ホモサピエンス種のタンパク質コード遺伝子
| E4F1 |
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| 識別子 |
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| エイリアス | E4F1、E4F、E4F 転写因子 1 |
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| 外部ID | オミム:603022; MGI : 109530;ホモロジーン: 3259;ジーンカード:E4F1; OMA :E4F1 - オルソログ |
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| 遺伝子の位置(マウス) |
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 | | クロ。 | 17番染色体(マウス)[2] |
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| | バンド | 17 A3.3|17 12.39 cM | 始める | 24,662,752 bp [2] |
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| 終わり | 24,689,287 bp [2] |
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| RNA発現パターン |
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| ブギー | | 人間 | マウス(相同遺伝子) |
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| トップの表現 | - 小脳の右半球
- 腓骨神経
- 甲状腺の右葉
- 顆粒球
- 甲状腺の左葉
- 下垂体
- 脚の皮膚
- 腹部の皮膚
- 心の頂点
- 下垂体前葉
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| | トップの表現 | - 顆粒球
- 網膜の神経層
- 太ももの筋肉
- リップ
- 右腎臓
- 上前頭回
- 尿道
- 桑実胚
- 桑実胚
- 心室帯
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| | 参照表現データの詳細 |
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| バイオGPS |  | | 参照表現データの詳細 |
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| 遺伝子オントロジー |
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| 分子機能 |
- DNA結合
- RNAポリメラーゼII転写調節領域配列特異的DNA結合
- 転写コリプレッサー活性
- DNA結合転写因子活性
- 転写活性化因子活性
- 金属イオン結合
- タンパク質結合
- DNA結合転写抑制活性、RNAポリメラーゼII特異的
- 核酸結合
- cAMP応答要素結合
- トランスフェラーゼ活性
- DNA結合転写因子活性、RNAポリメラーゼII特異的
| | 細胞成分 | | | 生物学的プロセス |
- 転写の調節、DNAテンプレート
- RNAポリメラーゼIIによる転写の負の制御
- 転写、DNAテンプレート
- 細胞分裂
- DNA複製
- 有糸分裂細胞周期の調節、胚
- タンパク質のユビキチン化
- 成長の規制
- 細胞周期
- 細胞集団の増殖
- ウイルスプロセス
- 細胞周期プロセスの調節
- 核酸テンプレート転写の正の制御
| | 出典:Amigo / QuickGO |
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| オルソログ |
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| 種 | 人間 | ねずみ |
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| エントレズ | | |
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| アンサンブル | | |
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| ユニプロット | | |
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| RefSeq (mRNA) | |
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NM_001288776 NM_001288778 NM_004424 |
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NM_001301784 NM_007893 NM_001355708 |
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| RefSeq (タンパク質) | |
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NP_001275705 NP_001275707 NP_004415 |
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NP_001288713 NP_031919 NP_001342637 |
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| 場所 (UCSC) | 16章: 2.22 – 2.24 Mb | 17章: 24.66 – 24.69 Mb |
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| PubMed検索 | [3] | [4] |
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| ウィキデータ |
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転写因子E4F1は、ヒトではE4F1遺伝子によってコードされるタンパク質である。[5] [6] [7]
関数
この遺伝子によってコードされるジンクフィンガータンパク質は、DNA結合活性がアデノウイルスE1Aの作用によって制御されるいくつかの細胞転写因子の1つです。全長タンパク質からタンパク質分解切断により50kDaのアミノ末端産物が生成されます。このタンパク質は、E1A誘導リン酸化によって異なる制御を受けます。全長遺伝子産物は、E1Aが存在しない場合にE4プロモーターからの転写を抑制しますが、50kDaの形態は、E1Aが存在する場合に転写活性化因子として機能します。[7]
インタラクション
E4F1 は以下と相互作用することが示されています:
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000167967 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000024137 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ Saccone S、Sandy P、Meroni G、Gostissa M、Della Valle G、Del Sal G (1998 年 11 月)。「in situ ハイブリダイゼーションおよび体細胞ハイブリッドによる E1A 制御転写因子 E4F 遺伝子 (E4F1) のヒト染色体バンド 16p13.3 への割り当て」。Cytogenet Cell Genet。82 ( 1–2 ) : 99–100。doi :10.1159/000015075。PMID 9763670。S2CID 46826484。
- ^ Burn TC、Connors TD、Van Raay TJ、Dackowski WR、Millholland JM、Klinger KW、Landes GM (1996 年 12 月)。「ヒト染色体 16p3.3 上の多発性嚢胞腎 1 型 (PKD1) および結節性硬化症 2 型 (TSC2) 疾患遺伝子を囲む 700 kb 領域の転写マップの生成」。Genome Res . 6 (6): 525–537. doi : 10.1101/gr.6.6.525 . PMID 8828041。
- ^ ab "Entrez Gene: E4F1 E4F 転写因子 1".
