ホモサピエンス種のタンパク質コード遺伝子
| LSP1 |
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| 利用可能な構造 |
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| PDB | オルソログ検索: PDBe RCSB |
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| PDB IDコードのリスト |
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3BH8、4NO0、4NO2 |
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| 識別子 |
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| エイリアス | LSP1、WP34、pp52、リンパ球特異的タンパク質1、リンパ球特異的タンパク質1 |
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| 外部ID | オミム: 153432; MGI : 96832;ホモロジーン: 1750;ジーンカード:LSP1; OMA :LSP1 - オルソログ |
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| 遺伝子の位置(マウス) |
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 | | クロ。 | 染色体7(マウス)[2] |
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| | バンド | 7 F5|7 87.93 cM | 始める | 142,014,546 bp [2] |
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| 終わり | 142,048,604 bp [2] |
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| RNA発現パターン |
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| ブギー | | 人間 | マウス(相同遺伝子) |
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| トップの表現 | - 顆粒球
- 血
- 単球
- 脾臓
- 付録
- 骨髄細胞
- 右副腎皮質
- リンパ節
- 左副腎
- 左副腎皮質
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| | トップの表現 | - 顆粒球
- 胸腺
- 腸間膜リンパ節
- 脛骨大腿関節
- 精管
- 脾臓
- 子宮
- リップ
- 輸出管
- 血
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| | 参照表現データの詳細 |
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| バイオGPS |  | | 参照表現データの詳細 |
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| オルソログ |
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| 種 | 人間 | ねずみ |
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| エントレズ | | |
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| アンサンブル | |
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ENSG00000130592 ENSG00000288199 |
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| ユニプロット | | |
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| RefSeq (mRNA) | NM_002339 NM_001013253 NM_001013254 NM_001013255 NM_001242932
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NM_001289005 |
| NM_001136071 NM_001271508 NM_001271509 NM_001271510 NM_001271523
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NM_019391 |
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| RefSeq (タンパク質) | NP_001013271 NP_001013272 NP_001013273 NP_001229861 NP_001275934
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NP_002330 |
| NP_001129543 NP_001258437 NP_001258438 NP_001258439 NP_001258452
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NP_062264 |
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| 場所 (UCSC) | 11 章: 1.85 – 1.89 Mb | 7 章: 142.01 – 142.05 Mb |
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| PubMed検索 | [3] | [4] |
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| ウィキデータ |
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リンパ球特異的タンパク質1は、ヒトではLSP1遺伝子によってコードされるタンパク質である。[5] [6]
この遺伝子は細胞内Fアクチン結合タンパク質をコードする。このタンパク質はリンパ球、好中球、マクロファージ、内皮細胞で発現し、好中球の運動性、フィブリノーゲンマトリックスタンパク質への接着、内皮透過性遊走を調節すると考えられる。選択的スプライシングにより、異なるアイソフォームをコードする複数の転写バリアントが生じる。[6]
参考文献
- ^ abc ENSG00000288199 GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000130592、ENSG00000288199 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000018819 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ Kadiyala RK、McIntyre BW、Krensky AM (1991 年 1 月)。「リン酸化ヒトリンパ球分化および活性化抗原 WP34 の分子クローニングと特性評価」。Eur J Immunol . 20 (11): 2417–23. doi :10.1002/eji.1830201109. PMID 2174784. S2CID 35829868.
- ^ ab 「Entrez Gene: LSP1 リンパ球特異的タンパク質 1」。
さらに読む
