| TAF1C |
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| 識別子 |
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| 別名 | TAF1C、MGC:39976、SL1、TAFI110、TAFI95、TATAボックス結合タンパク質関連因子、RNAポリメラーゼIサブユニットC |
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| 外部ID | オミム: 604905 ; MGI : 109576 ;ホモロジーン: 21163 ;ジーンカード:TAF1C ; OMA : TAF1C - オルソログ |
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| RNA発現パターン |
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| Bgee | | 人間 | マウス(相同体) |
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| トップは | - 左卵巣
- 右卵巣
- 子宮体部
- 甲状腺の右葉
- 子宮頸管
- 甲状腺の左葉
- 右卵管
- 脾臓
- 胃粘膜
- 心臓の頂点
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| | トップは | - 球形嚢
- 耳板
- 耳胞
- 回腸上皮
- 内頸動脈
- 外頸動脈
- 角膜実質
- 小腸のリーベルキューン腺窩
- 吻側回遊河川
- 胸腺
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| | より多くの参照発現データ |
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| バイオGPS |   | | より多くの参照発現データ |
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| 遺伝子オントロジー |
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| 分子機能 | - DNA結合
- タンパク質結合
- RNAポリメラーゼIコアプロモーター配列特異的DNA結合
| | 細胞成分 | - RNAポリメラーゼI転写調節複合体
- 線維中心
- 核質
- 核小体
- 核
| | 生物学的プロセス | - RNAポリメラーゼI転写の終結
- RNAポリメラーゼIプロモーターからの転写開始
- 転写可能な構造におけるクロマチンのエピジェネティックな維持
- 転写、DNA鋳型
- 転写の調節、DNAテンプレート
- RNAポリメラーゼIIによる転写
- RNAポリメラーゼIによる転写の調節
- RNAポリメラーゼI開始前複合体の組み立て
- RNAポリメラーゼIによる転写
- RNAポリメラーゼIプロモーターからの転写伸長
| | 出典:Amigo / QuickGO |
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| オルソログ |
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| 種 | 人間 | ねずみ |
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| アントレ | | |
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| アンサンブル | | |
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| UniProt | | |
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| RefSeq(mRNA) | | NM_001243156 NM_001243157 NM_001243158 NM_001243159 NM_001243160 |
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NM_005679 NM_139353 |
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| RefSeq(タンパク質) | | NP_001230085 NP_001230086 NP_001230087 NP_001230088 NP_001230089 |
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NP_005670 NP_647610 |
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| 所在地(UCSC) | Chr 16: 84.18 – 84.19 MB | Chr 8: 120.32 – 120.33 MB |
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| PubMed検索 | [ 3 ] | [ 4 ] |
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| ウィキデータ |
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TATAボックス結合タンパク質関連因子RNAポリメラーゼIサブユニットCは、ヒトではTAF1C遺伝子によってコードされる酵素である。[ 5 ] [ 6 ]
関数
RNAポリメラーゼIによる転写の開始には、TATA結合タンパク質(TBP)とRNAポリメラーゼIに特異的な3つのTBP関連因子(TAF)からなる複合体の形成が必要である。SL1として知られるこの複合体は、リボソームRNA遺伝子のコアプロモーターに結合してポリメラーゼを適切な位置に配置し、調節シグナルのチャネルとして機能する。この遺伝子は、最大のSL1特異的TAFをコードしている。異なるアイソフォームをコードする2つの転写産物が同定されている。[ 6 ]
