ホモサピエンス種のタンパク質コード遺伝子
ポルル2B 利用可能な構造 ＰＤＢ オルソログ検索: PDBe RCSB PDB IDコードのリスト 5IY9、5IYA、5IYC、5IYB、5IY7、5IY8、5IYD、5IY6
識別子 エイリアス POLR2B 、POL2RB、RPB2、hRPB140、hsRPB2、ポリメラーゼ（RNA）IIサブユニットB、RNAポリメラーゼIIサブユニットB 外部ID オミム ：180661; MGI : 2388280; ホモロジーン : 722; ジーンカード ：POLR2B; OMA :POLR2B - オルソログ 遺伝子の位置（ マウス ） クロ。 5番染色体（マウス） [2] バンド 5|5 C3.3 始める 77,457,994 bp [2] 終わり 77,497,171 bp [2]
RNA発現 パターン ブギー 人間 マウス （相同遺伝子） トップの表現 鼻咽頭上皮 胚上皮 内皮細胞 中側頭回 脛骨 人間のペニス 歯肉上皮 ブロードマン領域23 壁側胸膜 アキレス腱
トップの表現 球形嚢 耳板 耳小胞 原始的な線 毛包 毛様体 尿管 性器結節 髄質集合管 蝸牛管の前庭膜
参照表現データの詳細
バイオGPS 参照表現データの詳細
遺伝子オントロジー 分子機能
トランスフェラーゼ活性 DNA結合 ヌクレオチジルトランスフェラーゼ活性 リボヌクレオシド結合 RNAポリメラーゼII活性 クロマチン結合 金属イオン結合 DNA指向性5'-3' RNAポリメラーゼ活性 タンパク質結合 RNA結合 細胞成分 生物学的プロセス
スプライソソームを介したmRNAスプライシング 体性幹細胞集団の維持 RNAポリメラーゼIIプロモーターからの転写伸長 7-メチルグアノシンmRNAキャッピング RNAポリメラーゼIIによる転写 ウイルス転写の正の制御 転写連動ヌクレオチド除去修復 RNAポリメラーゼIIプロモーターからの転写開始 RNAポリメラーゼIIによるsnRNA転写 線維芽細胞増殖因子受容体シグナル伝達経路 転写、DNAテンプレート RNA代謝プロセス miRNAによる遺伝子サイレンシングの制御 出典:Amigo / QuickGO
オルソログ 種 人間 ねずみ エントレズ アンサンブル ユニプロット RefSeq (mRNA) NM_001303269 NM_000938 NM_001303268
RefSeq (タンパク質) NP_000929 NP_001290197 NP_001290198
場所 (UCSC) 4 章: 56.98 – 57.03 Mb 5 章: 77.46 – 77.5 Mb PubMed 検索 [3] [4]
ウィキデータ
DNA指向性RNAポリメラーゼIIサブユニットRPB2 は、ヒトでは POLR2B 遺伝子によってコードされる 酵素 である 。 [5] [6]
この遺伝子は、真核生物におけるメッセンジャーRNAの合成を担うポリメラーゼであるRNAポリメラーゼIIの2番目に大きいサブユニットをコードしています。このサブユニットは、少なくとも他の2つのポリメラーゼサブユニットと組み合わせて、ポリメラーゼ内の構造を形成し、酵素の活性部位でDNAテンプレートと新しく合成されたRNAとの接触を維持します。 [7]
インタラクション POLR2BはPOLR2C 、 [8] POLR2E 、 [8] POLR2H [8] および POLR2L と 相互作用する ことが示されている 。 [8]
参考文献
^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000047315 – Ensembl 、2017 年 5 月 ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000029250 – Ensembl 、2017 年 5 月 ^ 「Human PubMed Reference:」。 国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館 。 ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。 国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館 。 ^ Acker J、Wintzerith M、Vigneron M、他 (1992年10月)。「ヒトRNAポリメラーゼII(またはB)の2番目に大きいサブユニットの一次構造」。J Mol Biol . 226 (4): 1295–9. doi :10.1016/0022-2836(92)91071-V. PMID 1518060。 ^ Acker J、Mattei MG、Wintzerith M、他 (1994 年 8 月)。「ヒト RNA ポリメラーゼ II サブユニット遺伝子の染色体局在」。Genomics . 20 ( 3): 496–9. doi :10.1006/geno.1994.1208. PMID 8034326。 ^ 「Entrez Gene: POLR2B ポリメラーゼ (RNA) II (DNA 指向) ポリペプチド B、140kDa」。 ^ abcd Acker J, de Graaff M, Cheynel I, et al. (1997年7月). 「ヒトRNAポリメラーゼIIサブユニット間の相互作用」. J. Biol. Chem . 272 (27). 米国: 16815–21. doi : 10.1074/jbc.272.27.16815 . ISSN 0021-9258. PMID 9201987.
