MT-RNR1

ミトコンドリアにコードされた12S RNA
ミトコンドリアにコードされた12S RNA
識別子
シンボル	MT-RNR1
代替記号	MTRNR1 さん
NCBI遺伝子	4549
HGNC	7470
その他のデータ
軌跡	チャペルMT [1]

ミトコンドリアにコードされる12SリボソームRNA（12Sまたは12S rRNAと略されることが多い）は、ミトコンドリアリボソームのSSU rRNAである。ヒトでは、12SはMT-RNR1遺伝子によってコードされており、959ヌクレオチドの長さである。^[1]^[2]^[3] MT-RNR1は、動物のミトコンドリアゲノムに含まれる37の遺伝子の1つである。2つのrRNA、22のtRNA、および13のmRNA遺伝子は、特に12S rRNAと16S rRNAは、系統発生研究に非常に有用である。12S rRNAは、原核生物の16Sおよび真核生物の核18SリボソームRNAのミトコンドリア相同体である。 ^[4] MT-RNR1遺伝子の変異は、難聴に関連している可能性がある。^[5] rRNA遺伝子は、ミトコンドリア由来ペプチドMOTS-cまたはミトコンドリア12S rRNA-cのオープンリーディングフレームとしても知られるペプチドMOTS-cもコードしています。

構造

MT -RNR1遺伝子はミトコンドリアDNAのpアームの12番目の位置にあり、953塩基対にまたがっています。^[6]

関数

MT -RNR1遺伝子は、インスリン感受性と代謝恒常性の調節を担うrRNAをコードする。このタンパク質は葉酸サイクルの阻害剤として作用し、プリンの生合成を減少させ、プリンの生合成中間体である5-アミノイミダゾール-4-カルボキサミド（AICAR）の蓄積と代謝調節因子5'-AMP活性化タンパク質キナーゼ（AMPK）の活性化につながる。このタンパク質は加齢依存性および食事誘発性のインスリン抵抗性、ならびに食事誘発性肥満からも保護する。^[3]^[2]

臨床的意義

非症候性難聴および難聴、ミトコンドリア

MT-RNR1遺伝子の病原性変異は、遅発性のミトコンドリア非症候性難聴および素因性アミノグリコシド耳毒性を伴う難聴を引き起こすことがわかっている。^[7] 非症候性難聴は、他の徴候や症状を伴わない、さまざまな発症および重症度の部分的または完全な感音難聴（SNHL）を特徴とする。 ^[8]非症候性難聴のほとんどの形態は、内耳の構造の損傷によって引き起こされる永久的な難聴に関連している。^[2]^[3]MT-RNR1遺伝子の1494C>T、1555A>G、および1095T>Cの変異が難聴を引き起こすことが確認されている。^[9]^[10]^[11]

複合体IV欠損症

MT-RNR1変異は、ミトコンドリア呼吸鎖複合体IV欠損症（シトクロムc酸化酵素欠損症としても知られる）と関連している。シトクロムc酸化酵素欠損症は、骨格筋、心臓、脳、肝臓など、体の複数の部位に影響を及ぼす可能性のあるまれな遺伝性疾患である。一般的な臨床症状には、ミオパシー、筋緊張低下、脳筋症、乳酸アシドーシス、肥大型心筋症などがある。^[12]この欠損症の患者で9952G>A変異が見つかった。^[13]

