FBXL5

FBXL5
利用可能な構造
ＰＤＢ	オルソログ検索: PDBe RCSB
PDB IDコードのリスト
	3U9J、3U9M、3V5X、3V5Y、3V5Z
識別子
エイリアス	FBXL5、FBL4、FBL5、FLR1、Fボックスおよびロイシンリッチリピートタンパク質5、Fボックスおよびロイシンリッチリピートタンパク質5
外部ID	オミム：605655; MGI : 2152883;ホモロジーン: 8129;ジーンカード：FBXL5; OMA :FBXL5 - オルソログ
遺伝子の位置（ヒト）
クロ。	染色体4（ヒト）
終わり	15,681,679 bp
遺伝子の位置（マウス）
クロ。	5番染色体（マウス）
終わり	43,978,980 bp
RNA発現パターン
	トップの表現
	単球; ; 脈絡叢上皮; ; アキレス腱; ; 腎臓尿細管; ; 血; ; 精嚢; ; 胚上皮; ; 卵母細胞; ; 二次卵母細胞; ; 精子;
	トップの表現
	精母細胞; ; 顆粒球; ; 耳石器官; ; 卵形嚢; ; 精子細胞; ; 網膜の神経層; ; 小脳葉; ; 原腸胚; ; 小脳虫部; ; ハベヌラ;
	参照表現データの詳細
	; ;
	参照表現データの詳細
遺伝子オントロジー
分子機能	鉄イオン結合; タンパク質結合; 金属イオン結合; ユビキチンタンパク質転移酵素活性;
細胞成分	ユビキチンリガーゼ複合体; 細胞質; SCFユビキチンリガーゼ複合体; 細胞質の核周囲領域; 細胞質;
生物学的プロセス	SCF依存性プロテアソームユビキチン依存性タンパク質分解プロセス; タンパク質のユビキチン化; 鉄イオン恒常性; タンパク質ポリユビキチン化; 細胞鉄イオン恒常性; 翻訳後タンパク質修飾; ユビキチン依存性タンパク質分解プロセス;
	出典:Amigo / QuickGO
オルソログ
	26234
	242960
	ENSG00000118564
	ENSMUSG00000039753
	言語
	Q8C2S5
	NM_001193534 ; NM_001193535 ; NM_012161
	NM_001159963 ; NM_178729
	NP_001180463 ; NP_001180464 ; NP_036293
	NP_001153435 ; NP_848844
	ウィキデータ
人間の表示/編集	マウスの表示/編集

F-ボックス/LRRリピートタンパク質5は、ヒトではFBXL5遺伝子によってコードされるタンパク質である。^[5]^[6]

この遺伝子は、約 40 アミノ酸のモチーフである F ボックスを特徴とする F ボックスタンパク質ファミリーのメンバーをコードします。F ボックスタンパク質は、SCF (SKP1-cullin-F ボックス) と呼ばれるユビキチンタンパク質リガーゼ複合体の 4 つのサブユニットの 1 つを構成し、リン酸化依存性ユビキチン化で機能します。F ボックスタンパク質は、WD-40 ドメインを含む Fbws、ロイシンに富む繰り返しを含む Fbls、および異なるタンパク質間相互作用モジュールまたは認識可能なモチーフを含まない Fbxs の 3 つのクラスに分類されます。この遺伝子によってコードされるタンパク質は Fbls クラスに属し、F ボックスに加えて、いくつかのタンデムロイシンに富む繰り返しを含みます。この遺伝子の選択的スプライシングにより、2 つの転写バリアントが生成されます。^[6]

FBXL5は鉄と酸素のセンサーです。IRP2のユビキチン化を促進し、その後、鉄と酸素に依存して分解します。FBXL5 -IRP2複合体のクライオ電子顕微鏡構造は、タンパク質間相互作用界面のすぐ近くにあるFボックスタンパク質のロイシンリッチリピートドメインに埋め込まれた予期せぬ2Fe2Sクラスターを明らかにしました。^[7]したがって、FBXL5は鉄硫黄タンパク質です。FBXL5は、2Fe2Sクラスターが酸化状態にある場合にのみIRP2と結合できるため、酸素圧がIRP2の安定性を決定する仕組みが説明されます。

参考文献

^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000118564 – Ensembl、2017 年 5 月
^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000039753 – Ensembl、2017 年 5 月
^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
^ Cenciarelli C, Chiaur DS, Guardavaccaro D, Parks W, Vidal M, Pagano M (1999年10月). 「ヒトF-boxタンパク質ファミリーの同定」. Current Biology . 9 (20): 1177–1179. Bibcode :1999CBio....9.1177C. doi : 10.1016/S0960-9822(00)80020-2 . PMID 10531035. S2CID 7467493.
^ ab 「Entrez Gene: FBXL5 F-box およびロイシンリッチリピートタンパク質 5」。
^ Wang H、Shi H、Rajan M、Canarie ER、Hong S、Simoneschi D、et al. (2020年4月)。「FBXL5は酸素応答性[2Fe2S]クラスターを介して鉄恒常性におけるIRP2の安定性を制御する」。分子細胞。78 ( 1 ):31–41.e5。doi :10.1016/ j.molcel.2020.02.011。PMC 7159994。PMID 32126207。

