ホモサピエンス種のタンパク質コード遺伝子
GTF2H1 利用可能な構造 電子データ オルソログ検索: PDBe RCSB PDB IDコードのリスト 1PFJ、2DII、2RNR、2RUK、2RVB
識別子 エイリアス GTF2H1 、BTF2、P62、TFB1、TFIIH、一般転写因子IIHサブユニット1 外部ID オミム : 189972; MGI : 1277216; ホモロジーン : 3885; ジーンカード ：GTF2H1; OMA :GTF2H1 - オルソログ 遺伝子の位置（ マウス ） クロ。 染色体7（マウス） [2] バンド 7|7 B3 始める 46,445,527 bp [2] 終わり 46,473,224 bp [2]
RNA発現 パターン ブギー 人間 マウス （相同遺伝子） トップの表現 アキレス腱 脳梁 子宮内膜 扁桃腺 右精巣 左精巣 単球 ランゲルハンス島 平滑筋組織 胆嚢
トップの表現 精母細胞 精子細胞 卵黄嚢 吻側回遊流 涙腺 性器結節 網膜の神経層 胚葉上層 桑実胚 リンパ管の内皮細胞
参照表現データの詳細
バイオGPS 参照表現データの詳細
遺伝子オントロジー 分子機能
タンパク質キナーゼ活性 ATP依存性活性、DNAに作用する クロマチン結合 タンパク質結合 RNAポリメラーゼII CTDヘプタペプチドリピートキナーゼ活性 細胞成分
核質 転写因子TFIIHホロ複合体 核 転写因子TFIIHコア複合体 生物学的プロセス
RNAポリメラーゼI転写の終結 サイクリン依存性タンパク質セリン/スレオニンキナーゼ活性の調節 転写の調節、DNAテンプレート RNAポリメラーゼIプロモーターからの転写開始 RNAポリメラーゼIIプロモーターからの転写伸長 7-メチルグアノシンmRNAキャッピング RNAポリメラーゼIIによる転写 転写、DNAテンプレート DNA損傷刺激に対する細胞反応 ゲノム全体のヌクレオチド除去修復 転写連動ヌクレオチド除去修復 RNAポリメラーゼIIプロモーターからの転写開始 ヌクレオチド除去修復、DNA切断 DNA修復 RNAポリメラーゼIIによる転写の正の制御 ヌクレオチド除去修復、切断前複合体の安定化 ヌクレオチド除去修復 ヌクレオチド除去修復、DNA切断、5'-to損傷 ヌクレオチド除去修復、切断前複合体の組み立て RNAポリメラーゼIによる転写 RNAポリメラーゼII C末端ドメインのリン酸化 ヌクレオチド除去修復、DNA二重鎖の巻き戻し ヌクレオチド除去修復、DNA切断、3'-to損傷 RNAポリメラーゼIプロモーターからの転写伸長 出典:Amigo / QuickGO
オルソログ 種 人間 ねずみ エントレズ アンサンブル ENSG00000110768 ENSG00000288114
ユニプロット RefSeq (mRNA) NM_001291075 NM_008186 NM_001360075 NM_001360076
RefSeq (タンパク質) NP_001278004 NP_032212 NP_001347004 NP_001347005
場所 (UCSC) 11章: 18.32 – 18.37 Mb 7 章: 46.45 – 46.47 Mb PubMed 検索 [3] [4]
ウィキデータ
一般転写因子IIHサブユニット1 は、ヒトでは GTF2H1 遺伝子によってコードされる タンパク質 である 。 [5] [6] [7]
インタラクション GTF2H1 は以下と相互作用する ことが示されています :
参照
参考文献
^ abc ENSG00000288114 GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000110768、ENSG00000288114 – Ensembl 、2017 年 5 月 ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000006599 – Ensembl 、2017 年 5 月 ^ 「Human PubMed Reference:」。 国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館 。 ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。 国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館 。 ^ Fischer L, Gerard M, Chalut C, Lutz Y, Humbert S, Kanno M, Chambon P, Egly JM (1992年10月). 「基本転写因子BTF2の62キロダルトン成分のクローニング」. Science . 