真核生物における遺伝子群の転写を制御するタンパク質
| スピブ |
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| 識別子 |
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| エイリアス | SPIB、SPI-B、Spi-B転写因子 |
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| 外部ID | オミム:606802; MGI : 892986;ホモロジーン: 79220;ジーンカード:SPIB; OMA :SPIB - オルソログ |
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| 遺伝子の位置(マウス) |
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 | | クロ。 | 染色体7(マウス)[2] |
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| | バンド | 7 B3|7 28.83 cM | 始める | 44,175,417 bp [2] |
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| 終わり | 44,181,495 bp [2] |
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| RNA発現パターン |
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| ブギー | | 人間 | マウス(相同遺伝子) |
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| トップの表現 | - リンパ節
- 横行結腸粘膜
- 付録
- 顆粒球
- 頬粘膜細胞
- 脾臓
- 直腸
- 回腸粘膜
- 鼻咽頭上皮
- 血
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| | トップの表現 | - 腸間膜リンパ節
- 脾臓
- 脛骨大腿関節
- 血
- 顆粒球
- 皮下脂肪組織
- 顎下腺
- 骨髄
- 胸腺
- 大腿骨
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| | 参照表現データの詳細 |
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| バイオGPS |  | | 参照表現データの詳細 |
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| 遺伝子オントロジー |
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| 分子機能 |
- DNA結合転写因子活性
- 配列特異的DNA結合
- DNA結合
- RNAポリメラーゼIIシス調節領域配列特異的DNA結合
- DNA結合転写活性化因子活性、RNAポリメラーゼII特異的
- DNA結合転写因子活性、RNAポリメラーゼII特異的
| | 細胞成分 | | | 生物学的プロセス |
- RNAポリメラーゼIIによる転写の調節
- 細胞分化
- 転写の調節、DNAテンプレート
- 転写、DNAテンプレート
- RNAポリメラーゼIIによる転写
- RNAポリメラーゼIIによる転写の正の制御
| | 出典:Amigo / QuickGO |
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| オルソログ |
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| 種 | 人間 | ねずみ |
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| エントレズ | | |
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| アンサンブル | | |
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| ユニプロット | | |
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| RefSeq (mRNA) | |
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NM_003121 NM_001243998 NM_001243999 NM_001244000 |
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| RefSeq (タンパク質) | |
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NP_001230927 NP_001230928 NP_001230929 NP_003112 |
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| 場所 (UCSC) | 19章: 50.42 – 50.43 Mb | 7 章: 44.18 – 44.18 Mb |
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| PubMed検索 | [3] | [4] |
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| ウィキデータ |
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転写因子Spi-Bは、ヒトではSPIB遺伝子によってコードされるタンパク質である。[5] [6]
関数
SPI1 (MIM 165170) と SPIB は、ETS (ETS1、MIM 164720 を参照) 転写因子のサブファミリーのメンバーです。ETS タンパク質は、特定の DNA 結合を媒介する保存された ETS ドメインを共有しています。SPIB と SPI1 は、プリンを多く含む配列である PU ボックス (5-プライム-GAGGAA-3-プライム) に結合します。[OMIM 提供] [6]
インタラクション
SPIBはMAPK3 [7]およびMAPK8と相互作用することが示されている。[7]
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000269404 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000008193 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ Ray D、Bosselut R、Ghysdael J、Mattei MG、Tavitian A、Moreau-Gachelin F (1992 年 10 月)。「推定腫瘍タンパク質 Spi-1/PU.1 に関連する転写因子 Spi-B の特性」。分子細胞生物学。12 (10): 4297–304。doi :10.1128/ mcb.12.10.4297。PMC 360353。PMID 1406622 。
- ^ ab "Entrez Gene: SPIB Spi-B転写因子(Spi-1/PU.1関連)".
- ^ ab Mao C, Ray-Gallet D, Tavitian A, Moreau-Gachelin F (1996年2月). 「Spi-BおよびSpi-1転写因子の異なるリン酸化」. Oncogene . 12 (4): 863–73. PMID 8632909.
さらに読む
- Maruyama K, Sugano S (1994年1月). 「オリゴキャッピング: 真核生物mRNAのキャップ構造をオリゴリボヌクレオチドで置換する簡単な方法」. Gene . 138 (1–2): 171–4. doi :10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
- Mao C、Ray-Gallet D、Tavitian A、Moreau-Gachelin F (1996 年 2 月)。「Spi-B および Spi-1 転写因子の異なるリン酸化」。Oncogene。12 ( 4 ) : 863–73。PMID 8632909 。
- Ray-Gallet D、Tavitian A、Moreau-Gachelin F (1996年6 月)。「Spi-B 転写因子の選択的スプライシングアイソフォーム」。生化学および生物物理学的研究通信。223 (2): 257–63。doi : 10.1006 /bbrc.1996.0881。PMID 8670269 。
- Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (1997年10月). 「全長濃縮cDNAライブラリーおよび5'末端濃縮cDNAライブラリーの構築と特性評価」. Gene . 200 (1–2): 149–56. doi :10.1016/S0378-1119(97)00411-3. PMID 9373149.
