ホモサピエンス種のタンパク質コード遺伝子
EIF4G3 利用可能な構造 ＰＤＢ オルソログ検索: PDBe RCSB
識別子 エイリアス EIF4G3 、eIF-4G 3、eIF4G 3、eIF4GII、真核生物翻訳開始因子4ガンマ3 外部ID オミム ：603929; MGI : 1923935; ホモロジーン : 2789; ジーンカード ：EIF4G3; OMA :EIF4G3 - オルソログ 遺伝子の位置（ マウス ） クロ。 染色体4（マウス） [2] バンド 4|4 D3 始める 137,993,022 bp [2] 終わり 138,208,508 bp [2]
RNA発現 パターン ブギー 人間 マウス （相同遺伝子） トップの表現 精子 脈絡叢上皮 右精巣 左精巣 正面ポール ブロードマン領域10 心室帯 結腸上皮 視床の外側核群 中前頭回
トップの表現 太ももの筋肉 胎児の尾 性器結節 網膜の神経層 精細管 膝関節 小脳皮質 一次視覚野 上前頭回 上腕三頭筋
参照表現データの詳細
バイオGPS 参照表現データの詳細
遺伝子オントロジー 分子機能
RNAキャップ結合 翻訳因子活性、RNA結合 翻訳開始因子活性 RNA結合 タンパク質結合 mRNA結合 細胞成分 生物学的プロセス
翻訳開始 ウイルスプロセス タンパク質生合成 翻訳の規制 翻訳開始の制御 オートファジーの負の制御 出典:Amigo / QuickGO
オルソログ 種 人間 ねずみ エントレズ アンサンブル ユニプロット RefSeq (mRNA) NM_001198801 NM_001198802 NM_001198803 NM_003760 NM_001391892 NM_001391893 NM_001391894 NM_001391895 NM_001391896 NM_001391898 NM_001391899 NM_001391900 NM_001391901 NM_001391902 NM_ 001391903 NM_001391904 NM_001391905 NM_001391906 NM_001391907
NM_001256195 NM_001256198 NM_172703 NM_001355699 NM_001355700
RefSeq (タンパク質) NP_001185730 NP_001185731 NP_001185732 NP_003751
NP_001243124 NP_001243127 NP_766291 NP_001342628 NP_001342629 NP_001356059 NP_001356060
場所 (UCSC) 1 章: 20.81 – 21.18 Mb 4 章: 137.99 – 138.21 Mb PubMed 検索 [3] [4]
ウィキデータ
真核生物翻訳開始因子4ガンマ3 は、ヒトでは EIF4G3 遺伝子によってコードされる タンパク質 である 。 [5] [6] この遺伝子は、 メッセンジャーRNA テンプレートへの リボソーム の組み立てを助けることによって 翻訳 で機能するタンパク質をコードする。 [7]紛らわしいことに、このタンパク質は通常eIF4GIIと呼ばれる。これは、EIF4G3が真 核生物翻訳開始因子4ガンマ に類似する3番目の遺伝子であるにもかかわらず 、2番目の アイソフォームである EIF4G2が 活性な翻訳開始因子ではないためである。 [8]
インタラクション EIF4G3はPABPC1 と 相互作用する ことが示されている 。 [9]
参考文献
^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000075151 – Ensembl 、2017 年 5 月 ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000028760 – Ensembl 、2017 年 5 月 ^ 「Human PubMed Reference:」。 国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館 。 ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。 国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館 。 ^ Gradi A、Imataka H、Svitkin YV、Rom E、Raught B、Morino S、Sonenberg N (1998 年 1 月)。 「新規機能性ヒト真核生物翻訳開始因子 4G」。 モル。細胞。バイオル 。 18 (1): 334–42。 土井 ：10.1128/mcb.18.1.334。 PMC 121501 。 PMID 9418880。 ^ 「Entrez Gene: EIF4G3 真核生物翻訳開始因子 4 ガンマ、3」。 ^ Gingras AC、Raught B、Sonenberg N (1999)。「eIF4 開始因子: mRNA リボソームへのリクルートのエフェクターおよび翻訳の調節因子」。Annu . Rev. Biochem . 68 : 913–63. doi :10.1146/annurev.biochem.68.1.913. PMID 10872469。 ^ Gradi A、Imataka H、Svitkin YV、Rom E、Raught B、Morino S、Sonenberg N (1998)。 「新規機能性ヒト真核生物翻訳開始因子 4G」。 モル。細胞。バイオル 。 18 (1): 334–42。 土井 ：10.1128/mcb.18.1.334。 PMC 121501 。 PMID 9418880。 ^ Imataka H, Gradi A, Sonenberg N (1998年12月). 「ヒトeIF4Gの新たに同定されたN末端アミノ酸配列はポリ(A)結合タンパク質に結合し、ポリ(A)依存的翻訳において機能する」. EMBO J. 17 ( 24): 7480–9. doi :10.1093/emboj/17.24.7480. PMC 1171091. PMID 9857202 .
