ホモサピエンス種のタンパク質コード遺伝子
パルド6A 利用可能な構造 電子データ オルソログ検索: PDBe RCSB
識別子 エイリアス PARD6A 、PAR-6A、PAR6、PAR6C、PAR6alpha、TAX40、TIP-40、par-6ファミリー細胞極性調節因子アルファ 外部ID オミム ：607484; MGI : 1927223; ホモロジーン : 9661; ジーンカード ：PARD6A; OMA :PARD6A - オルソログ 遺伝子の位置（ マウス ） クロ。 染色体8（マウス） [2] バンド 8|8 D3 始める 106,427,780 bp [2] 終わり 106,430,128 bp [2]
RNA発現 パターン ブギー 人間 マウス （相同遺伝子） トップの表現 小脳の右半球 前頭前皮質 精子 右前頭葉 小脳の傍小葉 右精巣 臀筋 正面ポール 左精巣 上腕三頭筋
トップの表現 小脳葉 小脳虫部 精母細胞 精細管 精子細胞 橋核 一次卵母細胞 内側前庭核 深部小脳核 視覚野
参照表現データの詳細
バイオGPS 参照表現データの詳細
遺伝子オントロジー 分子機能
転写因子結合 GTP依存性タンパク質結合 タンパク質結合 プロテインキナーゼC結合 細胞成分
細胞質 細胞投影 膜 二細胞タイトジャンクション フリル 細胞膜 細胞皮質 核 細胞質 中心体 微小管形成中心 細胞骨格 細胞接合 中心小体衛星 タンパク質含有複合体 頂端細胞膜 生物学的プロセス
タンパク質リン酸化の負の調節 細胞分裂 細胞間結合の維持 二細胞タイトジャンクションアセンブリ 細胞周期 ウイルスプロセス トランスフォーミング成長因子β受容体シグナル伝達経路 Wntシグナル伝達経路、平面細胞極性経路 中心体へのタンパク質局在の正の制御 中心体周期 細胞極性の確立または維持 細胞局在の調節 タンパク質分泌の正の調節 出典:Amigo / QuickGO
オルソログ 種 人間 ねずみ エントレズ アンサンブル ユニプロット RefSeq (mRNA) NM_001047435 NM_001047436 NM_001286344 NM_001286345 NM_019695
RefSeq (タンパク質) NP_001040900 NP_001040901 NP_001273273 NP_001273274 NP_062669
場所 (UCSC) 16 章: 67.66 – 67.66 Mb 8 章: 106.43 – 106.43 Mb PubMed 検索 [3] [4]
ウィキデータ
パーティショニング欠陥6ホモログアルファ は、ヒトでは PARD6A 遺伝子によってコードされる タンパク質 である 。 [5] [6] [7]
関数 この遺伝子はPAR6ファミリーのメンバーであり、PSD95/Discs-large/ZO1（PDZ）ドメインとセミCdc42/Racインタラクティブ結合（CRIB）ドメインを持つタンパク質をコードしています。この細胞膜タンパク質は、多タンパク質複合体のメンバーとして、非対称細胞分裂および細胞分極プロセスに関与しています。このタンパク質は、転移性癌に関連する浸潤性表現型を特徴付ける上皮間葉転換（EMT）にも役割を果たしています。異なるアイソフォームをコードする代替転写スプライスバリアントが特徴付けられています。 [7]
最近の研究では、メラノーマにおいてPar6はPKC-ιと関連しているが、PKC-zetaとは関連していないことが示されています。発がん性PKC-iotaは、EMT中にPKC-ι/Par6経路をアップレギュレーションすることでメラノーマ細胞の浸潤を促進することができます。PKC-ιの阻害またはノックダウンにより、転移性メラノーマ細胞におけるE-カドヘリンおよびRhoAレベルが増加し、総ビメンチン、リン酸化ビメンチン（S39）、およびPar6が減少しました。これらの結果は、PKC-ιがメラノーマにおけるEMTをアップレギュレーションするシグナル伝達経路に関与していることを示唆しています。 [8]
インタラクション PARD6A は以下と相互作用する ことが示されています :
参考文献
^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000102981 – Ensembl 、2017 年 5 月 ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000005699 – Ensembl 、2017 年 5 月 ^ 「Human PubMed Reference:」。 国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館 。 ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。 国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館 。 ^ Rousset R、Fabre S、Desbois C、Bantignies F、Jalinot P (1998 年 3 月)。「HTLV-1 Tax オンコプロテインの C 末端は細胞タンパク質の PDZ ドメインとの相互作用を媒介する」。Oncogene . 16 ( 5): 643–54. doi : 10.1038/sj.onc.1201567 . PMID 9482110。 ^ abcd Noda Y, Takeya R, Ohno S, Naito S, Ito T, Sumimoto H (2001 年 3 月). 「Caenorhabditis elegans 細胞極性タンパク質 PAR6 のヒトホモログは、小型 GTPase Rac および Cdc42 を非定型タンパク質キナーゼ C にリンクするアダプターとして機能する」. Genes Cells . 