さらに読む
Jeang KT (1998). 「Tat、Tat関連キナーゼ、および転写」 J. Biomed. Sci . 5 (1): 24–7. doi :10.1007/BF02253352. PMID 9570510. Yankulov K, Bentley D (1998). 「転写制御: Tat 補因子と転写伸長」. Curr. Biol . 8 (13): R447–9. Bibcode :1998CBio....8.R447Y. doi : 10.1016/S0960-9822(98)70289-1 . PMID 9651670. S2CID 15480646. Romano G、Kasten M、De Falco G、et al. (2000)。「HIV tat トランス活性化経路遺伝子発現における Cdk9 およびサイクリン T1 の調節機能」。J . Cell. Biochem . 75 (3): 357–68. doi :10.1002/(SICI)1097-4644(19991201)75:3<357::AID-JCB1>3.0.CO;2-K. PMID 10536359. S2CID 43685090. Marcello A、 Zoppé M、Giacca M (2002)。「HIV-1 Tatトランスアクチベーターによる転写制御の複数のモード」。IUBMB Life。51 ( 3 ): 175–81。doi : 10.1080 / 152165401753544241。PMID 11547919。S2CID 10931640 。 Stevens M、De Clercq E、Balzarini J (2007)。「HIV-1転写の制御：化学療法介入の分子標的」。Med Res Rev . 26 (5): 595–625. doi :10.1002/med.20081. PMC 7168390 . PMID 16838299。 Harrich D、McMillan N、Munoz L 、 他 (2007)。「多様な Tat 相互作用は、新しい抗レトロウイルス薬のターゲットにつながるか?」 Current Drug Targets。7 ( 12): 1595–606。doi : 10.2174 /138945006779025338。PMID 17168834 。 Kato H, Sumimoto H, Pognonec P, et al. (1992). 「HIV-1 Tat は細胞伸長因子と連携して in vitro でプロセッシビティ因子として機能する」。 Genes Dev . 6 (4): 655–66. doi : 10.1101/gad.6.4.655 . PMID 1559613。 Southgate C、 Zapp ML 、Green MR (1990)。「別のタンパク質を介して新生RNAに結合したHIV-1 Tatタンパク質による転写の活性化」。Nature。345 ( 6276 ): 640–2。Bibcode :1990Natur.345..640S。doi :10.1038/ 345640a0。PMID 2190099。S2CID 4233742 。 Zheng XM、Black D、 Chambon P、et al. (1990)。「一般転写因子 BTF3 の相補 DNA の配列決定と発現」。Nature。344 ( 6266 ): 556–9。Bibcode :1990Natur.344..556Z。doi : 10.1038/ 344556a0。PMID 2320128。S2CID 4227320 。 Wu-Baer F、Sigman D、 Gaynor RB (1995)。「RNAポリメラーゼIIのヒト免疫不全ウイルストランス活性化領域RNAへの特異的結合は、細胞補因子とTatによって制御される」。Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 92 (16): 7153–7。Bibcode : 1995PNAS ... 92.7153W。doi : 10.1073 / pnas.92.16.7153。PMC 41297。PMID 7638159 。 Herrmann CH、Rice AP (1995)。「レンチウイルス Tat タンパク質は、RNA ポリメラーゼ II の大きなサブユニットのカルボキシル末端ドメインを過剰リン酸化させる細胞タンパク質キナーゼ TAK と特異的に結合し、Tat 補因子の候補となる」。J . Virol . 69 (3): 1612–20. doi :10.1128/JVI.69.3.1612-1620.1995. PMC 188757. PMID 7853496 。 Andersson B、Wentland MA、Ricafrente JY、他 (1996)。「改良されたショットガンライブラリ構築のための「ダブルアダプター」法」。Anal . Biochem . 236 (1): 107–13. doi :10.1006/abio.1996.0138. PMID 8619474。 Keen NJ、Gait MJ、Karn J (1996)。「ヒト免疫不全ウイルス 1 型 Tat は活性化転写伸長複合体の不可欠な構成要素である」。Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 93 ( 6 ): 2505–10。Bibcode : 1996PNAS ...93.2505K。doi : 10.1073/ pnas.93.6.2505。PMC 39827。PMID 8637904 。 Yang X、Herrmann CH、Rice AP (1996)。「ヒト免疫不全ウイルス Tat タンパク質は、生体内で TAK と特異的に結合し、機能には RNA ポリメラーゼ II のカルボキシル末端ドメインを必要とする」。J . Virol . 70 (7): 4576–84. doi :10.1128/JVI.70.7.4576-4584.1996. PMC 190394. PMID 8676484 。 Agostini I、Navarro JM、Rey F、et al. (1996)。「ヒト免疫不全ウイルス 1 型 Vpr トランスアクチベーター: プロモーター結合アクチベータードメインとの連携および TFIIB への結合」。J. Mol. Biol . 261 (5): 599–606. doi :10.1006/jmbi.1996.0485. PMID 8800208。 Zhou Q、Sharp PA (1996)。「Tat-SF1: HIV-1 Tat による転写伸長の刺激のための補因子」。Science . 274 ( 5287): 605–10。Bibcode : 1996Sci ...274..605Z。doi : 10.1126/science.274.5287.605。PMID 8849451。S2CID 13266489 。 Okamoto H, Sheline CT, Corden JL, et al. (1996). 「ヒト免疫不全ウイルス Tat タンパク質によるトランス活性化には RNA ポリメラーゼ II の C 末端ドメインが必要」 Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 93 (21): 11575–9. Bibcode :1996PNAS...9311575O. doi : 10.1073/pnas.93.21.11575 . PMC 38099. PMID 8876177 . Chun RF、Jeang KT (1996)。「ヒトレトロウイルス、ヒトT細胞リンパ向性ウイルスIおよびHIV-1の活性化転写におけるRNAポリメラーゼIIカルボキシル末端ドメインの要件」。J . Biol. Chem . 271 (44): 27888–94. doi : 10.1074/jbc.271.44.27888 . PMID 8910388。