257 (5075): 1392–5. Bibcode :1992Sci...257.1392F. doi :10.1126/science.1529339. PMID 1529339. ^ Heng HH、Xiao H、Shi XM、Greenblatt J、Tsui LC (1994年5月)。「RNAポリメラーゼII転写の一般的な開始因子をコードする遺伝子はヒトゲノム中に分散している」。Hum . Mol. Genet . 3 (1): 61–4. doi :10.1093/hmg/3.1.61. PMID 8162052。 ^ 「Entrez Gene: GTF2H1 一般転写因子 IIH、ポリペプチド 1、62kDa」。 ^ abc Rossignol M、Kolb-Cheynel I 、Egly JM (1997 年 4 月)。「CDK 活性化キナーゼ (CAK) の基質特異性は TFIIH との関連で変化する」。EMBO J. 16 (7): 1628–37. doi :10.1093/emboj/16.7.1628. PMC 1169767. PMID 9130708 。 ^ Shiekhattar R、Mermelstein F、 Fisher RP、Drapkin R、Dynlacht B、Wessling HC、Morgan DO、Reinberg D (1995 年 3 月)。「Cdk 活性化キナーゼ複合体はヒト転写因子 TFIIH の構成要素である」。Nature。374 ( 6519 ) : 283–7。Bibcode : 1995Natur.374..283S。doi : 10.1038/374283a0。PMID 7533895。S2CID 4282418。 ^ Yee A、Nichols MA、Wu L、Hall FL、Kobayashi R、Xiong Y (1995 年 12 月)。「サイクリン依存性キナーゼ活性化キナーゼ (CAK) アセンブリ因子である CDK7 関連ヒト MAT1 の分子クローニング」。Cancer Res . 55 ( 24): 6058–62。PMID 8521393。 ^ Vandel L、Kouzarides T (1999年8月)。「TFIIH によって リン酸化される残基はS期中のE2F-1分解に必要である」。EMBO J. 18 (15): 4280–91. doi :10.1093/emboj/18.15.4280. PMC 1171504. PMID 10428966 。 ^ Drapkin R、Reardon JT、Ansari A、Huang JC、Zawel L、Ahn K、Sancar A、Reinberg D (1994 年 4 月)。「DNA 除去修復と RNA ポリメラーゼ II による転写における TFIIH の二重の役割」。Nature。368 ( 6473 ) : 769–72。Bibcode : 1994Natur.368..769D。doi : 10.1038 /368769a0。PMID 8152490。S2CID 4363484。 ^ Chen D, Riedl T, Washbrook E, Pace PE, Coombes RC, Egly JM, Ali S (2000 年 7 月). 「S118 リン酸化によるエストロゲン受容体アルファの活性化には、TFIIH とのリガンド依存性相互作用と CDK7 の関与が関与している」. Mol. Cell . 6 (1): 127–37. doi :10.1016/s1097-2765(00)00014-9. PMID 10949034. ^ Archambault J、Pan G、Dahmus GK、Cartier M、Marshall N、Zhang S、Dahmus ME、Greenblatt J (1998 年 10 月)。「RNA ポリメラーゼ IIO のカルボキシル末端ドメインを脱リン酸化するヒトタンパク質ホスファターゼの RAP74 相互作用サブユニットである FCP1」。J . Biol. Chem . 273 (42): 27593–601。doi : 10.1074 /jbc.273.42.27593。PMID 9765293 。 ^ Pan G、Aso T、Greenblatt J (1997 年 9 月)。「プロモーター特異的開始が可能で転写活性化因子に応答するヒト RNA ポリメラーゼ II ホロ酵素と伸長因子 TFIIS および elongin A の相互作用」。J . Biol. Chem . 272 ( 39): 24563–71。doi : 10.1074/ jbc.272.39.24563。PMID 9305922 。 ^ ジリア=マリ G、コイン F、ラニッシュ JA、ホーグストラテン D、テイル A、ウィジャース N、ヤスパース NG、ラームス A、アルゼンティーニ M、ファン デル スペック PJ、ボッタ E、ステファニーニ M、エグリ JM、エバーソルド R、ホーエイメーカース JH、フェルミューレン W (2004 年 7 月)。 