ホモサピエンス種のタンパク質コード遺伝子
| RPA2 |
|---|
 |
| 利用可能な構造 |
|---|
| PDB | オルソログ検索: PDBe RCSB |
|---|
| PDB IDコードのリスト |
|---|
1DPU、1L1O、1QUQ、1Z1D、2PI2、2PQA、2Z6K、3KDF、4MQV、4OU0 |
|
|
| 識別子 |
|---|
| エイリアス | RPA2、REPA2、RP-A p32、RP-A p34、RPA32、複製タンパク質A2 |
|---|
| 外部ID | オミム: 179836; MGI : 1339939;ホモロジーン: 37712;ジーンカード:RPA2; OMA :RPA2 - オルソログ |
|---|
|
| 遺伝子の位置(マウス) |
|---|
 | | クロ。 | 染色体4(マウス)[2] |
|---|
| | バンド | 4|4 D2.3 | 始める | 132,495,643 bp [2] |
|---|
| 終わり | 132,506,063 bp [2] |
|---|
|
| RNA発現パターン |
|---|
| ブギー | | 人間 | マウス(相同遺伝子) |
|---|
| トップの表現 | - 心室帯
- 顆粒球
- 神経節隆起
- 右精巣
- 左精巣
- 腓腹筋
- アキレス腱
- 右子宮管
- 生殖腺
- 前脛骨筋
|
| | トップの表現 | - 体節
- 胎児肝臓造血前駆細胞
- 原始的な線
- 胚
- 心室帯
- 下顎突出
- 心内膜クッション
- 腹壁
- 胚葉
- 外胚葉
|
| | 参照表現データの詳細 |
|
|---|
| バイオGPS |  | | 参照表現データの詳細 |
|
|---|
|
| 遺伝子オントロジー |
|---|
| 分子機能 |
- DNA結合
- タンパク質N末端結合
- 一本鎖DNA結合
- 損傷したDNA結合
- タンパク質結合
- 酵素結合
- タンパク質ホスファターゼ結合
- ユビキチンタンパク質リガーゼ結合
- G-リッチ鎖テロメアDNA結合
- 二本鎖DNA結合
- 配列特異的DNA結合
| | 細胞成分 |
- 二本鎖切断部位
- PML本体
- 核質
- テロメア
- DNA複製因子A複合体
- クロマチン
- 核
- 核体
- 凝縮核染色体
| | 生物学的プロセス |
- ヌクレオチド除去修復、DNAギャップ充填
- DNA組み換え
- 鎖間架橋修復
- 相同組換えによる二本鎖切断修復の制御
- エラーのないトランスレジョン合成
- G1期
- エラーを起こしやすいトランスレジョン合成
- DNA損傷刺激に対する細胞反応
- DNA複製
- 有糸分裂G1 DNA損傷チェックポイントシグナル伝達
- DNA損傷チェックポイントの調節
- 熱に対する細胞反応の調節
- DNAミスマッチ修復
- トランスレジョン合成
- 転写連動ヌクレオチド除去修復
- ヌクレオチド除去修復、DNA切断
- 塩基除去修復
- ヌクレオチド除去修復
- ヌクレオチド除去修復、切断前複合体の安定化
- p53クラスメディエーターによるシグナル伝達の調節
- DNA修復
- 相同組換えによる二本鎖切断の修復
- ヌクレオチド除去修復、切断前複合体の組み立て
- ヌクレオチド除去修復、DNA切断、5'-to損傷
- ヌクレオチド除去修復、DNA切断、3'-損傷
- 染色体へのタンパク質の局在
- テロメア維持
- 半保存的複製によるテロメア維持
- 有糸分裂細胞周期のG1/S移行
- 組み換えによるテロメア維持
- DNAのトポロジー変化
- DNA複製に関与するDNAの巻き戻し
- 有糸分裂組換え
- テロメラーゼによるテロメア維持
- 減数分裂相互組み換え
- ヘテロ二本鎖形成
- ヘリカーゼ活性の正の調節
| | 出典:Amigo / QuickGO |
|
| オルソログ |
|---|
| 種 | 人間 | ねずみ |
|---|
| エントレズ | | |
|---|
| アンサンブル | | |
|---|
| ユニプロット | | |
|---|
| RefSeq (mRNA) | |
|---|
NM_001286076 NM_001297558 NM_002946 NM_001355128 NM_001355129 |
| |
|---|
| RefSeq (タンパク質) | |
|---|
NP_001273005 NP_001284487 NP_002937 NP_001342057 NP_001342058 |
| |
|---|
| 場所 (UCSC) | 1 章: 27.89 – 27.91 Mb | 4 番: 132.5 – 132.51 Mb |
|---|
| PubMed検索 | [3] | [4] |
|---|
|
| ウィキデータ |
|
複製タンパク質A 32 kDaサブユニットは、ヒトではRPA2遺伝子によってコードされるタンパク質である。[5] [6]
インタラクション