さらに読む
Maruyama K, Sugano S (1994). 「オリゴキャッピング：真核生物mRNAのキャップ構造をオリゴリボヌクレオチドで置き換える簡単な方法」 Gene . 138 (1–2): 171–4. doi :10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298. Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (1997). 「全長濃縮cDNAライブラリーおよび5'末端濃縮cDNAライブラリーの構築と特性評価」. Gene . 200 (1–2): 149–56. doi :10.1016/S0378-1119(97)00411-3. PMID 9373149. Imataka H, Gradi A, Sonenberg N (1998). 「ヒトeIF4Gの新たに同定されたN末端アミノ酸配列はポリ(A)結合タンパク質に結合し、ポリ(A)依存性翻訳において機能する」. EMBO J. 17 ( 24): 7480–9. doi :10.1093/emboj/17.24.7480. PMC 1171091. PMID 9857202. Pyronnet S, Imataka H, Gingras AC, Fukunaga R, Hunter T, Sonenberg N (1999). 「ヒト真核生物翻訳開始因子4G (eIF4G) はmnk1をリクルートしてeIF4Eをリン酸化します」. EMBO J. 18 ( 1): 270–9. doi :10.1093/emboj/18.1.270. PMC 1171121. PMID 9878069 . Waskiewicz AJ、Johnson JC、Penn B、Mahalingam M、Kimball SR、Cooper JA (1999)。「生体内でのタンパク質キナーゼMnk1によるキャップ結合タンパク質真核生物翻訳開始因子4Eのリン酸化」。Mol . Cell. Biol . 19 (3): 1871–80. doi :10.1128/MCB.19.3.1871. PMC 83980. PMID 10022874 。 ディアス ネト E、コレア RG、ヴェルジョフスキー アルメイダ S、ブリオネス MR、永井 MA、ダ シウバ W、ザーゴ MA、ボルディン S、コスタ FF、ゴールドマン GH、カルヴァーリョ AF、松隈 A、バイア GS、シンプソン DH、ブランスタイン A、デオリベイラ PS、ブッチャー P、ジョンギニール CV、オヘア MJ、ソアレス F、ブレンターニ RR、レイス LF、デ・ソウザ SJ、シンプソン AJ (2000)。 「ORF 発現配列タグを使用したヒト トランスクリプトームのショットガン シーケンス」。 手順国立アカド。科学。アメリカ 。 97 (7): 3491–6。 Bibcode :2000PNAS...97.3491D。 土井 ： 10.1073/pnas.97.7.3491 。 PMC 16267。PMID 10737800 。 Marcotrigiano J、Lomakin IB、Sonenberg N、Pestova TV、Hellen CU、Burley SK (2001)。「eIF4G 内の保存された HEAT ドメインが翻訳開始機構の組み立てを指示する」。Mol . Cell . 7 (1): 193–203. doi : 10.1016/S1097-2765(01)00167-8 . PMID 11172724。 Gradi A、Svitkin YV、Sommergruber W、Imataka H、Morino S、Skern T、Sonenberg N (2003)。 「真核生物開始因子（eIF）4GIとeIF4GIIのヒトライノウイルス2Aプロテイナーゼ切断部位は異なります。」 J. ヴィロル 77 (8): 5026–9。 土井 ：10.1128/JVI.77.8.5026-5029.2003。 