ホモサピエンス種のタンパク質コード遺伝子
| FKBP2 |
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| 利用可能な構造 |
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| 電子データ | オルソログ検索: PDBe RCSB |
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| 識別子 |
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| エイリアス | FKBP2、FKBP-13、PPIase、FK506結合タンパク質2、FKBPプロリルイソメラーゼ2、FKBP13 |
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| 外部ID | オミム: 186946; MGI : 95542;ホモロジーン:40604;ジーンカード:FKBP2; OMA :FKBP2 - オルソログ |
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| 遺伝子の位置(マウス) |
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 | | クロ。 | 19番染色体(マウス)[2] |
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| | バンド | 19|19A | 始める | 6,955,109 bp [2] |
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| 終わり | 6,957,869 bp [2] |
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| RNA発現パターン |
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| ブギー | | 人間 | マウス(相同遺伝子) |
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| トップの表現 | - 下垂体
- 下垂体前葉
- 膵臓の体
- 甲状腺の右葉
- 甲状腺の左葉
- 横行結腸粘膜
- 肝臓の右葉
- 一次視覚野
- 視床下部
- 人間の腎臓
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| | トップの表現 | - 精嚢
- 視索上核
- 第四脳室脈絡叢
- ランゲルハンス島
- 前立腺の葉
- 耳下腺
- 右腎臓
- 延髄
- 内側前庭核
- 卵黄嚢
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| | 参照表現データの詳細 |
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| バイオGPS |  | | 参照表現データの詳細 |
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| 遺伝子オントロジー |
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| 分子機能 |
- FK506バインディング
- タンパク質結合
- イソメラーゼ活性
- ペプチジルプロリルシス-トランスイソメラーゼ活性
| | 細胞成分 | | | 生物学的プロセス |
- シャペロンを介したタンパク質の折り畳み
- タンパク質ペプチジルプロリル異性化
| | 出典:Amigo / QuickGO |
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| オルソログ |
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| 種 | 人間 | ねずみ |
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| エントレズ | | |
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| アンサンブル | | |
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| ユニプロット | | |
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| RefSeq (mRNA) | |
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NM_001135208 NM_004470 NM_057092 |
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NM_001166368 NM_008020 NM_001360286 NM_001360288 |
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| RefSeq (タンパク質) | |
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NP_001128680 NP_004461 NP_476433 |
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NP_001159840 NP_032046 NP_001347215 NP_001347217 |
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| 場所 (UCSC) | 11 章: 64.24 – 64.24 Mb | 19 章: 6.96 – 6.96 Mb |
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| PubMed検索 | [3] | [4] |
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| ウィキデータ |
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FK506結合タンパク質2は、ヒトではFKBP2遺伝子によってコードされるタンパク質である。[5] [6]
関数
この遺伝子によってコードされるタンパク質は、免疫調節およびタンパク質の折り畳みと輸送を含む基本的な細胞プロセスにおいて役割を果たすイムノフィリンタンパク質ファミリーのメンバーである。このコードされるタンパク質は、免疫抑制剤 FK506 およびラパマイシンに結合するシス-トランスプロリルイソメラーゼである。これはERシャペロンとして機能すると考えられており、膜細胞骨格の足場の構成要素としても機能する可能性がある。この遺伝子には、同じアイソフォームをコードする 2 つの選択的スプライシング転写バリアントがある。この遺伝子には複数のポリアデニル化部位が記載されているが、この遺伝子の全長は決定されていない。[6]
インタラクション
FKBP2はARFGEF1 [7]およびEPB41L2 [8]と相互作用することが示されている。
