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| アルファコロナウイルス | |
|---|---|
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| 豚流行性下痢ウイルスのゲノムとウイルス粒子の構造 | |
ウイルスの分類 
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| (ランク外): | ウイルス |
| 領域: | リボビリア |
| 王国： | オルタナウイルス科 |
| 門: | ピスビリコタ |
| クラス： | ピソニビリセテス |
| 注文： | ニドウイルス目 |
| 家族： | コロナウイルス科 |
| 亜科: | オルソコロナウイルス |
| 属: | アルファコロナウイルス |
| 亜属と種 | |
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テキストを参照 | |
アルファコロナウイルス（Alpha-CoV）は、コロナウイルスの4つの属（アルファ、ベータ、ガンマ、デルタ）の最初の属に属します。これらはプラス鎖の一本鎖RNAウイルスで、ヒトを含む哺乳類に感染します。これらは、スパイクタンパク質の三量体によって形成されたクラブ型の表面突起を持つ球状のウイルス粒子と、ウイルスエンベロープを持っています。
アルファコロナウイルスは、コロナウイルス科のオルトコロナウイルス亜科に属します。アルファコロナウイルスとベータコロナウイルスの系統は両方ともコウモリのウイルス遺伝子プールから派生しています。[1] [2]アルファコロナウイルスは以前は「系統群1コロナウイルス」 として知られていました。
アルファコロナウイルス属は、特にコウモリにおいて非常に多様です。コウモリ由来の株のほとんどは、実験室で分離および培養に成功していません。他の哺乳類種に感染するアルファコロナウイルスは、はるかによく研究されています。コロナウイルスの生分離株のリストを参照してください。
語源
アルファコロナウイルスという名前は、古代ギリシャ語のἄλφα（álpha 、「ギリシャ語のアルファベットの最初の文字」）と、王冠を意味するκορώνη（korṓnē、「花輪、花冠」）に由来しており、電子顕微鏡で観察すると太陽コロナに似た表面突起の外観を表しています。[3]
構造
ウイルス粒子はエンベロープで覆われ、直径120～160nm、コアシェルは約65nmの球形です。糖タンパク質と三量体は大きな表面突起を形成し、太陽コロナのような外観を作り出します。この属は他のコロナウイルスと同様に、I型融合機構（S2）と受容体結合ドメイン（S1）を持つスパイクタンパク質を持っています。これは三量体に組み立てられます。ベータコロナウイルスやガンマコロナウイルスとは異なり、このタンパク質は2つに切断されません。[4]
ゲノム
ゲノムはプラス鎖の一本鎖RNAで、長さは27～29キロベース、3'-ポリAテールです。ゲノムの5'末端にある2つの大きな重複ORFは、リボソームフレームシフトによって融合タンパク質として発現される主要な非構造タンパク質をコードしています。これらには、プロテアーゼ、ヘリカーゼ、RNAポリメラーゼのモチーフを含む領域が含まれます。下流には構造タンパク質をコードする7つの遺伝子があります。これらは、3'末端のサブゲノムmRNAのネストされたセットから発現されます。
組み換え
アルファコロナウイルス1の両タイプ、ネココロナウイルス（FCoV）とイヌコロナウイルス（CCoV）は、2つの血清型が存在することが知られています。血清型IIはアミノペプチダーゼNを標的とし、血清型Iの受容体は不明です。この違いは、異なるスパイクタンパク質によるものです。[6] FCoVとCCoVには共通の祖先がいます。この祖先は徐々にFCoV IとCCoV Iに進化しました。未知のウイルスのSタンパク質が祖先に組み換えられ、CCoV IIが生成されました。CCoV IIは再びFCoVと組み換えられ、FCoV IIが生成されました。CCoV IIは徐々にTGEVに進化しました。TGEVのスパイクが欠失するとPRCVが生成されます。これらのウイルスはすべて、テガコウイルス亜属に分類されます。[6]
分類
以下の亜属と種が認められている：[7]
参照
参考文献
- ^ Woo, PC; Wang, M.; Lau, SK; Xu, H.; Poon, RW; Guo, R.; Wong, BH; Gao, K.; Tsoi, HW; Huang, Y.; Li, KS; Lam, CS; Chan, KH; Zheng, BJ; Yuen, KY (2007). 「3つの新規グループ2cおよびグループ2dコロナウイルスの12ゲノムの比較分析により、独自のグループおよびサブグループの特徴が明らかになった」。Journal of Virology . 81 (4): 1574–85. doi :10.1128/JVI.02182-06. PMC 1797546. PMID 17121802 .
- ^ ラウ、サウスカロライナ州;うーん、PC。そう、CC。ファン、RY;黄、Y.ワン、M。グオ、R.ラム、CS;アラスカ州ツァン;ライ、KK;チャン、KH;チェ、XY;鄭、BJ;ケンタッキー州ユエン（2012）。 「家ウサギからの新規ベータコロナウイルスサブグループAコロナウイルス、ウサギコロナウイルスHKU14の分離と特性評価」。ウイルス学ジャーナル。86 (10): 5481–96。土井：10.1128/JVI.06927-11。PMC 3347282。PMID 22398294。
- ^ デカロ、ニコラ (2011). 「アルファコロナウイルス」。Springer のウイルス インデックス。 371–383ページ。土井：10.1007/978-0-387-95919-1_56。ISBN 978-0-387-95918-4.S2CID 216061230 。
- ^ Wrapp, Daniel; McLellan, Jason S.; Gallagher, Tom (2019年11月13日). 「融合前構造における豚流行性下痢ウイルススパイクタンパク質の3.1オングストロームクライオ電子顕微鏡構造」。Journal of Virology . 93 (23): e00923-19. doi :10.1128/JVI.00923-19. PMC 6854500. PMID 31534041 .
- ^ Le Poder, Sophie (2011-07-31). 「ネコとイヌのコロナウイルス：共通の遺伝的および病理生物学的特徴」。Advances in Virology . 2011 : 609465. doi : 10.1155/2011/609465 . PMC 3265309 . PMID 22312347.
- ^ ab Jaimes, Javier A.; Millet, Jean K.; Stout, Alison E.; André, Nicole M.; Whittaker, Gary R. (2020年1月10日). 「2つのウイルスの物語：ネココロナウイルスの異なるスパイク糖タンパク質」.ウイルス. 12 (1): 83. doi : 10.3390/v12010083 . PMC 7019228. PMID 31936749 .
- ^ 「ウイルス分類：2019年リリース」。talk.ictvonline.org。国際ウイルス分類委員会。 2020年6月20日閲覧。
外部リンク
- http://viralzone.expasy.org/all_by_protein/766.html