ホモサピエンス種のタンパク質コード遺伝子
RNF2 利用可能な構造 PDB オルソログ検索: PDBe RCSB PDB IDコードのリスト 2H0D、3GS2、3H8H、3IXS、3RPG、4R8P、4S3O
識別子 エイリアス RNF2 、BAP-1、BAP1、DING、HIPI3、RING1B、RING2、リングフィンガータンパク質2、ring1B、LUSYAM 外部ID オミム :608985; MGI : 1101759; ホモロジーン : 2199; ジーンカード :RNF2; OMA :RNF2 - オルソログ 遺伝子の位置( マウス ) クロ。 染色体1(マウス) [2] バンド 1|1 G1 始める 151,333,755 bp [2] 終わり 151,376,706 bp [2]
RNA発現 パターン ブギー 人間 マウス (相同遺伝子) トップの表現 生殖腺 神経節隆起 心室帯 ランゲルハンス島 子宮内膜間質細胞 睾丸 単球 アキレス腱 結腸上皮 頬粘膜細胞
トップの表現 性器結節 受精卵 胎児の尾 内側神経節隆起 二次卵母細胞 生殖腺隆起 下顎突出 房室弁 上顎突出 一次卵母細胞
参照表現データの詳細
バイオGPS 参照表現データの詳細
遺伝子オントロジー 分子機能
ユビキチンタンパク質リガーゼ活性
クロマチン結合
RING様ジンクフィンガードメイン結合
金属イオン結合
ユビキチンタンパク質転移酵素活性
タンパク質結合
トランスフェラーゼ活性
亜鉛イオン結合
細胞成分
ユークロマチン
性染色体
ユビキチンリガーゼ複合体
核質
染色体
ヘテロクロマチン
MLL1複合体
PRC1複合体
PcGタンパク質複合体
核
核体
生物学的プロセス
生殖細胞の発達
ヒストンH2A-K119モノユビキチン化
転写の調節、DNAテンプレート
口を形成して2番目の胚葉を形成する
ヒストンH2Aモノユビキチン化
RNAポリメラーゼIIによる転写の負の制御
DNA結合転写因子活性の負の制御
転写、DNAテンプレート
タンパク質のユビキチン化
有糸分裂細胞周期
前後軸仕様
ヒストンのユビキチン化
G0からG1への遷移の負の調節
出典:Amigo / QuickGO
オルソログ 種 人間 ねずみ エントレズ アンサンブル ユニプロット RefSeq (mRNA) NM_011277 NM_001360844 NM_001360845 NM_001360847
RefSeq (タンパク質) NP_035407 NP_001347773 NP_001347774 NP_001347776
場所 (UCSC) 1 章: 185.05 – 185.1 Mb 1 章: 151.33 – 151.38 Mb PubMed 検索 [3] [4]
ウィキデータ
E3ユビキチンタンパク質リガーゼRING2 は、ヒトでは RNF2 遺伝子によってコードされる 酵素 である 。 [5] [6]
ポリコームグループ (PcG)タンパク質は、発達や細胞増殖に関わるさまざまな遺伝子の転写抑制に重要な多タンパク質複合体を形成します。この遺伝子によってコードされるタンパク質は、PcGタンパク質の1つです。転写因子CP2(TFCP2/CP2)と相互作用し、その活性を抑制することが示されています。マウスの対応物の研究では、この遺伝子が前後軸の指定と初期発達における細胞増殖に関与していることが示唆されました。このタンパク質は、ユビキチン結合酵素であるハンチンチン相互作用タンパク質2(HIP2)と相互作用し、ユビキチンリガーゼ活性を持つことも判明しました。 [6]
インタラクション
RNF2はTFCP2 [7] および HIP2 [5] と 相互作用する ことが示されている 。
参照
参考文献
^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000121481 – Ensembl 、2017 年 5 月
^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000026484 – Ensembl 、2017 年 5 月
^ 「Human PubMed Reference:」。 国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館 。
^ 「マウス PubMed リファレンス:」。 国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館 。
^ ab Lee SJ、Choi JY、Sung YM、Park H、Rhim H、Kang S (2001 年 8 月)。「ヒトユビキチン結合酵素 Hip-2 と相互作用する RING フィンガータンパク質の E3 リガーゼ活性」。FEBS Lett . 503 (1): 61–4. doi :10.1016/S0014-5793(01)02689-8. PMID 11513855. S2CID 42977319.
