| LYPD1 |
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| 識別子 |
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| 別名 | LYPD1、LYPDC1、PHTS、LY6/PLAURドメイン含有1 |
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| 外部ID | オミム: 610450 ; MGI : 1919835 ;ホモロジーン: 16937 ;ジーンカード: LYPD1 ; OMA : LYPD1 - オルソログ |
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| RNA発現パターン |
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| Bgee | | 人間 | マウス(相同体) |
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| トップは | - 右卵管
- 側坐核
- 尾状核
- 被殻
- 心室帯
- 視床下部
- 扁桃体
- 下垂体
- 帯状回
- 前帯状皮質
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| | トップは | - 舌咽神経節
- 迷走神経節
- 海馬歯状回顆粒細胞
- 楔形骨
- 脳神経
- 迷走神経下神経節
- 扁桃体
- 嗅神経
- 一次視覚野
- 上前頭回
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| | より多くの参照発現データ |
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| バイオGPS |  | | より多くの参照発現データ |
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| 遺伝子オントロジー |
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| 分子機能 | - アセチルコリン受容体結合
- アセチルコリン受容体阻害活性
| | 細胞成分 | | | 生物学的プロセス | - ニコチンに対する反応
- 行動的恐怖反応
- シグナル伝達受容体活性の負の制御
- シナプス伝達、コリン作動性
- 細胞活性化
- アセチルコリン受容体シグナル伝達経路
- タンパク質の細胞膜への局在の負の制御
| | 出典:Amigo / QuickGO |
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| オルソログ |
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| 種 | 人間 | ねずみ |
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| アントレ | | |
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| アンサンブル | | |
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| UniProt | | |
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| RefSeq(mRNA) | |
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NM_001077427 NM_144586 NM_001321234 NM_001321235 |
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NM_145100 NM_001311089 NM_001311090 |
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| RefSeq(タンパク質) | |
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NP_001070895 NP_001308163 NP_001308164 NP_653187 |
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NP_001298018 NP_001298019 NP_659568 |
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| 所在地(UCSC) | Chr 2: 132.64 – 132.67 MB | 染色体1:125.8~125.84MB |
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| PubMed検索 | [ 3 ] | [ 4 ] |
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| ウィキデータ |
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Ly6/PLAURドメイン含有タンパク質1は、ヒトではLYPD1遺伝子によってコードされるタンパク質である。[ 5 ] [ 6 ]
このタンパク質は、神経伝達物質受容体結合タンパク質であるLynxファミリーの一員である Lynx2 としても知られています。 [ 7 ] Lynx2 の発現がないトランスジェニックマウスは、不安関連行動が増加します。[ 8 ]
参考文献
- 1 2 3 GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000150551 – Ensembl、2017年5月
- 1 2 3 GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000026344 – Ensembl、2017年5月
- ↑ 「ヒトPubMed参照:」。米国国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ↑ 「マウス PubMed 参照:」。米国国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ↑ストラウスバーグ RL、ファインゴールド EA、グラウス LH、デルゲ JG、クラウスナー RD、コリンズ FS、ワーグナー L、シェンメン CM、シューラー GD、アルトシュール SF、ゼーベルク B、ビュトウ KH、シェーファー CF、バート NK、ホプキンス RF、ジョーダン H、ムーア T、マックス SI、ワン J、シェイ F、ディアチェンコL、マルシナ K、ファーマー AA、ルービン GM、ホン L、ステープルトン M、ソアレス MB、ボナルド MF、カサバント TL、シェッツ TE、ブラウンスタイン MJ、ウスディン TB、俊之 S、カルニンチ P、プランゲ C、ラハ SS、ロケジャノ NA、ピーターズ GJ、アブラムソン RD、マラヒー SJ、ボサック SA、マキューアン PJ、マッカーナンKJ、マレク JA、グナラトネPH、Richards S、Worley KC、Hale S、Garcia AM、Gay LJ、Hulyk SW、Villalon DK、Muzny DM、Sodergren EJ、Lu X、Gibbs RA、Fahey J、Helton E、Ketteman M、Madan A、Rodrigues S、Sanchez A、Whiting M、Madan A、Young AC、Shevchenko Y、Bouffard GG、Blakesley RW、Touchman JW、Green ED、Dickson MC、Rodriguez AC、Grimwood J、Schmutz J、Myers RM、Butterfield YS、Krzywinski MI、Skalska U、Smailus DE、Schnerch A、Schein JE、Jones SJ、Marra MA (2002 年 12 月)。「15,000 を超える全長ヒトおよびマウス cDNA 配列の生成と初期解析」。Proc Natl Acad Sci USA。99 (26): 16899–903 . Bibcode : 2002PNAS...9916899M . doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241 . PMID 12477932 .
