ホモサピエンスで発見された哺乳類タンパク質
| LRAT |
|---|
|
| 利用可能な構造 |
|---|
| PDB | オルソログ検索: PDBe RCSB |
|---|
|
|
| 識別子 |
|---|
| エイリアス | LRAT、LCA14、レシチンレチノールアシルトランスフェラーゼ(ホスファチジルコリン-レチノールO-アシルトランスフェラーゼ)、レシチンレチノールアシルトランスフェラーゼ |
|---|
| 外部ID | オミム:604863; MGI : 1891259;ホモロジーン: 3483;ジーンカード:LRAT; OMA :LRAT - オルソログ |
|---|
|
| 遺伝子の位置(マウス) |
|---|
 | | クロ。 | 染色体3(マウス)[2] |
|---|
| | バンド | 3|3 E3 | 始める | 82,799,886 bp [2] |
|---|
| 終わり | 82,811,280 bp [2] |
|---|
|
| RNA発現パターン |
|---|
| ブギー | | 人間 | マウス(相同遺伝子) |
|---|
| トップの表現 | - 網膜色素上皮
- 睾丸
- 生殖腺
- 胆嚢
- 小腸粘膜
- C1セグメント
- 十二指腸
- 肝臓の右葉
- S状結腸の筋層
- 脛骨神経
|
| | トップの表現 | - 網膜色素上皮
- 中央隆起
- 弓状核
- 小腸上皮
- 右肺
- 右肺葉
- パネートセル
- 毛様体
- 十二指腸
- 移動性腸管神経堤細胞
|
| | 参照表現データの詳細 |
|
|---|
| バイオGPS |  | | 参照表現データの詳細 |
|
|---|
|
| 遺伝子オントロジー |
|---|
| 分子機能 |
- アシルトランスフェラーゼ活性
- レチノール結合
- O-アシルトランスフェラーゼ活性
- トランスフェラーゼ活性
- レチノイン酸結合
- レシチン:11-シスレチノールアシルトランスフェラーゼ活性
- O-パルミトイルトランスフェラーゼ活性
- ホスファチジルコリン-レチノール O-アシルトランスフェラーゼ活性
| | 細胞成分 |
- 小胞体
- 細胞質
- エンドソーム
- 膜の不可欠な構成要素
- 膜
- 細胞内膜で囲まれた細胞小器官
- 小胞体膜
- 多胞体
- 粗面小胞体
- 細胞質の核周囲領域
| | 生物学的プロセス |
- ビタミンAの代謝プロセス
- 視覚
- レチノイド代謝プロセス
- 刺激に対する反応
- 脂質輸送の正の調節
- 白血病阻害因子に対する細胞反応
- レチノール代謝プロセス
- レチノイン酸への反応
- ビタミンAへの反応
- 細菌に対する反応
| | 出典:Amigo / QuickGO |
|
|
| ウィキデータ |
|
レシチンレチノールアシルトランスフェラーゼは、ヒトではLRAT遺伝子によってコードされる酵素である。[5] [6]
関数
レシチンレチノールアシルトランスフェラーゼは、光変換中にオールトランスレチノールをオールトランスレチニルエステルにエステル化する反応を触媒するミクロソーム酵素であり、視覚系のレチノイドサイクルと肝臓のビタミン A状態に不可欠な反応です。
臨床的意義
この遺伝子の変異は早期発症の重度網膜ジストロフィーと関連している。[6]
LRATは正常結腸上皮と比較して大腸癌細胞で過剰発現していた。強いLRAT発現は大腸癌患者の予後不良と関連していた。[7]
参照
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000121207 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000028003 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ Ruiz A、Winston A、Lim YH、Gilbert BA、Rando RR、Bok D (1999 年 2 月)。「レシチン レチノール アシルトランスフェラーゼの分子および生化学的特性」。J Biol Chem . 274 (6): 3834–41. doi : 10.1074/jbc.274.6.3834 . PMID 9920938。
- ^ ab "Entrez Gene: LRAT レシチン レチノール アシルトランスフェラーゼ (ホスファチジルコリン-レチノール O-アシルトランスフェラーゼ)"。
- ^ Brown, Gordon; Beatriz Cash; Daniela Blihoghe; Petronella Johansson; Ayham Alnabulsi; Graeme Murray (2014-03-07). 「大腸がんにおけるレチノイン酸代謝酵素の発現と予後的意義」. PLOS ONE . 9 (3): e90776. Bibcode :2014PLoSO...990776B. doi : 10.1371/journal.pone.0090776 . PMC 3946526. PMID 24608339 .
さらに読む
- Ross AC, Zolfaghari R (2004). 「肝臓レチノール代謝の調節:ビタミンA状態に関する研究からの視点」J. Nutr . 134 (1): 269S–275S. doi : 10.1093/jn/134.1.269S . PMID 14704332.
