ホモサピエンス種のタンパク質コード遺伝子
ガバラPL2 利用可能な構造 ＰＤＢ オルソログ検索: PDBe RCSB
識別子 エイリアス GABARAPL2 、ATG8、ATG8C、GATE-16、GATE16、GEF-2、GEF2、GABA A 型受容体関連タンパク質 2 様 外部ID オミム ：607452; MGI : 1890602; ホモロジーン : 68550; ジーンカード ：GABARAPL2; OMA :GABARAPL2 - オルソログ 遺伝子の位置（ マウス ） クロ。 染色体8（マウス） [2] バンド 8|8 E1 始める 112,667,335 bp [2] 終わり 112,680,244 bp [2]
RNA発現 パターン ブギー 人間 マウス （相同遺伝子） トップの表現 ポンス ブロードマン領域46 小脳虫部 内淡蒼球 上前庭核 視床下部 視床下核 脊髄 C1セグメント 側坐核
トップの表現 視床下部 神経管 小脳皮質 神経節隆起 胚盤胞 桑実胚 海馬歯状回顆粒細胞 右腎臓 前頭葉皮質 骨髄
参照表現データの詳細
バイオGPS 参照表現データの詳細
遺伝子オントロジー 分子機能
GABA受容体結合 微小管結合 ATPase結合 タンパク質結合 β-チューブリン結合 SNAREバインディング ユビキチンタンパク質リガーゼ結合 細胞成分
細胞質 ゴルジ体 ゴルジ膜 細胞内解剖構造 オートファゴソーム オートファゴソーム膜 細胞質小胞 細胞質 生物学的プロセス
ATP依存性活性の正の調節 オートファジー タンパク質輸送 プロテアソームタンパク質分解過程の負の調節 ゴルジ体内小胞輸送 マクロオートファジー オートファゴソームの成熟 オートファゴソームの組み立て ミトコンドリアのオートファジー 窒素欠乏に対する細胞反応 出典:Amigo / QuickGO
ウィキデータ
γ-アミノ酪酸受容体関連タンパク質様2 は、ヒトでは GABARAPL2 遺伝子によってコードされる タンパク質 である 。 [5] [6]
インタラクション GABARAPL2はULK1 、 [7]、 ATG4B 、 [8]、 [9] 、 FAM134B と 相互作用する ことが示されている 。 [10]
参考文献
^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000034713 – Ensembl 、2017 年 5 月 ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000031950 – Ensembl 、2017 年 5 月 ^ 「Human PubMed Reference:」。 国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館 。 ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。 国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館 。 ^ Xin Y, Yu L, Chen Z, Zheng L, Fu Q, Jiang J, Zhang P, Gong R, Zhao S (2001 年 6 月). 「GABA(A) 受容体関連タンパク質の 3 つのヒトホモログと 2 つのマウスホモログのクローニング、発現パターン、および染色体局在」. Genomics . 74 (3): 408–13. doi :10.1006/geno.2001.6555. PMID 11414770. ^ 「Entrez Gene: GABARAPL2 GABA(A) 受容体関連タンパク質様 2」。 ^ Okazaki N, Yan J, Yuasa S, Ueno T, Kominami E, Masuho Y, Koga H, Muramatsu M (2000 年 12 月). 「脳における Unc-51 様キナーゼと微小管関連タンパク質軽鎖 3 関連タンパク質の相互作用: 軸索伸長における小胞輸送の役割の可能性」. 脳研究. 分子脳研究 . 85 (1–2): 1–12. doi :10.1016/S0169-328X(00)00218-7. PMID 11146101. ^ Ewing RM、Chu P、Elisma F、Li H、Taylor P、Climie S、McBroom-Cerajewski L、Robinson MD、O'Connor L、Li M、Taylor R、Dharsee M、Ho Y、Heilbut A、Moore L、Zhang S、Ornatsky O、Bukhman YV、Ethier M、Sheng Y、Vasilescu J、Abu-Farha M、Lambert JP、Duewel HS、Stewart II、Kuehl B、Hogue K、Colwill K、Gladwish K、Muskat B、Kinach R、Adams SL、Moran MF、Morin GB、Topaloglou T、Figeys D (2007)。「質量分析法によるヒトタンパク質間相互作用の大規模マッピング」。 分子 システム生物学 。3 (1): 89。doi : 10.1038/msb4100134。 PMC 1847948。PMID 17353931 。 ^ シュテルツル U、ヴォルム U、ラロウスキー M、ハーニッヒ C、ブレンベック FH、ゲーラー H、シュトロディッケ M、ツェンクナー M、シェーンヘル A、ケッペン S、ティム J、ミンツラフ S、エイブラハム C、ボック N、キーツマン S、ゲーデ A、トクセズE、ドローゲ A、クロビッチ S、コーン B、バーヒマイヤーW、Lehrach H、Wanker EE (2005 年 9 月)。 「ヒトタンパク質間相互作用ネットワーク: プロテオームに注釈を付けるためのリソース」。 セル 。 122 (6): 957–68。 土井 ：10.1016/j.cell.2005.08.029。 hdl : 11858/00-001M-0000-0010-8592-0 。 PMID 16169070。S2CID 8235923 。 ^ Khaminets, Aliaksandr; Heinrich, Theresa; Mari, Muriel; Grumati, Paolo; Huebner, Antje K.; Akutsu, Masato; Liebmann, Lutz; Stolz, Alexandra; Nietzsche, Sandor (2015-06-18). 「選択的オートファジーによる小胞体ターンオーバーの調節」. Nature . 522 (7556): 354–358. Bibcode :2015Natur.522..354K. doi :10.1038/nature14498. ISSN 0028-0836. PMID 26040720. S2CID 4449106.
