよびマウス cDNA 配列の生成と初期分析」 Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899– 903. Bibcode :2002PNAS...9916899M. doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241 . PMID 12477932. 太田 孝文、鈴木 勇、西川 孝文、他 (2004)。「21,243 個の完全長ヒト cDNA の完全配列決定と特性解析」。Nat . Genet . 36 (1): 40–5 . doi : 10.1038/ng1285 . PMID 14702039。 Gregory SG、 Barlow KF、 McLay KE、他 (2006)。「ヒト染色体 1 の DNA 配列と生物学的注釈」。Nature . 441 ( 7091 ): 315– 21。Bibcode :2006Natur.441..315G。doi : 10.1038/nature04727。PMID 16710414 。
