ホモサピエンス種のタンパク質コード遺伝子
| ジェミン4 |
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| 識別子 |
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| エイリアス | GEMIN4、HC56、HCAP1、HHRF-1、p97、gem核小器官関連タンパク質4、NEDMCR |
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| 外部ID | オミム:606969; MGI : 2449313;ホモロジーン: 69193;ジーンカード:GEMIN4; OMA :GEMIN4 - オルソログ |
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| 遺伝子の位置(マウス) |
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 | | クロ。 | 11番染色体(マウス)[2] |
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| | バンド | 11|11 B5 | 始める | 76,101,397 bp [2] |
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| 終わり | 76,108,490 bp [2] |
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| RNA発現パターン |
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| ブギー | | 人間 | マウス(相同遺伝子) |
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| トップの表現 | - 精子
- 左精巣
- 右精巣
- 腹部の皮膚
- 脚の皮膚
- 生殖腺
- 歯肉上皮
- 左卵巣
- 胃の本体
- 右卵巣
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| | トップの表現 | - 精子細胞
- 睾丸
- 胚葉上層
- 食道
- 胚
- 胚
- 卵黄嚢
- 精母細胞
- 中脳
- 子宮
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| | 参照表現データの詳細 |
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| バイオGPS | 
 | | 参照表現データの詳細 |
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| 遺伝子オントロジー |
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| 分子機能 | | | 細胞成分 |
- SMN-Smタンパク質複合体
- 細胞質
- 核小体
- 小さな核リボ核タンパク質複合体
- 細胞外エクソソーム
- 膜
- コイル状の体のふたご座
- 核質
- SMN複合体
- 核
- 細胞質
- 核体
| | 生物学的プロセス |
- mRNA処理
- RNAスプライシング
- 核にインポートする
- スプライソソーム snRNP アセンブリ
- rRNA処理
| | 出典:Amigo / QuickGO |
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| ウィキデータ |
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ジェム関連タンパク質4は、ヒトではGEMIN4遺伝子によってコードされるタンパク質である。[5] [6]
関数
この遺伝子の産物は、細胞質、核小体、およびジェミニ体(gems)と呼ばれる個別の核小体に局在するSMNタンパク質複合体の一部です。複合体は細胞質内のスプライソソームsnRNPアセンブリで機能し、核内でのpre-mRNAスプライシングに必要なスプライソソームを再生します。コードされているタンパク質は、DEADボックスタンパク質およびいくつかのスプライソソームコアタンパク質と直接相互作用します。選択的スプライシング転写バリアントが記述されていますが、それらの生物学的妥当性は決定されていません。[6]
インタラクション
GEMIN4 は以下と相互作用することが示されています:
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000179409 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000049396 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
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- ^ ab 「Entrez Gene: GEMIN4 gem (核小器官) 関連タンパク質 4」。
- ^ ab Mourelatos Z、Dostie J、Paushkin S、Sharma A、Charroux B、Abel L、Rappsilber J 、Mann M、Dreyfuss G (2002 年 3 月)。「miRNP:多数のマイクロ RNA を含む新しいクラスのリボ核タンパク質」。Genes Dev . 16 (6): 720–8。doi :10.1101/gad.974702。PMC 15536 5。PMID 11914277。
- ^ ネルソン PT、ハッツィジョージオ AG、モウレラトス Z (2004 年 3 月)。 「ヒト神経細胞株のポリリボソームにおける miRNP:mRNA の会合」。RNA。10 (3): 387–94。土井:10.1261/rna.5181104。PMC 1370934。PMID 14970384。
- ^ Park JW、Voss PG、Grabski S、Wang JL、Patterson RJ (2001 年 9 月)。「SMN タンパク質を含む複合体におけるガレクチン 1 およびガレクチン 3 と Gemin4 の関連」。Nucleic Acids Res . 29 (17): 3595–602. doi :10.1093/nar/29.17.3595. PMC 55878 . PMID 11522829。
- ^ Meister G、Bühler D、Laggerbauer B、Zobawa M、Lottspeich F、Fischer U (2000 年 8 月)。「運動ニューロン生存 (SMN) タンパク質とスプライソソーム Sm タンパク質の特定のサブセットを含む核 20S 複合体の特性」。Hum . Mol. Genet . 9 (13): 1977–86. doi : 10.1093/hmg/9.13.1977 . PMID 10942426。
さらに読む
- Meister G、Bühler D、Laggerbauer B、Zobawa M、Lottspeich F、Fischer U (2000)。「運動ニューロンの生存 (SMN) タンパク質とスプライソソーム Sm タンパク質の特定のサブセットを含む核 20S 複合体の特性」。Hum . Mol. Genet . 9 (13): 1977–86. doi : 10.1093/hmg/9.13.1977 . PMID 10942426。
- Pellizzoni L、Charroux B、Rappsilber J、Mann M、Dreyfuss G (2001)。「生存運動ニューロン複合体とRNAポリメラーゼII間の機能的相互作用」。J . Cell Biol . 152 (1): 75–85. doi :10.1083/jcb.152.1.75. PMC 2193649. PMID 11149922 .
- ヴィーマン S、ヴァイル B、ヴェレンロイター R、ガッセンフーバー J、グラスル S、アンゾルゲ W、ベッヒャー M、ブロッカー H、バウアーザックス S、ブルーム H、ラウバー J、デュスターヘフト A、バイエル A、ケーラー K、ストラック N、メーヴェス HW、オッテンヴェルダー B 、オーバーマイヤー B、タンペ J、ホイブナー D、ワンブット R、コーン B、クライン M、プストカ A (2001)。 「ヒト遺伝子とタンパク質のカタログに向けて: ヒト cDNA をコードする 500 個の新規完全タンパク質の配列決定と分析」。ゲノム解析11 (3): 422-35。土井:10.1101/gr.GR1547R。PMC 311072。PMID 11230166。
- Park JW、Voss PG、Grabski S、Wang JL、Patterson RJ (2001)。「SMNタンパク質を含む複合体におけるガレクチン-1およびガレクチン-3とGemin4の関連」。Nucleic Acids Res . 29 (17): 3595–602. doi :10.1093/nar/29.17.3595. PMC 55878 . PMID 11522829。
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- Shpargel KB、Matera AG (2006)。「Smクラスリボ核タンパク質の効率的な組み立てにはジェミンタンパク質が必要である」。Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 102 (48): 17372–7. doi : 10.1073/pnas.0508947102 . PMC 1297697 . PMID 16301532。
- Ewing RM、Chu P、Elisma F、Li H、Taylor P、Climie S、McBroom-Cerajewski L、Robinson MD、O'Connor L、Li M、Taylor R、Dharsee M、Ho Y、Heilbut A、Moore L、Zhang S、Ornatsky O、Bukhman YV、Ethier M、Sheng Y、Vasilescu J、Abu-Farha M、Lambert JP、Duewel HS、Stewart II、Kuehl B、Hogue K、Colwill K、Gladwish K、Muskat B、Kinach R、Adams SL、Moran MF、Morin GB、Topaloglou T、Figeys D (2007)。「質量分析法によるヒトタンパク質間相互作用の大規模マッピング」。Mol . Syst. Biol . 3 (1): 89. doi :10.1038/msb4100134. PMC 1847948. PMID 17353931 .