ホモサピエンス種のタンパク質コード遺伝子
| SMTN |
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| 利用可能な構造 |
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| PDB | オルソログ検索: PDBe RCSB |
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| 識別子 |
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| エイリアス | SMTN、スムースリン |
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| 外部ID | オミム:602127; MGI : 1354727;ホモロジーン: 8482;ジーンカード:SMTN; OMA :SMTN - オルソログ |
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| 遺伝子の位置(マウス) |
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 | | クロ。 | 11番染色体(マウス)[2] |
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| | バンド | 11|11 A1 | 始める | 3,467,523 bp [2] |
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| 終わり | 3,490,612 bp [2] |
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| RNA発現パターン |
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| ブギー | | 人間 | マウス(相同遺伝子) |
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| トップの表現 | - 胃粘膜
- 膝窩動脈
- 脛骨動脈
- S状結腸の筋層
- 子宮体部
- 心の頂点
- 左子宮管
- 胸部大動脈下行
- 上行大動脈
- 右冠動脈
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| | トップの表現 | - 大動脈領域の中膜
- 上行大動脈
- 子宮
- リップ
- 大動脈弁
- 側頭筋
- 二腹筋
- 胸鎖乳突筋
- 上腕三頭筋
- 太ももの筋肉
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| | 参照表現データの詳細 |
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| バイオGPS | 
 | | 参照表現データの詳細 |
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| 遺伝子オントロジー |
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| 分子機能 | | | 細胞成分 |
- 細胞質
- 細胞骨格
- アクチン細胞骨格
- 微小管形成中心
- フィラメント状アクチン
- 核質
| | 生物学的プロセス |
- 平滑筋の収縮
- 筋肉器官の発達
- アクチン細胞骨格組織
| | 出典:Amigo / QuickGO |
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| オルソログ |
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| 種 | 人間 | ねずみ |
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| エントレズ | | |
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| アンサンブル | | |
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| ユニプロット | | |
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| RefSeq (mRNA) | |
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NM_001207017 NM_001207018 NM_006932 NM_134269 NM_134270 |
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NM_001159284 NM_001284427 NM_001284428 NM_001284429 NM_013870 |
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| RefSeq (タンパク質) | NP_001193946 NP_001193947 NP_008863 NP_599031 NP_599032
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NP_001369567 NP_001369568 NP_001369569 NP_001369570 NP_001369571 NP_001369572 NP_001369573 NP_001369574 NP_001369575 NP_001369576 NP_001369577 |
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NP_001152756 NP_001271356 NP_001271357 NP_001271358 NP_038898 |
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| 場所 (UCSC) | 22章: 31.06 – 31.1 Mb | 11 章: 3.47 – 3.49 Mb |
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| PubMed検索 | [3] | [4] |
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| ウィキデータ |
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スムーセリンは、ヒトではSMTN遺伝子によってコードされるタンパク質である。[5] [6] [7]
この遺伝子は、収縮性平滑筋細胞にのみ存在する構造タンパク質をコードする。ストレスファイバーと関連し、細胞骨格の一部を構成している。この遺伝子は、染色体22q12.3、TUPLE1遺伝子座の遠位、ディジョージ症候群欠失の外側に局在している。この遺伝子の選択的スプライシングにより、3つの転写変異体が生じる。[7]
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000183963 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000020439 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ Engelen JJ、Esterling LE、Albrechts JC、Detera-Wadleigh SD、van Eys GJ (1997 年 9 月)。「蛍光 in situ ハイブリダイゼーションおよび放射線ハイブリッド マッピングによるヒトのスムーセリン遺伝子 (SMTN) の染色体 22q12 への割り当て」。Genomics。43 ( 2 ) : 245–7。doi :10.1006/geno.1997.9999。PMID 9244445 。
- ^ ファン・デル・ループ FT、シャールト G、ティマー ED、ラマカース FC、ファン・エイス GJ (1996 年 9 月)。 「平滑筋細胞に特異的な新規細胞骨格タンパク質、スムーセリン」。Jセルバイオル。134 (2): 401-11。土井:10.1083/jcb.134.2.401。PMC 2120883。PMID 8707825。
- ^ ab 「Entrez Gene: SMTN スムースリン」。
さらに読む
- Luft FC (1999). 「あるスムーズオペレーターを別のスムーズオペレーターと区別する」J. Mol. Med . 77 (2): 255–7. doi :10.1007/s001090050347. PMID 10023778. S2CID 20566620.
- Maruyama K, Sugano S (1994). 「オリゴキャッピング:真核生物mRNAのキャップ構造をオリゴリボヌクレオチドで置き換える簡単な方法」Gene . 138 (1–2): 171–4. doi :10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
- van Eys GJ、Völler MC、Timmer ED、et al. (1997)。「スムーセリン発現特性:in vitroシステムにおける平滑筋細胞の開発と血管変異体の同定」。Cell Struct. Funct . 22 (1): 65–72. doi : 10.1247/csf.22.65 . hdl : 2066/28540 . PMID 9113392。
- Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, et al. (1997). 「全長濃縮および5'末端濃縮cDNAライブラリーの構築と特性評価」. Gene . 200 (1–2): 149–56. doi :10.1016/S0378-1119(97)00411-3. PMID 9373149.
- サンガーセンター、ワシントン大学ゲノムシークエンシングセンター (1999)。「完全なヒトゲノム配列に向けて」。 ゲノム研究8 ( 11): 1097–108。doi : 10.1101/gr.8.11.1097。PMID 9847074。
- Krämer J、Aguirre-Arteta AM、Thiel C、et al. (1999)。「平滑筋細胞分化マーカーであるスムーセリンの新規アイソフォーム」。J . Mol. Med . 77 (2): 294–8. doi :10.1007/s001090050352. PMID 10023782. S2CID 3017418.
- Johansson B、Eriksson A、Ramaekers F、Thornell L (2000)。「成人および発達中のヒトの動脈と心筋におけるスムーセリン」。Histochem . Cell Biol . 112 (4): 291–9. doi :10.1007/s004180050450. PMID 10550614. S2CID 10117431.
- Dunham I 、 Shimizu N、Roe BA、他 (1999)。「ヒト染色体22のDNA配列」。Nature . 402 ( 6761 ): 489–95。Bibcode :1999Natur.402..489D。doi : 10.1038/990031。PMID 10591208。
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- Beausoleil SA、Jedrychowski M、 Schwartz D、他 (2004)。「HeLa 細胞核リン酸化タンパク質の大規模特性評価」。Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 101 ( 33 ) : 12130–5。Bibcode :2004PNAS..10112130B。doi : 10.1073/ pnas.0404720101。PMC 514446。PMID 15302935。
- Rual JF、Venkatesan K、Hao T、他 (2005)。「ヒトタンパク質間相互作用ネットワークのプロテオームスケールマップに向けて」。Nature . 437 ( 7062 ) : 1173–8。Bibcode :2005Natur.437.1173R。doi : 10.1038 /nature04209。PMID 16189514。S2CID 4427026。