^ ab 「Entrez Gene: RNF2 リングフィンガータンパク質 2」。
^ Tuckfield A、Clouston David R、Wilanowski Tomasz M、Zhao Lin-Lin、Cunningham John M、Jane Stephen M (2002 年 3 月)。「RING ポリコームタンパク質と特定の標的遺伝子の結合は、発達転写因子のグラニーヘッド様ファミリーと複合している」。Mol . Cell. Biol . 22 (6): 1936–46. doi :10.1128/MCB.22.6.1936-1946.2002. ISSN 0270-7306. PMC 135618 . PMID 11865070.
さらに読む
García E、Marcos-Gutiérrez C、del Mar Lorente M、et al. (1999)。「RYBP、哺乳類ポリコーム複合体の構成要素および転写因子YY1と相互作用する新しいリプレッサータンパク質」。EMBO J. 18 (12): 3404–18. doi :10.1093/emboj/18.12.3404. PMC 1171420. PMID 10369680 。
Tuckfield A、Clouston DR、Wilanowski TM、他 (2002)。「RING ポリコームタンパク質と、発達転写因子のグラニーヘッド様ファミリーとの複合体における特定の標的遺伝子との結合」。Mol . Cell. Biol . 22 (6): 1936–46. doi :10.1128/MCB.22.6.1936-1946.2002. PMC 135618. PMID 11865070 。
Levine SS、Weiss A、Erdjument-Bromage H、他 (2002)。「ポリコーム抑制複合体の中核はハエとヒトで組成的にも機能的にも保存されている」。Mol . Cell. Biol . 22 (17): 6070–8. doi :10.1128/MCB.22.17.6070-6078.2002. PMC 134016. PMID 12167701 。
鈴木 正之、水谷- 小関 勇、藤村 勇、他 (2002)。「マウスの前後軸の規定におけるポリコームグループ遺伝子 Ring1B の関与」。 発達 。129 ( 18): 4171–83。doi :10.1242/dev.129.18.4171。PMID 12183370 。
Strausberg RL、Feingold EA、Grouse LH、他 (2003)。「15,000 を超える完全長のヒトおよびマウス cDNA 配列の生成と初期分析」。Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 99 ( 26): 16899–903。Bibcode : 2002PNAS ... 9916899M。doi : 10.1073/ pnas.242603899。PMC 139241。PMID 12477932 。
Voncken JW、Roelen BA、Roefs M、他 (2003)。「Rnf2 (Ring1b) 欠損は胚葉形成停止と細胞周期阻害を引き起こす」。Proc . Natl . Acad. Sci. USA . 100 ( 5): 2468–73。Bibcode :2003PNAS..100.2468V。doi : 10.1073/ pnas.0434312100。PMC 151364。PMID 12589020 。
太田 孝文、鈴木 勇、西川 孝文、他 (2004)。「21,243 個の完全長ヒト cDNA の完全な配列決定と特性解析」。Nat . Genet . 36 (1): 40–5. doi : 10.1038/ng1285 . PMID 14702039。
Obuse C, Yang H, Nozaki N, et al. (2004). 「HeLa 間期細胞からのセントロメア複合体のプロテオミクス解析: UV 損傷 DNA 結合タンパク質 1 (DDB-1) は CEN 複合体の構成要素であり、BMI-1 は間期にセントロメア領域と一時的に共存する」。Genes Cells . 9 (2): 105–20. doi : 10.1111/j.1365-2443.2004.00705.x . PMID 15009096. S2CID 21813024。
Wang H, Wang L, Erdjument-Bromage H, et al. (2004). 「ポリコームサイレンシングにおけるヒストンH2Aユビキチン化の役割」. Nature . 431 (7010): 873–8. Bibcode :2004Natur.431..873W. doi :10.1038/nature02985. PMID 15386022. S2CID 4344378.