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000173486 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000056629 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ Jin YJ、Albers MW、Lane WS、Bierer BE、Schreiber SL、Burakoff SJ (1991 年 9 月)。「膜結合型ヒト FK506 およびラパマイシン結合タンパク質 FKBP-13 の分子クローニング」。Proc . Natl . Acad. Sci. USA . 88 (15): 6677–81。Bibcode : 1991PNAS ...88.6677J。doi : 10.1073/ pnas.88.15.6677。PMC 52151。PMID 1713687。
- ^ ab 「Entrez Gene: FKBP2 FK506 結合タンパク質 2、13kDa」。
- ^ Padilla PI、Chang MJ、Pacheco-Rodriguez G、Adamik R、Moss J、Vaughan M (2003 年 3 月)。「FK506 結合タンパク質 13 とブレフェルジン A 阻害グアニンヌクレオチド交換タンパク質 1 (BIG1) との相互作用: FK506 の影響」。Proc . Natl . Acad. Sci. USA . 100 (5): 2322–7。Bibcode :2003PNAS..100.2322P。doi : 10.1073/pnas.2628047100 . PMC 151339 . PMID 12606707。
- ^ Walensky LD、Gascard P、Fields ME、Blackshaw S、Conboy JG、Mohandas N、Snyder SH (1998 年 4 月)。「13 kD FK506 結合タンパク質 FKBP13 は、赤血球膜細胞骨格タンパク質 4.1 の新規ホモログと相互作用する」。J . Cell Biol . 141 (1): 143–53. doi :10.1083/jcb.141.1.143. PMC 2132710. PMID 9531554 。
さらに読む
- DiLella AG、Hawkins A、Craig RJ、Schreiber SL、Griffin CA (1992)。「ヒト FKBP12 および FKBP13 をコードする遺伝子の染色体バンド割り当て」。Biochem . Biophys. Res. Commun . 189 (2): 819–23. doi :10.1016/0006-291X(92)92276-4. PMID 1281998。
- Hendrickson BA、Zhang W、Craig RJ、Jin YJ、Bierer BE、Burakoff S、DiLella AG (1993)。「ヒトおよびマウスの FK506 結合タンパク質 (FKBP) 13 をコードする遺伝子の構造構成と FKBP1 との比較」。Gene . 134 ( 2): 271–5. doi :10.1016/0378-1119(93)90106-D. PMID 7505249。
- Bush KT、Hendrickson BA、Nigam SK (1994)。「小胞体でタンパク質が誤って折り畳まれる条件下での FK506 結合タンパク質 FKBP13 の誘導」。Biochem . J. 303 ( Pt 3): 705–8. doi :10.1042/bj3030705. PMC 1137603. PMID 7526846 。
- Nigam SK、Jin YJ、Jin MJ、Bush KT、Bierer BE、Burakoff SJ (1993)。「FK506 結合タンパク質 FKBP 13 の小胞体腔への局在」。Biochem . J. 294 ( Pt 2): 511–5. doi :10.1042/bj2940511. PMC 1134484. PMID 8373365 。
- Walensky LD、Gascard P、Fields ME、Blackshaw S、Conboy JG、Mohandas N、Snyder SH (1998)。「13kD FK506 結合タンパク質 FKBP13 は、赤血球膜細胞骨格タンパク質 4.1 の新規ホモログと相互作用する」。J . Cell Biol . 141 (1): 143–53. doi :10.1083/jcb.141.1.143. PMC 2132710. PMID 9531554 。
- Padilla PI、Chang MJ、Pacheco-Rodriguez G、Adamik R、Moss J、Vaughan M (2003)。「FK506 結合タンパク質 13 とブレフェルジン A 阻害グアニンヌクレオチド交換タンパク質 1 (BIG1) との相互作用: FK506 の効果」。Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 100 (5): 2322–7。Bibcode :2003PNAS..100.2322P。doi : 10.1073 /pnas.2628047100 . PMC 151339 . PMID 12606707。
- Willingham S、Outeiro TF、DeVit MJ、Lindquist SL 、Muhowski PJ (2003)。「変異ハンチンチン断片またはα-シヌクレインの毒性を高める酵母遺伝子」。Science。302 ( 5651 ) : 1769–72。Bibcode : 2003Sci ...302.1769W。doi :10.1126/science.1090389。PMID 14657499。S2CID 43221047 。
- ルアル JF、ヴェンカテサン K、ハオ T、弘實=岸川 T、ドリコット A、リー N、ベリス GF、ギボンズ FD、ドレーゼ M、アイヴィ=グエデフスー N、クリットゴード N、サイモン C、ボクセム M、ミルスタイン S、ローゼンバーグ J、ゴールドバーグDS、チャン LV、ウォン SL、フランクリン G、リー S、アルバラ JS、リム J、フロートン C、ラモサス E、セビック S、ベックス C、ラメシュ P、シコルスキー RS、ヴァンデンハウト J、ゾグビ HY、スモリャル A、ボサック S、セケーラ R、ドゥセット スタム L、キュージック ME、ヒル DE、ロス FP、ビダル M ( 2005)。 「ヒトタンパク質間相互作用ネットワークのプロテオームスケールマップに向けて」。自然。437 (7062): 1173–8. Bibcode :2005Natur.437.1173R. doi :10.1038/nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
- Lim J、Hao T、Shaw C、Patel AJ、Szabó G、Rual JF、Fisk CJ、Li N、Smolyar A、Hill DE、Barabási AL、Vidal M、Zoghbi HY (2006)。「ヒト遺伝性運動失調症およびプルキンエ細胞変性症のタンパク質間相互作用ネットワーク」。Cell . 125 (4): 801–14. doi : 10.1016/j.cell.2006.03.032 . PMID 16713569. S2CID 13709685。