ホモサピエンス種のタンパク質コード遺伝子
| ＨＭＧＮ１ |
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| 識別子 |
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| エイリアス | HMGN1、HMG14、高移動度グループヌクレオソーム結合ドメイン1 |
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| 外部ID | オミム: 163920; MGI : 96120;ホモロジーン: 3643;ジーンカード：HMGN1; OMA :HMGN1 - オルソログ |
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| 遺伝子の位置（マウス） |
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 | | クロ。 | 16番染色体（マウス）[2] |
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| | バンド | 16 C4|16 56.83 cM | 始める | 95,921,818 bp [2] |
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| 終わり | 95,928,929bp [2 ] |
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| RNA発現パターン |
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| ブギー | | 人間 | マウス（相同遺伝子） |
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| トップの表現 | - 心室帯
- 神経節隆起
- 子宮内膜
- 右子宮管
- 付録
- リンパ節
- 鼻粘膜の嗅覚領域
- 直腸
- ランゲルハンス島
- 骨髄
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| | トップの表現 | - 網膜の神経層
- 卵黄嚢
- 心室帯
- 胚
- 胚
- 性器結節
- 胎児の尾
- リップ
- 受精卵
- 右腎臓
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| | 参照表現データの詳細 |
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| バイオGPS | |
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| 遺伝子オントロジー |
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| 分子機能 |
- ヌクレオソームDNA結合
- DNA結合
- クロマチン結合
| | 細胞成分 | | | 生物学的プロセス |
- DNAテンプレート転写、伸長の正の制御
- ヌクレオチド除去修復によるピリミジン二量体の修復
- 転写連動ヌクレオチド除去修復
- クロマチン組織
- RNAポリメラーゼIIによる転写の調節
- UV-Bへの反応
- UV-Cへの反応
- 発達の調節、異時性
- 胚後期のカメラ型眼の形態形成
- 上皮細胞増殖の調節
- NAD+ ADP-リボシルトランスフェラーゼ活性の正の調節
| | 出典:Amigo / QuickGO |
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| ウィキデータ |
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非ヒストン染色体タンパク質HMG-14は、ヒトではHMGN1遺伝子によってコードされるタンパク質である。[5] [6] [7]
関数
染色体タンパク質HMG14とその類似体HMG17 （MIM 163910）は、ヌクレオソームDNAの内側に結合し、DNAとヒストン八量体との相互作用を変化させる可能性があります。この2つのタンパク質は、転写可能な遺伝子を独特のクロマチン構造に維持するプロセスに関与している可能性があります。[8]これらの普遍的な分布と相対的な豊富さ、およびHMG14ファミリータンパク質のDNA結合ドメインの高度な進化的保存性は、これらが重要な細胞機能に関与している可能性があることを示唆しています。[7]
インタラクション
HMGN1はYWHAZと相互作用することが示されている。[9]
参照
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000205581 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000040681 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ Landsman D、Srikantha T、Westermann R、 Bustin M (1986年12月)。「染色体タンパク質HMG-14。完全なヒトcDNA配列と多重遺伝子ファミリーの証拠」。The Journal of Biological Chemistry。261 ( 34): 16082–6。doi : 10.1016 /S0021-9258(18)66680-3。PMID 3782107。
- ^ Landsman D、McBride OW、Soares N、Crippa MP、Srikantha T、Bustin M (1989年2月)。「染色体タンパク質HMG-14。大規模なヒト多重遺伝子ファミリーからの機能遺伝子の同定、特徴付け、および染色体局在」。The Journal of Biological Chemistry。264 ( 6): 3421–7。doi : 10.1016/S0021-9258(18) 94084-6。PMID 2563381。
- ^ ab 「Entrez Gene: HMGN1 高移動度グループ ヌクレオソーム結合ドメイン 1」。
- ^ マルティネス・デ・パスA、アウシオJ (2016). 「HMGN: エンハンサー・チャーマーズ」。バイオエッセイ。38 (3): 226–31。土井：10.1002/bies.201500157。PMID 26709929。S2CID 24768724 。
- ^ Prymakowska-Bosak M、Hock R、Catez F、Lim JH、Birger Y、Shirakawa H、Lee K、Bustin M (2002 年 10 月)。「染色体タンパク質 HMGN1 の有糸分裂リン酸化は核内への輸送を阻害し、14.3.3 タンパク質との相互作用を促進する」。分子細胞 生物学。22 (19): 6809–19。doi : 10.1128 /MCB.22.19.6809-6819.2002。PMC 134047。PMID 12215538。