6 (2): 107–19. doi : 10.1046/j.1365-2443.2001.00404.x . PMID 11260256. S2CID 8789941. ^ ab "Entrez Gene: PARD6A par-6 分割欠陥 6 ホモログ アルファ (C. elegans)"。 ^ ab Ratnayake WS、Apostolatos AH、Ostrov DA、Acevedo-Duncan M (2017)。「2つの新規非定型PKC阻害剤、ACPDとDNDAは、アポトーシスを誘導しながら転移性黒色腫の細胞増殖と上皮間葉転換を効果的に緩和する」。Int . J. Oncol . 51 (5): 1370–1382. doi :10.3892/ijo.2017.4131. PMC 5642393. PMID 29048609 。 ^ Joberty G、Petersen C、Gao L、Macara IG (2000 年 8 月)。「細胞極性タンパク質 Par6 は Par3 と非定型タンパク質キナーゼ C を Cdc42 にリンクします」。Nat . Cell Biol . 2 (8): 531–9. doi :10.1038/35019573. PMID 10934474. S2CID 27139234. ^ ab Qiu RG、Abo A、Steven Martin G (2000 年 6 月)。「C. elegans 極性決定因子 Par-6 のヒトホモログが Rac および Cdc42 を PKCzeta シグナル伝達および細胞形質転換に結び付ける」。Curr . Biol . 10 ( 12): 697–707。Bibcode :2000CBio...10..697Q。doi : 10.1016 /s0960-9822(00) 00535-2。PMID 10873802。S2CID 14825707 。 ^ ab Liu XF、Ishida H、Raziuddin R、Miki T (2004 年 8 月)。「ヌクレオチド交換因子 ECT2 は極性タンパク質複合体 Par6/Par3/タンパク質キナーゼ Czeta (PKCzeta) と相互作用し、PKCzeta の活性を調節する」。Mol . Cell. Biol . 24 (15): 6665–75. doi :10.1128/MCB.24.15.6665-6675.2004. PMC 444862. PMID 15254234 。 ^ ルアル JF、ヴェンカテサン K、ハオ T、弘實・岸川 T、ドリコット A、リー N、ベリス GF、ギボンズ FD、ドレーゼ M、アイヴィ・グエデフスー N、クリットゴード N、サイモン C、ボクセム M、ミルシュタイン S、ローゼンバーグ J、ゴールドバーグ DS、チャン LV、ウォン SL、フランクリン G、リー S、アルバラ JS、リム J、フロートン C、ラモサス E、セビック S、ベックス C、ラメシュ P、シコルスキー RS、ヴァンデンハウト J、ゾグビ HY、スモリャル A、ボサック S、セケーラ R、ドゥセット スタム L、キュージック ME、ヒル DE、ロス FP、ビダル M ( 2005 年 10 月）。 「ヒトタンパク質間相互作用ネットワークのプロテオームスケールマップに向けて」。 自然 。 437 (7062): 1173–8. Bibcode :2005Natur.437.1173R. doi :10.1038/nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
さらに読む
Solecki DJ、Govek EE、Hatten ME (2006)。「mPar6 アルファはニューロンの移動を制御する」。J . Neurosci . 26 (42): 10624–5. doi : 10.1523/JNEUROSCI.4060-06.2006 . PMC 6674730 . PMID 17050699。 Qiu RG、Abo A、Steven Martin G (2000)。「C. elegans 極性決定因子 Par-6 のヒト相同遺伝子が Rac および Cdc42 を PKCzeta シグナル伝達および細胞形質転換に結び付ける」。Curr . Biol . 10 (12 ) : 697–707。Bibcode : 2000CBio ...10..697Q。doi : 10.1016/S0960-9822(00) 00535-2。PMID 10873802。S2CID 14825707 。 Joberty G、Petersen C、Gao L、Macara IG (2000)。「細胞極性タンパク質 Par6 は Par3 と非定型タンパク質キナーゼ C を Cdc42 にリンクします」。Nat . Cell Biol . 2 (8): 531–9. doi :10.1038/35019573. PMID 10934474. S2CID 27139234. Johansson A、Driessens M、Aspenström P (2000)。「Caenorhabditis elegans 極性タンパク質 PAR-6 の哺乳類ホモログは、Rho GTPase Cdc42 および Rac1 の結合パートナーである」。J . Cell Sci . 113 (18): 3267–75. doi :10.1242/jcs.113.18.3267. PMID 10954424。 Suzuki A, Yamanaka T, Hirose T, Manabe N, Mizuno K, Shimizu M, Akimoto K, Izumi Y, Ohnishi T, Ohno S (2001). 「非定型タンパク質キナーゼ C は進化的に保存された par タンパク質複合体に関与し、上皮特異的接合構造の確立に重要な役割を果たす」 J. Cell Biol . 