参考文献

^ Anderson S、Bankier AT、Barrell BG、de Bruijn MH、Coulson AR、Drouin J、Eperon IC、Nierlich DP、Roe BA、Sanger F、Schreier PH、Smith AJ、Staden R、Young IG (1981 年 4 月)。「ヒトミトコンドリアゲノムの配列と構成」。Nature . 290 ( 5806 ) : 457–465。Bibcode : 1981Natur.290..457A。doi :10.1038/290457a0。PMID 7219534。S2CID 4355527。
^ abc 「UniProt: ユニバーサルタンパク質知識ベース」。核酸研究。45 (D1): D158–D169。2017年1月。doi : 10.1093 / nar/gkw1099。PMC 5210571。PMID 27899622 。
^ abc 「MT-RNR1 - ミトコンドリア由来ペプチド MOTS-c - Homo sapiens (ヒト) - MT-RNR1 遺伝子とタンパク質」。 2018年8月28日閲覧。 この記事には、CC BY 4.0 ライセンスに基づいて利用可能なテキストが組み込まれています。
^ Eperon IC、Anderson S、Nierlich DP (1980 年 7 月)。「ヒトミトコンドリアリボソーム RNA 遺伝子の独特な配列」。Nature . 286 ( 5772): 460–467。Bibcode : 1980Natur.286..460E。doi : 10.1038/286460a0。PMID 6157106。S2CID 4262269 。
^ Ballana E、Morales E、Rabionet R、Montserrat B、Ventayol M、Bravo O、Gasparini P、Estivill X (2006 年 3 月)。「ミトコンドリア 12S rRNA 遺伝子変異は RNA 二次構造に影響を及ぼし、聴覚障害の浸透度にばらつきをもたらす」。生化学および生物物理学的研究通信。341 (4): 950–957。doi :10.1016/ j.bbrc.2006.01.049。PMID 16458854 。
^ 「MT-RNR1ミトコンドリアでエンコードされた12S RNA [ホモサピエンス（ヒト）] - 遺伝子 - NCBI」。www.ncbi.nlm.nih.gov。
^ 宇佐美真一; 西尾真也 (1993)。「ミトコンドリア性非症候性難聴および聴覚障害」。GeneReviews®。ワシントン大学、シアトル。PMID 20301595 。
^ 参考文献、Genetics Home。「非症候性難聴」。Genetics Home Reference。
^ Li R, Greinwald JH, Yang L, Choo DI, Wenstrup RJ, Guan MX (2004 年 8 月). 「非症候性難聴の小児患者におけるミトコンドリア 12S rRNA および tRNASer(UCN) 遺伝子の分子解析」. Journal of Medical Genetics . 41 (8): 615–620. doi :10.1136/jmg.2004.020230. PMC 1735864. PMID 15286157 .
^ Zhao H、Li R、Wang Q、Yan Q、Deng JH、Han D、Bai Y、Young WY、Guan MX (2004 年 1 月)。「母系遺伝性のアミノグリコシド誘発性非症候性難聴は、大規模な中国人家族のミトコンドリア 12S rRNA 遺伝子の新規 C1494T 変異と関連している」。American Journal of Human Genetics。74 ( 1 ): 139–152。doi :10.1086/381133。PMC 1181901。PMID 14681830。
^ Yao YG、Salas A、Bravi CM、Bandelt HJ (2006 年6 月)。「聴覚障害のある東アジア人家族における完全な mtDNA 変異の再評価」。Human Genetics。119 ( 5 ) : 505–515。doi : 10.1007 /s00439-006-0154-9。PMID 16528519。S2CID 21173284。
^ 参考文献、遺伝学ホーム。「シトクロム c 酸化酵素欠損症」。遺伝学ホーム参考文献。この記事には、パブリックドメインであるこのソースからのテキストが組み込まれています。
^ Hanna MG、Nelson IP、Rahman S、Lane RJ、Land J、Heales S、Cooper MJ、Schapira AH、Morgan-Hughes JA、Wood NW (1998 年 7 月)。「ヒト mtDNA における最初の終止コドン点変異に関連するシトクロム c 酸化酵素欠損」。American Journal of Human Genetics。63 ( 1 ) : 29–36。doi :10.1086/301910。PMC 1377234。PMID 9634511。

外部リンク

GeneReviews/NCBI/NIH/UWの非症候性難聴と聴覚障害、ミトコンドリア

この記事には、パブリックドメインである米国国立医学図書館のテキストが組み込まれています。

[1] Anderson S、Bankier AT、Barrell BG、de Bruijn MH、Coulson AR、Drouin J、Eperon IC、Nierlich DP、Roe BA、Sanger F、Schreier PH、Smith AJ、Staden R、Young IG (1981 年 4 月)。「ヒトミトコンドリアゲノムの配列と構成」。Nature . 290 ( 5806 ) : 457–465。Bibcode : 1981Natur.290..457A。doi :10.1038/290457a0。PMID 7219534。S2CID 4355527。

