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RXNOオントロジーは、化学反応の正式なオントロジーです。[1] [2] これはもともと英国王立化学協会（RSC）で開発され、 Open Biomedical Ontologies Foundryと関連しています。RXNOオントロジーは、メルクインデックスやCarey、Laffan、Thomson、Williamsの階層など、化学反応を体系化するこれまでのいくつかの試みを統合しています。[3] [4]
主な反応カテゴリー
ケアリー、ラファン、トンプソン、ウィリアムズによって提案された12のトップレベルの反応カテゴリが、該当する場合はRXNOオントロジー識別子と同等のWikipediaカテゴリとともに以下の表に示されています。[3]
名前の反応
次の表は、いくつかの例の名前反応の RXNO 識別子を示しています。
- RXNO:0000003パーキン反応
- RNXO:0000006ディールス・アルダー反応
- RXNO:0000014グリニャール反応
- RXNO:0000015ウィッティヒ反応
- RXNO:0000021サンドマイヤー反応
- RXNO:0000024ヘック反応
- RXNO:0000026ベックマン転位
- RXNO:0000028コープ転位
- RXNO:0000031バイヤー・ビリガー酸化
- RXNO:0000042バーチリダクション
- RXNO:0000043クライゼン凝縮
- RXNO:0000056ホーナー・ワズワース・エモンズ反応
- RXNO:0000062スクラウプ反応
- RXNO:0000064フィッシャーインドール合成
- RXNO:0000074ウルツ反応
- RXNO:0000081ウルマン凝縮
- RXNO:0000084バルビエ反応
- RXNO:0000088根岸カップリング
- RXNO:0000090ウィリアムソンエーテル合成
- RXNO:0000098グレイザーカップリング
- RXNO:0000103ガブリエル合成
- RXNO:0000106フンスディーカー反応
- RXNO:0000140鈴木反応
- RXNO:0000147エンデ劣化
- RXNO:0000148クライゼンの再配置
- RXNO:0000156ロッセン再配置
- RXNO:0000157 Nef反応
- RXNO:0000183パーコウ反応
- RXNO:0000193檜山カップリング
- RXNO:0000210フレミング-タマオ酸化
- RXNO:0000218カニッツァーロの反応
- RXNO:0000288ローゼンムント・フォン・ブラウン反応
- RXNO:0000369フリーデル・クラフツ反応
- RXNO:0000444フライドポテトの再配置
- RXNO:0000550コリンズ酸化
参照
参考文献
- ^ Schneider, Nadine; Lowe, Daniel; Sayle, Roger; Tarselli, Michael; Landrum, Gregory (2016). 「医薬品特許からのビッグデータ：医薬品化学者の生計の計算分析」J. Med. Chem. 59 (9): 4385–4402. doi :10.1021/acs.jmedchem.6b00153. PMID 27028220.
- ^ Schneider, Nadine; Lowe, Daniel; Sayle, Roger; Landrum, Gregory (2015年1月)。「化学反応のための新しい指紋の開発と大規模反応の分類および類似性への応用」。Journal of Chemical Information and Modeling。55 ( 1): 39–53。doi :10.1021/ci5006614。PMID 25541888 。
- ^ ab Carey, JS; Laffan, D; Thomson, C; Williams, MT (2006 年 5 月). 「薬物候補分子の調製に使用される反応の分析」.有機・生体分子化学. 4 (12): 2337–2347. doi :10.1039/B602413K. PMID 16763676.
- ^ Roughley, Stephen D.; Jordan, Allan M. (2011 年 5 月). 「医薬品化学者のツールボックス: 医薬品候補の探索に使用される反応の分析」. Journal of Medicinal Chemistry . 54 (10): 3451–79. doi :10.1021/jm200187y. PMID 21504168.
外部リンク
- RXNOトランク（github）
- RSC での RXNO