ホモサピエンス種のタンパク質コード遺伝子
ユービーアイ2K 利用可能な構造 ＰＤＢ オルソログ検索: PDBe RCSB PDB IDコードのリスト 1YLA、2O25、3E46、3F92、3K9O、3K9P、5DFL
識別子 エイリアス UBE2K 、E2-25K、HIP2、HYPG、LIG、UBC1、ユビキチン結合酵素E2 K 外部ID オミム ：602846; MGI : 1858216; ホモロジーン : 3903; ジーンカード ：UBE2K; OMA :UBE2K - オルソログ 遺伝子の位置（ マウス ） クロ。 5番染色体（マウス） [2] バンド 5 C3.1|5 33.72 cM 始める 65,694,576 bp [2] 終わり 65,756,331 bp [2]
RNA発現 パターン ブギー 人間 マウス （相同遺伝子） トップの表現 精子 二次卵母細胞 ランゲルハンス島 中心後回 ブロードマン領域23 中側頭回 羊水 頬粘膜細胞 上前頭回 子宮内膜間質細胞
トップの表現 精細管 受精卵 胎児の尾 一次卵母細胞 原始的な線 二次卵母細胞 腹壁 性器結節 卵黄嚢 毛包
参照表現データの詳細
バイオGPS 参照表現データの詳細
遺伝子オントロジー 分子機能
ユビキチンタンパク質転移酵素活性 トランスフェラーゼ活性 ヌクレオチド結合 ユビキチン-ユビキチンリガーゼ活性 タンパク質結合 ATP結合 ユビキチンタンパク質リガーゼ結合 ユビキチン結合酵素活性 細胞成分 生物学的プロセス
タンパク質K48結合ユビキチン化 I型インターフェロンを介したシグナル伝達経路の正の調節 小胞体ストレスに対する内因性アポトーシスシグナル伝達経路 自由ユビキチン鎖重合 ペプチジルスレオニンリン酸化の正の制御 ユビキチン依存性タンパク質分解プロセス インターフェロンベータに対する細胞反応 プロテアソームを介したユビキチン依存性タンパク質分解プロセス プロテアソームユビキチン依存性タンパク質分解過程の調節 タンパク質のユビキチン化 出典:Amigo / QuickGO
オルソログ 種 人間 ねずみ エントレズ アンサンブル ユニプロット RefSeq (mRNA) NM_005339 NM_001111112 NM_001111113 NM_001312646 NM_001312647 NM_001312648 NM_032733
NM_016786 NM_001310618 NM_001310619
RefSeq (タンパク質) NP_001104582 NP_001104583 NP_001299575 NP_001299576 NP_001299577 NP_005330
NP_001297547 NP_001297548 NP_058066
場所 (UCSC) 4 章: 39.7 – 39.78 Mb 5 章: 65.69 – 65.76 Mb PubMed 検索 [3] [4]
ウィキデータ
ユビキチン結合酵素E2 Kは、ヒトでは UBE2K 遺伝子 によってコードされる タンパク質 である 。 [5] [6] [7]
この遺伝子によってコードされるタンパク質は、 ユビキチン結合酵素ファミリーに属します。 ハンチンチン のN末端の広い領域に選択的に結合します。この相互作用はハンチンチン ポリグルタミン鎖 の長さに影響されません 。このタンパク質は、ハンチンチンの分解と アポトーシス の抑制に関与していると考えられています。 [7]
インタラクション HIP2はハンチンチン [5] [8] および RNF2 [9] と 相互作用する ことが示されている 。
参考文献
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さらに読む
Petersén A, Mani K, Brundin P (1999). 「ハンチントン病の病因に関する最近の進歩」. Exp. Neurol . 157 (1): 1–18. doi :10.1006/exnr.1998.7006. PMID 10222105. S2CID 12974652. Coux O, Goldberg AL (1998). 「核因子κB1のp105前駆体のユビキチン化およびタンパク質分解処理を触媒する酵素」 J. Biol. Chem . 273 (15): 8820–8. doi : 10.1074/jbc.273.15.8820 . PMID 9535861. Whitby FG、Xia G、Pickart CM、Hill CP (1999)。「ヒトユビキチン様タンパク質NEDD8の結晶構造およびユビキチン経路酵素との相互作用」。J . Biol. Chem . 273 (52): 34983–91. doi : 10.1074/jbc.273.52.34983 . PMID 9857030。 Kikuchi J, Furukawa Y, Kubo N, Tokura A, Hayashi N, Nakamura M, Matsuda M, Sakurabayashi I (2000). 「ヒトマクロファージにおける凝集低密度リポタンパク質によるユビキチン結合酵素の誘導とアテローム性動脈硬化症への影響」 Arterioscler. Thromb. Vasc. Biol . 