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| ベータコロナウイルスNS6タンパク質 | |||||||||
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| 識別子 | |||||||||
| シンボル | 新型コロナウイルス | ||||||||
| パム | PF12133 | ||||||||
| インタープロ | 著作権 | ||||||||
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ORF6は、 SARS-CoVやSARS-CoV-2を含むサルベコウイルス亜属のコロナウイルスのウイルス補助タンパク質をコードする遺伝子である。MERS-CoVには存在しない。インターフェロン拮抗作用を介してウイルス感染に対する免疫系の反応を低下させると考えられている。[1] [2] [3]
構造
ORF6タンパク質は、SARS-CoVでは63アミノ酸残基長[2] 、 SARS-CoV-2では61アミノ酸残基長とかなり小さい。[3] ORF6配列は十分に保存されておらず、2つのウイルス間の配列同一性は約66％と比較的低い。[4] ORF6は膜に結合する両親媒性のN末端αヘリックスを持つが、膜貫通タンパク質ではない。約20残基のC末端テールは極性があり、細胞質まで伸びており、タンパク質輸送のためのシグナル配列を含む。[1] [2]
表現とローカリゼーション
ORF6遺伝子は、他の補助タンパク質の遺伝子と同様に、コロナウイルスRNAゲノムの5'末端にある構造タンパク質をコードする遺伝子の近くに位置している。ORF7a 、ORF7b、ORF8とともに、ORF6は膜（M）遺伝子とヌクレオカプシド（N）遺伝子の間に位置する。[1] [2] [3] ORF6は小胞体とゴルジ体に局在しており、[1] [2] [3] SARS-CoV-2の研究では、オートファゴソームやリソソームなどの小胞との関連も示されている。[3]
関数
ORF6タンパク質の主な機能は免疫調節とインターフェロン拮抗作用であると考えられています。ウイルスの複製には必須ではありませんが、それが存在しないと複製効率が低下するようです。[1] [2]
ウイルスタンパク質相互作用
SARS-CoVの研究では、 ORF6タンパク質が別のウイルスアクセサリタンパク質であるORF9bタンパク質とタンパク質間相互作用を示すことが示唆されています。 [1] [5] SARS-CoVでは、組み換えマウス肝炎ウイルスとは異なり、ORF6タンパク質がウイルス様粒子と成熟ウイルス粒子で検出されており、これがマイナーなウイルス構造タンパク質である可能性があることを示唆しています。[1] [2]
免疫効果
SARS-CoVとSARS-CoV-2の両方のORF6タンパク質はインターフェロン拮抗薬であり、免疫回避に関与していると考えられています。この効果を媒介する宿主細胞タンパク質とのいくつかのタンパク質間相互作用が報告されています。STAT転写因子の核内輸入を阻害し、インターフェロンの活性化を阻害することが報告されています。[1] [3] SARS-CoVの研究では、これがORF6タンパク質とカリオフェリンの結合によって媒介される可能性があると報告されています。[1] [4] SARS-CoV-2では、ORF6タンパク質がRAE1およびNUP98と相互作用し、カリオフェリン相互作用を阻害すると報告されています。[3] [6]
参考文献
- ^ abcdefghi Liu DX、Fung TS、Chong KK、Shukla A、Hilgenfeld R (2014年9月)。「SARS-CoVおよびその他のコロナウイルスのアクセサリータンパク質」。抗ウイルス研究。109 ：97–109。doi ：10.1016 /j.antiviral.2014.06.013。PMC 7113789。PMID 24995382。
- ^ abcdefg McBride R、Fielding BC（2012年11月）。「重症急性呼吸器症候群（ SARS ）コロナウイルスアクセサリタンパク質のウイルス病原性における役割」。 ウイルス。4（11）：2902–2923。doi ：10.3390/ v4112902。PMC 3509677。PMID 23202509。
- ^ abcdefg Redondo N、Zaldívar-López S、Garrido JJ、 Montoya M（2021年7月7日）。「ウイルス病原性におけるSARS-CoV-2アクセサリータンパク質：既知と未知」 。Frontiers in Immunology。12 ： 708264。doi ： 10.3389 / fimmu.2021.708264。PMC 8293742。PMID 34305949。
- ^ ab Suryawanshi RK、Koganti R、Agelidis A、Patil CD、Shukla D（2021年3月）。「SARS-CoV-2による細胞シグナル伝達の調節異常」。Trends in Microbiology。29 （3 ）： 224–237。doi ：10.1016 /j.tim.2020.12.007。PMC 7836829。PMID 33451855。
- ^ カルボ E、デディエゴ ML、ガルシア P、ロペス JA、ペレス＝ブレーニャ P、ファルコン A (2012 年 10 月)。 「重症急性呼吸器症候群コロナウイルスアクセサリータンパク質6と9bは生体内で相互作用する」。ウイルス研究。169 (1): 282–288。土井:10.1016/j.virusres.2012.07.012。PMC 7114373。PMID 22820404。
- ^ Miorin L, Kehrer T, Sanchez-Aparicio MT, Zhang K, Cohen P, Patel RS, et al. (2020年11月). 「SARS-CoV-2 Orf6はNup98をハイジャックしてSTAT核内輸送をブロックし、インターフェロンシグナル伝達に拮抗する」。米国科学アカデミー 紀要。117 ( 45 ): 28344– 28354。Bibcode :2020PNAS..11728344M。doi : 10.1073/ pnas.2016650117。PMC 7668094。PMID 33097660。