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| 熱ショック遺伝子発現抑制（ROSE）要素 | |
|---|---|
 | |
| 識別子 | |
| シンボル | 薔薇 |
| Rfam | RF00435 |
| その他のデータ | |
| RNAタイプ | シス-reg ; 体温調節器 |
| ドメイン | 細菌 |
| それで | 0000204 0000000 |
| PDB構造 | PDBe |
熱ショック遺伝子発現抑制（ROSE）エレメントは、一部の熱ショックタンパク質のmRNAの5' UTRに見られるRNAエレメントです。ROSEエレメントは、熱ショック遺伝子発現を負に制御するRNA温度計です。二次構造は温度によって変化すると考えられているため、RNA温度計です。この構造は、常温ではリボソーム結合部位へのアクセスをブロックします。しかし、熱ショック時には構造が変化し、リボソーム結合部位が解放され、発現が可能になります。[2] [3]
このRNA要素の部分構造はNMRを用いて決定されている。[1]
薔薇1ローズAT2
ROSE 1とROSE AT2はROSEエレメントの具体例です。[4] ROSE 1はBradyrhizobium japonicumに見られ、ROSE AT2はAgrobacterium tumefaciens由来の近縁エレメントです。2つのRNAエレメントは類似した二次構造を持ち、ROSE 1には余分なヘアピンがあります。[4]すべてのROSEエレメントには、シャイン・ダルガルノ配列結合部位の反対側に特徴的な「膨らんだG」が含まれており、このヌクレオチドがないとRNA温度計は温度感度を失います。[5]
イプバ
シュードモナス属の熱ショックタンパク質IpbAの発現は、ROSE型RNA温度計によって制御されています。この温度計は2つのヘアピンのみで構成されています。低温ではIpbAの翻訳を阻害し、温度が上昇すると翻訳を許可します。 [6]
rhlAそしてlsdIROSEのような要素
緑膿菌の クオラムセンシング依存性毒性因子は温度調節が可能であり、 rhlAの5'UTRに存在するROSE温度計とlasIの5'UTRに存在するROSE様温度計は低温での翻訳を阻害する。 [7]
参照
参考文献
- ^ ab チョードリー S、マリス C、アレイン FH、ナーバーハウス F (2006)。 「RNA温度計による温度感知の分子基盤」。エンボ J . 25 (11): 2487–2497。土井：10.1038/sj.emboj.7601128。PMC 1478195。PMID 16710302。
- ^ Nocker, A; Hausherr T; Balsiger S; Krstulovic NP; Hennecke H; Narberhaus F (2001). 「mRNA ベースの温度センサーが根粒菌の熱ショック遺伝子の発現を制御する」Nucleic Acids Res . 29 (23): 4800–4807. doi :10.1093/nar/29.23.4800. PMC 96696 . PMID 11726689.
- ^ Balsiger, S; Ragaz C; Baron C; Narberhaus F (2004). 「Agrobacterium tumefaciens における小型熱ショック遺伝子のレプリコン特異的制御」J Bacteriol . 186 (20): 6824–6829. doi :10.1128/JB.186.20.6824-6829.2004. PMC 522190. PMID 15466035 .
- ^ ab Narberhaus F、Waldminghaus T、Chowdhury S (2006 年 1 月)。「RNA 温度計」。FEMS Microbiol. Rev. 30 ( 1): 3–16. doi :10.1111/j.1574-6976.2005.004.x. PMID 16438677。
- ^ Nocker A、Hausherr T、Balsiger S、Krstulovic NP、Hennecke H、Narberhaus F (2001 年 12 月)。「mRNA ベースの温度センサーが根粒菌の熱ショック遺伝子の発現を制御する」。Nucleic Acids Res . 29 (23): 4800–4807. doi :10.1093/nar/29.23.4800. PMC 96696 . PMID 11726689。
- ^ Krajewski, SS; Nagel, M; Narberhaus, F (2013). 「短いROSEのようなRNA温度計がPseudomonas種のIbpA合成を制御する」. PLOS ONE . 8 (5): e65168. Bibcode :2013PLoSO...865168K. doi : 10.1371/journal.pone.0065168 . PMC 3669281. PMID 23741480 .
- ^ グロッソ・ベセーラ、マリア・ヴィクトリア;クロダ・ガルシア、ヘラルド。メリノ、エンリケ。ルイス、セルビン・ゴンザレス。モヒカ・エスピノーサ、ラウール。ソベロン・チャベス、グロリア (2014-10-28)。 「2つの新しいRNA温度計による緑膿菌の病原性因子の制御」。アメリカ合衆国国立科学アカデミーの議事録。111 (43): 15562–15567。Bibcode :2014PNAS..11115562G。土井：10.1073/pnas.1402536111。ISSN 1091-6490。PMC 4217398。PMID 25313031。
さらに読む
- De La Fuente, M.; Valera, S.; Martínez-Guitarte, JL (2012). 「NcRNA と体温調節: 原核生物と真核生物の視点」. FEBS Letters . 586 (23): 4061–4069. doi : 10.1016/j.febslet.2012.10.018 . PMID 23098758.
外部リンク
- Rfamの熱ショック遺伝子発現抑制 (ROSE) 要素のページ