20 (1): 128–34. doi : 10.1161/01.ATV.20.1.128 . PMID 10634809. 古川裕也、久保直人、菊池純、都倉亜人、藤田直人、桜林一（2000）。 「変性リポタンパク質によるマクロファージ特異的遺伝子発現の制御」。 電気泳動 。 21 (2): 338–46。 ドイ :10.1002/(SICI)1522-2683(20000101)21:2<338::AID-ELPS338>3.0.CO;2-9。 PMID 10675012。S2CID 22857626 。 Lee SJ、Choi JY、Sung YM、Park H、Rhim H、Kang S (2001)。「ヒトユビキチン結合酵素Hip-2と相互作用するRINGフィンガータンパク質のE3リガーゼ活性」。FEBS Lett . 503 (1): 61–4. doi :10.1016/S0014-5793(01)02689-8. PMID 11513855. S2CID 42977319. Gevaert K、Goethals M、Martens L、Van Damme J、Staes A、Thomas GR、Vandekerckhove J (2004)。「分類されたN末端ペプチドの質量分析によるプロテオームの探索とタンパク質処理の分析」 Nat. Biotechnol . 21 (5): 566–9. doi :10.1038/nbt810. PMID 12665801. S2CID 23783563. Goehler H、Lalowski M、Stelzl U、Waelter S、Stroedicke M、Worm U、Droege A、Lindenberg KS、Knoblich M、Haenig C、Herbst M、Suopanki J、Scherzinger E、Abraham C、Bauer B、Hasenbank R、Fritzsche A 、ルーデヴィヒ AH、ビュソウ K、ビュソウ K、コールマン SH、グテクンスト CA、 ラントヴェーマイヤー BG 、レーラッハ H、ワンカー EE (2004)。 「タンパク質相互作用ネットワークは、ハンチンチン凝集のエンハンサーである GIT1 とハンチントン病を結びつけます。」 モル。セル 。 15 (6): 853–65。 土井 ： 10.1016/j.molcel.2004.09.016 。 PMID 15383276。 木村和也、若松A、鈴木裕、太田隆、西川隆、山下R、山本J、関根正、釣谷和、若栗博、石井S、杉山隆、斉藤和久、磯野裕、入江R、櫛田直、米山隆、大塚 R、神田 K、横井 T、近藤 H、我妻 M、村川 K、石田 S、石橋 T、高橋-藤井 A、棚瀬 T、永井 K、菊池 H、中井 K、磯貝 哲、菅野 S (2006) 「転写調節の多様化: ヒト遺伝子の推定上の代替プロモーターの大規模な同定と特性評価」。 ゲノム 解析 16 (1): 55-65。 土井 ：10.1101/gr.4039406。 PMC 1356129 。 PMID 16344560。 Flierman D、Coleman CS、Pickart CM、Rapoport TA、Chau V (2006)。「E2-25K は、透過処理した細胞システムにおいて US11 誘導性の MHC クラス I 重鎖の逆転座を媒介する」。Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 103 (31): 11589–94。Bibcode :2006PNAS..10311589F。doi : 10.1073 / pnas.0605215103 . PMC 1520313 . PMID 16868077。 de Pril R, Fischer DF, Roos RA, van Leeuwen FW (2007). 「ユビキチン結合酵素 E2-25K はポリグルタミン病における凝集体形成と細胞死を増加させる」 Mol. Cell. Neurosci . 34 (1): 10–9. doi :10.1016/j.mcn.2006.09.006. PMID 17092742. S2CID 9704303. Ewing RM、Chu P、Elisma F、Li H、Taylor P、Climie S、McBroom-Cerajewski L、Robinson MD、O'Connor L、Li M、Taylor R、Dharsee M、Ho Y、Heilbut A、Moore L、Zhang S、Ornatsky O、Bukhman YV、Ethier M、Sheng Y、Vasilescu J、Abu-Farha M、Lambert JP、Duewel HS、Stewart II、Kuehl B、Hogue K、Colwill K、Gladwish K、Muskat B、Kinach R、Adams SL、Moran MF、Morin GB、Topaloglou T、Figeys D (2007)。「質量分析法によるヒトタンパク質間相互作用の大規模マッピング」。Mol . Syst. Biol . 3 (1): 89. doi :10.1038/msb4100134. PMC 1847948. PMID 17353931 .
