ホモサピエンス種のタンパク質コード遺伝子
PKD2L1 利用可能な構造 ＰＤＢ オルソログ検索: PDBe RCSB
識別子 エイリアス PKD2L1 、PCL、PKD2L、PKDL、TRPP3、ポリシスチン2類似体1、一過性受容体電位カチオンチャネル 外部ID オミム ：604532; MGI : 1352448; ホモロジーン : 22946; ジーンカード ：PKD2L1; OMA :PKD2L1 - オルソログ 遺伝子の位置（ マウス ） クロ。 19番染色体（マウス） [2] バンド 19 C3|19 36.91 cM 始める 44,136,076 bp [2] 終わり 44,180,881 bp [2]
RNA発現 パターン ブギー 人間 マウス （相同遺伝子） トップの表現 脾臓 右前頭葉 ブロードマン領域9 精子 糸球体 右肺 前帯状皮質 前頭前皮質 胎盤 単核細胞
トップの表現 脊髄の腰椎部分 精母細胞 精細管 胚 胚 脊髄前角 舌 有郭乳頭 原腸胚 精子細胞
参照表現データの詳細
バイオGPS 参照表現データの詳細
遺伝子オントロジー 分子機能
カルシウムイオン結合 カルシウム活性化陽イオンチャネル活性 筋肉のα-アクチニン結合 カルシウムチャネル活性 陽イオン膜輸送活性 カルシウム活性化カリウムチャネル活性 ナトリウムチャネル活性 細胞骨格タンパク質結合 タンパク質結合 アルファアクチニン結合 陽イオンチャネル活性 同一のタンパク質結合 酸味受容体の活性 細胞成分
膜の不可欠な構成要素 細胞投影 カルシウムチャネル複合体 膜 細胞内膜で囲まれた細胞小器官 受容体複合体 細胞膜 繊毛 細胞表面 小胞体 毛様体膜 陽イオンチャネル複合体 非運動性繊毛 細胞膜の不可欠な構成要素 細胞質小胞 生物学的プロセス
ナトリウムイオン膜輸送 酸性pHに対する細胞反応 陽イオン輸送 酸味の感覚的知覚 イオン輸送 タンパク質ホモ三量体化 カルシウムイオン膜輸送 機械的刺激の検出 カリウムイオン膜輸送 スムーズなシグナル伝達経路 酸味の感覚知覚に関わる化学刺激の検出 カルシウムイオン輸送 水に対する反応 味覚の知覚に関わる化学刺激の検出 タンパク質四量体化 タンパク質ホモ四量体化 pHに対する細胞反応 無機陽イオン膜輸送 出典:Amigo / QuickGO
ウィキデータ
多発性嚢胞腎2様1タンパク質は、 一過性受容体電位多嚢胞2 （TRPP2、以前はTRPP3） としても知られ、ヒトでは PKD2L1 遺伝子 によってコードされる タンパク質 です。 [5]
関数 TRPP2はポリシスチンタンパク質ファミリーの一員である。TRPP2には複数の膜貫通ドメインと細胞質N末端およびC末端が含まれる。TRPP2は細胞間/マトリックス相互作用に関与する膜貫通タンパク質である可能性がある。TRPP2はカルシウム調節非選択性陽イオンチャネルとして機能する。選択的スプライスバリアントが報告されているが、その全長配列は決定されていない。 [5]
インタラクション PKD2L1はTNNI3 と 相互作用する ことが示されている 。 [6]
参照
参考文献
^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000107593 – Ensembl 、2017 年 5 月 ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000037578 – Ensembl 、2017 年 5 月 ^ 「Human PubMed Reference:」。 国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館 。 ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。 国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館 。 ^ ab 「Entrez Gene: PKD2L1 多発性嚢胞腎 2 様 1」。 ^ Li Q, Liu Y, Shen PY, Dai XQ, Wang S, Smillie LB, Sandford R, Chen XZ (2003 年 6 月). 「トロポニン I はポリシスチン L に結合し、そのカルシウム誘導チャネル活性化を阻害する」. 生化学 . 42 (24): 7618– 25. doi :10.1021/bi034210a. PMID 12809519.