- ↑ "Entrez Gene: LYPD1 LY6/PLAURドメイン含有1"。
- ↑ Miwa, JM; Lester, HA; Walz, A. (2012). "ニコチン受容体のLynxモジュレーターによるコリン作動性トーンの最適化:可塑性とニコチン中毒への影響". Physiology . 27 (4): 187– 199. doi : 10.1152/physiol.00002.2012 . PMID 22875450 .
- ↑ Tekinay, AB; Nong, Y.; Miwa, JM; Lieberam, I.; Ibanez-Tallon, I.; Greengard, P.; Heintz, N. (2009). "不安関連行動におけるLYNX2の役割" . Proceedings of the National Academy of Sciences . 106 (11): 4477– 4482. Bibcode : 2009PNAS..106.4477T . doi : 10.1073/pnas.0813109106 . PMC 2657456 . PMID 19246390 .
さらに読む
- Yu DH、Fan W、Liu Gら (2006)。「PHTSは、新規の推定腫瘍抑制因子であり、p53経路とは独立してHeLaHF細胞の形質転換逆転に関与する」。Exp . Cell Res . 312 ( 6):865–76。doi : 10.1016 / j.yexcr.2005.12.006。PMID 16413018。
- Choy KW、Wang CC、Ogura Aら(2007)。「妊娠初期のヒト眼球から同定された15,809個のESTのゲノムアノテーション」 。Physiol . Genomics。25 ( 1):9–15。doi:10.1152 /physiolgenomics.00121.2005。PMID 16368877。
- Kimura K, Wakamatsu A, Suzuki Y, et al. (2006). "転写調節の多様化:ヒト遺伝子の推定代替プロモーターの大規模同定と特徴付け" . Genome Res . 16 (1): 55–65 . doi : 10.1101/gr.4039406 . PMC 1356129. PMID 16344560 .
- 大槻 哲也、太田 哲也、西川 哲也ら (2007). 「オリゴキャップ付きcDNAライブラリーから分泌タンパク質または膜タンパク質をコードする全長ヒトcDNAを選択するためのシグナル配列およびキーワードトラップのin silico」 . DNA Res . 12 (2): 117–26 . doi : 10.1093/dnares/12.2.117 . PMID 16303743 .
- Gerhard DS、Wagner L、Feingold EA、et al. (2004) 「NIH全長cDNAプロジェクトの現状、品質、および拡張:哺乳類遺伝子コレクション(MGC)」 . Genome Res . 14 (10B): 2121–7 . doi : 10.1101 /gr.2596504 . PMC 528928. PMID 15489334 .
- Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T, et al. (2004). "21,243個の全長ヒトcDNAの完全配列決定と特性解析" . Nat. Genet . 36 (1): 40–5 . doi : 10.1038/ng1285 . PMID 14702039 .
- Clark HF、Gurney AL、Abaya E、et al. (2003)。「分泌タンパク質発見イニシアチブ(SPDI)、新規ヒト分泌タンパク質および膜貫通タンパク質を同定するための大規模な取り組み:バイオインフォマティクス評価」。Genome Res . 13 ( 10): 2265–70 . doi : 10.1101/gr.1293003 . PMC 403697. PMID 12975309 .