遺伝学 では、トリヌクレオチド反復疾患は 、マイクロサテライト 拡張疾患(反復拡張疾患とも呼ばれる)のサブセットであり、トリヌクレオチド反復拡張 によって引き起こされる30 を超える遺伝性疾患 のセットです。トリヌクレオチド反復拡張とは、3 つのヌクレオチド の繰り返し(トリヌクレオチド 反復)のコピー数が増加し、閾値を超えると発達障害、神経障害、または神経筋障害を引き起こす一種の突然変異です。 [ 1 ] [ 2 ] [ 3 ] [ 4 ] これらのトリヌクレオチド反復の拡張に加えて、1 つのテトラヌクレオチド(CCTG)、[ 5 ] 5 つのペンタヌクレオチド(ATTCT、TGGAA、TTTTA、TTTCA、および AAGGG)、3 つのヘキサヌクレオチド(GGCCTG、CCCTCT、および GGGGCC)、および 1 つのドデカヌクレオチド(CCCCGCCCCGCG)反復の拡張は、他の 13 の疾患を引き起こします。[ 6 ] 不安定なトリヌクレオチド反復は、その位置に応じて、遺伝子 によってコードされるタンパク質 の欠陥を引き起こす可能性があります。遺伝子発現の調節を 変化させる。毒性RNA を生成するか、毒性タンパク質の生成につながる。[ 2 ] [ 3 ] 一般的に、拡大が大きいほど病気の発症が速くなり、病気が重症化する。[ 2 ] [ 3 ]
トリヌクレオチド反復配列は、すべてのゲノムに存在する不安定な マイクロサテライト 反復配列というより大きなクラスのサブセットである。
最初に特定されたトリヌクレオチド反復疾患は 脆弱X症候群であり、これは後に X染色体 の長腕にマッピングされました。患者は脆弱X症候群の原因遺伝子に230~4000個のCGG反復配列を持ち、影響を受けていない人は最大50個の反復配列を持ち、疾患の保因者は60~230個の反復配列を持っています。このトリヌクレオチド反復配列の伸長によって生じる染色体不安定性は、臨床的には知的障害 、特徴的な顔貌、および男性における精巣肥大 として現れます。2番目のDNAトリプレット反復疾患である脆弱XE症候群 もX染色体上で特定されましたが、これはCCG反復配列の伸長の結果であることがわかりました。[ 7 ] トリヌクレオチド反復配列が世代間伝達中に伸長し、疾患を引き起こす可能性があるという発見は、すべての疾患原因変異が親から子に安定して伝達されるわけではないという最初の証拠でした。[ 2 ]
トリヌクレオチド反復疾患および関連するマイクロサテライト反復疾患は、世界中で約 3,000 人につき 1 人の割合で発症します。ただし、特定の反復配列疾患の発生頻度は、民族グループや地理的な場所によって大きく異なります。[ 8 ] ゲノムの多くの領域 (エクソン、イントロン、遺伝子間領域) には、通常、トリヌクレオチド配列、つまり 1 つの特定のヌクレオチドの反復配列、または 2、4、5、6 つのヌクレオチドの配列が含まれています。このような反復配列は、「正常」とみなせる低レベルで発生します。[ 9 ] 時には、遺伝子に関連する反復配列のコピーが通常より多く存在するものの、その遺伝子の機能を変化させるほどではない場合があります。このような個人は「前変異保因者」と呼ばれます。世界における保因者の頻度は 340 人につき 1 人であるようです。 一部の保因者は、卵子または精子の形成中に、保有する反復配列の反復レベルが高くなることがあります。さらに高いレベルでは、「突然変異」レベルに達し、子孫に症状を引き起こす可能性がある。
ボワバンとシャルレ=ベルゲランは、トリヌクレオチド反復疾患と関連するマイクロサテライト(4、5、または6反復)疾患の3つのカテゴリーについて記述している。[ 3 ]
これらの著者らが論じる最初の主要なカテゴリーは、遺伝子のプロモーター領域内、またはプロモーター領域に近いが上流に位置する反復配列の伸長である。これらの反復配列は、シトシンのメチル化 などの局所的なDNAエピジェネティック 変化を促進することができる。このようなエピジェネティック変化は転写を阻害し[ 10 ] 、関連するコードタンパク質の発現低下を引き起こす可能性がある[ 3 ] 。 エピジェネティック変化とその影響については、BarbéとFinkbeiner [ 11 ] によってより詳細に説明されている 。これらの著者らは、個人が症状を経験し始める年齢と疾患の重症度は、反復配列のサイズと、反復配列内および反復配列周辺のエピジェネティック状態の両方によって決定されるという証拠を挙げている。反復配列領域付近のCpGアイランドではメチル化が増加することが多く、その結果、 クロマチンが 閉じた状態になり、遺伝子のダウンレギュレーションを 引き起こす[ 11 ] 。この最初のカテゴリーは「機能喪失」と指定されている[ 3 ] 。
