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| 膵臓リボヌクレアーゼ | |||||||||
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 RNase Aの構造 | |||||||||
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| EC番号 | 4.6.1.18 | ||||||||
| CAS番号 | 9001-99-4 | ||||||||
| データベース | |||||||||
| インテンズ | IntEnzビュー | ||||||||
| ブレンダ | BRENDAエントリー | ||||||||
| エクスパス | NiceZyme ビュー | ||||||||
| ケッグ | KEGGエントリー | ||||||||
| メタサイク | 代謝経路 | ||||||||
| プリアモス | プロフィール | ||||||||
| PDB構造 | RCSB PDB PDBe PDBsum | ||||||||
| 遺伝子オントロジー | アミゴー / クイックゴー | ||||||||
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| 膵臓リボヌクレアーゼ | |||||||||||
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| 識別子 | |||||||||||
| シンボル | RNaseA | ||||||||||
| パム | PF00074 | ||||||||||
| インタープロ | 著作権 | ||||||||||
| 頭いい | SM00092 | ||||||||||
| プロサイト | PDOC00118 | ||||||||||
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膵臓リボヌクレアーゼファミリー（EC 4.6.1.18、RNase、RNase I、RNase A、膵臓RNase、リボヌクレアーゼI、エンドリボヌクレアーゼI、リボ核酸ホスファターゼ、アルカリリボヌクレアーゼ、リボヌクレアーゼ、遺伝子S糖タンパク質、Ceratitis capitataアルカリリボヌクレアーゼ、SLSG糖タンパク質、遺伝子S遺伝子座特異的糖タンパク質、S遺伝子型関連糖タンパク質、リボ核酸3'-ピリミジノオリゴヌクレオチドヒドロラーゼ）は、特定の哺乳類と一部の爬虫類の膵臓に大量に見られるピリミジン特異的エンドヌクレアーゼのスーパーファミリーです。[1]
具体的には、酵素は、2',3'-環状リン酸中間体を持つ CP または UP で終わる3'-ホスホモノヌクレオチドおよび 3'-ホスホオリゴヌクレオチドのエンドヌクレアーゼ切断に関与しています。リボヌクレアーゼは一本鎖 RNA と複合体を形成することでRNAらせんをほどくことができます。この複合体は、酵素のリジンおよびアルギニン残基とヌクレオチドのリン酸基との間の拡張された多部位陽イオン-陰イオン相互作用によって生成されます。
著名な家族
ウシ膵臓リボヌクレアーゼは、このファミリーの中で最も研究が進んでいるメンバーであり、タンパク質の折り畳み、ジスルフィド結合の形成、タンパク質の結晶構造解析と分光法、タンパク質のダイナミクスに関する研究でモデルシステムとして機能してきました。[2]ヒトゲノムには、ウシ膵臓リボヌクレアーゼと構造と機能を共有する8つの遺伝子と、さらに5つの疑似遺伝子が含まれています。これらの酵素の構造とダイナミクスは、その多様な生物学的機能に関連しています。[3]
膵臓リボヌクレアーゼスーパーファミリーに属する他のタンパク質には、ウシ精嚢および脳リボヌクレアーゼ、腎臓非分泌リボヌクレアーゼ、[4]肝臓型リボヌクレアーゼ、[5] 正常組織および悪性組織の血管新生を誘導するアンジオジェニン、リボヌクレアーゼ活性を持つ細胞毒および蠕虫毒である好酸球カチオンタンパク質、[6]カエル肝臓リボヌクレアーゼおよびカエルシアリン酸結合レクチンなどがある。膵臓リボヌクレアーゼの配列には、4つの保存されたジスルフィド結合と、触媒活性に関与する3つのアミノ酸残基が含まれている。[7]
人間の遺伝子
このドメインを含むタンパク質をコードするヒト遺伝子には以下のものがあります。
細胞毒性
膵リボヌクレアーゼファミリーの一部のメンバーは細胞毒性効果を持っています。哺乳類細胞はリボヌクレアーゼ阻害剤（RI）に対する非常に高い親和性によりこれらの効果から保護されており、RIは細胞RNAを膵リボヌクレアーゼによる分解から保護します。[8] RIによって阻害されない膵リボヌクレアーゼは、 αサルシン、ジフテリア毒素、またはリシンとほぼ同程度の毒性があります。[9]
キタヒョウガエルの卵母細胞から分離された2つの膵臓リボヌクレアーゼ、アンフィナーゼとランピルナーゼはRIによって阻害されず、腫瘍細胞に対して異なる細胞毒性を示します。[10]ランピルナーゼは中皮腫の治療候補として第III相臨床試験で研究されましたが、この試験では主要評価項目に対する統計的有意性は示されませんでした。[11]
参考文献
- ^ Beintema JJ、van der Laan JM (1986)。「カメ膵臓リボヌクレアーゼの構造と哺乳類リボヌクレアーゼの構造の比較」。FEBS Lett . 194 (2): 338–343. doi : 10.1016/0014-5793(86)80113-2 . PMID 3940901. S2CID 21907373.