- Jongstra-Bilen J、Young AJ、Chong R、Jongstra J (1990)。「ヒトおよびマウスの LSP1 遺伝子は高度に保存されたリン酸化タンパク質をコードする」。J . Immunol . 144 (3): 1104–10. doi :10.4049/jimmunol.144.3.1104. PMID 2295815。
- Klein DP、Jongstra-Bilen J、Ogryzlo K、Chong R、Jongstra J (1989)。「リンパ球特異的Ca2+結合タンパク質LSP1は、細胞膜の細胞質面と関連している」。Mol . Cell. Biol . 9 (7): 3043–8. doi :10.1128/mcb.9.7.3043. PMC 362773. PMID 2674678 。
- Li Y、Guerrero A、Howard TH (1995)。「アクチン結合タンパク質、リンパ球特異的タンパク質1は、ヒト白血球およびヒト骨髄細胞株とリンパ細胞株で発現している」。J . Immunol . 155 (7): 3563–9. doi :10.4049/jimmunol.155.7.3563. PMID 7561054。
- Misener VL、Hui C、Malapitan IA、Ittel ME、Joyner AL、Jongstra J (1995)。 「マウス LSP1/S37 アイソフォームの発現。S37 は胚間葉細胞で発現されます。」J.Cell Sci.107 (12): 3591–600。土井:10.1242/jcs.107.12.3591。PMID 7706408。
- Maruyama K, Sugano S (1994). 「オリゴキャッピング:真核生物mRNAのキャップ構造をオリゴリボヌクレオチドで置き換える簡単な方法」Gene . 138 (1–2): 171–4. doi :10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
- Howard T、Li Y、Torres M、Guerrero A、Coates T (1994)。「47-kD および 89-kD タンパク質異常を伴う好中球アクチン機能不全で増加する 47-kD タンパク質はリンパ球特異的タンパク質である」。Blood . 83 ( 1): 231–41. doi : 10.1182/blood.V83.1.231.231 . PMID 8274738。
- May W、Korenberg JR、Chen XN、Lunsford L、Wood WJ、Thompson A、Wall R、Denny CT (1993)。「ヒトリンパ球特異的pp52遺伝子は高度に保存された分散ファミリーのメンバーである」。Genomics . 15 ( 3): 515–20. doi :10.1006/geno.1993.1102. PMID 8468046。
- Thompson AA、Omori SA、Gilly MJ、May W、Gordon MS、Wood J、Miyoshi E、Malone CS、Gimble J (1997)。「選択的スプライシングされたエクソンは、白血球 pp52 および間質細胞 S37 mRNA アイソフォームの組織特異的 5' 末端をエンコードします」。Genomics。32 ( 3 ) : 352–7。doi :10.1006/geno.1996.0129。PMID 8838798 。
- Huang CK、Zhan L、Ai Y、Jongstra J (1997)。「LSP1 はヒト好中球におけるミトゲン活性化プロテインキナーゼ活性化プロテインキナーゼ 2 の主要基質である」。J . Biol. Chem . 272 (1): 17–9. doi : 10.1074/jbc.272.1.17 . PMID 8995217。
- Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (1997). 「全長濃縮cDNAライブラリーおよび5'末端濃縮cDNAライブラリーの構築と特性評価」. Gene . 200 (1–2): 149–56. doi :10.1016/S0378-1119(97)00411-3. PMID 9373149.
- Palker TJ、Fong AM、 Scearce RM、Patel DD、Haynes BF (1999)。「ヒトT細胞成熟中の胸腺におけるリンパ球特異的タンパク質1(LSP1)発現の発達的調節」。ハイブリドーマ。17(6):497–507。doi :10.1089/hyb.1998.17.497。PMID 9890705 。
- Pulford K、Jones M、Banham AH、Haralambieva E、Mason DY (1999)。「リンパ球特異的タンパク質1:ヒト白血球の特異的マーカー」。免疫学。96 ( 2 ): 262–71。doi : 10.1046 / j.1365-2567.1999.00677.x。PMC 2326732。PMID 10233704。
- Zhang Q、Li Y、Howard TH (2000)。「ヒトリンパ球特異的タンパク質1は、47kDaおよび89kDaタンパク質異常(NAD 47/89)を伴う好中球アクチン機能不全において過剰発現するタンパク質であり、複数のF-アクチン結合ドメインを有する」。J . Immunol . 165 (4): 2052–8. doi : 10.4049/jimmunol.165.4.2052 . PMID 10925289。
- Zhang Q、Li Y、Howard TH (2002)。「ヒトリンパ球特異的タンパク質1の毛髪形成活性には、カルデスモン様ドメインとビリンヘッドピース様ドメインの協力が必要である」。Cell Motil 。細胞骨格。49 (4): 179–88。doi : 10.1002/ cm.1031。PMID 11746662 。
- Strausberg RL、Feingold EA、Grouse LH、Derge JG、Klausner RD、Collins FS、Wagner L、Shenmen CM、Schuler GD (2003)。「15,000 を超える完全長のヒトおよびマウス cDNA 配列の生成と初期分析」。Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 99 ( 26): 16899–903。Bibcode : 2002PNAS ... 9916899M。doi : 10.1073/ pnas.242603899。PMC 139241。PMID 12477932。
- Wong MJ、Malapitan IA、Sikorski BA、Jongstra J (2003)。「無細胞結合アッセイにより、LSP1 細胞骨格結合部位が COOH 末端の 30 アミノ酸にマッピングされる」。Biochim . Biophys. Acta . 1642 (1–2): 17–24. doi :10.1016/S0167-4889(03)00082-X. PMID 12972289。
- 太田 孝文、鈴木 勇、西川 孝文、大月 孝文、杉山 孝文、入江 亮、若松 明、林 健、佐藤 秀 (2004)。「21,243 個の完全長ヒト cDNA の完全配列決定と特性解析」。Nat . Genet . 36 (1): 40–5. doi : 10.1038/ng1285 . PMID 14702039。
- Harrison RE、Sikorski BA、Jongstra J (2005)。「白血球特異的タンパク質 1 は ERK/MAP キナーゼ スキャフォールド タンパク質 KSR と MEK1 および ERK2 をアクチン細胞骨格に標的化する」。J . Cell Sci . 117 (Pt 10): 2151–7. doi :10.1242/jcs.00955. PMID 15090600. S2CID 11827355.
- Hassel S、Eichner A、Yakymovych M、Hellman U、Knaus P、Souchelnytskyi S (2004)。「タイプ II 骨形成タンパク質受容体 (BMPR-II) に関連し、2 次元ゲル電気泳動および質量分析によって同定されたタンパク質」。プロテオミクス。4 ( 5 ) : 1346–58。doi : 10.1002 /pmic.200300770。PMID 15188402。S2CID 6773754。