トリヌクレオチド反復疾患および関連するマイクロサテライト疾患の2番目の主要なカテゴリーは、毒性RNA機能獲得メカニズムに関係しています。この2番目のタイプの疾患では、DNAの大きな反復伸長が病原性RNAに転写され、核内RNAフォーカスを形成します。これらのフォーカスはRNA結合タンパク質を引き付け、その位置と機能を変化させます。その結果、複数のRNA処理欠陥が生じ、これらの疾患の多様な臨床症状につながります。[ 3 ]
トリヌクレオチド反復疾患および関連するマイクロサテライト疾患の3番目の主要なカテゴリーは、反復配列が反復アミノ酸の連続を含む病原性タンパク質に翻訳されることによるものです。これにより、伸長したタンパク質に対して、毒性機能獲得、機能喪失、優性阻害効果、および/またはこれらのメカニズムの組み合わせが様々に生じます。これらの反復伸長の翻訳は、主に2つのメカニズムによって起こります。まず、通常のAUGまたは類似の(CUG、GUG、UUG、またはACG)開始コドンで翻訳が開始される場合があります。これにより、特定のコーディングフレームによってコードされた病原性タンパク質が発現します。次に、「反復関連非AUG(RAN)翻訳」と呼ばれるメカニズムでは、反復伸長内で直接開始される翻訳開始が使用されます。これにより、3つの可能な読み取りフレームによってコードされた3つの異なるタンパク質が発現する可能性があります。通常、3つのタンパク質のうち1つは、他の2つよりも毒性が強いです。これらのRAN型伸長の典型例は、トリヌクレオチド反復CAGを持つものです。これらはしばしばポリグルタミン含有タンパク質に翻訳され、封入体を形成し、神経細胞に毒性を示す。このメカニズムによって引き起こされる疾患の例としては、ハンチントン病およびハンチントン病様2、脊髄延髄性筋萎縮症、歯状核赤核淡蒼球ルイ体萎縮症、脊髄小脳失調症1~3、6~8、および17などがある。[ 3 ]
最初の主要なカテゴリーである、エピジェネティックな寄与を伴う機能喪失型では、プロモーター、プロモーターの上流の5'非転写領域、またはイントロンのいずれかにリピートが存在する。2番目のカテゴリーである毒性RNAでは、イントロンまたは終止コドンの先のコードの3'非翻訳領域にリピートが存在する。3番目のカテゴリーである、主にポリアラニンまたはポリグルタミンを含む毒性タンパク質を生成するカテゴリーでは、影響を受ける遺伝子のエクソンにトリヌクレオチドリピートが存在する。[ 3 ]
症状と兆候 2017年現在 10 種類の神経疾患および神経筋疾患は、CAG リピート数の増加によって引き起こされることが知られています。[ 12 ] これらの疾患は同じ反復コドン (CAG) といくつかの症状を共有していますが、反復は異なる無関係な遺伝子に見られます。SCA12のPPP2R2B の 5' UTR における CAG リピート伸長を除いて、伸長した CAG リピートは途切れないグルタミン残基の配列に翻訳され、ポリグルタミン トラクトを形成し、ポリグルタミン タンパク質の蓄積は、ユビキチン-プロテアソーム系などの重要な細胞機能を損傷します。ポリグルタミン病の一般的な症状は、 神経細胞 の進行性変性であり、通常は人生の後半に影響を及ぼします。しかし、異なるポリグルタミン含有タンパク質は、異なるサブセットのニューロンを損傷し、異なる症状を引き起こします。[ 21 ]
非ポリグルタミン病 または非コードトリヌクレオチド反復疾患は 、特定の症状を共有しておらず、ポリグルタミン病とは異なります。脆弱X症候群などの一部の疾患では、病理は、影響を受けた遺伝子によってコードされるタンパク質の正常な機能の欠如によって引き起こされます。筋強直性ジストロフィー1型などの他の疾患では、病理は、影響を受けた遺伝子の発現によって生成されるメッセンジャーRNA の変化を介して媒介されるタンパク質の発現または機能の変化によって引き起こされます。[ 2 ] さらに他の疾患では、病理は、細胞核内のRNAの毒性集合体によって引き起こされます。[ 22 ]
遺伝学 トリヌクレオチド反復疾患は一般的に遺伝的予期 を示します。つまり、その重症度は、それを継承する世代が進むにつれて増加します。これは、遺伝子が親から子に伝達される際に、影響を受ける遺伝子にCAG反復が追加されることによって説明できると考えられます。たとえば、ハンチントン病は、 HTT タンパク質をコードする遺伝子に35個以上のCAG反復がある場合に発生します。35個の反復を持つ親は正常とみなされ、病気の症状は示しません。[ 23 ] しかし、その親の子孫は、病気の原因となるタンパク質mHTT(変異型HTT)の産生を引き起こすにはCAGコドンが1つ追加されるだけで十分であるため、一般集団と比較してハンチントン病を発症するリスクが高くなります。