RPA2 は以下と相互作用することが示されています:
参照
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000117748 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000028884 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ Umbricht CB、Erdile LF、 Jabs EW、Kelly TJ (1993年3月)。「ヒト複製タンパク質Aの14kDaサブユニットのクローニング、過剰発現、ゲノムマッピング」。The Journal of Biological Chemistry。268 ( 9): 6131–8。doi : 10.1016/S0021-9258(18)53229-4。PMID 8454588 。
- ^ 「Entrez Gene: RPA2 複製タンパク質 A2、32kDa」。
- ^ Otterlei M、Warbrick E、Nagelhus TA、Haug T、Slupphaug G、Akbari M、Aas PA、Steinsbekk K、Bakke O、Krokan HE (1999 年 7 月)。 「複製焦点における複製後の塩基切除修復」。EMBO ジャーナル。18 (13): 3834–44。土井:10.1093/emboj/18.13.3834。PMC 1171460。PMID 10393198。
- ^ abc Shao RG、Cao CX、Zhang H、Kohn KW、Wold MS、Pommier Y (1999 年 3 月)。「カンプトテシンによる複製介在 DNA 損傷は、DNA 依存性タンパク質キナーゼによる RPA のリン酸化を誘導し、RPA:DNA-PK 複合体を解離する」。EMBOジャーナル。18 ( 5 ) : 1397–406。doi :10.1093/emboj/18.5.1397。PMC 1171229。PMID 10064605。
- ^ Sukhodolets KE、Hickman AB、Agarwal SK、Sukhodolets MV、Obungu VH、Novotny EA、Crabtree JS、Chandrasekharappa SC、Collins FS、Spiegel AM、Burns AL、Marx SJ (2003 年 1 月)。「複製タンパク質 A の 32 キロダルトンのサブユニットは、MEN1 腫瘍抑制遺伝子の産物であるメニンと相互作用する」。分子細胞生物学。23 ( 2): 493–509。doi :10.1128/ mcb.23.2.493-509.2003。PMC 151531。PMID 12509449 。
- ^ ab Bochkareva E、Korolev S、Lees-Miller SP、Bochkarev A (2002年4月)。「RPA三量体化コアの構造とRPAの多段階DNA結合機構における役割」。EMBOジャーナル。21 ( 7 ) :1855–63。doi :10.1093 / emboj/21.7.1855。PMC 125950。PMID 11927569。
- ^ Bochkareva E、Frappier L、 Edwards AM、Bochkarev A (1998 年 2 月)。「ヒト複製タンパク質 A の RPA32 サブユニットには一本鎖 DNA 結合ドメインが含まれる」。The Journal of Biological Chemistry。273 (7): 3932–6。doi : 10.1074/ jbc.273.7.3932。PMID 9461578。
- ^ Kim J、Kim D 、 Chung J (2000)。「複製タンパク質 a 32 kDa サブユニット (RPA p32) は STAT3 の SH2 ドメインに結合し、その転写活性を制御する」。Cell Biology International。24 ( 7 ) : 467–73。doi :10.1006/cbir.2000.0525。PMID 10875894。S2CID 23783745。
- ^ Yoo E、Kim BU、Lee SY、Cho CH、Chung JH、Lee CH (2005 年 8 月)。「53BP1 は複製タンパク質 A と関連しており、DNA 損傷後の RPA2 の過剰リン酸化に必要である」。Oncogene . 24 ( 35): 5423–30. doi : 10.1038/sj.onc.1208710 . PMID 15856006。