さらに読む
Geng L、Okuhara D、Yu Z、et al. (2006)。「ポリシスチン-2はN末端RVxPモチーフを利用してポリシスチン-1とは独立して繊毛へ移動する」。J . Cell Sci . 119 (Pt 7): 1383– 95. doi : 10.1242/jcs.02818 . PMID 16537653。 Gerhard DS、Wagner L、Feingold EA、他 (2004)。「NIH 完全長 cDNA プロジェクトの現状、品質、拡大: 哺乳類遺伝子コレクション (MGC)」。 Genome Res . 14 (10B): 2121–7 . doi :10.1101/gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334 。 Li Q, Liu Y, Shen PY, et al. (2003). 「トロポニン I はポリシスチン L に結合し、そのカルシウム誘導チャネル活性化を阻害する」。 生化学 。42 ( 24): 7618– 25. doi :10.1021/bi034210a. PMID 12809519。 Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003). 「15,000 を超える完全長のヒトおよびマウス cDNA 配列の生成と初期分析」 Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 99 (26): 16899– 903. Bibcode :2002PNAS...9916899M. doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241 . PMID 12477932. Li Q, Liu Y, Zhao W, Chen XZ (2002). 「ポリシスチンLのカルシウム結合EFハンドは、チャネル活性化とそれに続く不活性化のドメインではない」. FEBS Lett . 516 ( 1– 3): 270– 8. doi : 10.1016/S0014-5793(02)02513-9 . PMID 11959145. S2CID 1812119. Basora N、Nomura H、Berger UV、他 (2002)。「新規多発性嚢胞腎様遺伝子産物ポリシスチン-Lの組織および細胞内局在」。J. Am. Soc. Nephrol . 13 (2): 293– 301. doi : 10.1681/ASN.V132293 . PMID 11805156。 Stayner C, Zhou J (2001). 「ポリシスチンチャネルと腎臓疾患」. Trends Pharmacol. Sci . 22 (11): 543–6 . doi :10.1016/S0165-6147(00)01832-0. PMID 11698076. Guo L、Chen M、Basora N、Zhou J (2000)。「ヒト多発性嚢胞腎2型（PKDL）遺伝子：エクソン/イントロン構造と新しいスプライシング機構の証拠」。Mamm . Genome . 11 (1): 46– 50. doi :10.1007/s003350010009. PMID 10602992. S2CID 27177354. Veldhuisen B, Spruit L, Dauwerse HG, et al. (2000). 「常染色体優性多発性嚢胞腎遺伝子（PKD1 および PKD2）と相同な遺伝子」 Eur. J. Hum. Genet . 7 (8): 860– 72. doi : 10.1038/sj.ejhg.5200383 . PMID 10602361. Chen XZ、Vassilev PM、Basora N、et al. (1999)。「ポリシスチン-L はカルシウムイオンを透過するカルシウム調節陽イオンチャネルである」。Nature . 401 ( 6751): 383– 6. doi :10.1038/43907. PMID 10517637. S2CID 4412921。 Tsiokas L, Arnould T, Zhu C, et al. (1999). 「PKD2 遺伝子産物と TRPC1 チャネルの特異的関連性」 Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 96 (7): 3934– 9. Bibcode :1999PNAS...96.3934T. doi : 10.1073/pnas.96.7.3934 . PMC 22398 . PMID 10097141. Wu G、Hayashi T、 Park JH 、 et al. (1999)。「ヒトPKD2関連遺伝子PKD2Lの同定：組織特異的発現および染色体10q25へのマッピング」。Genomics。54 （ 3 ） ： 564–8。doi ： 10.1006 /geno.1998.5618。PMID 9878261 。 Nomura H, Turco AE, Pei Y, et al. (1998). 「腎臓および網膜の欠陥を持つマウスでマウスホモログが削除されている新規多発性嚢胞腎2型遺伝子PKDLの同定」 J. Biol. Chem . 273 (40): 25967– 73. doi : 10.1074/jbc.273.40.25967 . PMID 9748274.