「TFIIH の新しい 10 番目のサブユニットは、DNA 修復症候群であるトリコチオジストロフィー グループ A の原因となっています。」 ナット。ジュネット 。 36 (7): 714–9。 土井 ： 10.1038/ng1387 。 PMID 15220921。 ^ Marinoni JC、Roy R、Vermeulen W、Miniou P、Lutz Y、Weeda G、Seroz T、Gomez DM、Hoeijmakers JH、Egly JM (1997 年 3 月)。「転写/DNA 修復因子 TFIIH のコアの 5 番目のサブユニットである p52 のクローニングと特性評価」。EMBO J. 16 ( 5): 1093–102. doi :10.1093/emboj/16.5.1093. PMC 1169708. PMID 9118947 。
さらに読む
Jeang KT (1998). 「Tat、Tat関連キナーゼ、および転写」 J. Biomed. Sci . 5 (1): 24–7. doi :10.1007/BF02253352. PMID 9570510. Yankulov K, Bentley D (1998). 「転写制御: Tat 補因子と転写伸長」. Curr. Biol . 8 (13): R447-9. Bibcode :1998CBio....8.R447Y. doi : 10.1016/S0960-9822(98)70289-1 . PMID 9651670. S2CID 15480646. Shiekhattar R、Mermelstein F、 Fisher RP、Drapkin R、Dynlacht B、Wessling HC、Morgan DO、Reinberg D (1995)。「Cdk 活性化キナーゼ複合体はヒト転写因子 TFIIH の構成要素である」。Nature。374 ( 6519 ) : 283–7。Bibcode : 1995Natur.374..283S。doi : 10.1038/374283a0。PMID 7533895。S2CID 4282418。 Tong X、Drapkin R、Reinberg D、Kieff E (1995)。「転写因子IIHの62kDaおよび80kDaサブユニットは、エプスタイン・バーウイルス核タンパク質2との相互作用を媒介する」。Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 92 ( 8): 3259–63。Bibcode : 1995PNAS ...92.3259T。doi : 10.1073/ pnas.92.8.3259。PMC 42145。PMID 7724549 。 Fantes JA、Oghene K、Boyle S、Danes S、Fletcher JM、Bruford EA、Williamson K、Seawright A、Schedl A、Hanson I (1995)。「ヒト染色体 11 の高解像度統合物理、細胞遺伝学、遺伝地図: 遠位 p13 から近位 p15.1」 。Genomics。25 ( 2 ) : 447–61。doi :10.1016/0888-7543(95)80045-N。PMID 7789978 。 Xiao H、Pearson A、Coulombe B、Truant R、Zhang S、Regier JL、Triezenberg SJ、Reinberg D、Flores O、Ingles CJ (1994)。「VP16 および p53 の酸性活性化ドメインへの基礎転写因子 TFIIH の結合」。Mol . Cell. Biol . 14 (10): 7013–24. doi :10.1128/mcb.14.10.7013. PMC 359231. PMID 7935417 。 シェーファー L、モンコリン V、ロイ R、ストウブ A、メッツィーナ M、サラシン A、ウィーダ G、Hoeijmakers JH、エグリ JM (1994)。 「ERCC2/DNA修復タンパク質はクラスII BTF2/TFIIH転写因子と関連している」。 エンボ J . 13 (10): 2388–92。 土井 ：10.1002/j.1460-2075.1994.tb06522.x。 PMC 395103 。 PMID 8194528。 Blau J, Xiao H, McCracken S, O'Hare P, Greenblatt J, Bentley D (1996). 「転写活性化ドメインの3つの機能クラス」. Mol. Cell. Biol . 