ハンチントン病は自然発生的に発症することは非常にまれで、ほとんどの場合、罹患した親から欠陥遺伝子を受け継いだ結果です。しかし、家族歴にハンチントン病がない人でも散発的に発症することがあります。これらの散発的な症例では、HTT遺伝子にすでにかなりの数のCAGリピートを持つ親を持つ人、 特にリピート数が発症に必要な数(36)に近づいている人の頻度が高くなります。ハンチントン病の罹患家系では、世代を経るごとにCAGリピートがさらに増える可能性があり、リピート数が多いほど、病気はより重篤になり、発症も早くなります。[ 23 ] その結果、何世代にもわたってハンチントン病を患っている家系では、発症年齢が早くなり、病気の進行も速くなります。[ 23 ]
非トリヌクレオチド拡張 単純なDNA反復配列の伸長によって引き起こされる疾患の大部分はトリヌクレオチド反復配列によるものですが、テトラヌクレオチド、ペンタヌクレオチド、ドデカヌクレオチド反復配列の伸長によっても疾患が引き起こされることが知られています。特定の遺伝性疾患では、特定の遺伝子で伸長するのは1つの反復配列のみです。[ 24 ]
機構 トリプレットの拡張は、 DNA 複製 中またはDNA 修復合成中の スリップ によって引き起こされます。[ 25 ] タンデム リピートは互いに同一の配列を持つため、 2 つの DNA 鎖間の塩基対形成 は、配列に沿って複数の箇所で起こり得ます。これにより、DNA 複製中または DNA 修復合成中に「ループアウト」構造が形成される可能性があります。[ 26 ] これにより、繰り返し配列の繰り返しコピーが起こり、繰り返し回数が増加する可能性があります。ハイブリッド RNA:DNA 中間体を含む追加のメカニズムが提案されています。[ 27 ] [ 28 ]
参考文献 ↑ 「DNA反復配列:起源、保存、およびヒト疾患における役割」。シュプリンガー。 1 2 3 4 5 6 7 Orr HT、Zoghbi HY (2007)。 「トリ ヌクレオチド 反復疾患」。Annual Review of Neuroscience。30 ( 1 ): 575–621。doi : 10.1146 / annurev.neuro.29.051605.113042。PMID 17417937 。 1 2 3 4 5 6 7 8 9 Boivin M、Charlet-Berguerand N (2022)。 「トリヌクレオチドCGGリピート疾患: ポリ グリシンタンパク質の拡大する分野?」 Front Genet . 13 843014. doi : 10.3389/fgene.2022.843014 . PMC 8918734. PMID 35295941 . ↑ Depienne, Christel; Mandel, Jean-Louis (2021). "30 years of repeat expansion disorders: What have we learned and what are the remaining challenges?" . Am J Hum Genet . 108 (5): 764– 785. doi : 10.1016/j.ajhg.2021.03.011 . PMC 8205997 . PMID 33811808 . ↑ パップ、デヴィッド;ヘルナンデス、ルイス・A;マイ、テレサA;ハーネン、テレンス・J;オドネル、メーガン A;デュラン、アリエル・T;ヘルナンデス、ソフィア M;ナルヴァント、ジェニー・E。アルグエロ、ベレニス。オンウクウェ、マービン・O;セルゲイ・M・マーキン;キム、ジェーン C (2024-02-07)。 Rhind、N (編)。 「2型筋強直性ジストロフィーに関連するCCTGテトラヌクレオチドリピートの大規模な収縮は、DNAヘリカーゼに対する明確な要件を伴う二本鎖切断修復を介して起こります 。 」 G3: 遺伝子、ゲノム、遺伝学 。 14 (2)。 土井 : 10.1093/g3journal/jkad257 。 ISSN 2160-1836 。 PMC 10849350 。 PMID 37950892 。 ↑ Khristich, Alexandra N.; Mirkin, Sergei M. (2020年3月). "間違ったDNAトラック:反復配列を介したゲノム不安定性の分子メカニズム" . Journal of Biological Chemistry . 295 (13): 4134– 4170. doi : 10.1074/jbc.rev119.007678 . ISSN 0021-9258 . PMC 7105313 . PMID 32060097 . ↑ 「脆弱X症候群」 。遺伝性希少疾患情報センター(GARD)。 2013年3月9日時点のオリジナルより アーカイブ。 2012年 9月14日 取得 。 ↑ Ramakrishnan S、Gupta V. トリヌクレオチド反復疾患。