- ^ ab Rizos H、Diefenbach E、Badhwar P、Woodruff S、Becker TM、Rooney RJ、Kefford RF (2003 年 2 月)。「p14ARF と p120E4F 転写リプレッサーの関連により細胞周期阻害が促進される」。J . Biol. Chem . 278 (7): 4981–4989. doi : 10.1074/jbc.M210978200 . PMID 12446718。
- ^ Sandy P、Gostissa M、Fogal V、Cecco LD、Szalay K、Rooney RJ、Schneider C、Del Sal G (2000 年 1 月)。「p53 は p120E4F を介した増殖停止に関与している」。Oncogene . 19 ( 2): 188–199. doi : 10.1038/sj.onc.1203250 . PMID 10644996。
- ^ Fajas L、Paul C、Zugasti O、Le Cam L、Polanowska J、Fabbrizio E、Medema R、Vignais ML、Sardet C (2000 年 7 月)。「pRB は E1A 制御転写因子 p120E4F に結合し、その転写抑制活性を調節する」。Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 97 (14): 7738–7743。Bibcode : 2000PNAS ...97.7738F。doi : 10.1073/pnas.130198397 . PMC 16614 . PMID 10869426。
さらに読む
- Maruyama K, Sugano S (1994). 「オリゴキャッピング:真核生物mRNAのキャップ構造をオリゴリボヌクレオチドで置き換える簡単な方法」Gene . 138 (1–2): 171–174. doi :10.1016/0378-1119(94)90802-8. PMID 8125298.
- Fernandes ER、Rooney RJ (1997)。「アデノウイルス E1A 制御転写因子 E4F は、核因子 phiAP3 のヒト相同体から生成される」。Mol . Cell. Biol . 17 (4): 1890–1903. doi :10.1128/mcb.17.4.1890. PMC 232036. PMID 9121437 。
- Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (1997). 「全長濃縮cDNAライブラリーおよび5'末端濃縮cDNAライブラリーの構築と特性評価」. Gene . 200 (1–2): 149–156. doi :10.1016/S0378-1119(97)00411-3. PMID 9373149.
- Rooney RJ、Daniels RR、Jenkins NA、Gilbert DJ、Rothammer K、Morris SW、Higgs DR、Copeland NG (1998)。「ヒトおよびマウスにおけるアデノウイルス E1A 制御転写因子 E4F をコードする遺伝子の染色体位置と組織発現」。Mamm . Genome . 9 (4): 320–323. doi :10.1007/s003359900758. PMID 9530632. S2CID 31200297。
- Kim ST、Lim DS、Canman CE、Kastan MB (2000)。「ATMキナーゼファミリーメンバーの基質特異性と推定基質の同定」。J . Biol. Chem . 274 (53): 37538–37543。doi : 10.1074 / jbc.274.53.37538。PMID 10608806。
- Sandy P、Gostissa M、Fogal V、Cecco LD、Szalay K、Rooney RJ、Schneider C、Del Sal G (2000)。「p53 は p120E4F を介した増殖停止に関与している」。Oncogene . 19 (2): 188–199 . doi : 10.1038/sj.onc.1203250 . PMID 10644996。
- Fajas L、Paul C、Zugasti O、Le Cam L、Polanowska J、Fabbrizio E、Medema R、Vignais ML、Sardet C (2000)。「pRB は E1A 制御転写因子 p120E4F に結合し、その転写抑制活性を調節する」。Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 97 (14): 7738–7743。Bibcode : 2000PNAS ...97.7738F。doi : 10.1073/pnas.130198397 . PMC 16614 . PMID 10869426。
- Rizos H、Diefenbach E、Badhwar P、Woodruff S、Becker TM、Rooney RJ、Kefford RF (2003)。「p14ARF と p120E4F 転写リプレッサーの結合により細胞周期阻害が強化される」。J . Biol. Chem . 278 (7): 4981–4989. doi : 10.1074/jbc.M210978200 . PMID 12446718。
- Fenton SL、Dallol A、Agathanggelou A、Hesson L、Ahmed-Choudhury J、Baksh S、Sardet C、Dammann R、Minna JD、Downward J、Maher ER、Latif F (2004)。「E1A 制御転写因子 p120 E4F の RASSF1A 候補腫瘍抑制遺伝子の相互作用パートナーとしての同定」。Cancer Res . 64 (1): 102–107. doi :10.1158/0008-5472.CAN-03-2622. PMID 14729613. S2CID 13897912.
