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エンベコウイルスは、ベータコロナウイルス属のコロナウイルスの亜属です。 [ 1 ]この亜属のウイルスは、他のコロナウイルスとは異なり、ヘマグルチニンエステラーゼ(HE)遺伝子を持っています。 [ 2 ]この亜属のウイルスは、以前はグループ2aコロナウイルスとして知られていました。 [ 3 ] [ 4 ]
この亜属には、学名とそれに続く種の代表的なウイルスの順に、以下の種が含まれています。[ 5 ] [ 6 ]
この亜属のウイルスは、他のコロナウイルスと同様に、膜(M)、エンベロープ(E)、スパイク(S)構造タンパク質が固定されている脂質二重層エンベロープを持っています。[ 7 ]他のコロナウイルスとは異なり、この亜属のウイルスは、ヘマグルチニンエステラーゼ(HE)と呼ばれる、より短いスパイク状の構造タンパク質も持っています。[ 2 ] [ 8 ]
遺伝子組換えは、 2 つ以上のウイルスゲノムが同じ宿主細胞内に存在する場合に起こり得る。ヒトコブラクダベータコロナウイルス (Beta-CoV HKU23) は、アフリカのラクダ集団において遺伝的多様性を示している。[ 9 ] この多様性に寄与しているのは、過去に近縁のエンベコウイルス亜属のベータコロナウイルス間で起こったいくつかの組換え事象である。[ 9 ]
ベータコロナウイルスサブグループAのすべてのメンバーでは、ノイラミン酸O-アセチルエステラーゼ活性と活性部位FGDSを持つ糖タンパク質をコードするヘマグルチニンエステラーゼ(HE)遺伝子がORF1abの下流、S遺伝子の上流に存在します(図1)。
図 2 を参照。
CoVは、アルファコロナウイルス、ベータコロナウイルス、ガンマクロナウイルス、デルタコロナウイルスの4つの属に分類されます。ベータコロナウイルス内では、系統 A、B、C、D にさらに分類できます [1]。 2018年に、これら4つの系統はベータコロナウイルスの亜属として再分類され、エンベコウイルス(以前の系統A)、サルベコウイルス(以前の系統B)、メルベコウイルス(以前の系統C)、ノベコウイルス(以前の系統D)と改名されました[2]。さらに、5番目の亜属であるヒベコウイルスも追加されました(図1)[2]。
HE 遺伝子が Betacoronavirus サブグループ A のメンバーにのみ存在し、Betacoronavirus サブグループ B、C、D のメンバーには存在しないことから、組換えは Betacoronavirus の他のサブグループの祖先から分岐した後、Betacoronavirus サブグループ A のメンバーの祖先で起こった可能性が高いことが示唆された。