- Rao S、Matsumura A、Yoon J、Simon MC (1999 年 4 月)。「SPI-B は、独自のプロリン、セリン、スレオニンドメインを介して転写を活性化し、PU.1 とは異なる DNA 結合親和性を示します」。The Journal of Biological Chemistry。274 ( 16): 11115–24。doi : 10.1074 / jbc.274.16.11115。PMID 10196196 。
- Nagy M、Chapuis B、Matthes T (2002 年 2 月)。「正常なヒト形質細胞および多発性骨髄腫細胞における転写因子 Pu.1、Spi-B、Blimp-1、BSAP、および oct-2 の発現」。British Journal of Haematology。116 ( 2 ) : 429–35。doi : 10.1046/j.1365-2141.2002.03271.x。PMID 11841448。S2CID 22132659 。
- 山本 浩、木原 根岸 文、山田 孝、鈴木 正、中野 孝、及川 哲也 (2002 年 2 月)。「造血 Ets 転写因子 Spi-B とコアクチベーター CREB 結合タンパク質の相互作用は c-Myb との負のクロストークと関連している」。細胞増殖と分化。13 (2): 69–75。PMID 11864910 。
- Schotte R、Rissoan MC、Bendriss-Vermare N、Bridon JM、Duhen T、Weijer K、Brière F、Spits H (2003 年 2 月)。「転写因子 Spi-B は形質細胞様 DC 前駆細胞で発現し、T 細胞、B 細胞、NK 細胞の発達を阻害する」。Blood。101 ( 3 ) : 1015–23。doi : 10.1182 /blood- 2002-02-0438。PMID 12393575 。
- Schotte R、Nagasawa M、Weijer K、Spits H 、 Blom B (2004 年 12 月)。「ETS 転写因子 Spi-B はヒト形質細胞様樹状細胞の発生に必要である」( PDF )。The Journal of Experimental Medicine。200 ( 11): 1503–9。doi :10.1084/ jem.20041231。PMC 2211952。PMID 15583020。
- ルアル JF、ヴェンカテサン K、ハオ T、弘實=岸川 T、ドリコット A、リー N、ベリス GF、ギボンズ FD、ドレーゼ M、アイヴィ=グエデフスー N、クリットゴード N、サイモン C、ボクセム M、ミルスタイン S、ローゼンバーグ J、ゴールドバーグDS、チャン LV、ウォン SL、フランクリン G、リー S、アルバラ JS、リム J、フロートン C、ラモサス E、セビック S、ベックス C、ラメシュ P、シコルスキー RS、ヴァンデンハウト J、ゾグビ HY、スモリャル A、ボサク S、セケーラ R、ドゥセット スタム L、キュージック ME、ヒル DE、ロス FP、ビダル M ( 2005 年 10 月)。 「ヒトタンパク質間相互作用ネットワークのプロテオームスケールマップに向けて」。自然。437 (7062): 1173–8. Bibcode :2005Natur.437.1173R. doi :10.1038/nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
- Geng CD、Vedeckis WV (2005 年 12 月)。「c-Myb および c-Ets 転写因子ファミリーのメンバーは、ヒトグルココルチコイド受容体 1A プロモーターの反対のステロイド制御を媒介する分子スイッチとして機能します。」The Journal of Biological Chemistry。280 ( 52): 43264–71。doi : 10.1074/ jbc.M508245200。PMID 16263717。
- Dontje W、Schotte R、Cupedo T、Nagasawa M、Scheeren F、Gimeno R、Spits H、Blom B (2006 年 3 月)。「Delta-like1 誘導 Notch1 シグナル伝達は、GATA-3 および Spi-B の制御を介して、ヒト形質細胞様樹状細胞と T 細胞系統の決定を制御します」。Blood。107 ( 6 ) : 2446–52。doi : 10.1182 /blood-2005-05-2090。PMID 16317090。
外部リンク
- 米国国立医学図書館の医学主題標目表(MeSH)における SPIB+タンパク質、+ヒト
この記事には、パブリックドメインである米国国立医学図書館のテキストが組み込まれています。