ＨＭＢＳ 利用可能な構造 ＰＤＢ オルソログ検索: PDBe RCSB
識別子 エイリアス HMBS 、PBG-D、PBGD、PORC、UPS、ヒドロキシメチルビラン合成酵素 外部ID オミム ：609806; MGI : 96112; ホモロジーン : 158; ジーンカード ：HMBS; OMA :HMBS - オルソログ 遺伝子の位置（ マウス ） クロ。 9番染色体（マウス） [2] バンド 9 A5.2|9 24.84 cM 始める 44,247,636 bp [2] 終わり 44,255,525 bp [2]
RNA発現 パターン ブギー 人間 マウス （相同遺伝子） トップの表現 海綿骨 骨髄 骨髄細胞 横行結腸粘膜 生殖腺 太ももの筋肉 心の頂点 腓腹筋 肝臓の右葉 直腸
トップの表現 胎児肝臓造血前駆細胞 脛骨大腿関節 人間の胎児 脾臓 大腿骨体 心内膜クッション 卵黄嚢 腹壁 右腎臓 肝臓の左葉
参照表現データの詳細
バイオGPS
遺伝子オントロジー 分子機能
トランスフェラーゼ活性 ヒドロキシメチルビラン合成酵素活性 細胞成分 生物学的プロセス
プロトポルフィリノーゲンIXの生合成過程 テトラピロール生合成プロセス ポルフィリン含有化合物の生合成プロセス ペプチジルピロメタン補因子結合 ヘム生合成プロセス 出典:Amigo / QuickGO
オルソログ 種 人間 ねずみ エントレズ アンサンブル ユニプロット RefSeq (mRNA) NM_000190 NM_001024382 NM_001258208 NM_001258209
RefSeq (タンパク質) NP_000181 NP_001019553 NP_001245137 NP_001245138
場所 (UCSC) 11 章: 119.08 – 119.09 Mb 9 章: 44.25 – 44.26 Mb PubMed 検索 [3] [4]
ウィキデータ
ポルフォビリノーゲンデアミナーゼ （ ヒドロキシメチルビラン合成酵素 、または ウロポルフィリノーゲン I 合成酵素 ）は 、ヒトでは HMBS 遺伝子によってコード化される 酵素 （ EC 2.5.1.61）です。ポルフォビリノーゲンデアミナーゼは、 ヘム生 合成経路の 3 番目のステップに関与しています。4 つのポル フォビリノーゲン 分子を頭尾方向に縮合させて 直鎖 ヒドロキシメチルビラン を生成すると同時に、4 つの アンモニア 分子を放出します。
4 ポルホビリノーゲン + H 2 O ヒドロキシメチルビラン + 4 NH 3
⇌
{\displaystyle \rightleftharpoons }
構造と機能 機能的には、ポルフォビリノーゲンデアミナーゼは、ポルフォビリノーゲンモノマーからのアンモニアの損失（ 脱アミノ化 ）と、それに続く線状テトラピロールへの重合を触媒し、ヒドロキシメチルビランとして放出されます。
PBデアミナーゼの全体的な反応 生物間で高度に保存されている 40～42 kDa のポルフォビリノーゲンデアミナーゼの構造は、3 つのドメインから構成されています。 [5] [6] ドメイン 1 と 2 は構造的に非常に類似しており、それぞれヒトでは 5 つのベータシートと 3 つのアルファヘリックスから構成されています。 [7] ドメイン 3 は他の 2 つの間に位置し、平坦なベータシート形状をしています。この酵素の 補因子 で、 2 つの凝縮したポルフォビリノーゲン分子からなるジピロールは、ドメイン 3 に共有結合しており、活性部位であるドメイン 1 と 2 の間の溝まで伸びています。 [8] ドメイン 1 と 2 から活性部位に面するように配置された いくつかの正に帯電した アルギニン 残基は、入ってくるポルフォビリノーゲンのカルボキシレート官能基と、成長するピロール鎖を安定化させることが示されています。これらの構造的特徴は、最終的なヒドロキシメチルビラン生成物の形成に有利であると考えられます。 [9] ポルホビリノーゲンデアミナーゼは通常、細胞の
細胞質 内に二量体単位で存在する。
反応メカニズム PBGデアミナーゼの完全なメカニズム 最初のステップは、 ポルフォビリノーゲンからアンモニアを E1脱離させ、カルボカチオン中間体（1）を生成すると考えられている。 [10] この中間体は、ポルフォビリノーゲンデアミナーゼのジピロール補因子によって攻撃され、プロトンを失った後、酵素に共有結合した三量体（2）を生成する。 この中間体は、ポルフォビリノーゲンとのさらなる反応に開放される（1と2をさらに3回繰り返す）。 六量体が形成されると、加水分解によってヒドロキシメチルビランが放出され、補因子が再生される（3）。 [11] [12]
病理学 ポルフォビリノーゲンデアミナーゼに関連する最もよく知られた健康問題は、 急性間欠性ポルフィリン症 です。これは常染色体優性遺伝性疾患で、ヒドロキシメチルビランが不十分に生成され、細胞質にポルフォビリノーゲンが蓄積します。これは遺伝子変異によって引き起こされ、90%の症例で酵素の量が減少します。しかし、活性の低い酵素や異なるアイソフォームの変異が報告されています。 [13] [14] [15] この遺伝子には、少なくとも115の疾患を引き起こす変異が発見されています。 [16]
参考文献
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さらに読む
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外部リンク GeneReviews/NCBI/NIH/UW のヒドロキシメチルビラン合成酵素欠損症に関するエントリ ヘム合成 - 一部の反応は 細胞質 で起こり、一部の反応は ミトコンドリア で起こることに注意してください（黄色）
