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| アヴァショート 5' UTR 温度計 | |
|---|---|
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| 識別子 | |
| Rfam | RF02699 |
| その他のデータ | |
| ドメイン | 細菌 |
| 行く | GO:0009266、GO:0045974 |
| それで | SO:0005836、SO:0000204 |
| PDB構造 | PDBe |
| アバロン 5' UTR 温度計 | |
|---|---|
 | |
| 識別子 | |
| Rfam | RF02698 |
| その他のデータ | |
| ドメイン | 細菌 |
| 行く | GO:0009266、GO:0045974 |
| それで | SO:0005836、SO:0000204 |
| PDB構造 | PDBe |
最初のシアノバクテリアRNA温度計（RNAT）Hsp17は、Synechocystis熱ショックhsp17 mRNAの5'UTRで発見されました。 [1]さらなる研究により、シアノバクテリアは熱ショック遺伝子の翻訳を制御するためにRNATをよく使用することが実証されました。HspAは、好熱性シアノバクテリアThermosynechococcus elongatusのHsp17の相同遺伝子です。さらに2つの温度計が、中温性シアノバクテリアA. variabilisとNostoc spの5'UTRで発見されました。avashortと呼ばれる最初のRNATは、 AUG翻訳開始部位をマスクすることで翻訳を制御することが示されました。avalongと呼ばれる2番目のRNATは、最初のヘアピンが拡張されているため、三次相互作用を伴う可能性があり、 ROSE要素と類似しています。[2]
参考文献
- ^ Kortmann J、Sczodrok S、Rinnenthal J、 Schwalbe H 、 Narberhaus F (2011 年 4 月)。「シンプルな RNA ベース の温度センサーによるオンデマンド翻訳」。核酸研究。39 ( 7): 2855–2868。doi :10.1093/nar/gkq1252。PMC 3074152。PMID 21131278。
- ^ Cimdins A, Klinkert B, Aschke-Sonnenborn U, Kaiser FM, Kortmann J, Narberhaus F (2014-01-01). 「RNA温度計による中温および高温シアノバクテリアの小型熱ショック遺伝子の翻訳制御」. RNA Biology . 11 (5): 594–608. doi :10.4161/rna.28648. PMC 4152365. PMID 24755616 .