2023年8月22日。StatPearls [インターネット]。フロリダ州トレジャーアイランド:StatPearls Publishing; 2023年1月–。PMID 32644680。 ↑ Tóth G、Gáspári Z、Jurka J (2000 年7 月 )。 「様々 な 真核生物 ゲノムにおけるマイクロサテライト:調査と分析」 。Genome Res。10 ( 7 ) : 967–81。doi : 10.1101/ gr.10.7.967。PMC 310925。PMID 10899146 。 ↑ Irvine RA、Lin IG、Hsieh CL (2002 年 10 月)。 「 DNA メチル 化は転写とヒストンアセチル化に局所的な影響を与える」 。Mol Cell Biol。22 ( 19 ): 6689–96。doi : 10.1128 / MCB.22.19.6689-6696.2002。PMC 134040。PMID 12215526 。 1 2 Barbé L、Finkbeiner S (2022)。 「遺伝 的および エピ ジェネティックな相互作用 が 反復疾患の発症と重症度を決定する」 。Front Aging Neurosci。14 750629。doi : 10.3389 / fnagi.2022.750629。PMC 9110800。PMID 35592702 。 1 2 Adegbuyiro A、Sedighi F 、 Pilkington AW、Groover S、Legleiter J (2017 年 3 月)。 「 拡張 ポリ グルタミン鎖を含むタンパク質と神経変性疾患」 。Biochemistry。56 ( 9 ) : 1199–1217。doi : 10.1021/ acs.biochem.6b00936。PMC 5727916。PMID 28170216 。 ↑ Laskaratos A、Breza M、Karadima G、Koutsis G (2021年6月)。「脊髄性および球麻痺性筋萎縮症における浸透率低下アレルの広範囲:モデルベースのアプローチ」。Journal of Medical Genetics。58 ( 6 ) : 385–391。doi : 10.1136 / jmedgenet -2020-106963。PMID 32571900。S2CID 219991108 。 ↑ Trollet, Capucine; Boulinguiez, Alexis; Roth, Fanny; Stojkovic, Tanya; Butler-Browne, Gillian; Evangelista, Teresinha; Lacau St Guily, Jean; Richard, Pascale (1993). "眼咽頭筋ジストロフィー" . GeneReviews® . シアトル (WA): ワシントン大学シアトル校. PMID 20301305 . ↑ Gao FB 、Richter JD (2017 年1 月 )。 「 マイクロサテライト拡張疾患:翻訳における反復毒性の発見」 。Neuron。93 ( 2 ) : 249–251。doi : 10.1016/j.neuron.2017.01.001。PMID 28103472 。 ↑ LaCroix AJ、Stabley D、Sahraoui R、Adam MP、Mehaffey M、Kernan K、et al. (2019 年 1 月)。 「 XYLT1 の GGC リピート拡張とエクソン 1 メチル化は 、 バラテラ・スコット症候群の一般的な病原 性 変異である」 。American Journal of Human Genetics。104 ( 1): 35–44。doi : 10.1016 /j.ajhg.2018.11.005。PMC 6323552。PMID 30554721 。 ↑ Schoser, Benedikt (1993), Adam, Margaret P.; Feldman, Jerry; Mirzaa, Ghayda M.; Pagon, Roberta A. (編)、 「筋強直性ジストロフィー2型」 、 GeneReviews® 、シアトル(ワシントン州):ワシントン大学シアトル校、 PMID 20301639 、 2024年7月2日 取得 ↑ Meola, Giovanni; Cardani, Rosanna (2015-07-22). "筋強直性ジストロフィー2型:臨床的側面、遺伝的および病態分子メカニズムの最新情報" . Journal of Neuromuscular Diseases . 2 (Suppl 2): S59– S71. doi : 10.3233/JND-150088 . ISSN 2214-3599 . PMC 5240594 . PMID 27858759 . ↑ Srivastava AK、Takkar A 、 Garg A、Faruq M (2017年1月)。 