ジエチルピロカーボネート

ジエチルピロカーボネート
名前
	推奨されるIUPAC名ジエチルジカーボネート
	その他の名前ジエチルピロカーボネート; ジエチルオキシジホルメート; エトキシギ酸無水物; ピロ炭酸ジエチルエステル; ドイツ;
識別子
CAS番号	1609-47-8 ;
3Dモデル（JSmol）	インタラクティブ画像;
チェビ	チェビ:59051 ;
チェムBL	チェムBL55517 ;
ケムスパイダー	2943 ;
ECHA 情報カード	100.015.039
EC番号	216-542-8;
ケッグ	C11592 ;
メッシュ	ジエチルピロカーボネート
パブケム CID	3051;
ユニ	言語 ;
CompTox ダッシュボード ( EPA )	ＤＴＸＳＩＤ２０５１７６４;
	InChI InChI=1S/C6H10O5/c1-3-9-5(7)11-6(8)10-4-2/h3-4H2,1-2H3 キー: FFYPMLJYZAEMQB-UHFFFAOYSA-N ; InChI=1/C6H10O5/c1-3-9-5(7)11-6(8)10-4-2/h3-4H2,1-2H3 キー: FFYPMLJYZAEMQB-UHFFFAOYAU;
	笑顔 O=C(OCC)OC(=O)OCC;
プロパティ
化学式	Ｃ6Ｈ10Ｏ5
モル質量	162.141 グラムモル−1
外観	無色透明の液体
密度	25℃で1.101 g/mL ; 20℃で1.121 g/ mL
沸点	24 hPa で 93 ～ 94 °C (199 ～ 201 °F; 366 ～ 367 K)
危険
	労働安全衛生（OHS/OSH）：
主な危険	有害
	GHSラベル:
ピクトグラム
シグナルワード	警告
危険有害性情報	H302、H315、H319、H332、H335
注意事項	P261、P264、P270、P271、P280、P301+P312 、P302+P352、P304 +P312、P304+P340、P305+P351+P338、P312、P321、P330、P332+P313、P337+P313、P362、P403+P233、P405、P501
引火点	69 °C (156 °F; 342 K) 密閉カップ
	致死量または濃度（LD、LC）：
LD 50 (平均投与量)	経口 - ラット - 850 mg/kg
関連化合物
関連化合物	ジ-tert-ブチルジカーボネート; ジメチルジカーボネート
	特に記載がない限り、データは標準状態（25 °C [77 °F]、100 kPa）の材料に関するものです。確認する（何ですか？）インフォボックス参照

ジエチルピロカーボネート（DEPC）は、ジエチルジカーボネート（IUPAC名）とも呼ばれ、実験室では水中や実験器具上のRNase 酵素を不活性化するために使用されます。ヒスチジン（最も強力）、リジン、システイン、チロシン残基を共有結合修飾することで不活性化します。^[1]^[2]

DEPC 処理された（したがって RNase を含まない）水は、RNA が RNase によって分解されるリスクを軽減するために、実験室で RNAを扱う際に使用されます。

通常、水は 0.1% v/v DEPC で 37 °C で少なくとも 2 時間処理され、その後オートクレーブ(少なくとも 15 分) で処理されて微量の DEPC が不活性化されます。この方法で DEPC を不活性化すると、CO ₂とエタノールが生成されます。DEPC の濃度が高いほど、より多くの RNase を不活性化できますが、残留する微量または副産物が、in vitro 転写などのさらなる生化学反応を阻害する可能性があります。さらに、微量の DEPC またはその副産物が存在すると、カルボキシメチル化などの RNA の化学修飾が起こる可能性があり、バッファー交換後 (沈殿後) でも完全な RNA の回収が損なわれます。

DEPCは水中で不安定で、特に求核剤が存在すると二酸化炭素とエタノールに加水分解されやすい。このため、DEPCはTris緩衝液やHEPES緩衝液では使用できません。対照的に、リン酸緩衝生理食塩水やMOPSでは使用できます。^[3]便利なルールとして、活性-O:、-N:、または-S:を持つ酵素または化学物質は、DEPCがこれらの種と反応するため、DEPCで処理してRNaseフリーにすることはできないということです。さらに、DEPCの分解産物はin vitro転写を阻害する可能性があります。

ヒスチジンのDEPC誘導体化は、酵素におけるヒスチジン残基の重要性を研究するためにも使用されます。DEPCによるヒスチジンの修飾により、イミダゾール環の N-オメガ-2 窒素にカルボエトキシル化誘導体が生成されます。ヒスチジンの DEPC 修飾は、中性 pH で 0.5 Mヒドロキシルアミンで処理することで元に戻すことができます。

DEPC は二本鎖 DNA の構造を調べるためにも使用できます。^{[引用が必要]}

参照

12月

参考文献

^ Chirgwin, John M ; et al . (1979). 「リボヌクレアーゼを豊富に含むソースからの生物学的に活性なリボ核酸の単離」。生化学。18 ( 24): 5294–5299。doi :10.1021/bi00591a005。PMID 518835。
^ Wolf, Barry; Lesnaw, Judith A.; Reichmann, Manfred E. (1970). 「ジエチルピロカーボネートによるウシ膵臓リボヌクレアーゼの不可逆的不活性化のメカニズム。ジエチルピロカーボネートとタンパク質の一般的な反応」。European Journal of Biochemistry . 13 (3): 519–25. doi : 10.1111/j.1432-1033.1970.tb00955.x . PMID 5444158.
^ 「DEPCに関するFAQ」 Sigma-Aldrich . 2012年8月12日閲覧。

外部リンク

OpenWetWare 生命科学者 wiki の DEPC
RNaseおよびDEPC処理

[1] ^ Chirgwin, John M ; et al . (1979). 「リボヌクレアーゼを豊富に含むソースからの生物学的に活性なリボ核酸の単離」。生化学。18 ( 24): 5294–5299。doi :10.1021/bi00591a005。PMID 518835。

[2] Wolf, Barry; Lesnaw, Judith A.; Reichmann, Manfred E. (1970). 「ジエチルピロカーボネートによるウシ膵臓リボヌクレアーゼの不可逆的不活性化のメカニズム。ジエチルピロカーボネートとタンパク質の一般的な反応」。European Journal of Biochemistry . 13 (3): 519–25. doi : 10.1111/j.1432-1033.1970.tb00955.x . PMID 5444158.

[sigma-3] 「DEPCに関するFAQ」 Sigma-Aldrich . 2012年8月12日閲覧。