| シアノファージN-1 | |
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| ウイルスの分類 | |
| グループ: | グループ I ( dsDNA )
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| 注文: | |
| 家族: | |
| 属: | シアノミオウイルス(提案)
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| 種: | シアノファージN-1
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シアノファージN-1は、淡水産糸状シアノバクテリアであるNostoc属に感染するミオウイルス バクテリオファージである。[1]このウイルスは、1971年に米国でケネス・アドルフとロバート・ハゼルコーンによって窒素固定シアノバクテリアであるNostoc muscorumから初めて単離された。[2] [3] N-1はシアノファージA-1と近縁であるが、淡水産または海洋産の他のシアノファージとは遠縁である。 [1]
構造
ウイルスは直径約61nmの多面体の頭部を持つ。収縮性の尾部は長さ100nmで、尾部頭を介して頭部に付着している。首の部分に繊維がある。成熟したウイルス粒子には少なくとも19種類のタンパク質が含まれている。[2] [4] [5]
ゲノム
線状の二本鎖 DNAゲノムの長さは 64,960 塩基対で、収縮性尾部を持つほとんどのファージの半分の大きさで、通常 161~231 kb の範囲です。GC含有量は 35.4% です。91 個のオープン リーディング フレーム(ORF) のうち、他の既知の配列と類似しているのは 33 個だけです。注目すべきことに、シアノファージ N1 のゲノムは機能的なCRISPRアレイをコードしており、これは競合するウイルスによる感染から宿主を保護すると考えられています。[1]
ライフサイクルと宿主との相互作用
N. muscorumへのウイルス吸着の最適pHは7.6~8.1です。吸着率は宿主細胞の加齢とともに低下します。ウイルスの潜伏期間は7時間で、LPP-1グループのシアノファージと同程度です。バーストサイズは細胞あたり100 プラーク形成単位です。[6]
ウイルスの複製には宿主の光合成が必要であり、光合成は特定の時点ではなくライフサイクル全体を通じて必要である。ウイルスの複製は、周期的な光リン酸化と炭水化物貯蔵の使用によって行われ、光化学系IIの活性は必要ない。[7] [8] N. muscorumのシアノファージN-1感染は、グルコース-6-リン酸脱水素酵素濃度の上昇やグルタミン合成酵素活性の低下など、宿主の炭素および窒素代謝におけるいくつかの変化と関連している。[9]
参考文献
- ^ abc Chénard C、Wirth JF、Suttle CA (2016)、「淡水糸状シアノバクテリア(Nostoc sp.)に感染するウイルスは、機能的なCRISPRアレイとプロテオバクテリアDNAポリメラーゼBをコードする」、mBio、7(3):e00667-16、doi:10.1128/mBio.00667-16、PMC 4916379、PMID 27302758
- ^ ab Adolph KW、Haselkorn R (1971)、「藍藻Nostoc muscorumに感染するウイルスの分離と特徴付け」、Virology、46 (2): 200–208、doi :10.1016/0042-6822(71)90023-7、PMID 4108613
- ^ サルマ 2012、420、423 ページ
- ^ サルマ 2012、423 ページ
- ^ Adolph KW、Haselkorn R (1973)、「藍藻ウイルスN-1:物理的特性と構造部分への分解」、Virology、53(2):427–40、doi:10.1016/0042-6822(73)90222-5、PMID 4268208
- ^ サルマ 2012、427、429 ページ
- ^ サルマ 2012、430 ページ
- ^ カレンダー2006、p.524
- ^ サルマ 2012、433 ページ
出典
- カレンダー R.バクテリオファージ(オックスフォード大学出版局; 2006) ( ISBN 0195148509 )
- サルマ TA.シアノバクテリアハンドブック( CRC Press ; 2012) ( ISBN 1466559411 )