- ^ Nagelhus TA、Haug T、Singh KK、Keshav KF、Skorpen F、Otterlei M、Bharati S、Lindmo T、Benichou S、Benarous R、Krokan HE (1997 年 3 月)。「ヒトウラシル DNA グリコシラーゼの N 末端領域にある XPA と相同性のある配列は、複製タンパク質 A の 34 kDa サブユニットの C 末端部分と相互作用する」。The Journal of Biological Chemistry。272 ( 10): 6561–6。doi : 10.1074/jbc.272.10.6561。PMID 9045683。
さらに読む
- Dutta A、Stillman B (1992 年 6 月)。「cdc2 ファミリーキナーゼはヒト細胞 DNA 複製因子 RPA をリン酸化して DNA 複製を活性化する」。EMBO ジャーナル。11 ( 6 ) : 2189–99。doi :10.1002/ j.1460-2075.1992.tb05278.x。PMC 556686。PMID 1318195。
- Erdile LF、Wold MS、Kelly TJ (1990 年 2 月)。「ヒト複製タンパク質 A の 32 kDa サブユニットの一次構造」。The Journal of Biological Chemistry。265 ( 6 ): 3177–82。doi : 10.1016 /S0021-9258(19)39750-9。PMID 2406247 。
- Li L、Lu X、Peterson CA、Legerski RJ (1995 年 10 月)。「DNA 修復因子 XPA と複製タンパク質 A の相互作用は、ヌクレオチド除去修復に不可欠である」。分子細胞生物学。15 (10): 5396–402。doi :10.1128 / mcb.15.10.5396。PMC 230789。PMID 7565690 。
- Umbricht CB、Griffin CA、Hawkins AL、Grzeschik KH、O'Connell P、Leach R、Green ED、Kelly TJ (1994 年 3 月)。「3 つのヒト複製タンパク質 A 遺伝子 (RPA1、RPA2、および RPA3) の高解像度ゲノムマッピング」。Genomics . 20 ( 2): 249–57. doi : 10.1006/geno.1994.1161 . PMID 8020972。
- Nagelhus TA、Haug T、Singh KK、Keshav KF、Skorpen F、Otterlei M、Bharati S、Lindmo T、Benichou S、Benarous R、Krokan HE (1997 年 3 月)。「XPA と相同性のあるヒトウラシル DNA グリコシラーゼの N 末端領域の配列は、複製タンパク質 A の 34 kDa サブユニットの C 末端部分と相互作用する」。The Journal of Biological Chemistry。272 ( 10): 6561–6。doi : 10.1074/jbc.272.10.6561。PMID 9045683。
- Amacker M、Hottiger M、Mossi R、Hübscher U (1997 年 3 月)。「HIV-1 ヌクレオカプシドタンパク質と複製タンパク質 A は、レンチウイルス逆転写酵素の鎖置換 DNA 合成に影響を与える」。AIDS。11 ( 4 ): 534–6。PMID 9084803 。
- Niu H、Erdjument-Bromage H、Pan ZQ、Lee SH、Tempst P、Hurwitz J (1997 年 5 月)。「in vitro で DNA 依存性タンパク質キナーゼおよび Cdc2 キナーゼによってリン酸化されたヒト一本鎖 DNA 結合タンパク質の p34 サブユニットにおけるアミノ酸残基のマッピング」。The Journal of Biological Chemistry。272 ( 19): 12634–41。doi : 10.1074 /jbc.272.19.12634。PMID 9139719。
- Zernik-Kobak M、Vasunia K、Connelly M、Anderson CW、Dixon K (1997 年 9 月)。「HeLa 細胞からの複製タンパク質 A の p34 サブユニットの UV 誘導リン酸化部位」。The Journal of Biological Chemistry。272 ( 38): 23896–904。doi : 10.1074/ jbc.272.38.23896。PMID 9295339。
- Bochkareva E、Frappier L、Edwards AM、Bochkarev A (1998 年 2 月)。「ヒト複製タンパク質 A の RPA32 サブユニットには一本鎖 DNA 結合ドメインが含まれています」。The Journal of Biological Chemistry . 273 (7): 3932–6. doi : 10.1074/jbc.273.7.3932 . PMID 9461578。