[uniprot0-2] 「UniProt: ユニバーサルタンパク質知識ベース」。核酸研究。45 (D1): D158–D169。2017年1月。doi : 10.1093 / nar/gkw1099。PMC 5210571。PMID 27899622 。

[uniprot-3] 「MT-RNR1 - ミトコンドリア由来ペプチド MOTS-c - Homo sapiens (ヒト) - MT-RNR1 遺伝子とタンパク質」。 2018年8月28日閲覧。 この記事には、CC BY 4.0 ライセンスに基づいて利用可能なテキストが組み込まれています。

[4] ^ Eperon IC、Anderson S、Nierlich DP (1980 年 7 月)。「ヒトミトコンドリアリボソーム RNA 遺伝子の独特な配列」。Nature . 286 ( 5772): 460–467。Bibcode : 1980Natur.286..460E。doi : 10.1038/286460a0。PMID 6157106。S2CID 4262269 。

[pmid16458854-5] Ballana E、Morales E、Rabionet R、Montserrat B、Ventayol M、Bravo O、Gasparini P、Estivill X (2006 年 3 月)。「ミトコンドリア 12S rRNA 遺伝子変異は RNA 二次構造に影響を及ぼし、聴覚障害の浸透度にばらつきをもたらす」。生化学および生物物理学的研究通信。341 (4): 950–957。doi :10.1016/ j.bbrc.2006.01.049。PMID 16458854 。

[entrez-6] 「MT-RNR1ミトコンドリアでエンコードされた12S RNA [ホモサピエンス（ヒト）] - 遺伝子 - NCBI」。www.ncbi.nlm.nih.gov。

[7] 宇佐美真一; 西尾真也 (1993)。「ミトコンドリア性非症候性難聴および聴覚障害」。GeneReviews®。ワシントン大学、シアトル。PMID 20301595 。

[8] 参考文献、Genetics Home。「非症候性難聴」。Genetics Home Reference。

[9] Li R, Greinwald JH, Yang L, Choo DI, Wenstrup RJ, Guan MX (2004 年 8 月). 「非症候性難聴の小児患者におけるミトコンドリア 12S rRNA および tRNASer(UCN) 遺伝子の分子解析」. Journal of Medical Genetics . 41 (8): 615–620. doi :10.1136/jmg.2004.020230. PMC 1735864. PMID 15286157 .

[10] Zhao H、Li R、Wang Q、Yan Q、Deng JH、Han D、Bai Y、Young WY、Guan MX (2004 年 1 月)。「母系遺伝性のアミノグリコシド誘発性非症候性難聴は、大規模な中国人家族のミトコンドリア 12S rRNA 遺伝子の新規 C1494T 変異と関連している」。American Journal of Human Genetics。74 ( 1 ): 139–152。doi :10.1086/381133。PMC 1181901。PMID 14681830。

[11] ^ Yao YG、Salas A、Bravi CM、Bandelt HJ (2006 年6 月)。「聴覚障害のある東アジア人家族における完全な mtDNA 変異の再評価」。Human Genetics。119 ( 5 ) : 505–515。doi : 10.1007 /s00439-006-0154-9。PMID 16528519。S2CID 21173284。

[12] 参考文献、遺伝学ホーム。「シトクロム c 酸化酵素欠損症」。遺伝学ホーム参考文献。この記事には、パブリックドメインであるこのソースからのテキストが組み込まれています。

[13] Hanna MG、Nelson IP、Rahman S、Lane RJ、Land J、Heales S、Cooper MJ、Schapira AH、Morgan-Hughes JA、Wood NW (1998 年 7 月)。「ヒト mtDNA における最初の終止コドン点変異に関連するシトクロム c 酸化酵素欠損」。American Journal of Human Genetics。63 ( 1 ) : 29–36。doi :10.1086/301910。PMC 1377234。PMID 9634511。