さらに読む
Rohwer A、Kittstein W、Marks F、Gschwendt M (1999 年 7 月)。「A6 関連タンパク質のクローニング、発現および特性評価」。European Journal of Biochemistry . 263 (2): 518–25. doi : 10.1046/j.1432-1327.1999.00537.x . PMID 10406962。 Sagiv Y、Legesse-Miller A、Porat A、Elazar Z (2000 年 4 月)。「膜輸送調節因子 GATE-16 は NSF およびゴルジ v-SNARE GOS-28 と相互作用する」。EMBO ジャーナル 。19 ( 7 ) : 1494–504。doi : 10.1093 /emboj/19.7.1494。PMC 310219。PMID 10747018 。 Hartley JL、Temple GF、 Brasch MA (2000 年 11 月)。「in vitro 部位特異的組み換えを用いた DNA クローニング」。 ゲノム 研究 。10 ( 11): 1788–95。doi :10.1101/gr.143000。PMC 310948。PMID 11076863 。 Okazaki N, Yan J, Yuasa S, Ueno T, Kominami E, Masuho Y, Koga H, Muramatsu M (2000 年 12 月)。「脳における Unc-51 様キナーゼと微小管関連タンパク質軽鎖 3 関連タンパク質の相互作用: 軸索伸長における小胞輸送の役割の可能性」。脳研究 。 分子脳研究 。85 (1–2): 1–12。doi : 10.1016 /S0169-328X(00)00218-7。PMID 11146101 。 Simpson JC、Wellenreuther R、 Poustka A、Pepperkok R 、Wiemann S (2000 年 9 月)。「大規模 cDNA シーケンシングによって同定された新規タンパク質の系統的細胞内局在」。EMBO レポート 。1 ( 3 ): 287–92。doi :10.1093/embo-reports/kvd058。PMC 1083732。PMID 11256614 。 Tanida I, Tanida-Miyake E, Nishitani T, Komatsu M, Yamazaki H, Ueno T, Kominami E (2002 年 3 月)。「マウス Apg12p は、3 つの Apg8p ホモログよりもマウス Apg7p に対して基質選択性がある」。 生化学 および 生物物理学的研究通信 。292 (1): 256–62。doi :10.1006/bbrc.2002.6645。PMID 11890701 。 Scherz-Shouval R、Sagiv Y、Shorer H、Elazar Z (2003 年 4 月)。「ゴルジ体内輸送調節因子 GATE-16 の COOH 末端は、ヒトシステインプロテアーゼ HsApg4A によって切断される」。The Journal of Biological Chemistry。278 ( 16): 14053–8。doi : 10.1074/ jbc.M212108200。PMID 12473658 。 Wiemann S、Arlt D、Huber W、Wellenreuther R、Schleeger S、Mehrle A、Bechtel S、Sauermann M、Korf U、Pepperkok R、Sültmann H、Poustka A (2004 年 10 月)。 「ORFeome から生物学へ: 機能的ゲノミクス パイプライン」。 ゲノム研究 。 14 (10B): 2136–44。 土井 ：10.1101/gr.2576704。 PMC 528930 。 PMID 15489336。 ルアル JF、ヴェンカテサン K、ハオ T、弘實＝岸川 T、ドリコット A、リー N、ベリス GF、ギボンズ FD、ドレーゼ M、アイヴィ＝グエデフスー N、クリットゴード N、サイモン C、ボクセム M、ミルスタイン S、ローゼンバーグ J、ゴールドバーグDS、チャン LV、ウォン SL、フランクリン G、リー S、アルバラ JS、リム J、フロートン C、ラモサス E、セビック S、ベックス C、ラメシュ P、シコルスキー RS、ヴァンデンハウト J、ゾグビ HY、スモリャル A、ボサック S、セケーラ R、ドゥセット スタム L、キュージック ME、ヒル DE、ロス FP、ビダル M ( 2005 年 10 月）。 「ヒトタンパク質間相互作用ネットワークのプロテオームスケールマップに向けて」。 自然 。 437 (7062): 1173–8. Bibcode :2005Natur.437.1173R. doi :10.1038/nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026. Sou YS、Tanida I、Komatsu M、Ueno T、Kominami E (2006 年 2 月)。「ホスファチジルセリンはホスファチジルエタノールアミンに加えて、哺乳類 Atg8 修飾因子 LC3、GABARAP、および GATE-16 の in vitro ターゲットである」。The Journal of Biological Chemistry。281 ( 6): 3017–24。doi : 10.1074/jbc.M505888200。PMID 16303767 。 Mehrle A、Rosenfelder H、Schupp I、del Val C、Arlt D、Hahne F、Bechtel S、Simpson J、Hofmann O、Hide W、Glatting KH、Huber W、Pepperkok R、Poustka A、Wiemann S (2006 年 1 月)。 「2006 年の LIFEdb データベース」。 核酸研究 。 34 (データベースの問題): D415-8。 土井 ：10.1093/nar/gkj139。 PMC 1347501 。 PMID 16381901。 Ewing RM、Chu P、Elisma F、Li H、Taylor P、Climie S、McBroom-Cerajewski L、Robinson MD、O'Connor L、Li M、Taylor R、Dharsee M、Ho Y、Heilbut A、Moore L、Zhang S、Ornatsky O、Bukhman YV、Ethier M、Sheng Y、Vasilescu J、Abu-Farha M、Lambert JP、Duewel HS、Stewart II、Kuehl B、Hogue K、Colwill K、Gladwish K、Muskat B、Kinach R、Adams SL、Moran MF、Morin GB、Topaloglou T、Figeys D (2007)。「質量分析法によるヒトタンパク質間相互作用の大規模マッピング」。 分子 システム生物学 。3 (1): 89。doi : 10.1038/msb4100134。 PMC 1847948。PMID 17353931 。