さらに読む
- Pash J、Popescu N、Matocha M、Rapoport S、Bustin M (1990 年 5 月)。「染色体タンパク質 HMG-14 遺伝子はヒト染色体 21 のダウン症候群領域にマッピングされ、マウスの 16 トリソミーで過剰発現している」。米国 科学アカデミー紀要。87 (10): 3836–40。Bibcode : 1990PNAS ...87.3836P。doi : 10.1073 / pnas.87.10.3836。PMC 53998。PMID 2140193。
- Leffak M、 Trempe JP (1985年7 月)。「ヒストン H1 と HMG 14/17は核内に非ランダムに沈着する」。 核酸研究。13 (13): 4853–69。doi :10.1093/nar/13.13.4853。PMC 321831。PMID 4022776。
- Postnikov YV、Trieschmann L、Rickers A、Bustin M (1995 年 9 月)。「ヌクレオソームコア内の染色体タンパク質 HMG-14 および HMG-17 のホモ二量体」。Journal of Molecular Biology。252 ( 4): 423–32。doi : 10.1006 /jmbi.1995.0508。PMID 7563062 。
- Ding HF、Rimsky S、Batson SC、Bustin M、Hansen U (1994 年 8 月)。「染色体タンパク質 HMG-14 による RNA ポリメラーゼ II 伸長の刺激」。Science。265 ( 5173 ) : 796–9。Bibcode : 1994Sci ...265..796D。doi :10.1126/science.8047885。PMID 8047885 。
- Pash JM、Alfonso PJ、Bustin M (1993 年 6 月)。「高移動度群染色体タンパク質 14 の異常発現は細胞分化に影響を与える」。The Journal of Biological Chemistry。268 ( 18): 13632–8。doi : 10.1016/S0021-9258(19) 38695-8。PMID 8514795。
- Bustin M、Alfonso PJ、Pash JM、Ward JM、Gearhart JD、Reeves RH (1995 年 12 月)。「クロマチン中の染色体タンパク質 HMG-14 の含有量が増加したトランスジェニック マウスの特性」。DNAおよび細胞生物学。14 (12): 997–1005。doi :10.1089/dna.1995.14.997。PMID 8534374 。
- Hock R、Scheer U、Bustin M (1998 年 12 月)。「染色体タンパク質 HMG-14 および HMG-17 は有糸分裂染色体から放出され、能動輸送によって核に取り込まれる」。The Journal of Cell Biology。143 ( 6 ): 1427–36。doi :10.1083/jcb.143.6.1427。PMC 2132996。PMID 9852141 。
- Louie DF、Gloor KK、Galasinski SC、 Resing KA、Ahn NG (2000 年 1 月)。「質量分析法による高移動度グループタンパク質 14 および 17 のリン酸化と細胞内再分布の分析」。タンパク質科学。9 ( 1 ) : 170–9。doi :10.1110/ps.9.1.170。PMC 2144438。PMID 10739259。
- Bergel M、Herrera JE、Thatcher BJ、Prymakowska-Bosak M、Vassilev A、Nakatani Y、Martin B、Bustin M (2000 年 4 月)。「p300 による染色体タンパク質 HMG-14 のヌクレオソーム結合ドメイン内の新規部位のアセチル化により、ヌクレオソームとの相互作用が変化する」。The Journal of Biological Chemistry。275 ( 15): 11514–20。doi : 10.1074/jbc.275.15.11514。PMID 10753971。
- Prymakowska-Bosak M、Misteli T、Herrera JE、Shirakawa H 、 Birger Y、Garfield S、Bustin M (2001 年 8 月)。「有糸分裂リン酸化は HMGN タンパク質のクロマチンへの結合を阻止する」。 分子細胞生物学。21 (15): 5169–78。doi : 10.1128 /MCB.21.15.5169-5178.2001。PMC 87241。PMID 11438671。
- Prymakowska-Bosak M、Hock R、Catez F、Lim JH、Birger Y、Shirakawa H、Lee K、Bustin M (2002 年 10 月)。「染色体タンパク質 HMGN1 の有糸分裂リン酸化は核内への輸送を阻害し、14.3.3 タンパク質との相互作用を促進する」。分子 細胞生物学。22 (19): 6809–19。doi :10.1128/ MCB.22.19.6809-6819.2002。PMC 134047。PMID 12215538。
- Soloaga A、Thomson S、Wiggin GR、Rampersaud N、Dyson MH、Hazzalin CA、Mahadevan LC、Arthur JS (2003 年 6 月)。「MSK2 と MSK1 は、ミトゲンおよびストレスによるヒストン H3 と HMG-14 のリン酸化を媒介する」。EMBOジャーナル。22 ( 11 ) : 2788–97。doi : 10.1093/emboj/cdg273。PMC 156769。PMID 12773393。
- Zou Y、Jiang X、Wang Y (2004 年 5 月)。「MCF-7 ヒト乳がん細胞由来の高移動度グループ N1 タンパク質における新規生体内リン酸化部位の同定」。生化学。43 ( 20 ): 6322–9。doi :10.1021/bi0362828。PMID 15147216 。
- Beausoleil SA、Jedrychowski M、Schwartz D、Elias JE、Villén J、Li J、Cohn MA、Cantley LC、Gygi SP (2004 年 8 月)。「HeLa 細胞核リン酸化タンパク質の大規模特性評価」。米国科学アカデミー紀要。101 (33): 12130–5。Bibcode : 2004PNAS..10112130B。doi : 10.1073 / pnas.0404720101。PMC 514446。PMID 15302935。