「脊髄小脳失調症12型とPPP2R2Bにおける中間長の異常CAGリピートの臨床的挙動」 。Brain。140 ( 1 ) : 27–36。doi : 10.1093 /brain / aww269。PMID 27864267 。 ↑ O'Hearn E、Holmes SE、Margolis RL (2012-01-01)。 「第34章 - 脊髄小脳失調症12型」 。Subramony SH 、Dürr A (編) 『臨床神経学ハンドブック』 。 失調性疾患。第103 巻 。Elsevier。pp. 535–547。doi : 10.1016/b978-0-444-51892-7.00034-6。ISBN 978-0-444-51892-7 PMID 21827912。S2CID 25745894。 2022年12 月7 日取得 。 ↑ Fan HC、Ho LI 、 Chi CS、Chen SJ、Peng GS、Chan TM、et al. (2014 年 5 月)。 「 ポリ グルタミン(PolyQ) 疾患: 遺伝学 から 治療まで」 。Cell Transplantation。23 ( 4–5 ): 441–458。doi : 10.3727 /096368914X678454。PMID 24816443 。 ↑ Sanders DW 、 Brangwynne CP (2017年6 月 )。 「神経変性疾患:RNA反復配列 が 細胞 を 凍結させる」 。Nature。546 (7657) : 215–216。Bibcode : 2017Natur.546..215S。doi : 10.1038 / nature22503。PMID 28562583 。 1 2 3 4 Walker FO (2007 年 1 月). 「ハンチントン病」. Lancet . 369 (9557): 218– 228. doi : 10.1016/S0140-6736(07)60111-1 . PMID 17240289 . S2CID 46151626 . ↑ Mirkin SM (2007年6月)「拡張可能 なDNA反復配列とヒトの疾患」 Nature . 447 (7147): 932–940 . Bibcode : 2007Natur.447..932M . doi : 10.1038/nature05977 . PMID 17581576. S2CID 4397592 . ↑ Usdin K、House NC、Freudenreich CH (2015)。 「DNA修復中の反復配列の不安定性:モデルシステムからの知見」 。Critical Reviews in Biochemistry and Molecular Biology。50 ( 2 ): 142– 167。doi : 10.3109 / 10409238.2014.999192。PMC 4454471。PMID 25608779 。 ↑ Petruska J、Hartenstine MJ、Goodman MF ( 1998 年 2 月)。 「神経変性疾患に関連する CAG/CTG トリプレット リピートの DNA ポリメラーゼ拡張における鎖スリップの解析」 。The Journal of Biological Chemistry。273 ( 9): 5204–5210。doi : 10.1074 /jbc.273.9.5204。PMID 9478975 。 ↑ McIvor EI、Polak U 、Napierala M ( 2010 )。 「反復 配列 の不安定 性 に関する新たな知見:RNA・DNAハイブリッドの役割」 。RNA Biology。7 (5): 551–558。doi : 10.4161 /rna.7.5.12745。PMC 3073251。PMID 20729633 。 ↑ Salinas-Rios V、Belotserkovskii BP、 Hanawalt PC (2011年9月)。 「DNAスリップアウトはin vitroでRNAポリメラーゼIIの停止を引き起こす:遺伝的不安定性への潜在的な影響」 。Nucleic Acids Research。39 ( 17 ) : 7444–7454。doi : 10.1093 /nar / gkr429。PMC 3177194。PMID 21666257 。
外部リンク 米国国立医学図書館の 医学主題見出し (MeSH)における トリヌクレオチド反復配列の拡張GeneReviews/NCBI/NIH/UW の DRPLA エントリー 国立神経疾患・脳卒中研究所(NINDS)のアーカイブ(2016年12月15日、 Wayback Machine にて保存) 遺伝学ホームリファレンス