- ^ Marshall GR、Feng JA 、Kuster DJ (2008)。「バック・トゥ・ザ・フューチャー：リボヌクレアーゼA」。バイオポリマー。90 ( 3 ) : 259–77。doi : 10.1002 /bip.20845。PMID 17868092。S2CID 2905312。
- ^ Narayanan C, Bernard DN, Bafna K, Gagné D, Chennubhotla CS, Doucet N, Agarwal PK (2018年3月). 「酵素スーパーファミリーにおける生物学的機能に関連するダイナミクスの保存」. Structure . 26 (3): 426–436. doi :10.1016/j.str.2018.01.015. PMC 5842143. PMID 29478822 .
- ^ Rosenberg HF, Tenen DG, Ackerman SJ (1989). 「ヒト好酸球由来神経毒の分子クローニング：リボヌクレアーゼ遺伝子ファミリーの一員」Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 86 (12): 4460–4464. Bibcode :1989PNAS...86.4460R. doi : 10.1073/pnas.86.12.4460 . PMC 287289 . PMID 2734298.
- ^ Hofsteenge J、Matthies R、 Stone SR (1989)。「リボヌクレアーゼスーパーファミリーの新メンバー、ブタ肝臓由来リボヌクレアーゼの一次構造」。生化学。28 ( 25): 9806–9813。doi :10.1021/bi00451a040。PMID 2611266 。
- ^ Rosenberg HF、Ackerman SJ、Tenen DG (1989)。「ヒト好酸球カチオンタンパク質。リボヌクレアーゼ活性を持つ細胞毒素およびヘルミントトキシンの分子クローニング」。J . Exp. Med . 170 (1): 163–176. doi :10.1084/jem.170.1.163. PMC 2189377. PMID 2473157 。
- ^ Raines RT (1998). 「リボヌクレアーゼA」. Chem. Rev. 98 ( 3): 1045–1066. doi :10.1021/cr960427h. PMID 11848924.
- ^ Gaur, D; Swaminathan, S; Batra, JK (2001 年 7 月 6 日). 「ヒト膵臓リボヌクレアーゼとヒトリボヌクレアーゼ阻害剤との相互作用。阻害剤耐性細胞傷害性変異体の生成」。The Journal of Biological Chemistry . 276 (27): 24978–84. doi : 10.1074/jbc.m102440200 . PMID 11342552.
- ^ Saxena, SK; Rybak, SM; Winkler, G; Meade, HM; McGray, P; Youle, RJ; Ackerman, EJ (1991 年 11 月 5 日)。「アフリカツメガエル卵母細胞への注入における RNase と毒素の比較」。The Journal of Biological Chemistry 。266 ( 31 ) : 21208–14。doi : 10.1016/S0021-9258(18)54842-0。PMID 1939163。
- ^ Lee JE、Raines RT (2008)。 「新しい化学 療法剤としてのリボヌクレアーゼ：ランピルナーゼの例」。BioDrugs。22 (1): 53–58。doi : 10.2165 /00063030-200822010-00006。PMC 2802594。PMID 18215091。
- ^ 「Alfacell Annual Report 2009」（PDF） 。 2015年2月2日閲覧。