- Shao RG、Cao CX、Zhang H、Kohn KW、Wold MS、Pommier Y (1999 年 3 月)。「カンプトテシンによる複製介在 DNA 損傷は、DNA 依存性タンパク質キナーゼによる RPA のリン酸化を誘導し、RPA:DNA-PK 複合体を解離する」。EMBOジャーナル。18 ( 5 ) : 1397–406。doi :10.1093/emboj/18.5.1397。PMC 1171229。PMID 10064605。
- Otterlei M、Warbrick E、Nagelhus TA、Haug T、Slupphaug G、Akbari M、Aas PA、Steinsbekk K、Bakke O、Krokan HE (1999 年 7 月)。 「複製焦点における複製後の塩基切除修復」。EMBO ジャーナル。18 (13): 3834–44。土井:10.1093/emboj/18.13.3834。PMC 1171460。PMID 10393198。
- Bochkarev A、Bochkareva E、Frappier L、Edwards AM (1999 年 8 月)。「複製タンパク質 A サブユニット RPA32 と RPA14 の複合体の結晶構造は、一本鎖 DNA 結合のメカニズムを明らかにします」。EMBOジャーナル。18 ( 16 ) : 4498–504。doi :10.1093/emboj/18.16.4498。PMC 1171524。PMID 10449415。
- Lao Y、Gomes XV、Ren Y、Taylor JS、Wold MS (2000 年 2 月)。「複製タンパク質 A と DNA の相互作用。III. 損傷 DNA の認識の分子的基礎」。生化学。39 ( 5 ) : 850–9。doi :10.1021/bi991704s。PMID 10653628。
- コステロ JF、フリューヴァルト MC、スミラグリア DJ、ラッシュ LJ、ロバートソン GP、ガオ X、ライト FA、フェラミスコ JD、ペルトマキ P、ラング JC、シュラー DE、ユウ L、ブルームフィールド CD、カリギウリ MA、イェーツ A、ニシカワ R、スー ファンH、Petrelli NJ、Zhang X、O'Dorisio MS、Held WA、Cavenee WK、Plas C (2000 年 2 月)。 「異常なCpGアイランドメチル化にはランダムではなく、腫瘍の種類に特異的なパターンがある。」自然遺伝学。24 (2): 132-8。土井:10.1038/72785。PMID 10655057。S2CID 6273676 。
- Kim J、Kim D 、 Chung J ( 2000)。「複製タンパク質 a 32 kDa サブユニット (RPA p32) は STAT3 の SH2 ドメインに結合し、その転写活性を調節する」。Cell Biology International。24 ( 7): 467–73。doi : 10.1006/cbir.2000.0525。PMID 10875894。S2CID 23783745。
- Cho JM、Song DJ、Bergeron J、Benlimame N、Wold MS、Alaoui-Jamali MA (2000 年 9 月)。「RBT1 は新規転写コアクチベーターであり、複製タンパク質 A の 2 番目のサブユニットに結合する」。 核酸研究。28 ( 18 ): 3478–85。doi :10.1093 / nar/28.18.3478。PMC 110737。PMID 10982866。
- Brush GS、Kelly TJ (2000 年 10 月)。「Saccharomyces cerevisiae チェックポイント応答における複製タンパク質 A 大サブユニットのリン酸化」。核酸研究。28 ( 19 ) : 3725–32。doi : 10.1093/ nar /28.19.3725。PMC 110765。PMID 11000264。
- Mer G、Bochkarev A、Gupta R、Bochkareva E、Frappier L、Ingles CJ、Edwards AM、Chazin WJ (2000 年 10 月)。「複製因子 RPA による DNA 修復タンパク質 UNG2、XPA、および RAD52 の認識の構造的基礎」。Cell。103 ( 3 ) : 449–56。doi : 10.1016 / S0092-8674(00)00136-7。PMID 11081631。S2CID 16640087。
- Habel JE、Ohren JF、 Borgstahl GE (2001 年 2 月)。「全長ヒト RPA14/32 二量体の動的光散乱分析: 精製、結晶化、自己会合」。Acta Crystallographica Section D 。57 ( Pt 2): 254–9。doi : 10.1107/ S0907444900015225。PMID 11173472。