オランダ領マラッカ(1641年~1825年)は、マラッカが外国の支配下にあった最長期間でした。オランダは、フランス革命期と後のナポレオン戦争(1795年~1815年)におけるイギリスの断続的な占領を除けば、ほぼ183年間マラッカを統治しました。この時代は、1606年にオランダとジョホール王国との間で結ばれた協定のおかげで、マレーのスルタン国からの深刻な妨害はほとんどなく、比較的平和でした。この時期はまた、マラッカの重要性が低下した時期でもありました。オランダは、この地域の経済と行政の中心地としてバタビア(現在のジャカルタ)を好み、マラッカの支配は、他のヨーロッパ列強による都市の喪失と、それに伴う競争を防ぐためでした。こうして、17世紀にはマラッカが重要な港としての地位を失うと、ジョホール王国は港の開港とオランダとの同盟により、この地域の支配的な勢力となりました。

17世紀初頭、オランダ東インド会社(オランダ語: Verenigde Oostindische Compagnie、VOC )は、東洋におけるポルトガルの勢力を奪うための作戦を開始した。当時、ポルトガルはマラッカを難攻不落の要塞( Fortaleza de Malaca )に変え、マラッカ海峡の航路と香辛料貿易を支配していた。オランダはまず、ポルトガルに対して小規模な侵攻や小競り合いを仕掛けた。最初の本格的な試みは、 1606年にオランダ共和国から派遣された第3次VOC艦隊(11隻)がコルネリス・マテリーフ・デ・ヨンゲ提督の指揮下でマラッカを包囲し、ラチャド岬沖海戦へと発展したことである。オランダ軍は敗走したが、ゴア総督マルティン・アフォンソ・デ・カストロ率いるポルトガル艦隊はより大きな損害を被り、この戦いはジョホール王国軍を結集させ、オランダ軍、そして後にアチェ王国軍との同盟へと発展させた。
オランダ軍は、地元のジャワ人同盟軍とともに約700人の兵力で、1641年1月にポルトガルからマラッカを攻撃し奪取した。ジョホール王国からも約500~600人の兵力がオランダ軍に提供された。オランダ軍はまた、近隣のバタビアや最近占領した基地からも物資や食料を受け取った。[ 1 ]この作戦により、ポルトガルの最後の拠点が事実上破壊され、マレー諸島におけるポルトガルの影響力は消滅した。1606年のジョホールとの協定に従い、オランダはマラッカを支配下に置き、領土を求めたり、マレー王国と戦争をしたりしないことに同意した。
マラッカ征服後、17世紀にはペラ州からの錫貿易のおかげで町は大きな利益を上げた。[ 2 ]: 104しかし1700年までに、オランダはマラッカでの貿易の復活に苦戦した。同年、町はバタビアに送られる錫の割当量を満たすことがほとんどできなかった。総督による貿易復活の試みが何度か行われたが、バタビアのVOC(オランダ東インド会社)の役人はそこでの錫貿易の見通しを改善しようとはせず、代わりに貿易をバタビアに振り向ける政策をとった。1711年、あるイギリス人はこの町を「健康的な場所だが、貿易は盛んではない」と評した。ジョホール・スルタン国によるブギス族の支配が始まると、リアウへの貿易が促進され、マラッカでの貿易活動は減少した。[ 2 ]: 102-105
1743年にマラッカ総督を務めたロジャー・ド・ラバーは、錫貿易を奨励しようと努力したにもかかわらず、状況は改善せず、その原因はインド人商人が主にアチェ、ケダ、ペラで貿易を行っていたため激しい競争が原因だと述べている。[ 2 ]: 107
1795年1月、イギリスに亡命を求めたオランダ総督ウィリアム5世(オラニエ公)は、キュー書簡を発布し、植民地のオランダ総督に対し、本国が侵略の脅威にさらされている間は、一時的にイギリスに権限を移譲し、フランスとの戦争においてイギリスに協力するよう指示した。こうしてマラッカはイギリスの支配下に置かれ、ナポレオン戦争終結までイギリスの占領下に置かれることになった。マラッカは、約20年にわたるイギリス統治の間、名目上はオランダの主権下に留まった。
イギリス統治下において、ポルトガル時代のマラッカ要塞は1807年から段階的に取り壊された。イギリスは、オランダが将来の地域紛争でこの要塞をイギリスに対する攻撃に利用するのではないかと懸念していたためである。しかし、遅ればせながらスタンフォード・ラッフルズ卿の介入により、ポルタ・デ・サンティアゴ(ア・ファモサ)だけが破壊を免れた。
1814年の英蘭条約によりマラッカはオランダの支配下に戻ったが、オランダが完全な支配権を取り戻したのは1818年になってからだった。 1824年の英蘭条約により、マラッカの主権はイギリスに永久的に譲渡された。

マラッカはオランダ東インド会社の植民地として統治されていた。マラッカの最高行政官は、ナポレオン戦争中に短期間イギリス駐在官の管轄下にあった時期を除いて、すべてオランダ人総督であった。しかし、オランダはバタビアに注力することを優先したため、マラッカの行政に対する関心は次第に薄れていった。[ 3 ]
オランダ人はポルトガルの要塞を改良・拡張し、 1670年には要塞の門を改修した。さらに港を守るための壁を建設し、都市を拡張した。17世紀半ばには市庁舎(スタットハウス)が建設され、オランダ植民地の行政の中心として機能し、それは今日まで残っている。[ 4 ]
1757 年、オランダ人はブギスと協力してクアラ リンギにコタ スパイを建設しました。それは数年後に放棄されました。[ 5 ]
北緯2度11分20秒、東経102度23分4秒/北緯2.18889度、東経102.38444度/北緯2.18889度、東経102.38444度