PMC 152112 。 PMID 12663812。 三浦 孝文、白鳥 勇、志間 暢 (2003)。「ヒト真核生物翻訳開始因子 4E (eIF4E) と 7-メチルグアノシン二リン酸 (m7GDP) およびヒト eIF4GII 由来の 17 アミノ酸ペプチドとの複合体のバックボーン共鳴割り当て」。J . Biomol. NMR . 27 (3): 279–80. doi :10.1023/A:1025442322316. PMID 12975586. S2CID 46050990. Qin H、Raught B、Sonenberg N、Goldstein EG、Edelman AM (2003)。「リン酸化スクリーニングにより、翻訳開始因子4GIIがCa(2+)/カルモジュリン依存性タンパク質キナーゼIの細胞内標的であることが確認された」。J . Biol. Chem . 278 (49): 48570–9. doi : 10.1074/jbc.M308781200 . PMID 14507913。 Gradi A、Foeger N、Strong R、Svitkin YV、Sonenberg N、Skern T、Belsham GJ (2004)。「口蹄疫ウイルス感染細胞内での真核生物翻訳開始因子 4GII の切断: in vitro での L-プロテアーゼ切断部位の特定」。J . Virol . 78 (7): 3271–8. doi :10.1128/JVI.78.7.3271-3278.2004. PMC 371048. PMID 15016848 。 Lejeune F、Ranganathan AC、Maquat LE (2004)。「eIF4G は哺乳類細胞における翻訳のパイオニアラウンドに必要である」。Nat . Struct. Mol. Biol . 11 (10): 992–1000. doi :10.1038/nsmb824. PMID 15361857. S2CID 3093989. ルアル JF、ヴェンカテサン K、ハオ T、弘實＝岸川 T、ドリコット A、リー N、ベリス GF、ギボンズ FD、ドレーゼ M、アイヴィ＝グエデフスー N、クリットゴード N、サイモン C、ボクセム M、ミルスタイン S、ローゼンバーグ J、ゴールドバーグDS、チャン LV、ウォン SL、フランクリン G、リー S、アルバラ JS、リム J、フロートン C、ラモサス E、セビック S、ベックス C、ラメシュ P、シコルスキー RS、ヴァンデンハウト J、 ゾグビ HY 、スモリャル A、ボサク S、 Sequerra R、Doucette-Stamm L、Cusick ME、Hill DE、Roth FP、Vidal M (2005)。 「ヒトタンパク質間相互作用ネットワークのプロテオームスケールマップに向けて」。 自然 。 437 (7062): 1173–8. Bibcode :2005Natur.437.1173R. doi :10.1038/nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026. Beausoleil SA、Villén J、Gerber SA、Rush J、Gygi SP (2006)。「高スループットタンパク質リン酸化分析および部位局在化のための確率ベースのアプローチ」 Nat. Biotechnol . 24 (10): 1285–92. doi :10.1038/nbt1240. PMID 16964243. S2CID 14294292. Olsen JV、Blagoev B、Gnad F、Macek B、Kumar C、Mortensen P 、Mann M (2006)。「シグナル伝達ネットワークにおける全体的、生体内、および部位特異的なリン酸化ダイナミクス」。Cell . 127 (3): 635–48. doi : 10.1016/j.cell.2006.09.026 . PMID 17081983. S2CID 7827573。