- Nakamura Y, Igarashi K, Suzuki T, Kanno J, Inoue T, Tazawa C, Saruta M, Ando T, Moriyama N, Furukawa T, Ono M, Moriya T, Ito K, Saito H, Ishibashi T, Takahashi S, Yamada S, Sasano H (2005). 「マイクロアレイ解析により、アテローム動脈硬化予防に関与する可能性のある新規エストロゲン応答性遺伝子 E4F1 が明らかになった」Am. J. Pathol . 165 (6): 2019–2031. doi : 10.1016 /s0002-9440(10)63253-1. PMC 1618705. PMID 15579445.
- ルアル JF、ヴェンカテサン K、ハオ T、弘實=岸川 T、ドリコット A、リー N、ベリス GF、ギボンズ FD、ドレーゼ M、アイヴィ=グエデフスー N、クリットゴード N、サイモン C、ボクセム M、ミルスタイン S、ローゼンバーグ J、ゴールドバーグDS、チャン LV、ウォン SL、フランクリン G、リー S、アルバラ JS、リム J、フロートン C、ラモサス E、セビック S、ベックス C、ラメシュ P、シコルスキー RS、ヴァンデンハウト J、ゾグビ HY、スモリャル A、ボサク S、セケーラ R、ドゥセット スタム L、キュージック ME、ヒル DE、ロス FP、ビダル M ( 2005)。 「ヒトタンパク質間相互作用ネットワークのプロテオームスケールマップに向けて」。自然。437 (7062): 1173–1178. Bibcode :2005Natur.437.1173R. doi :10.1038/nature04209. PMID 16189514. S2CID 4427026.
- Paul C、Lacroix M、Iankova I、Julien E、Schäfer BW、Labalette C、Wei Y、Le Cam A、Le Cam L、Sardet C (2006)。「LIM のみのタンパク質 FHL2 は E4F1 の負の調節因子である」。Oncogene . 25 ( 40): 5475–5484. doi :10.1038/sj.onc.1209567. PMID 16652157. S2CID 19655591。
- Le Cam L、Linares LK、Paul C、Julien E、Lacroix M、Hatchi E、Triboulet R、Bossis G、Shmueli A、Rodriguez MS、Coux O、Sardet C (2006)。「E4F1 は、分解とは無関係に p53 エフェクター機能を調整する非定型ユビキチンリガーゼです」。Cell . 127 ( 4): 775–788. doi : 10.1016/j.cell.2006.09.031 . PMID 17110336. S2CID 542082。
- Cvetanovic M、Rooney RJ、Garcia JJ、Toporovskaya N、Zoghbi HY、Opal P (2007)。「E4F を介した転写抑制における LANP とアタキシン 1 の役割」。EMBO Rep . 8 (7): 671–677. doi : 10.1038 /sj.embor.7400983. PMC 1905893. PMID 17557114.
外部リンク
- 米国国立医学図書館の医学主題標目表(MeSH)における E4F1+タンパク質、+ヒト
この記事には、パブリックドメインである米国国立医学図書館のテキストが組み込まれています。