- Herr FM、Ong DE (1992)。「レシチン-レチノールアシルトランスフェラーゼと細胞レチノール結合タンパク質との異なる相互作用」。生化学。31 ( 29 ): 6748–55。doi :10.1021/bi00144a014。PMID 1322170 。
- Mata NL、Tsin AT (1998)。「ウシ網膜色素上皮膜における11-cis LRAT、11-cis RD、11-cis REHの分布」。Biochim . Biophys. Acta . 1394 (1): 16–22. doi :10.1016/s0005-2760(98)00078-2. PMID 9767084。
- Mondal MS、 Ruiz A、 Bok D、Rando RR (2000)。「レシチンレチノールアシルトランスフェラーゼには触媒に必須のシステイン残基が含まれている」。生化学。39 (17): 5215–20。doi :10.1021/bi9929554。PMID 10819989 。
- Ruiz A、Kuehn MH、Andorf JL、他 (2001)。「ヒト網膜色素上皮におけるレシチンレチノールアシルトランスフェラーゼをコードする遺伝子のゲノム構成と変異分析」。Invest . Ophthalmol. Vis. Sci . 42 (1): 31–7. PMID 11133845。
- Andreola F、Giandomenico V、Spero R、De Luca LM (2001)。「MCF-7 細胞における小型レシチン:レチノールアシルトランスフェラーゼ転写産物の発現とレチノールエステル化の減少」。Biochem . Biophys. Res. Commun . 279 (3): 920–4. doi :10.1006/bbrc.2000.3995. PMID 11162450. S2CID 25916469。
- Thompson DA、Li Y、McHenry CL、他 (2001)。「レシチン レチノール アシルトランスフェラーゼをコードする遺伝子の変異は、早期発症の重篤な網膜ジストロフィーと関連している」。Nat . Genet . 28 (2): 123–4. doi :10.1038/88828. PMID 11381255. S2CID 19391022.
- Jahng WJ、Cheung E、Rando RR (2002)。「レシチンレチノールアシルトランスフェラーゼは機能的ホモ二量体を形成する」。 生化学。41 ( 20 ) : 6311–9。doi :10.1021/bi015710b。PMC 5503676。PMID 12009892。
- Strausberg RL、Feingold EA、Grouse LH、他 (2003)。「15,000 を超える完全長のヒトおよびマウス cDNA 配列の生成と初期分析」。Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 99 ( 26): 16899–903。Bibcode : 2002PNAS ... 9916899M。doi : 10.1073/ pnas.242603899。PMC 139241。PMID 12477932。
- Zhan HC、Gudas LJ、Bok D、他 (2004)。「レチノールをエステル化する酵素、レシチン:レチノールアシルトランスフェラーゼの、ヒト腎癌のサブタイプと正常腎臓における異なる発現」。Clin . Cancer Res . 9 (13): 4897–905. PMID 14581364。
- Jahng WJ 、Xue L、Rando RR (2004)。「レシチン レチノール アシルトランスフェラーゼ は、新しい酵素ファミリーの創始メンバーです。」生化学。42 (44): 12805–12。doi : 10.1021 /bi035370p。PMC 5511752。PMID 14596594。
- Boorjian S、Tickoo SK、Mongan NP、他 (2004)。「レシチン:レチノールアシルトランスフェラーゼ発現の減少は膀胱癌における病理学的腫瘍ステージの上昇と相関する」。Clin . Cancer Res . 10 (10): 3429–37. doi : 10.1158/1078-0432.CCR-03-0756 . PMID 15161698。
- Zolfaghari R、Ross AC (2005)。「ヒト肝臓由来レシチン:レチノールアシルトランスフェラーゼcDNAにおける選択的スプライシングプロセスのクローニング、遺伝子構成および同定」。Gene . 341 : 181–8. doi :10.1016/j.gene.2004.06.043. PMC 3843125 . PMID 15474300。
- Gerhard DS、Wagner L、Feingold EA、他 (2004)。「NIH 完全長 cDNA プロジェクトの現状、品質、拡大: 哺乳類遺伝子コレクション (MGC)」。Genome Res . 14 (10B): 2121–7. doi :10.1101/gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334 。
- O'Byrne SM、Wongsiriroj N、Libien J、他 (2005)。「レシチン:レチノールアシルトランスフェラーゼ (LRAT) を欠損したマウスではレチノイドの吸収と貯蔵が阻害される」。J . Biol. Chem . 280 (42): 35647–57. doi : 10.1074/jbc.M507924200 . PMC 1352312. PMID 16115871 。
- Rual JF、Venkatesan K、Hao T、他 (2005)。「ヒトタンパク質間相互作用ネットワークのプロテオームスケールマップに向けて」。Nature . 437 ( 7062 ) : 1173–8。Bibcode :2005Natur.437.1173R。doi : 10.1038 /nature04209。PMID 16189514。S2CID 4427026。
- Xue L, Jahng WJ, Gollapalli D, Rando RR (2006). 「レシチンレチノールアシルトランスフェラーゼのパルミトイルトランスフェラーゼ活性」.生化学. 45 (35): 10710–8. doi :10.1021/bi060897y. PMC 2529161. PMID 16939223 .
- Sénéchal A、Humbert G、Surget MO、他。 (2006年)。 「レチノイド代謝の遺伝子のスクリーニング: レバー先天性黒内障における新規 LRAT 変異」。午前。 J.Ophthalmol.142 (4): 702–4。土井:10.1016/j.ajo.2006.04.057。PMID 17011878。
外部リンク
- GeneReviews/NCBI/NIH/UW の網膜色素変性症に関するエントリーの概要