ヒトのタンパク質コード遺伝子
| ＤＤＸ２３ |
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| 利用可能な構造 |
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| ＰＤＢ | ヒト UniProt 検索: PDBe RCSB |
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| 識別子 |
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| エイリアス | DDX23、PRPF28、SNRNP100、U5-100K、U5-100KD、prp28、DEADボックスヘリカーゼ23 |
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| 外部ID | オミム：612172; MGI : 1921601;ホモロジーン: 3542;ジーンカード：DDX23; OMA :DDX23 - オルソログ |
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| 遺伝子の位置（マウス） |
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 | | クロ。 | 15番染色体（マウス）[2] |
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| | バンド | 15|15 F1 | 始める | 98,543,015 bp [2] |
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| 終わり | 98,560,775 bp [2] |
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| RNA発現パターン |
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| ブギー | | 人間 | マウス（相同遺伝子） |
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| トップの表現 | - アキレス腱
- 腓骨神経
- 顆粒球
- 心室帯
- 右子宮管
- 胃の本体
- 神経節隆起
- 直腸
- 甲状腺の右葉
- 横行結腸
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| | トップの表現 | - 網膜の神経層
- 心室帯
- 太ももの筋肉
- 卵黄嚢
- 胎児の尾
- 食道
- 上前頭回
- 性器結節
- 海馬歯状回顆粒細胞
- リップ
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| | 参照表現データの詳細 |
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| バイオGPS | 
 | | 参照表現データの詳細 |
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| 遺伝子オントロジー |
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| 分子機能 |
- ヌクレオチド結合
- ヘリカーゼ活性
- タンパク質結合
- 核酸結合
- 加水分解酵素活性
- ATP結合
- RNA結合
| | 細胞成分 |
- 触媒ステップ 2 スプライソソーム
- U5 スナバ
- 核質
- スプライソソーム複合体
- 細胞外エクソソーム
- 核
- 核小体
- 細胞質
| | 生物学的プロセス |
- スプライソソームを介したmRNAスプライシング
- エステル交換反応によるRNAスプライシング
- mRNA処理
- RNA二次構造の巻き戻し
- RNAスプライシング
- 前触媒スプライソソームのシスアセンブリ
| | 出典:Amigo / QuickGO |
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| ウィキデータ |
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おそらくATP依存性RNAヘリカーゼDDX23は、ヒトではDDX23遺伝子によってコードされる酵素である。[5] [6] [7]
この遺伝子は、DEAD ボックスタンパク質ファミリーのメンバーをコードします。DEAD ボックスタンパク質は、保存されたモチーフ Asp-Glu-Ala-Asp (DEAD) を特徴とし、推定 RNA ヘリカーゼです。これらは、翻訳開始、核およびミトコンドリアのスプライシング、リボソームおよびスプライソソームの組み立てなど、RNA の二次構造の変化を伴う多くの細胞プロセスに関与しています。分布パターンに基づいて、このファミリーの一部のメンバーは、胚形成、精子形成、および細胞の成長と分裂に関与していると考えられています。この遺伝子によってコードされるタンパク質は、U5 snRNP 複合体の構成要素であり、核 premRNA スプライシング中にスプライソソームの構造変化を促進する可能性があります。この遺伝子には、選択的スプライシング転写バリアントが見つかっていますが、その生物学的妥当性は決定されていません。[7]
参考文献
- ^ abc GRCh38: Ensembl リリース 89: ENSG00000174243 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ abc GRCm38: Ensembl リリース 89: ENSMUSG00000003360 – Ensembl、2017 年 5 月
- ^ 「Human PubMed Reference:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ 「マウス PubMed リファレンス:」。国立生物工学情報センター、米国国立医学図書館。
- ^ Teigelkamp S、Mundt C、Achsel T、Will CL、Luhrmann R (1998 年 1 月)。「ヒト U5 snRNP 特異的 100 kD タンパク質は、酵母スプライシング因子 Prp28p と有意な相同性を持つ RS ドメイン含有の推定 RNA ヘリカーゼである」。RNA。3 ( 11 ) : 1313–26。PMC 1369570。PMID 9409622。
- ^ Laggerbauer B、Achsel T、 Luhrmann R (1998年5月)。「ヒトU5-200kD DEXHボックスタンパク質は、in vitroでU4/U6 RNA重複体を解く」。Proc Natl Acad Sci USA。95 ( 8): 4188–92。Bibcode : 1998PNAS ...95.4188L。doi : 10.1073/ pnas.95.8.4188。PMC 22463。PMID 9539711。
- ^ ab "Entrez Gene: DDX23 DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) ボックスポリペプチド 23".
さらに読む
- Achsel T、Ahrens K、Brahms H、他 (1998)。「ヒト U5-220kD タンパク質 (hPrp8) は、RNA アンワインダーゼ、リボソーム伸長因子 EF-2 の相同体、および新規 WD-40 タンパク質を含むいくつかの U5 特異的タンパク質と安定した RNA フリー複合体を形成する」。Mol . Cell. Biol . 18 (11): 6756–66. doi :10.1128/mcb.18.11.6756. PMC 109259. PMID 9774689 。
- Jurica MS、Licklider LJ、Gygi SR 、 et al. (2002)。「3次元構造解析に適したネイティブスプライソソームの精製と特性評価」 。RNA。8 ( 4 ) : 426–39。doi : 10.1017 /S1355838202021088。PMC 1370266。PMID 11991638。
- Irobi J、Nelis E、Verhoeven K、他 (2002)。「12q24.3 に連鎖する遠位遺伝性運動ニューロパチー II 型 (遠位 HMN II) の 12 候補遺伝子の変異解析」。J . Peripher. Nerv. Syst . 7 (2): 87–95. doi :10.1046/j.1529-8027.2002.02014.x. PMID 12090300. S2CID 8453412。
- Strausberg RL、Feingold EA、Grouse LH、他 (2003)。「15,000 を超える完全長のヒトおよびマウス cDNA 配列の生成と初期分析」。Proc . Natl. Acad. Sci. USA . 99 ( 26): 16899–903。Bibcode : 2002PNAS ... 9916899M。doi : 10.1073/ pnas.242603899。PMC 139241。PMID 12477932。
- Gerhard DS、Wagner L、Feingold EA、他 (2004)。「NIH 完全長 cDNA プロジェクトの現状、品質、拡大: 哺乳類遺伝子コレクション (MGC)」。Genome Res . 14 (10B): 2121–7. doi :10.1101/gr.2596504. PMC 528928. PMID 15489334 。
- Andersen JS 、Lam YW、Leung AK 、他 (2005)。「核小体プロテオームダイナミクス」。Nature . 433 ( 7021 ): 77–83。Bibcode :2005Natur.433...77A。doi : 10.1038/nature03207。PMID 15635413。S2CID 4344740。
- Olsen JV、Blagoev B、Gnad F、et al. (2006)。「シグナル伝達ネットワークにおける全体的、生体内、および部位特異的なリン酸化ダイナミクス」。Cell . 127 (3): 635–48. doi : 10.1016/j.cell.2006.09.026 . PMID 17081983. S2CID 7827573。
- Ewing RM、Chu P、Elisma F、他 (2007)。「質量分析法によるヒトタンパク質間相互作用の大規模マッピング」。Mol . Syst. Biol . 3 (1): 89. doi :10.1038/msb4100134. PMC 1847948. PMID 17353931 。