16 (5): 2044–55. doi : 10.1128/MCB.16.5.2044. PMC 231191. PMID 8628270. Iyer N、Reagan MS、Wu KJ、Canagarajah B、Friedberg EC (1996)。「ヒトRNAポリメラーゼII転写/ヌクレオチド除去修復複合体TFIIH、ヌクレオチド除去修復タンパク質XPG、およびコケイン症候群グループB（CSB）タンパク質の相互作用」。 生化学。35 （ 7 ） ：2157–67。doi ：10.1021/bi9524124。PMID 8652557 。 Reardon JT、Ge H、Gibbs E、Sancar A、Hurwitz J、Pan ZQ (1996)。「2つのヒト転写因子IIH（TFIIH）関連複合体の単離と特性：ERCC2/CAKおよびTFIIH」。Proc . Natl . Acad. Sci. USA。93 （ 13）：6482–7。Bibcode ： 1996PNAS ...93.6482R。doi ： 10.1073 / pnas.93.13.6482。PMC 39049。PMID 8692841 。 Drapkin R, Le Roy G, Cho H, Akoulitchev S, Reinberg D (1996). 「ヒトサイクリン依存性キナーゼ活性化キナーゼは3つの異なる複合体に存在する」 Proc. Natl. Acad. Sci. USA . 93 (13): 6488–93. Bibcode :1996PNAS...93.6488D. doi : 10.1073/pnas.93.13.6488 . PMC 39050 . PMID 8692842. Zhou Q、Sharp PA (1996)。「Tat-SF1: HIV-1 Tat による転写伸長の刺激のための補因子」。Science . 274 ( 5287): 605–10。Bibcode : 1996Sci ...274..605Z。doi : 10.1126/science.274.5287.605。PMID 8849451。S2CID 13266489 。 Parada CA、Roeder RG (1996)。「Tat 誘導によるカルボキシ末端ドメインのリン酸化によって誘発される RNA ポリメラーゼ II のプロセッシビティの強化」。Nature。384 ( 6607 ) : 375–8。Bibcode : 1996Natur.384..375P。doi : 10.1038/384375a0。PMID 8934526。S2CID 4278432。 García-Martínez LF、Ivanov D、 Gaynor RB (1997)。「精製されたHIV-1およびHIV-2転写開始前複合体とTatの関連」。J . Biol. Chem . 272 (11): 6951–8. doi : 10.1074/jbc.272.11.6951 . PMID 9054383。 Marinoni JC、Roy R、Vermeulen W、Miniou P、Lutz Y、Weeda G、Seroz T、Gomez DM、Hoeijmakers JH、Egly JM (1997)。「転写/DNA修復因子TFIIHのコアの第5サブユニットであるp52のクローニングと特性評価」。EMBO J。16 ( 5 ) : 1093–102。doi : 10.1093 / emboj/16.5.1093。PMC 1169708。PMID 9118947 。 Cujec TP、Cho H、Maldonado E、Meyer J、Reinberg D、Peterlin BM (1997)。「ヒト免疫不全ウイルストランスアクチベーターTatはRNAポリメラーゼIIホロ酵素と相互作用する」。Mol . Cell. Biol . 17 (4): 1817–23. doi :10.1128/mcb.17.4.1817. PMC 232028. PMID 9121429 。 Rossignol M、Kolb-Cheynel I 、Egly JM (1997)。「CDK活性化キナーゼ（CAK）の基質特異性はTFIIHとの関連で変化する」。EMBO J. 16 (7): 1628–37. doi :10.1093/emboj/16.7.1628. PMC 1169767. PMID 9130708 。 García-Martínez LF、Mavankal G、Neveu JM、Lane WS 、Ivanov D、Gaynor RB (1997)。「Tat 関連キナーゼの精製により、HIV-1 転写を調節する TFIIH 複合体が明らかになった」。EMBO J. 16 ( 10): 2836–50. doi :10.1093/emboj/16.10.2836. PMC 1169892. PMID 9184228.
外部リンク
この記事には、 パブリックドメイン である 米国国立医学図書館 のテキストが組み込まれています。