参考文献
- 1 2 3 GRCh38: Ensemblリリース89: ENSG00000103168 – Ensembl、2017年5月
- 1 2 3 GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000031832 – Ensembl、2017年5月
- ↑ 「ヒトPubMed参照:」。米国国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ↑ 「マウス PubMed 参照:」。米国国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ↑ Comai L 、Zomerdijk JC、Beckmann H、Zhou S、Admon A、Tjian R (1994)。「転写因子SL1の再構成:SL1またはTFIIDサブユニットによるTBPの排他的結合」。Science。266 ( 5193 ) : 1966–72。Bibcode : 1994Sci ... 266.1966C。doi : 10.1126 / science.7801123。PMID 7801123。
- 1 2 "Entrez Gene: TAF1C TATAボックス結合タンパク質(TBP)関連因子、RNAポリメラーゼI、C、110kDa"。
- ↑ Voit R、Grummt I (2001年11月) 「UBFのセリン388のリン酸化はRNAポリメラーゼIとの相互作用およびrDNA転写の活性化に必要である」。Proc . Natl . Acad . Sci. USA。98 ( 24 ) : 13631–6。Bibcode : 2001PNAS...9813631V。doi : 10.1073 / pnas.231071698。PMC 61092。PMID 11698641。
- ↑ Zhai W、Comai L(2000年8月)。「腫瘍抑制因子p53によるRNAポリメラーゼI転写の抑制」。Mol . Cell . Biol . 20(16):5930–8。doi:10.1128 / MCB.20.16.5930-5938.2000。PMC 86070。PMID 10913176。
さらに読む
- Di Pietro C、Rapisarda A、Amico V、Bonaiuto C、Viola A、Scalia M、Motta S、Amato A、Engel H、Messina A、Sichel G、Grzeschik K、Purrello M (2000)「クラスI一般転写開始因子SL1のTAF(I)48、TAF(I)63、TAF(I)110サブユニットをコードするヒト遺伝子TAF1A、TAF1B、TAF1Cのゲノム上の位置」Cytogenet . Cell Genet . 89 ( 1–2 ): 133–6 . doi : 10.1159/000015592 . PMID 10894955. S2CID 27014629 .
- ミラー G、パノフ KI、フリードリヒ JK、トリンクル・マルケイ L、ラモンド AI、ゾメルダイク JC (2001)。「hRRN3 は、SL1 を介した RNA ポリメラーゼ I の rRNA 遺伝子プロモーターへの動員に不可欠です。 」エンボ J . 20 (6): 1373 – 82. doi : 10.1093/emboj/20.6.1373。PMC 145519。PMID 11250903。
- Yuan X, Zhao J, Zentgraf H, Hoffmann-Rohrer U, Grummt I (2002). "RNAポリメラーゼI、TIF-IA、TAF(I)サブユニット間の複数の相互作用がリボソーム遺伝子プロモーターにおける開始前複合体の組み立てを制御する" . EMBO Rep . 3 (11): 1082– 7. doi : 10.1093/embo-reports/kvf212 . PMC 1307603 . PMID 12393749 .
- Yamamoto K, Yamamoto M, Hanada K, Nogi Y, Matsuyama T, Muramatsu M (2004). "RNAポリメラーゼI関連因子PAF49による複数のタンパク質間相互作用とrRNA転写におけるPAF49の役割" . Mol. Cell. Biol . 24 (14): 6338–49 . doi : 10.1128/MCB.24.14.6338-6349.2004 . PMC 434256 . PMID 15226435 .
- Grandori C、Gomez-Roman N、Felton-Edkins ZA、Ngouenet C、Galloway DA、Eisenman RN、White RJ (2005)。「c-MycはヒトのリボソームDNAに結合し、RNAポリメラーゼIによるrRNA遺伝子の転写を促進する」。Nat . Cell Biol . 7 (3): 311–8 . doi : 10.1038/ncb1224 . PMID 15723054. S2CID 8913931 .
- Friedrich JK、Panov KI、Cabart P、Russell J、Zomerdijk JC (2005)。 「TBP-TAF複合体SL1はRNAポリメラーゼIの開始前複合体の形成を誘導し、rDNAプロモーター上の上流結合因子を安定化する」。J . Biol. Chem . 280 (33): 29551–8 . doi : 10.1074/jbc.M501595200 . PMC 3858828. PMID 15970593 .
- Zhang C, Comai L, Johnson DL (2005). "PTENはSL1複合体を破壊することによりRNAポリメラーゼIの転写を抑制する" . Mol . Cell. Biol . 25 (16): 6899–911 . doi : 10.1128/MCB.25.16.6899-6911.2005 . PMC 1190253. PMID 16055704 .
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