Gerhard DS、Wagner L、Feingold EA、他 (2004)。「NIH 完全長 cDNA プロジェクトの現状、品質、拡大: 哺乳類遺伝子コレクション (MGC)」。 Genome Res . 14 (10B): 2121–7. doi :10.1101/gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334 。
Voncken JW、Niessen H、Neufeld B、et al. (2005)。「MAPKAPキナーゼ3pKはポリコームグループタンパク質Bmi1のクロマチン結合をリン酸化して制御する」。J . Biol. Chem . 280 (7): 5178–87. doi : 10.1074/jbc.M407155200 . PMID 15563468。
Barrios-Rodiles M、Brown KR、Ozdamar B 、et al. (2005)。「哺乳類細胞における動的シグナル伝達ネットワークのハイスループットマッピング」。Science。307 ( 5715 ) : 1621–5。Bibcode : 2005Sci ...307.1621B。doi : 10.1126 /science.1105776。PMID 15761153。S2CID 39457788 。
Lee SJ、Choi D、Rhim H、Kang S (2005)。「E3 ユビキチンリガーゼ RNF2 は S6' プロテアソーム ATPase サブユニットと相互作用し、S6' の ATP 加水分解活性を増加させる」。Biochem . J. 389 ( Pt 2): 457–63. doi :10.1042/BJ20041982. PMC 1175123. PMID 15773819 .
Glinsky GV、Berezovska O、Glinskii AB (2005)。「マイクロアレイ解析により、複数の種類の癌患者の治療失敗を予測する癌による死亡のシグネチャーが特定される」。J . Clin. Invest . 115 (6): 1503–21. doi :10.1172/JCI23412. PMC 1136989. PMID 15931389 。
Dou Y、Milne TA、Tackett AJ 、 et al. (2005)。「H3 K4 メチルトランスフェラーゼ MLL1 と H4 K16 アセチルトランスフェラーゼ MOF の物理的結合と協調機能」。Cell . 121 (6): 873–85. doi : 10.1016/j.cell.2005.04.031 . PMID 15960975. S2CID 14717470。
Rual JF、Venkatesan K、Hao T、他 (2005)。「ヒトタンパク質間相互作用ネットワークのプロテオームスケールマップに向けて」。Nature . 437 ( 7062 ) : 1173–8。Bibcode :2005Natur.437.1173R。doi : 10.1038 /nature04209。PMID 16189514。S2CID 4427026。
曹R、塚田裕、張裕(2006)。 「H2A ユビキチン化と Hox 遺伝子サイレンシングにおける Bmi-1 と Ring1A の役割」。 モル。セル 。 20 (6): 845-54。 土井 : 10.1016/j.molcel.2005.12.002 。 PMID 16359901。
Gregory SG、 Barlow KF、 McLay KE、他 (2006)。「ヒト染色体 1 の DNA 配列と生物学的注釈」。Nature . 441 ( 7091 ): 315–21。Bibcode :2006Natur.441..315G。doi : 10.1038/nature04727。PMID 16710414 。
Li Z, Cao R, Wang M, et al. (2006). 「Bmi-1-Ring1B ポリコームグループユビキチンリガーゼ複合体の構造」 J. Biol. Chem . 281 (29): 20643–9. doi : 10.1074/jbc.M602461200 . PMID 16714294.
外部リンク
RNF2+タンパク質、+ヒト、米国国立医学図書館 医学件名標目表 (MeSH)