さらに読む

Andersson B、 Wentland MA、Ricafrente JY、Liu W 、 Gibbs RA (1996 年 4 月)。「改良されたショットガンライブラリ構築のための「ダブルアダプター」法」。Analytical Biochemistry。236 ( 1): 107–113。doi :10.1006/abio.1996.0138。PMID 8619474 。
Yu W、Andersson B、Worley KC、Muzny DM、Ding Y、Liu W 、他 (1997 年 4 月)。「大規模連結 cDNA シーケンシング」。ゲノム研究。7 ( 4): 353–358。doi : 10.1101 /gr.7.4.353。PMC 139146。PMID 9110174。
Winston JT、Koepp DM、Zhu C、Elledge SJ、Harper JW (1999 年 10 月)。「哺乳類の F ボックスタンパク質ファミリー」。Current Biology。9 ( 20 ) : 1180–1182。Bibcode : 1999CBio ....9.1180W。doi : 10.1016 /S0960-9822(00) 80021-4。PMID 10531037。S2CID 14341845 。
Ilyin GP、Rialland M、Pigeon C、Guguen-Guillouzo C (2000 年 7 月)。「哺乳類 F ボックスタンパク質ファミリーの新メンバーの cDNA クローニングと発現解析」。Genomics . 67 ( 1): 40–47. doi :10.1006/geno.2000.6211. PMID 10945468。
Hartley JL、Temple GF、 Brasch MA (2000 年 11 月)。「in vitro部位特異的組み換えを用いた DNA クローニング」。ゲノム研究。10 ( 11): 1788–1795。doi :10.1101/gr.143000。PMC 310948。PMID 11076863。
Wiemann S、Weil B、Wellenreuther R、Gassenhuber J、Glassl S、Ansorge W、他 (2001 年 3 月)。「ヒト遺伝子およびタンパク質のカタログに向けて: 500 個の新規完全タンパク質コーディングヒト cDNA の配列決定と分析」。ゲノム研究。11 ( 3 ): 422–435。doi :10.1101/ gr.GR1547R。PMC 311072。PMID 11230166。
Wiemann S、Arlt D、Huber W、Wellenreuther R、 Schleeger S 、 Mehrle A、他 (2004 年 10 月)。「ORFeome から生物学へ: 機能ゲノミクスパイプライン」。ゲノム研究。14 ( 10B): 2136–2144。doi :10.1101/gr.2576704。PMC 528930。PMID 15489336 。
Mehrle A、Rosenfelder H、Schupp I、del Val C、Arlt D、Hahne F、他 (2006 年 1 月)。「2006 年の LIFEdb データベース」。核酸研究。34 (データベース 号): D415–D418。doi :10.1093/nar/gkj139。PMC 1347501。PMID 16381901。
Zhang N、Liu J、Ding X、Aikhionbare F、Jin C、Yao X (2007 年 7 月)。「FBXL5 は p150Glued と相互作用し、そのユビキチン化を制御する」。生化学および生物物理学的研究通信。359 (1): 34–39。doi : 10.1016/ j.bbrc.2007.05.068。PMID 17532294 。

[refGRCh38Ensembl-1] GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000118564 – Ensembl、2017 年 5 月

[refGRCm38Ensembl-2] GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000039753 – Ensembl、2017 年 5 月

[3] 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。

[4] 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。

[pmid10531035-5] Cenciarelli C, Chiaur DS, Guardavaccaro D, Parks W, Vidal M, Pagano M (1999年10月). 「ヒトF-boxタンパク質ファミリーの同定」. Current Biology . 9 (20): 1177–1179. Bibcode :1999CBio....9.1177C. doi : 10.1016/S0960-9822(00)80020-2 . PMID 10531035. S2CID 7467493.

[entrez-6] 「Entrez Gene: FBXL5 F-box およびロイシンリッチリピートタンパク質 5」。

[7] Wang H、Shi H、Rajan M、Canarie ER、Hong S、Simoneschi D、et al. (2020年4月)。「FBXL5は酸素応答性[2Fe2S]クラスターを介して鉄恒常性におけるIRP2の安定性を制御する」。分子細胞。78 ( 1 ):31–41.e5。doi :10.1016/ j.molcel.2020.02.011。PMC 7159994。PMID 32126207。