152 (6): 1183–96. doi :10.1083/jcb.152.6.1183. PMC 2199212. PMID 11257119. Kohjima M, Noda Y, Takeya R, Saito N, Takeuchi K, Sumimoto H (2003). 「細胞極性タンパク質 PAR3 の新規ホモログである PAR3beta はタイトジャンクションに局在する」. Biochem. Biophys. Res. Commun . 299 (4): 641–6. doi :10.1016/S0006-291X(02)02698-0. PMID 12459187. Hurd TW、Gao L、Roh MH、Macara IG、Margolis B (2003)。「上皮タイトジャンクションアセンブリに関与する2つの極性複合体の直接相互作用」。Nat . Cell Biol . 5 (2): 137–42. doi :10.1038/ncb923. PMID 12545177. S2CID 25212419. Brajenovic M、Joberty G、Küster B、Bouwmeester T、Drewes G (2004)。「ヒト Par タンパク質複合体の包括的なプロテオーム解析により、相互接続されたタンパク質ネットワークが明らかになりました」。J . Biol. Chem . 279 (13): 12804–11. doi : 10.1074/jbc.M312171200 . PMID 14676191。 Lemmers C、Michel D、Lane-Guermonprez L、Delgrossi MH、Médina E、Arsanto JP、Le Bivic A (2004)。「CRB3 は Par6 に直接結合し、哺乳類上皮細胞のタイトジャンクションの形態形成を制御する」。Mol . Biol. Cell . 15 (3): 1324–33. doi :10.1091/mbc.E03-04-0235. PMC 363137. PMID 14718572 。 Weyrich P、Kapp K、Niederfellner G、Melzer M、Lehmann R、Häring HU、Lammers R (2005)。 「分配欠損プロテイン 6 は、非定型プロテインキナーゼ C を介してインスリン依存性グリコーゲン合成を制御します。」 モル。内分泌 。 18 (5): 1287–300。 土井 ： 10.1210/me.2003-0253 。 PMID 14976222。 Liu XF、Ishida H、Raziuddin R、Miki T (2004)。「ヌクレオチド交換因子ECT2は極性タンパク質複合体Par6/Par3/タンパク質キナーゼCzeta（PKCzeta）と相互作用し、PKCzeta活性を制御する」。Mol . Cell. Biol . 24 (15): 6665–75. doi :10.1128/MCB.24.15.6665-6675.2004. PMC 444862. PMID 15254234 。 Ballif BA、Villén J、Beausoleil SA、Schwartz D、Gygi SP (2005)。「発達中のマウス脳のホスホプロテオミクス解析」。Mol . Cell. Proteomics . 3 (11): 1093–101. doi : 10.1074/mcp.M400085-MCP200 . PMID 15345747。 Hirano Y, Yoshinaga S, Takeya R, Suzuki NN, Horiuchi M, Kohjima M, Sumimoto H, Inagaki F (2005). 「細胞極性調節因子の構造、非定型PKCとPar6 PB1ドメインの複合体」 J. Biol. Chem . 280 (10): 9653–61. doi : 10.1074/jbc.M409823200 . PMID 15590654. Weyrich P、Lammers R、Fritsche A、Machicao F、Häring HU、Stefan N (2005)。「分割欠陥タンパク質-6α遺伝子のプロモーターにおける新規機能多型（-336A/G）は、耐糖能の上昇および血清非エステル化脂肪酸濃度の低下と関連している」。Diabetologia . 48 ( 4): 669–74. doi : 10.1007/s00125-005-1688-4 . PMID 15744531。 Ozdamar B、Bose R、Barrios - Rodiles M、Wang HR、Zhang Y、Wrana JL (2005)。「TGFbeta 受容体による極性タンパク質 Par6 の調節が上皮細胞の可塑性を制御する」。Science。307 ( 5715 ) : 1603–9。Bibcode : 2005Sci ...307.1603O。doi :10.1126/science.1105718。PMID 15761148。S2CID 41013935 。 Barrios-Rodiles M、Brown KR、Ozdamar B、Bose R、Liu Z、Donovan RS、Shinjo F、Liu Y、Dembowy J、Taylor IW、Luga V、Przulj N、Robinson M、Suzuki H、Hayashizaki Y、Jurisica I、Wrana JL (2005)。「哺乳類細胞における動的シグナル伝達ネットワークのハイスループットマッピング」。Science。307 ( 5715 ) : 1621–5。Bibcode : 2005Sci ...307.1621B。doi :10.1126/science.1105776。PMID 15761153。S2CID 39457788 。
